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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Mmadhc methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblD type, with homocystinuria MGI:1923786 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27931237 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50133851 | f | Mmadhc : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13470306 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135542 | r | Mmadhc : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931236 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135658 | f | Mmadhc : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223141 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135710 | f | Mmadhc : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223142 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135711 | f | Mmadhc : mRNA-UTR | 3 | SNP | T | T | G | G | G | G | G | T | T | G | G | T | G | G | G | T | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||
| rs4223143 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135724 | f | Mmadhc : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | C | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223144 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135725 | f | Mmadhc : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4223145 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50135806 | f | Mmadhc : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||
| rs27931235 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50136659 | f | Mmadhc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||
| rs27931234 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50138451 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29560071 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50138804 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931233 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50139981 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931232 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50143318 | f | Mmadhc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs13470305 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50143405 | r | Mmadhc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931231 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50143598 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931230 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50143632 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931229 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50143655 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931228 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144308 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | A | C | C | C | C | A | C | A | C | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931227 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144347 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931226 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144365 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931225 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144428 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931224 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144442 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931223 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50144764 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | C | T | T | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||
| rs27931222 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50145088 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27931221 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50146628 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33245766 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50147562 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33150008 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50150843 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33482053 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50150881 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | A | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33003463 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50150912 | f | Mmadhc : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33151514 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50152339 | f | Mmadhc : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29537170 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:50152454 | f | Mmadhc : Locus-Region | 1 | SNP | T | G | G | G | G/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 06/05/2013 MGI 5.13 |
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