About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hsf1
heat shock factor 1
MGI:96238

51 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51549945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76475796fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPG GGGG   G GGAG        G          G      G A    G A/G
rs48179897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476032fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPT TTTT   C TTCC        T          T      T C    T C/T
rs49328402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476069fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AA          A          A      A G    A A/G
rs50392807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476143fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA   G AA A        A          A      A A    A A/G
rs50502796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476741fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCTC        C          C      C T    C C/T
rs49000376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476882fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA   G AAGG        A          A      A G    A A/G
rs48064213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76476971fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA   G AA A        A          A      A G    A A/G
rs46433095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76477080fBop1 : Intron
Hsf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA   C AA A        A          A      A C    A A/C
rs50656101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76477245fBop1 : mRNA-UTR
Hsf1 : Locus-Region
1SNPC CCCC   T CC C        C          C      C T    C C/T
rs50457328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76478065fBop1 : Locus-Region
Hsf1 : Intron
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A G    A A/G
rs48620985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76478442fBop1 : Locus-Region
Hsf1 : Intron
1SNPT TTTT   T TT T        T          T      T G    T G/T
rs48987082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76478606fBop1 : Locus-Region
Hsf1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGAG        G          G      G A    G A/G
rs51710912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76484775fHsf1 : Intron1SNP  T        T                                      T
rs49867575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76484808fHsf1 : Intron1SNP TC        C                                      C/T
rs31796342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76485078fHsf1 : Intron1SNP GG   A                                           A/G
rs32350111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76490378fHsf1 : Intron1SNPCCC   C    G                                      C/G
rs47200517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76490897fHsf1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC        C          C      C C    C C/T
rs50107374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76490949fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT        T          T      T T    T C/T
rs49251290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491197fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT        T          T      T T    T C/T
rs51344049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491222fHsf1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs47625341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491325fHsf1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA        A          A      A A    A A/G
rs50772575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491346fHsf1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA        A          A      A A    A A/G
rs47408943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491614fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTGT        T          T      T T    T G/T
rs46957630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491721fHsf1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs50111769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76491952fHsf1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA        A          A      A G    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51500777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76492072fHsf1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C T    C C/T
rs49192233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76492251fHsf1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C T    C C/T
rs50318284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76492297fHsf1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG        G          G      G A    G A/G
rs46879170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76492315fHsf1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC        C          C      C A    C A/C
rs46799820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76493431fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT        T          T      T T    T C/T
rs45942743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76493681fHsf1 : Intron2SNPTTTTTT   C TTCT        T          T    C T C    T C/T
rs51980686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76493735fHsf1 : Intron1SNP CC        C                           T          C/T
rs51956020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76493937fHsf1 : Intron1SNP GG        G                           A          A/G
rs46410575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76494336fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT        T          T      T T    T C/T
rs46375523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76496094fHsf1 : Intron2SNPAAAAAA   A AAGA        A          A    G A G    A A/G
rs51427212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76496484fHsf1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G GGGA        G          G      G G    G A/G
rs51387313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76497288fHsf1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs49915013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76497489fHsf1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G A    G A/G
rs32255066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76498342fHsf1 : Intron3SNPAAGAGGA  G AGAA    A   A          AG     A A    A A/G
rs46928447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76498784fHsf1 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T C    T C/T
rs32002299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76500133fHsf1 : Intron3SNP GA   G    G       G               A              A/G
rs4230833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76500424fHsf1 : Coding-Synonymous1SNP  G GGG  A G          G                           A/G
rs4230834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76500735fHsf1 : mRNA-UTR6SNPTTCTCCTTTCCTCCTTCCTTCT TTTTTCCTTTCTCCCCCCTCCTCCTTTC/T
rs31948622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501099fHsf1 : Locus-Region4SNPG AGAAG  G GAGG    G   G          GA     G G    G A/G
rs46682912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501470fHsf1 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T T    C C/T
rs51646388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501488fHsf1 : 516 bp downstream of1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C C    T C/T
rs46309303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501690fDgat1 : Intron
Hsf1 : 718 bp downstream of
1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T C    T C/T
rs46517673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501746fDgat1 : Intron
Hsf1 : 774 bp downstream of
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G A    G A/G
rs49737577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76501833fDgat1 : Intron
Hsf1 : 861 bp downstream of
1SNPA AAAA   A AAGA        A          A      A G    A A/G
rs31874675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76502013fDgat1 : Splice-Site
Hsf1 : 1041 bp downstream of
4SNPAAGAGGA  G AGGG    A   A          AG     A      A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31674537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:76502794fDgat1 : Intron
Hsf1 : 1822 bp downstream of
3SNP CT   C    C       C               T              C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory