About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hnmt
histamine N-methyltransferase
MGI:2153181

109 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4223013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002656fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  G G  GA G      G          A/G
rs4223014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002687fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  C C CCT C      C          C/T
rs4223015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002692fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  C C CCT C      C          C/T
rs4223016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002694fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  T T TTG T      T          G/T
rs4223017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002865fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  G G GGA G      G          A/G
rs4223018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002885fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  C C CCT C      C          C/T
rs4223019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24002986fDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  A A AAG A      A          A/G
rs8240195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003081rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  A  A A        G A   A A   A/G
rs8240194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003083rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  C  C C        T C   C C   C/T
rs8240193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003133rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  C  C C        T C   C C   C/T
rs8240192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003171rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  T  T T      T C T   T T   C/T
rs8240191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003330rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  C  C C      C A C   C C   A/C
rs8240190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003360rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  A  A A        G A   A A   A/G
rs8240189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003421rDwh : within coordinates of
Hnmt : mRNA-UTR
1SNP  T  T          G T   T T   G/T
rs8240188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003712rDwh : within coordinates of
Hnmt : Coding-Synonymous
1SNP     C C      C T C   C C   C/T
rs27219355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003815fDwh : within coordinates of
Hnmt : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C T CCCC     CC    C CC/T
rs8240187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003841rDwh : within coordinates of
Hnmt : Coding-NonSynonymous
1SNP     A A      A C A   A A   A/C
rs8240186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003914rDwh : within coordinates of
Hnmt : Coding-Synonymous
1SNP     C C      C T C   C C   C/T
rs8240185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24003961rDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP     C C      C T C   C C   C/T
rs27219354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24005015fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    T TC/T
rs33346193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24005810fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP GG    A  G                 A/G
rs27219353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24008368fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C    CCC      C     ACA/C
rs33451156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24012251fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
2SNP CT                         C/T
rs33200481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24012756fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
2SNPGGT    G                    G/T
rs6242612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24012789fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP       C A                  A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6245403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24013302fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP       T C                  C/T
rs6245931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24013361fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP       T A                  A/T
rs50664190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24016823fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP AA       A            G    A/G
rs46319125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24016867fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP CC       C            T    C/T
rs49667091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24016868fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP AA       A            G    A/G
rs46008451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24016997fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP AA       A            G    A/G
rs46398350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24017056fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP CC       C            T    C/T
rs50659423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24017167fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  C       C            T    C/T
rs47471717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24017180fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  G       G            T    G/T
rs32864334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24024331fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
2SNP GG       T                 G/T
rs32474019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24026115rDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP C     C  T                 C/T
rs248921549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24026604fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP               A     T      A/T
rs27219351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24029235fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CTCC/T
rs27219350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24029804fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  AAA A G  AAA     AA    AAAA/G
rs27219349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24031663fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G A GGGG     GG    GGGA/G
rs27219348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24031713fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A G AAAA     AA    AGAA/G
rs27219347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24033117fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A    AGAA/G
rs27219346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24033174fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A C AAAA     AA    ACAA/C
rs27219345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24033396fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C G CGCC     CC    CGGC/G
rs108435200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24037799rDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP T        C                 C/T
rs33721471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24039255fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
2SNPGGA    G  A                 A/G
rs27219344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24040041fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs27219343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24040448fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  TTT T A TTTT      T    TTTA/T
rs27219342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24040491fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T G TTTT     TT    TTTG/T
rs27219341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24040990fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27219340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24041037fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CACA/C
rs27219339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24041040fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TTTC/T
rs27219338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24041463fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C G CCCC     CC    CGCC/G
rs27219337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24041504fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24041610fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A    AGAA/G
rs28318626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042146fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042276fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A   AAAA     AA    AGAA/G
rs27219334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042604fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C   CCCC     CC    CACA/C
rs27219333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042651fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     CC    CTCC/T
rs27219332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042745fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C A CCCC     CC    CACA/C
rs27219331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042830fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C  TTT     TT    TCTC/T
rs27219330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042921fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24042947fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs27219328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043167fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G A GGGG     GG    GGGA/G
rs27219327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043250fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     GG    GCGC/G
rs27219326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043332fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     CC    CCCC/T
rs27219325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043415fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A A  AAA     AA    AGAA/G
rs27219324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043447fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     GG    GCGC/G
rs27219323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043468fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A   AGAA     AA    AGGA/G
rs27219322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043478fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043712fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C A CCCC     CC    CCCA/C
rs27219320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24043781fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G A GGGG     GG    GGGA/G
rs27219319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24044395fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     GG    GCGC/G
rs27219318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24044750fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A C AAAA     AA    AAAA/C
rs27219317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24044761fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     GG    GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27219316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24044920fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A G AAAA     AA    AGAA/G
rs27219315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045059fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A A AGAA     AA    AGGA/G
rs27219314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045327fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CACA/C
rs27219313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045588fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CTCC/T
rs8240183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045734fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  A  A A      A G A   A A   A/G
rs8240184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045796fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
2SNPG GGGGGGG GGGGG C GGG G GGCGC/G
rs27219312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045836fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TT    T T TT      T     CTC/T
rs108466515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24045875fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP GG       C                 C/G
rs27219311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24046456fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TGTG/T
rs27219310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047001fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs27219309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047014fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A A AAAA     AA    AGAA/G
rs27219308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047049fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CTCC/T
rs27219307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047098fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C A CCCC     CC    CCCA/C
rs27219306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047142fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs27219305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047197fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C C CCCC     CC    CGCC/G
rs27219304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047471fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs27219303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047545fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A A AAAA     AA    ATAA/T
rs27219302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24047855fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A T  AAA      A    ATAA/T
rs27219301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048050fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     CC    CTCC/T
rs27219300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048074fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPC CCC C T CCCC     CC    CTCC/T
rs27219299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048447fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048470fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T C TTTT     TT    TCTC/T
rs27219297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048490fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPA AAA A A AAAA     AA    AACA/C
rs27219296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048520fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPT TTT T G TTTT     TT    TGTG/T
rs27219295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048652fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G C GGGG     GG    GCGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27219294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048789fDwh : within coordinates of
Hnmt : Coding-NonSynonymous
Hnmt : Coding-Synonymous
1SNPT TTT T G TTTT     TT    TGTG/T
rs27219293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048837fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G A GGGG     GG    GGGA/G
rs27219292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048874fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNPG GGG G G GGGG     GG    GGAA/G
rs8240182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24048936fDwh : within coordinates of
Hnmt : Intron
1SNP  G  G G      G A G   G G   A/G
rs8240181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24049506rDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP  G  G G      G C G     G   C/G
rs27219291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24049687fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T
rs48773010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24050298fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP TT       T            C    C/T
rs48963220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24050397fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNP GG                         G
rs27219290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:24051335fDwh : within coordinates of
Hnmt : Locus-Region
1SNPT TTT T T TTTT     TT    TCTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory