About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Fmr1
fragile X mental retardation syndrome 1
MGI:95564

88 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51119329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68677475fFmr1 : Locus-Region
Gm10474 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP  C      T   T     C    C/T
rs8238954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68679361rFmr1 : Intron
Gm10474 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
1SNP  GG GG AG     GG       A/G
rs8237010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68679657rFmr1 : Intron
Gm10474 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
2SNP  CC CC TC     CC       C/T
rs8238958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68680357rFmr1 : Intron
Gm10474 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
1IN-DEL        T       -       -/T
rs8238957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68680364rFmr1 : Intron
Gm10474 : Locus-Region
Stol : within coordinates of
3SNP CTC TT TC   C CC  T    C/T
rs8238956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68680478rFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1IN-DEL  AA AA -A     AA       -/A
rs8238955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68680497rFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  TT TT GT     TT       G/T
rs8238959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68680756rFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  T  TT GT     TT       G/T
rs245180745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68681266fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     C    A/C
rs50354273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68682106fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP AT          A     T    A/T
rs51312958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68682787fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     A    A/G
rs51626826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68683155fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     T    G/T
rs212267276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68683844fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     C    A/C
rs46501019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68684099fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP  G      C   C     G    C/G
rs29049185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68684524fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP           CA         C A/C
rs31695296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68685124fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  T        C          T C/T
rs52272218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68686326fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP AC          A     C    A/C
rs52395696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68686924fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP  C      T   T     C    C/T
rs240479293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68687403fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     A    A/G
rs259836510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68687469fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     A    A/G
rs30677435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68687905fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP AG    A                A/G
rs30970247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68687906fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP GA    G                A/G
rs30718712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68688268fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNP GT    G     G     T    G/T
rs30677702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68689116fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPC T    C C   C     T    C/T
rs249843835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68689918fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             T     C    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30869191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68690364fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPTTA    T     T     A    A/T
rs31016348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68690680fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPTTA    T     T     A    A/T
rs31695295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68691611fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP  A A   A  TA         A A/T
rs31695294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68692078fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT CTC T  TTTT    TC  CTTC/T
rs263638726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68692447fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     T    A/T
rs226274364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68692448fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     C    A/C
rs247832965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68692482fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     A    A/G
rs263553411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68693800fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     G    A/G
rs31694693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68694656fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A TAAAA    AA  AAAA/T
rs29048671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68694762fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT T CTTCT    TT  TCTC/T
rs29048670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68694867fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCTC    CC  CTCC/T
rs219324400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68695777fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             C     T    C/T
rs29048669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68696756fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCCC    CC  TCCC/T
rs31694692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68697356fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGG G TGGGG    GG  GGGG/T
rs29048668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68697599fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT   CTTCT     T  TCTC/T
rs8250999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68697959fFmr1 : Coding-Synonymous
Stol : within coordinates of
1SNP     CC CC    TCC       C/T
rs8251000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698000fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP    GTT T     TTT       G/T
rs8251001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698037fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP     AA AA    TAA       A/T
rs8251002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698064fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1IN-DEL    TTT -T    TTT       -/T
rs8251003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698066fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1IN-DEL     -- T-    T--       -/T
rs8251004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698103fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP     GG G     CGG       C/G
rs31694691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698469fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A CAAAA    AA  AAAA/C
rs29048667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698705fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A CAACA    AA  ACAA/C
rs29048666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68698900fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPG AGA A AGGAAG   GGA AAAA/G
rs29048665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68700308fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPTTCTC C CTTCCT   TTC CCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29048664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68700328fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPAACAC C CAACCA   AAC CCAA/C
rs29048133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68700501fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A GAAGA    AA  AGAA/G
rs31694690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68700797fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP   A    GA A      A  AA A/G
rs31694689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68701915fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGG G AGGGG    GG  GGGA/G
rs29048132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68701976fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
3SNPG AGA A AGGAAG   GGA AAAA/G
rs31694688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68702656fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCCC    CC  CCCC/T
rs31694687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68702690fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TT  T TTAT         TTTA/T
rs31694686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68702700fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C ACCCC    CC  CCCA/C
rs29048131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68702881fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGCG    GG  GCGC/G
rs29048130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68702969fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT T TTTTT    TT  TTCC/T
rs29048129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68703351fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C CCCTC    CC  CTCC/T
rs29048128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68703903fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNPG GGG G  GGAG    GG AGAGA/G
rs50269894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704065fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP  G          A     G    A/G
rs50223309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704141fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP  T          G     T    G/T
rs29048127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704226fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A GAAAA    AA  AAAA/G
rs29048126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704294fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A AAAGA    AA  AGAA/G
rs29048125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704438fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT T GTTTT    TT  TTTG/T
rs258294450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68704787fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             T     C    C/T
rs31694685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68705022fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT T  TTTT    TT  TATA/T
rs31694684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68705159fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A CAACA    AA  ACAA/C
rs214264867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68705202fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             G     A    A/G
rs233295556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68705204fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             T     A    A/T
rs29048124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68706158fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNPG GGG G GGGAG    GG  GAGA/G
rs47087558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68708791fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP TG      T   T     G    G/T
rs213135898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68712777fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             A     G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49397542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68713715fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP AG          A     G    A/G
rs50855825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68714110fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
2SNP TC          T     C    C/T
rs226819133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68715111fFmr1 : Intron
Stol : within coordinates of
1SNP             C     A    A/C
rs8250997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68715706fFmr1 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
1SNP  C  CC CC    T C       C/T
rs8250998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68715832fFmr1 : mRNA-UTR
Stol : within coordinates of
3SNP AC  CC CA   AC A  C    A/C
rs29047893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68718597fFmr1 : 634 bp downstream of
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A CAAAA    AA  AAAA/C
rs49174867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68718676fFmr1 : 713 bp downstream of
Stol : within coordinates of
2SNP             A     TA   A/T
rs48305994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68718758fFmr1 : 795 bp downstream of
Stol : within coordinates of
2SNP  T          A     TT   A/T
rs48949063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68719202fFmr1 : 1239 bp downstream of
Stol : within coordinates of
2SNP  G          A     G    A/G
rs29047892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68719552fFmr1 : 1589 bp downstream of
Stol : within coordinates of
1SNPG GGG G  GGAG    GG  GAGA/G
rs29047891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68719581fFmr1 : 1618 bp downstream of
Stol : within coordinates of
1SNPA AAA A AAACA    AA  ACAA/C
rs31694173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68719607fFmr1 : 1644 bp downstream of
Stol : within coordinates of
1SNPC CCC C TCCCC    CC  CCCC/T
rs31694172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:68719807fFmr1 : 1844 bp downstream of
Stol : within coordinates of
1SNPT TTT T GTTTT    TT  TTTG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory