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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Hsf1 heat shock factor 1 MGI:96238 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs51549945 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76306226 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs48179897 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76306462 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | C | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49328402 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76306499 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50392807 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76306573 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50502796 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76307171 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49000376 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76307312 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | G | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs48064213 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76307401 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46433095 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76307510 | f | Bop1 : Intron Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50656101 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76307675 | f | Bop1 : mRNA-UTR Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50457328 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76308495 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs48620985 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76308872 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs48987082 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76309036 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31796342 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76315411 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32350111 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76320808 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47200517 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321327 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50107374 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321379 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49251290 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321627 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51344049 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321652 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47625341 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321755 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50772575 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76321776 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47408943 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322044 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46957630 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322151 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50111769 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322382 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51500777 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322502 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49192233 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322681 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs50318284 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322727 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46879170 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76322745 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46799820 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76323861 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs45942743 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76324111 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46410575 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76324766 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46375523 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76326524 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51427212 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76326914 | f | Hsf1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51387313 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76327718 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49915013 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76327919 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32255066 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76328772 | f | Hsf1 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | A | G | G | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46928447 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76329214 | f | Hsf1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32002299 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76330563 | f | Dgat1 : Locus-Region Hsf1 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230833 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76330854 | f | Dgat1 : Locus-Region Hsf1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4230834 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76331165 | f | Dgat1 : Locus-Region Hsf1 : mRNA-UTR | 4 | SNP | T | T | C | T | C | C | T | T | T | C | C | T | C | C | T | T | C | C | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C | C | T | T | T | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | T | T | T | C/T | |
| rs31948622 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76331529 | f | Dgat1 : Locus-Region Hsf1 : Locus-Region | 2 | SNP | G | A | G | A | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46682912 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr15:76331900 | f | Dgat1 : Locus-Region Hsf1 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/22/2013 MGI 5.13 |
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