About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
C1qa
complement component 1, q subcomponent, alpha polypeptide
MGI:88223

75 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27625227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894069fC1qa : 1848 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPGGAAAA GAAAAAAAA AAAA/G
rs27625226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894096fC1qa : 1821 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPGGAAAA GAAAAAAAA AAAA/G
rs27625225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894145fC1qa : 1772 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNPGGAAGG GGGGG G   GGAA/G
rs27625224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894153fC1qa : 1764 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPCCTTTT CTTCTTTTT TCTC/T
rs27625223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894210fC1qa : 1707 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPCCTTTT CTTCTTTTT TCTC/T
rs27625222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894399fC1qa : 1518 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
4SNPTTCCCCTTCCTCCCCC CTCC/T
rs27625221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894629fC1qa : 1288 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
4SNPTT CCC CCCTCCCCC CCCC/T
rs32184820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894716fC1qa : 1201 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNP G      A   A  A    A/G
rs248467438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894828fC1qa : 1089 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            C  C    C
rs27625220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894870fC1qa : 1047 bp downstream of
C1qc : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPC         C      AA A/C
rs27625219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894927fC1qa : 990 bp downstream of
ctl : within coordinates of
2SNPC  TTT CTTCTTTTT TCTC/T
rs27625218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136894963fC1qa : 954 bp downstream of
ctl : within coordinates of
1SNPA  AAA AAATA AA  AAAA/T
rs27625217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136895604fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNPG  A   G AG A  G AGAA/G
rs27625216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136895666fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs50958922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136895804fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP TC     C       T   C/T
rs50770980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136895836fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP TC     C   C  CT   C/T
rs51295770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136895874fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP TC     C   C  T    C/T
rs52054580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896085fC1qa : mRNA-UTR
ctl : within coordinates of
1SNP AG     G           A/G
rs27625215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896238fC1qa : Coding-Synonymous
ctl : within coordinates of
4SNPTTCCCCTCCCTCCCCC CTCC/T
rs27625214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896298fC1qa : Coding-Synonymous
ctl : within coordinates of
4SNPAAGGGGAGGGAGGGGG GAGA/G
rs27625213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896746fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
4SNPGGAAAAGAAAGAAAAA AGAA/G
rs32077075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896872fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNP TC   T     C  C    C/T
rs27625212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136896989fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
4SNPTTCCCCTCCCT CCCC CTCC/T
rs31943000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897013fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNP TG   T     G  G    G/T
rs27625211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897069fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
1SNPT  TTT ATTTT TT  TTTA/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs246062776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897182fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
1SNP            T  T    T
rs27625210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897257fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
2SNPG  GAA GAAGAGAGA AGGA/G
rs33018609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897362fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
1SNP CT   C             C/T
rs27625209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897413fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPTTCCTTTTTTTT TC  TTTC/T
rs27625208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897614fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPC CCGG GGGCGGGCG GCCC/G
rs27625207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897651fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPA GGGG AGGAGGGGG GAGA/G
rs27625206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897791fC1qa : Coding-NonSynonymous
ctl : within coordinates of
3SNPG AAAA GAAGAAAAA AGGA/G
rs27625205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897839fC1qa : mRNA-UTR
ctl : within coordinates of
3SNPG AAAA AAAGAAAAA AGAA/G
rs27625204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897924fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPT CCCC CCCTCCCCC CTCC/T
rs50397504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897972fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
2SNP  G         G  G    G
rs27625203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136897973fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPT CCCC CCCTCCCCC CTCC/T
rs47936546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136898089fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
2SNP CT     T   T  T    C/T
rs27625202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136898485fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
1SNPG  GGG AGGGG GG  GGGA/G
rs27625201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136898530fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
3SNPTTGGGG GGGTGGGGG GGGG/T
rs27625200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136898549fC1qa : Intron
ctl : within coordinates of
1SNPA  GAA AAAAA AG  AAGA/G
rs27625199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899028fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPA  GAA AAAAA AG  AAGA/G
rs27625198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899072fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPC  CCC CCCCC CC  CCAA/C
rs27625197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899132fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPA  GAA GAAAA AG  AAGA/G
rs27625196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899180fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPA  CAA CAAAA AC  AACA/C
rs27625195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899208fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPG  CGG  GGGG GC  GGCC/G
rs27625194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899242fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPA  CAA CAAAA AC  AACA/C
rs49477775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899371rC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP G                  G
rs31964585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899475fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPCC    C T   T  T    C/T
rs32675087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899677fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPCCC   C T   T  T    C/T
rs32361764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899693fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPAA    A G   G  G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27625193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899734fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
4SNPGGGG  GGTTGTT GT TGGG/T
rs32080892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899735fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNPGGG   G A   A  A    A/G
rs27625192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899744fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
4SNPAA A GAAGGAGGGAG GAAA/G
rs46391298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899804fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP T      G   G  G    G/T
rs47474816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899819fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP AA     C   C  C    A/C
rs49356399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899820fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP GG     T   T  T    G/T
rs45891335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899839fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP GG     C   C  C    C/G
rs32307850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899934fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
3SNP CC     T   T  T    C/T
rs50307398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136899992fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP TC     C   C  C    C/T
rs51088227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900087fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP TT     C   C  C    C/T
rs46097332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900113fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP CC     G   G  G    C/G
rs47287428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900141fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP GG     A   A  A    A/G
rs48141734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900173fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP TA     A   A  T    A/T
rs265211248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900184fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            A  G    A/G
rs227283925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900190fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            A  T    A/T
rs242821164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900234fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            C  T    C/T
rs258742312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900260fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            G  A    A/G
rs229096323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900265fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            A  C    A/C
rs245180221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900368fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            G  G    G
rs216634236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900443fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            T  T    T
rs108094600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900487fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
2SNP  C         C  C    C
rs251493510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900507fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            C  C    C
rs212285707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900570fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            T  T    T
rs27625191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900602fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNPT  ATT TTTTT TA  TTAA/T
rs230735552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:136900809fC1qa : Locus-Region
ctl : within coordinates of
1SNP            A  A    A

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory