About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Chrna2
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 2 (neuronal)
MGI:87886

91 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31062430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66139112fChrna2 : Locus-Region1SNPT      T T C       TTC/T
rs31062428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66139173fChrna2 : Locus-Region1SNPG G    G G A       GGA/G
rs30801101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66140529fChrna2 : Locus-Region3SNP CC   G  C   C  C    C/G
rs31062426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66140687fChrna2 : Locus-Region1SNP  A AA T A         T A/T
rs31062424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66140712fChrna2 : Locus-Region1SNP  C    T C T       T C/T
rs31061372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66141128fChrna2 : Intron1SNPA A  A G A G       GAA/G
rs31061370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66141243fChrna2 : Intron1SNP  C    C   G       CCC/G
rs31061368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66141348fChrna2 : Intron1SNPG G GG A GGA       A A/G
rs31061367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66141958fChrna2 : Intron1SNPA A  A A AAC       AAA/C
rs31061365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142059fChrna2 : Intron1SNPG G  G G   G   G   TGG/T
rs31060493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142087fChrna2 : Intron1SNP     A G   A       AAA/G
rs31060491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142305fChrna2 : Intron1SNPC C C  T CCT       T C/T
rs31060489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142323fChrna2 : Intron1SNPG GGGG A GG        AGA/G
rs31060487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142766fChrna2 : Intron1SNPC C CC A C A       ACA/C
rs31060486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66142886fChrna2 : Intron1SNPC C    C C T   C   CCC/T
rs30876979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66143052fChrna2 : Intron2SNP  C   C  T           C/T
rs31060484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66143491fChrna2 : Coding-NonSynonymous1SNP  T    G T G       GTG/T
rs31059832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145206fChrna2 : Intron1SNPA A AA A AAG       AAA/G
rs31059830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145269fChrna2 : Intron1SNPC    C T   C   C   T C/T
rs31059828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145365fChrna2 : Intron1SNP       G A A       G A/G
rs31059826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145615fChrna2 : Intron1SNPG G    A G G       AGA/G
rs31059824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145640fChrna2 : Intron1SNPG      T   G       T G/T
rs31058852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66145704fChrna2 : Intron1SNP       G   C       G C/G
rs31058850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146033fChrna2 : Intron1SNP       T   C       T C/T
rs31058848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146137fChrna2 : Intron1SNPA A AA G A A       GAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31058846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146202fChrna2 : Intron1SNPT T  T C TTC   T   CTC/T
rs31058844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146219fChrna2 : Intron1SNPA A AA G AAA       GAA/G
rs31057832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146253fChrna2 : Intron1SNPT T    A   T       ATA/T
rs31057830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146277fChrna2 : Intron1SNPG      A   G       A A/G
rs31057828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146358fChrna2 : Intron1SNP       T   A       T A/T
rs31057826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146437fChrna2 : Coding-NonSynonymous1SNP  T      T C         C/T
rs31057824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146603fChrna2 : Intron1SNPG G GG A GGG       AGA/G
rs31056992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146617fChrna2 : Intron1SNPT T    C T T       C C/T
rs214898865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66146794fChrna2 : Intron1SNP             G  G    G
rs31056990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147172fChrna2 : Intron1SNP       C   T       C C/T
rs231219958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147338fChrna2 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs31056988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147548fChrna2 : Intron1SNP       C T T       C C/T
rs31056986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147769fChrna2 : Intron1SNPG G GG A GGG   G   AGA/G
rs31056984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147845fChrna2 : Intron1SNPC C  C T  CC       TCC/T
rs31056092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147885fChrna2 : Intron1SNPT      T   C       TTC/T
rs31056090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147912fChrna2 : Intron1SNPT      C   T       C C/T
rs31056088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66147931fChrna2 : Intron1SNPA      T   T       T A/T
rs6187848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148466fChrna2 : Intron2SNP      CGGC C   C   GCC/G
rs6188373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148596fChrna2 : Intron1SNP      T A            A/T
rs6188802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148648fChrna2 : Intron1SNP      G A            A/G
rs6188830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148668fChrna2 : Intron2SNPT T   TCCT T       CTC/T
rs31056084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148681fChrna2 : Intron1SNPC CCCC C CCT  C    CCC/T
rs31058860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66148686fChrna2 : Intron1SNPC C    A CC        ACA/C
rs31058858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149099fChrna2 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC T CCTC CC   TCC/T
rs31058856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149202fChrna2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TTCT T    CTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31058854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149261fChrna2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TTTT TT   CTC/T
rs31058012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149303fChrna2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA G AAAA AA   GAA/G
rs31058010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149525fChrna2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG A GGGG G    AGA/G
rs31058008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149543fChrna2 : Coding-NonSynonymous1SNPT TTTT A TTTT TT   ATA/T
rs31058006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66149960fChrna2 : Intron1SNPA AAAA G AAGA A    GAA/G
rs31058004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66150024fChrna2 : Intron1SNPC CCCC T CCCC C     CC/T
rs31057022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66150201fChrna2 : Intron1SNPT TTTT A TTAT T     TA/T
rs31057020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66150256fChrna2 : Intron1SNPC CCCC   CCGC C    GCC/G
rs31057018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66150414fChrna2 : Intron1SNPT TTTT A TTTT T    ATA/T
rs31057017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66150843fChrna2 : Intron1SNPT TTT  C TTTT T    CTC/T
rs31057015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66151336fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTCT T    CTC/T
rs31056303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66151449fChrna2 : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGAG G    AGA/G
rs31056301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66151547fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTCT T    CTC/T
rs31056299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66151608fChrna2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC A CCAC C    ACA/C
rs31056297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152020fChrna2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA T AAAA A    TAA/T
rs31056295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152098fChrna2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC T CCCC C    TCC/T
rs31055483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152181fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTTT T    CTC/T
rs31055481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152209fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTTT T   TCTC/T
rs31055479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152254fChrna2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA G AAAA A    AAA/G
rs31055477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152306fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   TTTT T   TCTC/T
rs31055475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152505fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT G TTTT T    GTG/T
rs31054793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152522fChrna2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC C CCTC CC   CCC/T
rs31054791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152551fChrna2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA T AAAA A    TAA/T
rs31054789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152593fChrna2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTTT T     TC/T
rs31054787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152699fChrna2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC T CCCC C    TCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31054785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152725fChrna2 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGAG GG    GA/G
rs30552350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152858fChrna2 : mRNA-UTR
Ptk2b : Intron
4SNPGGCCCGGG GCGCCC C  GCC/G
rs31054082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152863fChrna2 : mRNA-UTR
Ptk2b : Intron
1SNPA    A G   G       G A/G
rs31054080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152957fChrna2 : Locus-Region
Ptk2b : Intron
1SNPT TTTT T TTTT T    CTC/T
rs31054078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66152972fChrna2 : Locus-Region
Ptk2b : Intron
1SNP  TTTT C TTTT T    CTC/T
rs31054076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66153011fChrna2 : Locus-Region
Ptk2b : Intron
1SNPG GGGG A GGGG G    GGA/G
rs31054074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66153129fChrna2 : Locus-Region
Ptk2b : Intron
1SNPT TTTT C TTCT T    CTC/T
rs13474074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66153901rChrna2 : 953 bp downstream of
Ptk2b : mRNA-UTR
3SNP CT      C   T  T    C/T
rs13474076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66153922rChrna2 : 974 bp downstream of
Ptk2b : mRNA-UTR
3SNP AG      A   G  G    A/G
rs31053342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154326fChrna2 : 1378 bp downstream of
Ptk2b : Intron
1SNPT    T C T         C C/T
rs31053340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154351fChrna2 : 1403 bp downstream of
Ptk2b : Intron
2SNPG    G A G A A  A  A A/G
rs31053338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154373fChrna2 : 1425 bp downstream of
Ptk2b : Intron
1SNPG GGGG G GGAG G    GGA/G
rs31053336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154375fChrna2 : 1427 bp downstream of
Ptk2b : Intron
1SNPG GGGG A GGGG G    AGA/G
rs50147385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154728fChrna2 : 1780 bp downstream of
Ptk2b : Intron
1SNP  C      C       A   A/C
rs31053334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154856fChrna2 : 1908 bp downstream of
Ptk2b : Intron
2SNPTTTTTT C TTCT T  C CTC/T
rs31052472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:66154936fChrna2 : 1988 bp downstream of
Ptk2b : Intron
2SNPCCCCCC G CCGC C  G GCC/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory