Gene Expression Image Detail

Reference

Figure

ID

J:171421 Vandunk C, et al., J Neurosci. 2011 Apr 27;31(17):6457-67

6

MGI:7660783

Image

Caption

A-C: In situ hybridization in suprachiasmatic nucleus (SCN) progenitor domain from E10.5 to E13.5 (rows). Leftmost column shows entire coronal section, with dotted box indicating approximate region of enlarged images in corresponding panes to the right. Dotted black lines in enlarged Six3 images indicate hypothesized early SCN margins outlined by Six3 expression from E11.5 to E13.5. Scale bar, 500 um. D: Rostrocaudal location of SCN progenitor domain. In situ hybridization in transverse plane from rostral eye fields to caudal developing pituitary at E11.5 and E13.5. Open bars above indicate the developing SCN within the rostrocaudal axis. D: E11.5 depicts same transverse images as shown in A-C, and E13.5 shows the same Six6 and Fzd5 images shown in A-C now within the rostrocaudal context of the developing brain. Scale bar, 500um.

Copyright

This image is from Vandunk C, J Neurosci 2011 Apr 27;31(17):6457-67, and is displayed under the terms of the Creative Commons Attribution-Noncommercial-ShareAlike 3.0 Unported License.

Associated
Assays

Label	Assay & Result Details (Gene Symbol)	Spatial Mapping
A E10.5 low mag	MGI:7660839 (Six3)
A E12.5 low mag	MGI:7660839 (Six3)
A E13.5 low mag	MGI:7660839 (Six3)
A E11.5 low mag	MGI:7660839 (Six3)
A E10.5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
A E10.5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
B E10.5 Rx	MGI:7661034 (Rax)
B E10.5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
A E11.5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
A E13.5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
A E12.5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
A E11.5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
A E12.5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
A E13.5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
B E11.5 Rx	MGI:7661034 (Rax)
B E12.5 Rx	MGI:7661034 (Rax)
B E13.5 Rx	MGI:7661034 (Rax)
B E11.5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
B E12.5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
B E13.5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
B E10.5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
B E11.5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
B E12.5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
B E13.5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
C E11.5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
C E10.5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
C E12.5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
C E13.5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
C E10.5 SHH	MGI:7661039 (Shh)
C E11.5 SHH	MGI:7661039 (Shh)
C E12.5 SHH	MGI:7661039 (Shh)
C E13.5 SHH	MGI:7661039 (Shh)
D E11.5 Rostral 1 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E11.5 2 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E11.5 3 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E11.5 4 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E11.5 Caudal 5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E11.5 Rostral 1 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E11.5 Rostral 1 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E11.5 Rostral 1 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E11.5 Rostral 1 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E11.5 2 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E11.5 2 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E11.5 2 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E11.5 2 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E11.5 3 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E11.5 3 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E11.5 3 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E11.5 3 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E11.5 4 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E11.5 4 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E11.5 4 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E11.5 4 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E11.5 Caudal 5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E11.5 Caudal 5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E11.5 Caudal 5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E11.5 Caudal 5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E13.5 Rostral 1 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E13.5 Rostral 1 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E13.5 Rostral 1 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E13.5 Rostral 1 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E13.5 Rostral 1 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E13.5 2 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E13.5 2 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E13.5 2 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E13.5 2 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E13.5 2 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E13.5 3 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E13.5 3 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E13.5 3 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E13.5 3 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E13.5 3 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E13.5 4 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E13.5 4 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E13.5 4 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E13.5 4 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E13.5 4 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)
D E13.5 Caudal 5 Six3	MGI:7660839 (Six3)
D E13.5 Caudal 5 Lhx1	MGI:7660849 (Lhx1)
D E13.5 Caudal 5 Six6	MGI:7660840 (Six6)
D E13.5 Caudal 5 Dlx2	MGI:7661037 (Dlx2)
D E13.5 Caudal 5 Fzd5	MGI:7661038 (Fzd5)