About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Fgfr4
fibroblast growth factor receptor 4
MGI:95525

85 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs227291893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55152326fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNP             C  T   C/T
rs48734479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55153386fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  G G  G C  G      CC/G
rs48166611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55153601fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNP TT          T  T   T
rs48095193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55153718fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  TTT  C   C       CC/T
rs49132073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55154700fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP    G  T   T        G/T
rs47562723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55154869fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  A A  G A G      A A/G
rs45820682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55154916fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  G GG C G C  G    GC/G
rs51212714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55154931fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  C CC T C T      T C/T
rs29243093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55155408fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNPCCC                 C
rs29884055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55157369fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP  G   A  G   G  G   A/G
rs224207133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55157753fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP             A  A   A
rs52061950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55158055fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP    T  T G T        G/T
rs238310491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55158591fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP             T  C   C/T
rs29635666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55158988fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNP  A   G      A  A   A/G
rs47046003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55159630fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNP  T      T   T  T   T
rs47309546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55160296fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
1SNP  C CC T   T      T C/T
rs51635503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55161878fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP    A  G A G        A/G
rs29582570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55162443fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNPCCT   C  C          C/T
rs235729095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55162471fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP             A  G   A/G
rs51123021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55163197fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  C C  A   A        A/C
rs29572133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55163401fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP CC   T  C   C  C   C/T
rs29730196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55163431fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP AA   G  A   A  A   A/G
rs29233694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55163603fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP TT   C  T   T  T   C/T
rs30004641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55163717fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP GG   A  G   G  G   A/G
rs46881588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164100fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52367915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164114fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs29533210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164139fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNPGGG   A      G  G   A/G
rs51350084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164690fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPA AAAA A AAAA AA AGAA/G
rs50122476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164768fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPA AAAA A AAAA AA AGAA/G
rs49417981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164811fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs46475383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55164824fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs246067589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165152fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP             A  A   A
rs50382213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165396fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP         C          C
rs45990646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165400fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP         T          T
rs45819659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165446fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT A TTAT TT TTTA/T
rs45998537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165485fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPC CCCC T CCTC CC CCCC/T
rs29637039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165655fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP GG   A  G   G  G   A/G
rs48190697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165738fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPA AAAA A  AA  AA  C A/C
rs49844727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55165816fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP  GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs48158317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166080fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT T TTTT TT TCTC/T
rs29234220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166136fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
4SNPTTTTTTCC TTCTTTTTTCTC/T
rs51573895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166232fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA A AAAA AA AGAA/G
rs46089463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166299fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs50566514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166398fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT T TTTT TT TCTC/T
rs50610920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166501fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs46992361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166755fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPA AAAA A AAAA AA ACAA/C
rs6356463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55166776fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNP      G T           G/T
rs6370603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167123fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
3SNP GG   A GG   G  G   A/G
rs48251025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167135fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
1SNP             T  T   T
rs51555340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167248fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50164972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167326fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT T TTTT TT TATA/T
rs48769883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167351fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
2SNP  G      G   G  G   G
rs48945269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167577fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT C TTCT TT TTTC/T
rs46475377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167797fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPT TTTT C TTCT TT TTTC/T
rs29877642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167838fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-NonSynonymous
3SNP  T   C      T  T   C/T
rs48914114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167866fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs29251765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167927fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
3SNP  G   A  G   G  G   A/G
rs47781739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55167948fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC  TCC/T
rs51523335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168168fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs232145905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168188fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
1SNP             T  C   C/T
rs13462056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168192fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
4SNPT TTTTGG TTGTT TTTGTG/T
rs49079207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168365fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs47532725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168493fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
1SNPC CCCC   CC C CC CACA/C
rs13462055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168507fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
3SNP      A  C   C  C   A/C
rs48067665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168680fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
2SNPG GGGG A GGAGGGGGGAGA/G
rs46366803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168688fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs50715124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168829fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs46351335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168851fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs51475937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55168933fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs51702840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169061fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNPC CCCC T CCTC CC CCCC/T
rs50522667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169170fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : Locus-Region
1SNPA AAAA A AAAA AA ATAA/T
rs46445180
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169398fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 639 bp downstream of
1SNPA AAAA A AAAA AA ACAA/C
rs51908283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169415fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 656 bp downstream of
1SNPT TTTT C TTCT TT TTTC/T
rs6299877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169802fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1043 bp downstream of
1SNP      G A           A/G
rs6299895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169811fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1052 bp downstream of
1SNP      T C           C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29225539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169872fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1113 bp downstream of
2SNP  T   C  T   T  T   C/T
rs6300487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169938fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1179 bp downstream of
1SNP      C T           C/T
rs6300969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55169992fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1233 bp downstream of
1SNP      G A           A/G
rs6301020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170021fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1262 bp downstream of
1SNP      G T           G/T
rs6313708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170060fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1301 bp downstream of
1SNP      A T           A/T
rs47055441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170268fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1509 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGAG GG G GA/G
rs46443666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170318fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1559 bp downstream of
1SNPG GGGG A GGAG GG GGGA/G
rs48084516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170331fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1572 bp downstream of
1SNPG GGGG G GG G GG GTGG/T
rs51311588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170418fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1659 bp downstream of
1SNPT TTTT T TTTT TT TCTC/T
rs29775582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55170505fDel(13Simc1-B4galt7)2Dja : within coordinates of
Fgfr4 : 1746 bp downstream of
3SNP CC   T  C   C  C   C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/21/2015
MGI 5.22
The Jackson Laboratory