About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Paxip1
PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1
MGI:1890430

226 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32115224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28065361fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC T CCTC    C   CCTCC/T
rs32120435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28065467fPaxip1 : Locus-Region1SNPT TTTT C TTCT    T   TT TC/T
rs3089756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28065541fPaxip1 : Locus-Region1SNP       A     CCCC CCC    A/C
rs3089757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28065559fPaxip1 : Locus-Region2SNPA AAAA G AAAAAAAAAAAAAAAAA/G
rs32119322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28065737fPaxip1 : Locus-Region1SNPA AAAA T AATA    A   AA AA/T
rs32119320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066017fPaxip1 : Locus-Region1SNPG GGGG A GGAG    G   GGAGA/G
rs32119317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066113fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTC    C   CC CC/T
rs32119315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066420fPaxip1 : Locus-Region1SNPG GGGG A GGGG    G   GG  A/G
rs33142814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066570fPaxip1 : Locus-Region1SNPA G   A  A               A/G
rs32118472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066628fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC A CCCC    C   CCCCA/C
rs32118470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066873fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC T CCCC    C   CC CC/T
rs32118467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28066881fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTC    C   CC CC/T
rs32118464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28067081fPaxip1 : Locus-Region1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32117811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28067133fPaxip1 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGAG    G   GG GA/G
rs32117808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28067425fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC C CCTC    C   CCCCC/T
rs32117805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28067512fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AAGA    A   AA AA/G
rs32117352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28067904fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPA AAAA G AAAA    A   AAAAA/G
rs32117349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068080fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPA AAAA C AACA    A   AACAA/C
rs32117346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068201fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPG GGGG T GGGG    G   GGG G/T
rs32117003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068228fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPG GGGG C GGGG    G   GGGGC/G
rs32117000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068276fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32116997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068512fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPA AAAA C AA A    A   AA AA/C
rs32116994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28068543fPaxip1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTTT    T   TTTTC/T
rs32116541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069151fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTTT    T   TTTTC/T
rs32116538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069621fPaxip1 : Intron2SNPAACCCCAA AAAA    A   AAAAA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32116535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069657fPaxip1 : Intron1SNPT    C C TTTT    T   TTTCC/T
rs33118790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069677fPaxip1 : Intron1SNP TC   T  T               C/T
rs32116092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069688fPaxip1 : Intron2SNPTTCCCCTT TTTT    T   TTTTC/T
rs32116089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069706fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGGAA/G
rs32116086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069869fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGTG    G   GGTGG/T
rs32115423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069895fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AA GA/G
rs32115420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28069927fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTTT    T   TTTTC/T
rs33073754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28070210fPaxip1 : Intron1SNPT G   T  T               G/T
rs32115417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28070280fPaxip1 : Intron2SNPA TTTTAT AATA    A   AAT A/T
rs32115414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28070377fPaxip1 : Intron2SNPGGAAAAGG GGGG    G   GGGGA/G
rs32114611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28070482fPaxip1 : Intron2SNPTTAAAATA TTAT    T   TT AA/T
rs32114608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28070786fPaxip1 : Intron2SNPCCGGGGCG CCGC    C   CCGGC/G
rs32114605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28071153fPaxip1 : Intron2SNPA GGGGAG AAGA    A   AAG A/G
rs29532325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28071172fPaxip1 : Intron1SNP  A   G  G               A/G
rs33317408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28071265fPaxip1 : Intron1SNP  T   A  A               A/T
rs32120337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28071425fPaxip1 : Intron1SNPA CCCC A AAAA    A   AAA A/C
rs33452788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28072780fPaxip1 : Intron1SNP GA   G  G               A/G
rs33631352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28072885fPaxip1 : Intron1SNP TA   T  T               A/T
rs33042045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28073204fPaxip1 : Intron1SNPGGA   G  G               A/G
rs33544419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28073699fPaxip1 : Intron1SNPCCT   C  C               C/T
rs6369862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28074328fPaxip1 : Intron1SNP      A G                A/G
rs32120334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28074621fPaxip1 : Intron1SNPG AAAA G GGGG    G   GG  A/G
rs29774847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28075265fPaxip1 : Intron2SNPTTCCCC C TTCT    T   TTC C/T
rs32119389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28075284fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GG  A/G
rs29513093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28075334fPaxip1 : Intron2SNPGGCC C G GGCG    G   GGC C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32119384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28077180fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT G TTGT    T   TTG G/T
rs32118481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28077203fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG   GGAG    G   GGA A/G
rs29777738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28078347fPaxip1 : Intron2SNPGGAAAA G GGGG    G   GGG A/G
rs29780412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28078478fPaxip1 : Intron1SNP GC      G               C/G
rs32118476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28078999fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTAT    T   TTAAA/T
rs32117833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28079152fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG C GGGG    G   GGG C/G
rs32117830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28079504fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAG A/G
rs32117827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28079896fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAAA    A   AAA A/G
rs32117824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28080159fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTTT    T   TTT C/T
rs29506739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28080180fPaxip1 : Intron2SNPT AAAATT TTTT    T   TTT A/T
rs32117479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28080209fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG   GGAG    G   GGG A/G
rs32117476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28080695fPaxip1 : Intron1SNPG AAAA G GGGG    G   GGG A/G
rs32117083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28080942fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG C GGGG    G   GGGCC/G
rs32117080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28081066fPaxip1 : Coding-Synonymous2SNPTTCCCC C TTCT    T   TTC C/T
rs32117077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28081221fPaxip1 : Intron2SNPCCTTTT C CCCC    C   CCC C/T
rs32117074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28081612fPaxip1 : Intron1SNPG  G G   G AG    G   GG  A/G
rs32116631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28081725fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGGG    G   GGG A/G
rs32116628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28081832fPaxip1 : Intron2SNPT GGGGTG TTGT    T   TTG G/T
rs32116625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28082848fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CC CC/T
rs32116152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28083119fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGG     G   GGGAA/G
rs32116149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28083127fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGAGA/G
rs32116146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28083645fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AATA    A   AAAAA/T
rs32115443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28083742fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCC     C   CCCTC/T
rs32115440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28083887fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGA     G   GGGGA/G
rs32115437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28084833fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGA     G   GGAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32115434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28084843fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGGAA/G
rs33200144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28085086fPaxip1 : Coding-Synonymous1SNPC T      C               C/T
rs32114591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28085377fPaxip1 : Intron2SNPGGAAAA A GGAG    G   GGAAA/G
rs32114588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28085445fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAAA    A   AATAA/T
rs33390840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28085586fPaxip1 : Intron1SNPAAC      A               A/C
rs29807423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28085616fPaxip1 : Intron2SNPGGAAAA G GGGG    G   GGGGA/G
rs32120240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28086080fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTT     T   TTTTC/T
rs32120237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28086153fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32120234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28086388fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32119401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28086855fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAA     A   AAAAA/G
rs32119398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28086963fPaxip1 : Intron1SNPA GGGG G AAGA    A   AAGGA/G
rs33498347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28087532fPaxip1 : Intron1SNPTTC      T               C/T
rs32119395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28088347fPaxip1 : Intron2SNPCCTTTTCC CCCC    C   CCCCC/T
rs32118532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28088516fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AA T    A   AAAAA/T
rs32118529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28088939fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA T AAAA    A   AAAAA/T
rs29633334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28089147fPaxip1 : Intron2SNPTTCCCC C TTCT    T   TTCCC/T
rs32118524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28089780fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTT     T   TTTTC/T
rs32117951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28089839fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGT     G   GGGGG/T
rs33526679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090155fPaxip1 : Intron1SNPT C   T  T               C/T
rs32117948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090387fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTC     T   TTCTC/T
rs32117945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090527fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGAGA/G
rs32117572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090617fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCT     C   CCCCC/T
rs32117569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090738fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTAT    T   TTATA/T
rs32117566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28090962fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGAG    G   GGAGA/G
rs32117113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28091340fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29627818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28091592fPaxip1 : Intron1SNP TC      C               C/T
rs32117110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28091729fPaxip1 : Coding-Synonymous2SNPCCTTTT C CCCC    C   CCCCC/T
rs32117107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28091920fPaxip1 : Intron2SNPAAGGGG G AAGA    A   AAGGA/G
rs32117104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28092020fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCTC    C   CCTCC/T
rs32116691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28092731fPaxip1 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
rs32116688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28092891fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGCG    G   GGCGC/G
rs32116685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28092989fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AA G    A    A  A/G
rs32116202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28093988fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AACA    A   AACAA/C
rs32116199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28094645fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGAGA/G
rs32116196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28094697fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGGG    G   GGGGA/G
rs32115393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095075fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAAAA/G
rs32115390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095110fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCAC    C   CCACA/C
rs32115388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095318fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AAAA    A   AAACA/C
rs32115386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095346fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CC C    C   CCTCC/T
rs32114573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095477fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAGAA/G
rs32114570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095509fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGGA/G
rs32114567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095573fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTCCC/T
rs32114564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095791fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGAGA/G
rs32120990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28095986fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAAA    A   AACAA/C
rs29587162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28096254fPaxip1 : Intron2SNPAAGGGGAG AAGA    A   AAGGA/G
rs32120985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28096696fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGGA/G
rs32120212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28097046fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCCC/T
rs32120209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28097074fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCCC/T
rs32120206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28097855fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGAGA/G
rs32119373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28098427fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32119370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28098440fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTTT    T   TTTAA/T
rs32119367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28098988fPaxip1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG A GGAG    G   GGAAA/G
rs32119364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28099227fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32118521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28099291fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
rs32118518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28099429fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTTTC/T
rs32118515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28099445fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGGA/G
rs32117872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28100052fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT   TTGT    T   TTGGG/T
rs32117869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28100065fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCCCC/T
rs32117866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28100497fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCCC/T
rs32117403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28100934fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAGAA/G
rs32117400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28101012fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCTC    C   CC TC/T
rs32117397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28101151fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGAG    G   GGAAA/G
rs32117394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28101279fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTTT    T   TTTTC/T
rs33582613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28101755fPaxip1 : Intron1SNPC T   T  T               C/T
rs32116881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28101914fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
rs32116878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102085fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTTT    T   TTTCC/T
rs32116875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102095fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGAGA/G
rs32116282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102223fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGGGA/G
rs32116279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102258fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32116276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102315fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGGGA/G
rs32115493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102471fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGGG    G   GGGGA/G
rs32115490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102486fPaxip1 : Intron1SNPT CCCC C TTTT    T   TTCCC/T
rs32115487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102517fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32115484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28102774fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGGGA/G
rs32114631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28103348fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32114628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28103472fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC A CCAC    C   CCAAA/C
rs32114625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28103872fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAAA    A   AAAAA/G
rs32116488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28103884fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAAAA/G
rs32116485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28103954fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTAT    T   TTTTA/T
rs32116042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104058fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
rs32116039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104059fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGGG    G   GGGGA/G
rs32116036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104327fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCCC/T
rs32115193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104405fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AAAA    A   AAAAA/C
rs32115190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104459fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGAG    G   GGAGA/G
rs32115187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28104471fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGGAA/G
rs32115184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28105416fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCTC/T
rs32114441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28105845fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCTCC/T
rs32114438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28106414fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AACA    A   AAAAA/C
rs32114435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28106474fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32113582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28106579fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT A TTAT    T   TTAAA/T
rs32113579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28107042fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGCG    G   GG CC/G
rs32113576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28107087fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC G CCGC    C   CCGGC/G
rs32112743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28107376fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTTTC/T
rs32112740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28107408fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32112737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28107543fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT G TTTT    T   TTTTG/T
rs32112734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28108210fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGGG    G   GGGGA/G
rs6294868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28108242fPaxip1 : Intron2SNPG GGGGGAAGGAG    G   GGAGA/G
rs32111749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28108823fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32111746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109017fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AA A    A   AAGGA/G
rs32111744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109020fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CC CC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32110831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109122fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA T AAAA    A   AATAA/T
rs32110829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109140fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG T GGGG    G   GGGGG/T
rs32110827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109176fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGTGG/T
rs32110824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109206fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGTGG/T
rs32110001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109260fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT   TTTT    T   TTCCC/T
rs32109998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109291fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAAA    A   AAGAA/G
rs32109995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109361fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32109192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109408fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTGT    T   TTGGG/T
rs32109189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109442fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAAA    A   AATAA/T
rs32109186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109553fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTTT    T   TTGTG/T
rs32115903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28109910fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGAA/G
rs32115900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28110148fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG   GGGG    G   GGGAA/G
rs32115897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28110423fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32115894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28110640fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG C GGGG    G   GGGGC/G
rs32115161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28110768fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTTT    T   TTTTC/T
rs32115158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111034fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCCCC/T
rs32115155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111104fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTAT    T   TTTTA/T
rs32114362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111233fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGGG    G   GGGAA/G
rs32114359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111315fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG A GGAG    G   GGGGA/G
rs32114356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111678fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTTTC/T
rs32113643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111685fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32113640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111833fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGCG    G   GGGGC/G
rs32113637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111958fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGGGA/G
rs32113634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28111977fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCCC    C   CCGCC/G
rs32112841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28112093fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32112838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28112239fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAAA    A   AAAGA/G
rs33220387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28112720fPaxip1 : Intron1SNPGGA   G  G               A/G
rs29570053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28112802fPaxip1 : Intron1SNPCCC   T  T               C/T
rs32112835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28113951fPaxip1 : Intron2SNPAAGGGGAG AAGA    A   AAGGA/G
rs32112052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28114014fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAGA    A   AAGAA/G
rs32112049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28114076fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT C TTCT    T   TTCTC/T
rs32112046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28114600fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AACA    A   AA CA/C
rs32111283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28114621fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AA A    A   AA  A/G
rs32111280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28114775fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32111277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115352fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AAAA    A   AAAAA/C
rs32111274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115650fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTCTC/T
rs32110851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115828fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTTT    T   TTCTC/T
rs32110848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115858fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA A AAGA    A   AAGAA/G
rs32110845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115905fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGAGA/G
rs32110162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115917fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA G AAAA    A   AAAAA/G
rs32110159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28115944fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG T GGTG    G   GGTGG/T
rs32110156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116109fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT T TTCT    T   TTTTC/T
rs32109313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116241fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C   CCCCC/T
rs32109310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116374fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCGC    C   CCGCC/G
rs32109307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116412fPaxip1 : Intron1SNPT TTTT   TTCT    T   TTCTC/T
rs32109304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116463fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG T GGTG    G   GGTGG/T
rs32116300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116552fPaxip1 : Intron1SNPA AAAA C AAAA    A   AAAAA/C
rs32116297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116620fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
rs32116294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116693fPaxip1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG    G   GGAGA/G
rs32115641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116767fPaxip1 : Intron1SNPC CCCC C CCTC    C   CCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32115638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:28116842fPaxip1 : Intron1SNPG AAAA G GGGG    G   GGGAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory