About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Bai2
brain-specific angiogenesis inhibitor 2
MGI:2451244

136 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27506990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129667471fBai2 : Locus-Region2SNPGGGGGGC GGCGGCGGGC/G
rs27506989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129667669fBai2 : Locus-Region1SNPC CCCC  CCCCCCCTCC/T
rs27506988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129667713fBai2 : Locus-Region2SNPCCTTTTCCTCCTCCTCTC/T
rs32230495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129667915fBai2 : Locus-Region1SNPG G   A G        A/G
rs27506987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668067fBai2 : Locus-Region2SNPT TTTTC TTCTTCTCTC/T
rs27506986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668306fBai2 : Locus-Region1SNPG GGGG  GGAGGAGAGA/G
rs27506985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668357fBai2 : Locus-Region2SNPC CCCCT CCTCCTCTCC/T
rs27506984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668484fBai2 : Locus-Region2SNPT TTTTC TTCTTCTCTC/T
rs27506983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668852fBai2 : Locus-Region2SNPC TTTTC TCCTCCTCTC/T
rs27506982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129668978fBai2 : Locus-Region2SNPG GGGGC GGCGGCGCGC/G
rs27506981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129669006fBai2 : Locus-Region2SNPC CCCCT CCTCCT TCC/T
rs27506980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129669047fBai2 : Locus-Region2SNPC CCCCG CCGCCGCGCC/G
rs32638552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129669279fBai2 : Locus-Region1SNP  C   T C        C/T
rs27506979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670016fBai2 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC  CTCCCCCCCC/T
rs27506978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670110fBai2 : Coding-Synonymous1SNPC AAAA CACCACCACAA/C
rs27506977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670339fBai2 : Intron1SNPT CCCC CCTCCTCCCCC/T
rs27506976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670404fBai2 : Intron1SNPA GGGG GG GGAGGGGA/G
rs33005158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670429fBai2 : Intron1SNP  G   T G        G/T
rs27506975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670507fBai2 : Intron2SNPG GGGGT GGTGGTGTGG/T
rs27506974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670851fBai2 : Intron2SNPCCTTTT  TCCTCCTCTC/T
rs32931783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670889fBai2 : Intron1SNP GA     A        A/G
rs27506973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129670962fBai2 : Intron2SNPGGC CCG CGGCGGCGCC/G
rs27506972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129671116fBai2 : Intron2SNPCCTTTTC TCCTCCTCTC/T
rs27506971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129671172fBai2 : Intron2SNPGGAAAAG AGGAGGAGAA/G
rs32677962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129671910fBai2 : Intron1SNP AG   G G        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27506970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129672103fBai2 : Intron2SNPTTCCCC  CTCCTCCCCC/T
rs27506969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129672220fBai2 : Intron2SNPAACCCC CCACCACCCCA/C
rs27506968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129672329fBai2 : Intron2SNPTTCCCC CCCCCTCCCCC/T
rs27506967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129672360fBai2 : Intron2SNPAAGGGG  GAGGAGGGGA/G
rs27506966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129672529fBai2 : Intron2SNPTTTT  C TTCTTCTCTC/T
rs27506965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673208fBai2 : Intron2SNPCCCCCCT CCTCCTCTCC/T
rs27506964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673378fBai2 : Intron1SNPA AAAA  AAAAAAAGAA/G
rs27506963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673477fBai2 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCTCTCC/T
rs27506962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673528fBai2 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAGAGAA/G
rs27506961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673590fBai2 : Intron1SNP          GA GAGAA/G
rs27506960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673605fBai2 : Intron1SNP          AC A ACA/C
rs27506959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129673986fBai2 : Intron1SNPT  T T  T A  AT TA/T
rs27506958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129674989fBai2 : Intron1SNPA AA A  AAGAAGAGAA/G
rs27506957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129675071fBai2 : Intron1SNPG GGGG  GGCGGCGCGC/G
rs27506956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129675436fBai2 : Intron1SNPG GGGG  GCGGGGGGGC/G
rs27506955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129675821fBai2 : Intron2SNPCCCCCCGGCCGCCGCGCC/G
rs27506954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129675921fBai2 : Intron2SNPAAAAAAG AAGAAGAGAA/G
rs32299515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129676012fBai2 : Intron1SNPTTT   C T        C/T
rs32754459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129676013fBai2 : Intron1SNPGGG   C G        C/G
rs32421816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129676018fBai2 : Intron1SNPTTT   C T        C/T
rs27506953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129676050fBai2 : Intron2SNPCCCCCCG CCGCCGCGCC/G
rs27506952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129676320fBai2 : Intron1SNP  CCCC    GC GCG C/G
rs31993369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129678082fBai2 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs32863776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129678147fBai2 : Intron1SNP GG   C G        C/G
rs32916820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129678265fBai2 : Intron1SNP AA   G A        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32707326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129678281fBai2 : Intron1SNP AT   C T        A/C/T
rs27506951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129681792fBai2 : Intron2SNPG CCCC  CG C  C CC/G
rs32349939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129681867fBai2 : Intron1SNPA     G A        A/G
rs32817267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129681911fBai2 : Intron1SNPG     A G        A/G
rs27506950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129682433fBai2 : Intron1SNPC TTTT  TT TC T TC/T
rs32743872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129683088fBai2 : Intron1SNP  G   A G        A/G
rs32776841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129684483fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs32176548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129684730fBai2 : Intron1SNP TC   C C        C/T
rs32984626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129685434fBai2 : Intron1SNP CG     G        C/G
rs27506949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129685836fBai2 : Intron1SNPG GGGG GGAGGGGGGGA/G
rs27506948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129685903fBai2 : Intron1SNPA AAAA AAAAACACAAA/C
rs31965963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129685934fBai2 : Intron1SNP CC   T C        C/T
rs27506947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129686104fBai2 : Intron2SNPT TTTTCCTTCTTC CTC/T
rs32017656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129686493fBai2 : Coding-Synonymous1SNPG G   A G        A/G
rs33025425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129686686fBai2 : Intron1SNPG G   A G        A/G
rs27506946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129686834fBai2 : Intron2SNPTTTTTTCCTTCT C CTC/T
rs27506945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129686906fBai2 : Coding-Synonymous2SNPCCCCCCGCCC CCG GCC/G
rs27506944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129687060fBai2 : Intron2SNPTTTTTTCCTTCT C CTC/T
rs27506943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129687222fBai2 : Intron2SNPGGGGGGAAGGAGGA AGA/G
rs27506942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129687230fBai2 : Intron2SNPGGG   AAGGA  A A A/G
rs31881471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129687283fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs27506941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129687738fBai2 : Intron2SNPCCCCCCTTCCTC TCTCC/T
rs32794647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688019fBai2 : Intron1SNPCCA   C A        A/C
rs32710467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688120fBai2 : Intron1SNPAAG   A G        A/G
rs32242381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688190fBai2 : Intron1SNPAAA   G A        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32542345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688293fBai2 : Intron1SNPGGG   A G        A/G
rs32288386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688357fBai2 : Intron1SNPGGA   G          A/G
rs27506940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688714fBai2 : Intron2SNPAAAAAAGGAAGA G GAA/G
rs32756305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688752fBai2 : Intron1SNP CC   T          C/T
rs32721054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129688970fBai2 : Intron1SNP  T   A T        A/T
rs27506939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689006fBai2 : Intron1SNPT TTTT CTTTT T TTC/T
rs27506938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689114fBai2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG GGAGGGGGGGA/G
rs27506937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689336fBai2 : Intron2SNPC CCCCTTCCTC T TCC/T
rs27506936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689389fBai2 : Intron2SNPG GGGGAGGGAGGA AGA/G
rs27506935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689459fBai2 : Intron1SNPT TTTT CTTCT C CTC/T
rs27506934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129689594fBai2 : Coding-Synonymous1SNP  AA      CAACCAAA/C
rs31851885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129690220fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs32771174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129690220fBai2 : Intron1SNP GG   C G        C/G
rs32792405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129690220fBai2 : Intron1SNP GG   C G        C/G
rs27506933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129690913fBai2 : Intron1SNP  AA A GAGGA G GGA/G
rs27506932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129691491fBai2 : Intron2SNPAAAAAAGGA GAGG GAA/G
rs27506931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129691725fBai2 : Intron1SNPG GGGG GGTGGGGGGGG/T
rs27506930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129691848fBai2 : Coding-Synonymous2SNPTTTTTTCCTCCTTCTCCC/T
rs32247060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129691921fBai2 : Intron1SNP  G   A G        A/G
rs32762086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129691924fBai2 : Intron1SNP  C   T C        C/T
rs27506929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129692598fBai2 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs31927373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129693236fBai2 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs32348053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129693683fBai2 : Intron1SNPA A   G          A/G
rs27506928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129693834fBai2 : Intron1SNPG GGGG TGGGGGGGGGG/T
rs3680581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129693961fBai2 : Intron2SNPG G   A G        A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27506927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694013fBai2 : Intron1SNPC CCCC CCTCCCC CCC/T
rs27506926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694432fBai2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA GAAAAAA AAA/G
rs27506925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694606fBai2 : Intron2SNPAAAAAAGGA GA G GAA/G
rs32999176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694742fBai2 : Intron1SNP CC   T C        C/T
rs27506924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694850fBai2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT CTTCTTC CTC/T
rs27506923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129694899fBai2 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs32574795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129695083fBai2 : Intron1SNP  A   G A        A/G
rs32887642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129695411fBai2 : Intron1SNP  C   T C        C/T
rs27506922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129695760fBai2 : Intron2SNPAAAAAAC A CAAC CAA/C
rs27506921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129695772fBai2 : Intron2SNP AAAAAGAA GAAG GAA/G
rs27506920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129696725fBai2 : Intron2SNPC CCCC  CCTCCT CCC/T
rs27506919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129696832fBai2 : Intron2SNPT TTTTCCTCCTTC CCC/T
rs27506918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697004fBai2 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTT TTC/T
rs31975784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697496fBai2 : Intron1SNP      A C        A/C
rs27506917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697504fBai2 : Intron2SNPT TTTTCCTTCTTCTCTC/T
rs27506916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697541fBai2 : Intron2SNPG GGGGAAGGAGGAGAGA/G
rs32505075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697880fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs31955277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697881fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs32425963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697925fBai2 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs32367059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129697953fBai2 : Intron1SNP TT   C T        C/T
rs27506915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698043fBai2 : Intron2SNPAAAAAACCAACAACACAA/C
rs27506914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698236fBai2 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs27506913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698537fBai2 : Intron2SNPGGGGGGA GGAGGAGGGA/G
rs27506912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698758fBai2 : Intron2SNPAAAAAAGGAGGAAGAGGA/G
rs27506911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698893fBai2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32305110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129698954fBai2 : Intron1SNP AA   T A        A/T
rs27506910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699042fBai2 : Intron1SNPG GGGG CGCGGGGGGGC/G
rs27506909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699086fBai2 : Intron1SNPT TTTT CTCTTTTTTCC/T
rs27506908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699171fBai2 : Intron2SNP TTTTTC TTCTTC TTC/T
rs27506907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699285fBai2 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGGGAA/G
rs27506906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699303fBai2 : Intron1SNPA AAAA AACAAAAAACA/C
rs27506905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699333fBai2 : Intron2SNPG GGGGC GGCGGCGCGC/G
rs27506904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699540fBai2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG GGGGGGGGAGA/G
rs27506903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699591fBai2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs27506902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699785fBai2 : Locus-Region2SNPCCCCCCTCCCTCCTCTCC/T
rs27506901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:129699986fBai2 : Locus-Region2SNPGGGG  A G AGGAGA A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory