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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Stx16 syntaxin 16 MGI:1923396 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27669735 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173899972 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29818979 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173900102 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669734 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173900710 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669733 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173900935 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33364848 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173901274 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29537087 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173902274 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29920562 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173903545 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33121936 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173905170 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29631311 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173905269 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3672580 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173905468 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3674328 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173905747 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3674362 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173905764 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669732 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173906201 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669731 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173907040 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669730 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173907544 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29560715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173908190 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29773217 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173909543 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33610320 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173910001 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173910062 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669728 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173910338 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173910825 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669726 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173910980 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173911282 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6212371 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173911620 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173912523 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27669723 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173912599 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | T | G | G | T | G | T | T | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669722 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173912627 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669721 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173912917 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | G | G | A | G | A | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669720 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173913099 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | G | A | G | A | A | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669719 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173913851 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29917718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173914002 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173914060 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669717 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173914306 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | T | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669716 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173914609 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173914937 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669714 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915028 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669713 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915089 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | G | A | G | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669712 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915193 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669711 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915396 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | C | A | A | C | A | C | C | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669710 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915548 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669709 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915657 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | C | G | G | C | G | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669708 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915857 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669707 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173915952 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669706 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173916940 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669705 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173917357 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669704 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173917361 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669703 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173917717 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669702 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918412 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669701 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918438 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | T | G | T | G | G | G | G | G | G | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669700 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918456 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33104088 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918576 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669699 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918665 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | A | T | T | T | T | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669698 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918709 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669697 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173918972 | f | Stx16 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669696 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173919095 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | G | A | G | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669695 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173919168 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669694 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173919371 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | A | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669693 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920098 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669692 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920282 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669691 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920469 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669690 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920510 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669689 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920514 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13476928 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920566 | f | Stx16 : Coding-Synonymous | 3 | SNP | G | G | G | G | G | ? | A | A | A | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A | A | G | A | G | G | G | ? | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A/G |
| rs27669688 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920736 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669687 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920796 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669686 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173920991 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669685 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173921251 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669684 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173921351 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669683 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173921790 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669682 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922113 | f | Stx16 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669681 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922191 | f | Stx16 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669680 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922639 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669679 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922736 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669678 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922754 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669677 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173922832 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27669676 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173923701 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669675 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173923727 | f | Stx16 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | A | C | C | A | A | A | C | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27669674 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:173924062 | f | Stx16 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 06/05/2013 MGI 5.13 |
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