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Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
D5Dmo4
DNA segment, Chr 5, David Ornitz 4
MGI:2152900

64 matching SNPs displayed
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Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs245694097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Slc2a9 : Intron
1SNP            T  C   C/T
rs51425324
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Slc2a9 : Intron
2SNP TC         C  C   C/T
rs32697201
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Slc2a9 : Intron
3SNP GAAAA G    A  A  AA/G
rs46894510
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         A  G   A/G
rs49191104
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         G  A   A/G
rs49318787
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Slc2a9 : Intron
2SNP CT         T  C   C/T
rs108481357
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Slc2a9 : Coding-Synonymous
2SNP CT         T  T   C/T
rs49992667
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         G  G   A/G
rs233954374
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Slc2a9 : Intron
1SNP            G  C   C/G
rs253724997
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Slc2a9 : Intron
1SNP            G  G   G
rs47472484
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         G  G   A/G
rs50809657
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Slc2a9 : Intron
1SNP AG                A/G
rs46164077
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Slc2a9 : Intron
1SNP TC                C/T
rs107740912
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         G  G   A/G
rs29557598
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Slc2a9 : Intron
4SNP GA  AGG    A  AG AA/G
rs33056878
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Slc2a9 : Intron
2SNP  T   C            C/T
rs33662913
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Slc2a9 : Intron
3SNP  G   A     G  G   A/G
rs108705537
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1SNP  G                G
rs33716937
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Slc2a9 : Intron
3SNP  A   G     A  A   A/G
rs33256448
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Slc2a9 : Intron
3SNP  C   G     C  C   C/G
rs32697198
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Slc2a9 : Intron
3SNPCCTTTT C    T  TCTTC/T
rs32697196
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Slc2a9 : Intron
3SNP AC    G    C  CA  A/C/G
rs108592252
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Slc2a9 : Intron
2SNP AT         T  T   A/T
rs107811449
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Slc2a9 : Intron
2SNP CA         C  A   A/C
rs107804513
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Slc2a9 : Intron
2SNP  C         C  C   C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs212415756
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1SNP            G  G   G
rs229531842
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1SNP            A  A   A
rs248280157
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Slc2a9 : Intron
1SNP            C  C   C
rs217588324
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Slc2a9 : Intron
1SNP            C  C   C
rs234202938
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Slc2a9 : Intron
1SNP            A  G   A/G
rs253669534
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Slc2a9 : Intron
1SNP            A  A   A
rs108543213
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Slc2a9 : Intron
2SNP  T         T  T   T
rs108572785
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Slc2a9 : Intron
2SNP CA         A  A   A/C
rs36432346
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Slc2a9 : Intron
3SNPCCTTTT  CCTCTCCTCTTC/T
rs107999438
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Slc2a9 : Intron
2SNP  T         T  T   T
rs108382500
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Slc2a9 : Intron
2SNP  C         C  C   C
rs107842734
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Slc2a9 : Intron
2SNP  A     G   A  A   A/G
rs37527534
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Slc2a9 : Intron
3SNPT CCCC  TTCTC TCTCCC/T
rs38268437
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Slc2a9 : Intron
3SNPC TTTT  CCTCTCCTCTTC/T
rs36281397
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Slc2a9 : Intron
3SNPC TTTT  CCTCTCCTCTTC/T
rs107880367
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Chr5:38394274fD5Dmo4 : 996 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
2SNP  C     T   C  C   C/T
rs36813072
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Slc2a9 : Intron
3SNPA GGGG  AAGAGAAGAGGA/G
rs38356928
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Chr5:38394443fD5Dmo4 : 1165 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs264738831
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Slc2a9 : Intron
1SNP            T  T   T
rs229369994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394512fD5Dmo4 : 1234 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
1SNP            G  G   G
rs248268729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394557fD5Dmo4 : 1279 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
1SNP            C  C   C
rs108729800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394562fD5Dmo4 : 1284 bp upstream of
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Del(5Letm1-D5Mit81)3Jcs : within coordinates of
rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNP GA     G   A  G   A/G
rs108629698
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Chr5:38394573fD5Dmo4 : 1295 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
2SNP CT     C   C  T   C/T
rs108538131
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Chr5:38394604fD5Dmo4 : 1326 bp upstream of
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rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNP CT     C   T  T   C/T
rs36395939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394746fD5Dmo4 : 1468 bp upstream of
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Del(5Letm1-D5Mit81)3Jcs : within coordinates of
rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNPTTCCCC  TTCT TT TCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108558938
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Chr5:38394776fD5Dmo4 : 1498 bp upstream of
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rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNP TC     T   C  C   C/T
rs107858259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394799fD5Dmo4 : 1521 bp upstream of
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Del(5Letm1-D5Mit81)3Jcs : within coordinates of
rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNP CA     C   A  A   A/C
rs108484715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38394840fD5Dmo4 : 1562 bp upstream of
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rs : within coordinates of
Slc2a9 : Intron
2SNP GA     G   A  A   A/G
rs37390820
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Chr5:38394884fD5Dmo4 : 1606 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
3SNPGGAAAA  GGAGAGGAGAAA/G
rs108034110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:38395002fD5Dmo4 : 1724 bp upstream of
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Slc2a9 : Intron
2SNP AG         G  A   A/G
rs108261573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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3SNPTTCCCT  TTCTCTTCTCCC/T
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3SNPCCTTT  TCCTCTCCTCTTC/T
rs242394232
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1SNP            T  T   T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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02/02/2016
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