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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Mcfd2 multiple coagulation factor deficiency 2 MGI:2183439 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs33630276 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87652042 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33140616 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87652416 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33195403 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87652444 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33168398 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87652467 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762281 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653138 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762280 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653241 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762279 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653247 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762278 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653387 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762277 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653540 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762276 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653630 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762275 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653671 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | A | C | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29762274 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653762 | f | Mcfd2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | G | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761313 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87653873 | f | Mcfd2 : Locus-Region Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | C | A | C | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761312 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654086 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | C | C | C | T | C | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761311 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654176 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761310 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654272 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | G | A | G | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761309 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654471 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | A | A | A | A | C | A | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761308 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654630 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761307 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654691 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | G | T | T | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761306 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654778 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761305 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654856 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | G | G | A | G | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29761304 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87654879 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | T | T | T | T | C | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760393 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655049 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760392 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655164 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | G | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760391 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655215 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs29760390 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655263 | f | Mcfd2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760389 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655287 | f | Mcfd2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760388 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655311 | f | Mcfd2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | G | A | A | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760387 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655437 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | A | A | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760386 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655492 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | A | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760385 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655531 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29760384 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655628 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | A | T | A | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768031 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655723 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | C | A | C | C | C | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768030 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655766 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768029 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87655924 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | C | C | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768028 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656014 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | G | T | T | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768027 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656308 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768026 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656340 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | G | A | A | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768025 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656418 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | G | A | G | A | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29768024 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656441 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | G | G | G | G | G | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29517699 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656840 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33229804 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656884 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29518835 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87656885 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33150718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87657114 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13459155 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87657327 | r | Mcfd2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | T | T | T | C | T | T | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | T | T | T | C | C | C | C | C/T | |
| rs29542285 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87657567 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33309769 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87659637 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33358146 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87659669 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33396947 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87659796 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33408714 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87659851 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33124476 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87659960 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33044927 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87661905 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33694727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87661952 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33235706 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87663720 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29519459 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87663833 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33441341 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87663857 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33119802 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87663910 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33345581 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664039 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33172494 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664066 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33497765 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664261 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33243343 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664283 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33125242 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664653 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33434119 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664788 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33603443 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664804 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33440801 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:87664833 | f | Mcfd2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | G | G | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/22/2013 MGI 5.13 |
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