About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Slc4a11
solute carrier family 4, sodium bicarbonate transporter-like, member 11
MGI:2138987

82 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27259917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682193fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1920 bp downstream of
1SNP    GT G  TGT    TG/T
rs27259916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682242fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1871 bp downstream of
1SNP    CT C  TCT    TC/T
rs27259915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682432fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1681 bp downstream of
1SNP    CG C  GCG    GC/G
rs27259914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682457fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1656 bp downstream of
1SNP    TC T  CTC    CC/T
rs27259913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682823fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1290 bp downstream of
1SNP    CG C  GCG    GC/G
rs27259912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130682860fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1253 bp downstream of
1SNP    G  G  AGA    AA/G
rs27259911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683032fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1081 bp downstream of
1SNP    TC T  CCC    CC/T
rs27259910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683072fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 1041 bp downstream of
1SNP    AG A  GGG    GA/G
rs27259909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683162fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : 951 bp downstream of
1SNP    TT T  TCT    TC/T
rs27259908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683656fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP    AG A  GGG    GA/G
rs27259907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683717fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP    TG T  GGG    GG/T
rs27259906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683829fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP    AG A  GAG    GA/G
rs27259905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130683851fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP     G A  GAG    GA/G
rs27259904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684003fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP   GGG G  GAG    GA/G
rs27259903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684038fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP    AC A  CCC    CA/C
rs27259902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684049fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  CCCC C  CTCC   CC/T
rs27259901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684060fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  TTGT G  TTTT   TG/T
rs27259900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684604fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    TT T  TCT    TC/T
rs27259899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684659fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    GG G  GGG    AA/G
rs27259898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684812fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    AG A  GGG    GA/G
rs27259897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130684930fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    AA A  AGA    AA/G
rs27259896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130685061fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    AA A  AGA  A AA/G
rs27259895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130685080fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CC C  CTC    CC/T
rs108313274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130685470fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP CC      C        C
rs27259894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130685875fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    GA G  AGA    AA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27259893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130686306fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    TC T  CTC    CC/T
rs27259892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130686335fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CC C  CACC   CA/C
rs27259891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130686492fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CT C  TCT    TC/T
rs6229348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130686795fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP      G A         A/G
rs6243023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130686995fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
2SNP    CGGCC GCG    GC/G
rs27259890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687031fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    GG G  GTG    GG/T
rs27259889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687116fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    AG A  G G    GA/G
rs27259888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687137fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP   TCT C  TCT    TC/T
rs27259887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687393fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    TT T  TCT    TC/T
rs27259886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687453fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    GG G  GAG    GA/G
rs27259885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687489fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    GA G  AG     AA/G
rs27259884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130687791fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    GA G  AGA    AA/G
rs27259883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130688270fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    TT T  TCTC   TC/T
rs27259882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130688441fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    GT G  TGT    GG/T
rs27259881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130688942fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    G  G   AG    GA/G
rs27259880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130688996fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  A G  G   GA    AA/G
rs27259879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689189fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CC C  CCT    CC/T
rs27259878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689212fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  C CC C  CTC    CC/T
rs27259877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689467fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP   GGG G  GAGG   GA/G
rs27259876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689527fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    A  A  AGA    AA/G
rs27259875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689588fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP   CCC C  CTCC   CC/T
rs27259874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689609fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    TT T  TGT    TG/T
rs27259873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130689754fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CC C  CTCC   CC/T
rs27259872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130690198fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    C  C  GCG    GC/G
rs27259871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130690317fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    AA A  ACA    AA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27259870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130690414fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    CC T  CCC    CC/T
rs27259869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130690771fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP   CCC C  CTCC   CC/T
rs27259868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691342fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP    AA A  AGA    AA/G
rs27259867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691437fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    GA G  AGA    AA/G
rs27259866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691550fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP    CC C  CTC    CC/T
rs27259865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691591fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-NonSynonymous
1SNP    TC T  CCC    CC/T
rs27259864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691625fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP  G GG G  GAG    GA/G
rs27259863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691663fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNPT GGGG G GGTGGGGG G/T
rs27259862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130691760fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Coding-Synonymous
1SNP  AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27259861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130692149fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  AAGG G AGGGAAAGGA/G
rs27259860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130694171fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
2SNP AAAGG G AGG AAAGGA/G
rs27259859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130694504fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  AAAA A AAA AAATAA/T
rs27259858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130694665fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  AAAA A AAG AAAAAA/G
rs52375472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130694938fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP         T        T
rs47590638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130695067fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP         T        T
rs27259857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130695119fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  CCAC A CCCCCCCACA/C
rs27259856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130695266fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  AAAA A AAG AAAAAA/G
rs51102862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130695416fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP AA      A        A
rs27259855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130695768fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  GGAG A GGA GGGAGA/G
rs27259854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130696288fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  GGC  C GC  G GC C/G
rs27259853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130696785fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  TTCT C TTT TTT TC/T
rs27259852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130696803fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  GGA  A GGG GGGAGA/G
rs27259851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130696949fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Intron
1SNP  GGAG A GGG GGG  A/G
rs27259850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130697497fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : mRNA-UTR
1SNP  TTCT C TT  TTTCTC/T
rs27259849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130697548fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  TTAT A TT  TTTATA/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27259848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130697713fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  CCT  T CCC CCCTCC/T
rs27259847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130697806fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  GGTG T GGG GGGTGG/T
rs27259846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130697941fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  CCTC T CCC CCCTCC/T
rs27259845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130698082fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  CCTC T CCC CCCTCC/T
rs27259844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130698939fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  TTCC C TCC TTTCCC/T
rs27259843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130698951fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  AAA  A AGA AAAAGA/G
rs52523149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:130699481fnmf62 : within coordinates of
Slc4a11 : Locus-Region
1SNP  A      A        A

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory