About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Foxred1
FAD-dependent oxidoreductase domain containing 1
MGI:2446262

63 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs38151318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35202424fFoxred1 : 1782 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          T   C C  C/T
rs37500361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35202694fFoxred1 : 1512 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          T   C C  C/T
rs30424086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35202848fFoxred1 : 1358 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
4SNP AA   C A C A AAA  A/C
rs37013979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35202915fFoxred1 : 1291 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          A   T T  A/T
rs36699242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203021fFoxred1 : 1185 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          C   T T  C/T
rs36735944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203108fFoxred1 : 1098 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          C   T T  C/T
rs232407641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203315fFoxred1 : 891 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP            A  G   A/G
rs36246052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203453fFoxred1 : 753 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          A   G G  A/G
rs30138619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203551fFoxred1 : 655 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
3SNPG G   C G   G  G   C/G
rs37871305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35203654fFoxred1 : 552 bp downstream of
Srpr : within coordinates of
1SNP          T   C C  C/T
rs38281976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35204144fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : within coordinates of
1SNP          A   G    A/G
rs36552816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35204941fFoxred1 : Coding-Synonymous
Srpr : within coordinates of
1SNP          A   G G  A/G
rs36314079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35205424fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  AAAA AAAGA GA AGAA/G
rs37096386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35205725fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  CCCC  CCTC  C CTCC/T
rs37571173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35205844fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  CCCC  CCTC  C CTCC/T
rs38327657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35206117fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCTC CC CCCC/T
rs36474732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35206136fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  TTTT  TTCT  T TCTC/T
rs37379776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35206254fFoxred1 : Coding-NonSynonymous
Srpr : within coordinates of
1SNP  TTTT TTTTT TT TCTC/T
rs36929767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35206520fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNPA TTTT A  TT  T T TA/T
rs29736303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207318fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
3SNP  C   T C   C  C   C/T
rs36574099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207374fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNPC CTCC CTCCT CC CCCC/T
rs239292501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207624fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP            T  T   T
rs38402788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207791fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  CCCC  CCTC TC CTCC/T
rs50321370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207821fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
2SNP AA     A   A  A   A
rs29795103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207869fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
4SNP TTTTTC TTCTT TTTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29591893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207899fFoxred1 : Coding-Synonymous
Srpr : within coordinates of
3SNP TT   C T   T  T   C/T
rs38995487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35207947fFoxred1 : Coding-Synonymous
Srpr : within coordinates of
2SNP CCTCC  T CT CT CCCC/T
rs37603619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35208060fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  CCCC  CCCC TC CTCC/T
rs39660216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35208122fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNPG GGGG GGG G GG GTGG/T
rs30181504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35208646fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
2SNPCCC   C A          A/C
rs33725634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35208767fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
4SNPAAAAA G A GAAGAAAG A/G
rs38385341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35208862fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
1SNP  TTTT  TTAT TT TTTA/T
rs30418774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35209202fFoxred1 : Intron
Srpr : within coordinates of
4SNP AAAAAG AAGAA AAAGAA/G
rs36310566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35209623fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
1SNPG GGGG GGGAG GG GGGA/G
rs45675758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35209747fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
2SNP  G     G   G  G   G
rs49250194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35209925fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
2SNP TT         T  T   T
rs36428841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35210403fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
1SNP  GGGG  GGAG AG GAGA/G
rs39135604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35210434fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
1SNP  AAAA  AAGA  A AGAA/G
rs38389492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35210546fFoxred1 : Intron
Srpr : Locus-Region
1SNP  CCCC  CCCC TC CTCC/T
rs36907487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211004fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Locus-Region
1SNP  GGGG  GGCG GG GGGC/G
rs37791820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211056fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Locus-Region
1SNP  TTTT  TTGT  T TGTG/T
rs39903170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211088fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Locus-Region
1SNP  CCCC  CCTC TC CTCC/T
rs234267909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211105fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Locus-Region
1SNP            G  T   G/T
rs29648220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211250fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : mRNA-UTR
4SNP AAAAAG AAGAA AGA  A/G
rs36504968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211375fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Coding-Synonymous
1SNP  CCCC  CCGC GC CGCC/G
rs37424517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211478fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  CCCC CCCTC CC CCCC/T
rs29882226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211518fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
3SNP GG   T G   G  G   G/T
rs29586426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211587fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
3SNP AA   T A   A  A   A/T
rs37453242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211647fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNPC CCCC  CCGC GC CGCC/G
rs29892854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211726fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
3SNP  C   G C   C  C   C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37455868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211931fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  GGGG GGGAG AG GAGA/G
rs30274320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35211960fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
3SNP  A   G A   A  A   A/G
rs37827185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212182fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  GGGG GGGAG  G GAGA/G
rs36669946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212243fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  CCCC  CCTC  C CTCC/T
rs30277095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212340fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
4SNP CCCCCA CCACCACCCACA/C
rs30437276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212457fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Coding-NonSynonymous
4SNP CCCCCT CCTCCTCCCTTC/T
rs36738198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212476fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Coding-Synonymous
1SNP  AAAA  AAGA GA AGAA/G
rs36385669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212592fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  AAAA  AAGA  A AGAA/G
rs36316937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212660fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNPT TTTT  TTCT TT TTTC/T
rs37837837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212681fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs37344560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212917fFoxred1 : Locus-Region
Srpr : Intron
1SNP  AAAA  AAAA GA AGAA/G
rs36519546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35212940fFoxred1 : 1885 bp upstream of
Srpr : Intron
1SNP  AAAA  AAGA AA AAAA/G
rs50830864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:35213001fFoxred1 : 1946 bp upstream of
Srpr : Intron
2SNP CC     C   C  C   C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory