About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hoxd10
homeobox D10
MGI:96202

8 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs226991932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74690376fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd11)32Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd12)19Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Gm28309 : within coordinates of
Hoxd10 : Locus-Region
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP          GAA/G
rs246756172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74690402fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd11)32Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd12)19Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Gm28309 : within coordinates of
Hoxd10 : Locus-Region
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP          CTC/T
rs27967861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74693705fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd11)32Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd12)19Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Gm28309 : within coordinates of
Hoxd10 : Intron
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP  CC G  G   C/G
rs27967860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74694110fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd11)32Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd12)19Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Gm28309 : within coordinates of
Hoxd10 : Coding-Synonymous
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP  TT T TGT  G/T
rs33516844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74694829fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd11)32Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd12)19Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)7Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)10Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd10-Hoxd13)38Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Hoxd10 : mRNA-UTR
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNPAA  G A     A/G
rs216140005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74695471fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Hoxd10 : Locus-Region
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP          GAA/G
rs228781810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74695656fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Gm14396 : within coordinates of
Hoxd10 : 551 bp downstream of
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
1SNP          CTC/T
rs29506296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:74696251fDel(2Cd44-Hoxd11)43Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd10)26Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)1Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)12Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd1-Hoxd13)54Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd11)36Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)28Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd4-Hoxd13)30Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)15Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd10)21Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)9Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd8-Hoxd13)11Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd10)14Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd12)20Ddu : within coordinates of
Del(2Hoxd9-Hoxd13)8Ddu : within coordinates of
Dp(2Hoxd8-Hoxd10)1Ddu : within coordinates of
Gm14396 : within coordinates of
Hoxd9 : Locus-Region
Hoxd10 : 1146 bp downstream of
In(2Cd44;Hoxd11)2Ddu : within coordinates of
2SNPAA  T T     A/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory