| Gene | Allele | Assay Type | Description |
|---|---|---|---|
| D17Tu1 | PCR amplified length variant | D17Tu1-pA, D17Tu1-pB | |
| Dynlt1b | Southern analysis | Tctex-1 | |
| D17Mit19 | |||
| D17Aus9 | Southern analysis | Au9 | |
| T | Southern analysis | T probe 4 | |
| D17Leh119 | Southern analysis | Tu119 | |
| D17Mit18 | |||
| D17Mit25a | |||
| D17Pri2 | PCR amplified length variant | D17Pri2-pA, D17Pri2-pB | |
| D17Pri3 | PCR amplified length variant | D17Pri-pA, D17Pri3-pB | |
| D17Tu34 | Southern analysis | Tu34 | |
| Map3k4 | |||
| Plg | Southern analysis | pMP33B | |
| Thbs2 | Southern analysis | Thbs-2 | |
| D17Aus53 | Southern analysis | Au53 | |
| D17Aus17 | Southern analysis | Au17 | |
| D17Leh55 | Southern analysis | Tu55 | |
| Ccnb1-rs3 | Southern analysis | Cyc-B | |
| D17Leh80 | Southern analysis | Tu80 | |
| D17Leh111 | Southern analysis | Tu111 | |
| D17Pri1 | Southern analysis | p71RI1.5 | |
| D17Tu50 | Southern analysis | Tu50 | |
| D17Leh54 | Southern analysis | p54M | |
| D17Lon1 | Southern analysis | p12M | |
| D17Lon2 | Southern analysis | p92M | |
| D17Aus126 | Southern analysis | P126 | |
| D17Mit26 | |||
| D17Mit46 | |||
| Hba-ps4 | Southern analysis | Hba-9 | |
| D17Aus57 | |||
| D17Mit44 | |||
| Pim1 | |||
| D17Aus7 | |||
| D17Mit45 | |||
| Cryaa | Southern analysis | Crya-10 | |
| D17Aus127 | |||
| D17Mit28 | |||
| D17Mit16 | |||
| H2-Ab1 | |||
| Lta | |||
| D17Mit13 | |||
| H2-M2 | |||
| D17Leh171 | Southern analysis | D17Leh171 | |
| D17Tu49 | Southern analysis | Tu49 | |
| D17Mit47 | |||
| Tcte1 | Southern analysis | Tcte-1 | |
| D17Mit35 | |||
| Mea1 | Southern analysis | Mea1 cDNA | |
| D17Mit36 | |||
| D17Mit10 | |||
| D17Mit37 | |||
| D17Mit9 | |||
| D17Mit6 | |||
| C3 | |||
| D17Mit4 | |||
| D17Mit5 | |||
| D17Mit7 |
| MC #mice | D17Tu1 | Dynlt1b | D17Mit19 | D17Aus9 | T | D17Leh119 | D17Mit18 | D17Mit25a | D17Pri2 | D17Pri3 | D17Tu34 | Map3k4 | Plg | Thbs2 | D17Aus53 | D17Aus17 | D17Leh55 | Ccnb1-rs3 | D17Leh80 | D17Leh111 | D17Pri1 | D17Tu50 | D17Leh54 | D17Lon1 | D17Lon2 | D17Aus126 | D17Mit26 | D17Mit46 | Hba-ps4 | D17Aus57 | D17Mit44 | Pim1 | D17Aus7 | D17Mit45 | Cryaa | D17Aus127 | D17Mit28 | D17Mit16 | H2-Ab1 | Lta | D17Mit13 | H2-M2 | D17Leh171 | D17Tu49 | D17Mit47 | Tcte1 | D17Mit35 | Mea1 | D17Mit36 | D17Mit10 | D17Mit37 | D17Mit9 | D17Mit6 | C3 | D17Mit4 | D17Mit5 | D17Mit7 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 124 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 130 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 8 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 3 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 5 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 7 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 6 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 4 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 1 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 4 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 4 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 11 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 1 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 2 | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | c | c |
| 11 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b | b |
| 2 | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | b | b | b | b | b |
| 4 | b | b | b | b | bb | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | b | c | c | c | c | c |
| Marker 1 | Marker 2 | # Recombinants | Total | % Recombinants | Std Error |
|---|---|---|---|---|---|
| D17Tu1 | Dynlt1b | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| Dynlt1b | D17Mit19 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit19 | D17Aus9 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Aus9 | T | 6 | 369 | 1.626 | 0.658 |
| T | D17Leh119 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
| D17Leh119 | D17Mit18 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit18 | D17Mit25a | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit25a | D17Pri2 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
| D17Pri2 | D17Pri3 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Pri3 | D17Tu34 | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
| D17Tu34 | Map3k4 | 10 | 369 | 2.710 | 0.845 |
| Map3k4 | Plg | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| Plg | Thbs2 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| Thbs2 | D17Aus53 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Aus53 | D17Aus17 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Aus17 | D17Leh55 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
| D17Leh55 | Ccnb1-rs3 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
| Ccnb1-rs3 | D17Leh80 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Leh80 | D17Leh111 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Leh111 | D17Pri1 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Pri1 | D17Tu50 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Tu50 | D17Leh54 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Leh54 | D17Lon1 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
| D17Lon1 | D17Lon2 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Lon2 | D17Aus126 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
| D17Aus126 | D17Mit26 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit26 | D17Mit46 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit46 | Hba-ps4 | 5 | 369 | 1.355 | 0.602 |
| Hba-ps4 | D17Aus57 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Aus57 | D17Mit44 | 17 | 369 | 4.607 | 1.091 |
| D17Mit44 | Pim1 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
| Pim1 | D17Aus7 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Aus7 | D17Mit45 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit45 | Cryaa | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
| Cryaa | D17Aus127 | 4 | 369 | 1.084 | 0.539 |
| D17Aus127 | D17Mit28 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Mit28 | D17Mit16 | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| D17Mit16 | H2-Ab1 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| H2-Ab1 | Lta | 1 | 369 | 0.271 | 0.271 |
| Lta | D17Mit13 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit13 | H2-M2 | 8 | 369 | 2.168 | 0.758 |
| H2-M2 | D17Leh171 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Leh171 | D17Tu49 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Tu49 | D17Mit47 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit47 | Tcte1 | 13 | 369 | 3.523 | 0.960 |
| Tcte1 | D17Mit35 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit35 | Mea1 | 3 | 369 | 0.813 | 0.467 |
| Mea1 | D17Mit36 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit36 | D17Mit10 | 2 | 369 | 0.542 | 0.382 |
| D17Mit10 | D17Mit37 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit37 | D17Mit9 | 11 | 369 | 2.981 | 0.885 |
| D17Mit9 | D17Mit6 | 6 | 369 | 1.626 | 0.658 |
| D17Mit6 | C3 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| C3 | D17Mit4 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit4 | D17Mit5 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
| D17Mit5 | D17Mit7 | 0 | 369 | 0.000 | 0.000 |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Models of Human Cancer database (MMHCdb) (formerly Mouse Tumor Biology (MTB)), Gene Ontology (GO) |
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last database update 09/30/2025 MGI 6.24 |
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