About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Stx16
syntaxin 16
MGI:1923396

89 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27669735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174074471fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1837 bp upstream of
1SNPG GGGG   G GGAG       G         G      G G    G A/G
rs29818979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174074601fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1707 bp upstream of
2SNP AA        G       G             A              A/G
rs29720510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174074939fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1369 bp upstream of
2SNP GG   C                                         C/G
rs27669734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174075209fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Locus-Region
1SNP         T A                                    A/T
rs27669733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174075434fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Locus-Region
1SNP         T C                    C               C/T
rs33364848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174075825fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Locus-Region
2SNP AA   C    C                                    A/C
rs29537087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174076773fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Locus-Region
3SNP CC   T    T       T             C              C/T
rs29920562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174078044fD130084N16Rik : within coordinates of
Hrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP G    A    G                                    A/G
rs33121936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174079669fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP TT   C    C       T             T              C/T
rs29631311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174079768fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP TT   G    G       T             T              G/T
rs3672580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174079967fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNPGGG   C    C       C             G              C/G
rs3674328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174080246fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPCCC   A    A       A             C              A/C
rs3674362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174080263fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPAAA   C    C       A             A              A/C
rs27669732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174080700fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP         G C                                    C/G
rs27669731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174081539fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP     A   G A                                    A/G
rs27669730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174082043fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP         C G                                    C/G
rs29560715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174082689fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP CC   G    G       G             C              C/G
rs254119973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174083239fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP                   T             C              C/T
rs224714827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174084038fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP                   T             C              C/T
rs29773217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174084042fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP GG   A    A       G             G              A/G
rs33610320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174084500fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP CC   G    G       C             C              C/G
rs27669729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174084561fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP         T C                                    C/T
rs27669728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174084837fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP     G   A G                                    A/G
rs27669727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174085324fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP         C T                                    C/T
rs27669726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174085479fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNP         C T                    T               C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27669725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174085781fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNP GG   A  G A       G             G              A/G
rs6212371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174086119fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPA AAAAA  GGAA A       A         A      A G    A A/G
rs27669724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174087022fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAA    G AAAA       A         A      A A    A A/G
rs27669723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174087098fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPG G T    G GTGT    T  T         TG       G    G G/T
rs27669722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174087126fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAAA   A AATA       A         A      A T    A A/T
rs27669721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174087416fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNPGGG AA   G GAGA    A  A          G     A G    G A/G
rs27669720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174087598fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNPGGGGA    G GAGA    A  A         AG     G G    G A/G
rs27669719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174088350fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs29917718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174088501fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNP GG   C    C       C             G              C/G
rs27669718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174088559fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAAA   G AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27669717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174088805fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCC    T CCT        C                  T    C C/T
rs27669716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089108fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPC C T    C CTCT    T  T         TC     C C    C C/T
rs27669715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089436fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G G    A A/G
rs27669714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089527fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAA    G AAGA       A         A      A G    A A/G
rs27669713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089588fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPG G A    G GAGA    A  A          G       G    G A/G
rs27669712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089692fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPTTT CCC    CC      C  C          T     C C    C C/T
rs27669711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174089895fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPA AAC    A ACAC    C  C         CA       A    A A/C
rs27669710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174090047fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   A GGAG       G         G      G A    G A/G
rs27669709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174090156fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   C GGCG                        G C    G C/G
rs27669708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174090356fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPT TTTT   C TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27669707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174090451fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAAA   C AACA       A         A      A C    A A/C
rs27669706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174091439fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G G    A A/G
rs27669705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174091856fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPT TTTT   A TTAT       T         T      T A    T A/T
rs27669704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174091860fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPAAAGGGG  G GG G    G  G         GA     G G    G A/G
rs27669703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174092216fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPA A GG   G GGGG    G  G         GA     A G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27669702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174092911fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPT TTTT   A TTAT       T         T      T A    T A/T
rs27669701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174092937fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPG GGG T  G TGGG    G  G         GG     G G    T G/T
rs27669700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174092955fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   T CCTC       C         C      C T    C C/T
rs33104088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093075fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
3SNPT T   C    C       C             T              C/T
rs27669699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093164fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPT TTTTA  T ATTT    T             T     T T    A A/T
rs27669698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093208fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   T CCCC       C         C      C C    C C/T
rs27669697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093471fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC   T CCCC       C         C      C C    C C/T
rs27669696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093594fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPG G A    G GAG     A             G     A G    G A/G
rs27669695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093667fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   T CCTC       C         C      C T    C C/T
rs27669694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174093870fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
2SNPG GG G     GAA     A            GG     G A    G A/G
rs27669693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174094597fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G G    A A/G
rs27669692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174094781fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       G         G      G A    G A/G
rs27669691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174094968fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   G CCGC       C         C      C G    C C/G
rs27669690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095009fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       C         C      C C    A A/C
rs27669689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095013fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPT TTTT   C TTTT       T         T      T T    T C/T
rs13476928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095065fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Coding-Synonymous
5SNPGGGGG?AAAGGAGGGAGGGGGGGGAAAGAGGG?GGGGGGGGGGGGAGGA/G
rs27669688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095235fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPT TTTT   G TTGT       T         T      T G    T G/T
rs27669687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095295fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   C CCTC       C         C      C C    C C/T
rs27669686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095490fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAAA   G AAAA       A         A      A A    A A/G
rs27669685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095750fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   A CCAC       C         C      C A    C A/C
rs27669684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174095850fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPC CCCC   T CCCC       C         C      C C    C C/T
rs27669683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174096289fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPA AAAA   A AAAA       A         A      A A    G A/G
rs27669682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174096612fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   A GGGG       G         G      G G    G A/G
rs27669681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174096690fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
4SNPAAAGGGG  G GG G    G  G         GA     G G    G A/G
rs27669680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174097138fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   G AA A       A         A      A G    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27669679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174097235fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
4SNPTT CCC   C CCCC    C  C         CT     C C    C C/T
rs27669678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174097253fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   A AAAA       A         A      A A    C A/C
rs27669677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174097331fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT   C TTCT       T         T      T C    T C/T
rs27669676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174098200fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG   A GG G       G         G      G      G A/G
rs27669675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174098226fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
2SNPC C A    C CA A    A  A          C     C C    C A/C
rs27669674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174098561fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   A AA A       A         A      A G    A A/G
rs27669673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174099180fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : mRNA-UTR
2SNPG GGAA   G GA A    A  A         AG     G G    G A/G
rs27669672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174100166fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : Intron
1SNPG GGGG   G GG G       G         G      G C    G C/G
rs27669671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174100364fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 593 bp downstream of
1SNPA   A    G AA A                        A G    A A/G
rs27669670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174100852fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1081 bp downstream of
4SNPG GGGGA  G AG G    G  G         GG     G G    G A/G
rs27669669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174100927fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1156 bp downstream of
2SNPA A G      AG G    G             A     G      A A/G
rs27669668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174101071fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1300 bp downstream of
1SNPG GGGG   A GG G       G         G      G G    G A/G
rs27669667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174101168fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1397 bp downstream of
4SNPG GGG A  G AG G    G  G          G     G      G A/G
rs27669666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:174101441fHrh3 : within coordinates of
Stx16 : 1670 bp downstream of
4SNPG GGG A  G AG      G  G         GG     G G    G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory