Mapping Data

Experiment

• Experiment
  CROSS
• Chromosome
  2
• Reference
  J:37225 Peichel CL, et al., Genetic and physical mapping of the mouse Ulnaless locus. Genetics. 1996 Dec;144(4):1757-67
• ID
  MGI:48129

Genes

Gene	Assay Type	Description
D2Mit11	SSLP
D2Mit245	SSLP
D2Pri1	Southern analysis	FF1L
Evx2	SSLP	Evx2F/Evx2R
Hoxd11	SSLP	D2Tfv9f/D2Tfv9R
Hoxd10	reported elsewhere
Hoxd9	PCR amplified length variant	D2Tfv11f/D2Tfv11R, D2Tfv10f/D2Tfv10R
Hoxd	visible phenotype
D2Mit247	SSLP
D2Mit418	SSLP
D2Mit219	SSLP
D2Mit435	SSLP
D2Mit93	SSLP
D2Mit183	SSLP
D2Mit159	SSLP
D2Mit220	SSLP
D2Mit14a	SSLP

Notes

• Reference
  Authors state that all ten genes of the Hoxd cluster are possible candidate genes for U1.
• Experiment
  F1 direction known.
  

CROSS

• Type
  Backcross, female
• Female Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c> <c>
• Strain
  (CBA-Lnpk

  /+ x CAST/Ei)F1
• Male Parent
  <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>/<b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b> <b>
• Strain
  CBA.C3-Lnpk
• Allele 1
  b from CBA.C3-Lnpk
• Allele 2
  c from CAST/EiJ

2x2 Data Reported

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	# Parentals
D2Mit11	D2Mit245	7	542
D2Mit245	D2Pri1	5	544
D2Mit245	Evx2	5	544
D2Mit245	Hoxd11	5	544
D2Mit245	Hoxd10	5	544
D2Mit245	Hoxd9	5	544
D2Mit245	Hoxd	5	544
D2Mit245	D2Mit247	5	544
D2Mit245	D2Mit418	5	544
D2Pri1	D2Mit219	1	548
Evx2	D2Mit219	1	548
Hoxd11	D2Mit219	1	548
Hoxd10	D2Mit219	1	548
Hoxd9	D2Mit219	1	548
Evx2	Hoxd	0	549
Hoxd10	Hoxd	0	549
Hoxd9	Hoxd	0	549
Hoxd	D2Mit219	1	548
D2Mit247	Hoxd11	0	549
D2Mit247	Hoxd	0	549
D2Mit247	D2Mit219	1	548
D2Mit418	Hoxd11	0	549
D2Mit418	Hoxd	0	549
D2Mit418	D2Mit219	1	548
D2Mit219	D2Mit435	7	542
D2Mit435	D2Mit93	1	548
D2Mit93	D2Mit183	1	548
D2Mit183	D2Mit159	1	548
D2Mit159	D2Mit220	4	545
D2Mit220	D2Mit14a	1	548

Statistics

Marker 1	Marker 2	# Recombinants	Total	% Recombinants	Std Error
D2Mit11	D2Mit245	7	549	1.275	0.479
D2Mit245	D2Pri1	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	Evx2	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	Hoxd11	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	Hoxd10	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	Hoxd9	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	Hoxd	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	D2Mit247	5	549	0.911	0.405
D2Mit245	D2Mit418	5	549	0.911	0.405
D2Pri1	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
Evx2	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
Hoxd11	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
Hoxd10	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
Hoxd9	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
Evx2	Hoxd	0	549	0.000	0.000
Hoxd10	Hoxd	0	549	0.000	0.000
Hoxd9	Hoxd	0	549	0.000	0.000
Hoxd	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
D2Mit247	Hoxd11	0	549	0.000	0.000
D2Mit247	Hoxd	0	549	0.000	0.000
D2Mit247	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
D2Mit418	Hoxd11	0	549	0.000	0.000
D2Mit418	Hoxd	0	549	0.000	0.000
D2Mit418	D2Mit219	1	549	0.182	0.182
D2Mit219	D2Mit435	7	549	1.275	0.479
D2Mit435	D2Mit93	1	549	0.182	0.182
D2Mit93	D2Mit183	1	549	0.182	0.182
D2Mit183	D2Mit159	1	549	0.182	0.182
D2Mit159	D2Mit220	4	549	0.729	0.363
D2Mit220	D2Mit14a	1	549	0.182	0.182