About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Optn
optineurin
MGI:1918898

236 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27111475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940648fOptn : Locus-Region1SNPT TT   G TT        G/T
rs27111474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4941712fOptn : mRNA-UTR1SNPA A    G A         A/G
rs13473091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4941979rOptn : mRNA-UTR1SNPG G    AG  G  GG   A/G
rs27111473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942053fOptn : mRNA-UTR1SNPC CCC  TCCCC  CCC CC/T
rs27111472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942469fOptn : Coding-Synonymous1SNPG GGGG CGGGG  G    C/G
rs27111471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942626fOptn : Intron1SNPA AAAA G A A   A  AA/G
rs27111470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942813fOptn : Intron1SNPG GG G CGGG        C/G
rs27111469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942887fOptn : Intron1SNPA AAAA CAAAA  AA  AA/C
rs27111468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942898fOptn : Intron1SNPG GGGG A G    G    A/G
rs27096167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4942987fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  G GAGA/G
rs27096166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943048fOptn : Intron1SNPA AAAA GAAAA  A AGAA/G
rs27096165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943079fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TCTC/T
rs27096164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943347fOptn : Intron1SNPA AAAA AAAAA  A ATAA/T
rs27096163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943411fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  G GGGA/G
rs27096162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943695fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  C CTCC/T
rs27096161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4943842fOptn : Intron1SNPT TTTT GTTTT  T TTTG/T
rs27096160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4944588fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  C CTCC/T
rs27096159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4944760fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  C CTCC/T
rs27096158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4944908fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  G GCGC/G
rs27096157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4944942fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  G GAGA/G
rs27096156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4944955fOptn : Intron1SNPA AAAA   AAA  A ACAA/C
rs27096155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945036fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  C CTCC/T
rs27096154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945062fOptn : Intron1SNPA AAAA GAAAA  A AGAA/G
rs27096153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945202fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  C CTCC/T
rs27096152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945224fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945254fOptn : Intron1SNPA AAAA CAAAA  A ACAA/C
rs27096150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945306fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  C CACA/C
rs27096149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945447fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TCTC/T
rs27096148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4945476fOptn : Intron1SNPA AAAA AAAAA    ACAA/C
rs27096147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4946601fOptn : Intron1SNP  TTTT CT TT  T T TC/T
rs27096146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4947140fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  G GAGA/G
rs27096145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4947481fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  G GGGA/G
rs27096144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948064fOptn : Intron1SNPC CCCC ACCCC  C CCCA/C
rs27096143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948096fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  T CTCC/T
rs27096142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948110fOptn : Intron1SNPT TTTT  TTTT  T TGTG/T
rs27096141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948117fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  C CCCC/T
rs27096140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948141fOptn : Intron1SNPT TTTT TTTTT  G TTTG/T
rs27096139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4948439fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TTTC/T
rs27096138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950432fOptn : Intron1SNPG GGAG GGAGG  G GGAA/G
rs27096137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950455fOptn : Intron1SNPG GGAG GGAGG  G GAAA/G
rs27096136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950476fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  C CTCC/T
rs27096135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950550fOptn : Intron1SNPG GGAG GGAGG  G GGAA/G
rs27096134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950643fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  G GTGG/T
rs27096133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950858fOptn : Intron1SNPA AATA TATAA  A ATTA/T
rs27096132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950882fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  G GCGC/G
rs27096131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4950968fOptn : Intron1SNPT TT T GT TT  T TG G/T
rs27096130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4951137fOptn : Intron1SNPG GGAG GGAGG  G GGAA/G
rs27096129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4951273fOptn : Intron1SNPG GGGG TGGGG  G GGGG/T
rs27096128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4951296fOptn : Intron1SNPT TTTT CTCTT  T TCTC/T
rs27096127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952246fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952273fOptn : Intron1SNPA   AA GGAAA  G AGAA/G
rs27096125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952294fOptn : Intron1SNPC CCCC GCCCC  C CGCC/G
rs27096124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952321fOptn : Coding-Synonymous1SNPG GGGG GGGGG  G GAGA/G
rs27096123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952358fOptn : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG GGGGG  G GAGA/G
rs27096122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952393fOptn : Coding-Synonymous1SNPT TTTT TTTTT  T TCTC/T
rs27096121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952426fOptn : Coding-Synonymous1SNPG G GG A G G  A  GGA/G
rs27096120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952468fOptn : Intron1SNPA AAAA AAAAA    AGAA/G
rs27096119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952607fOptn : Intron1SNPT TTTT GTTTT  G TGTG/T
rs27096118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952631fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T TCTC/T
rs27096117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952883fOptn : Intron1SNPG GGAG AGAGG  G GAAA/G
rs27096116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952930fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  T CTCC/T
rs27096115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952958fOptn : Intron1SNPA AAAA TAAAA    ATAA/T
rs27096114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4952977fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT    TCTC/T
rs27096113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953043fOptn : Intron1SNPA AAAA CAAAA    AAAA/C
rs27096112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953561fOptn : Intron1SNP       A      C  AAA/C
rs27096111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953835fOptn : Intron1SNPC CC C TC CC  C CT C/T
rs27096110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953891fOptn : Intron1SNPT TTCT TTCTT    TTCC/T
rs27096109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953914fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  C CTCC/T
rs27096108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4953950fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T T TC/T
rs27096107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955278fOptn : Coding-NonSynonymous1SNPC   C  T         TCC/T
rs27096106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955622fOptn : Intron1SNPC   C  T         C C/T
rs27096105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955663fOptn : Intron1SNPA   A  A         C A/C
rs27096104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955707fOptn : Intron1SNPC   C  T         CCC/T
rs27096103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955742fOptn : Intron1SNPG   G  T GG      GGG/T
rs27096102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955920fOptn : Intron1SNPA   A  C A       AAA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4955972fOptn : Intron1SNPC   C  C C       TCC/T
rs27096100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4956254fOptn : Intron1SNPC   C  C         TCC/T
rs27096099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4956278fOptn : Intron1SNPT   T  C         TTC/T
rs4222950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957549rOptn : Intron1SNP  A AAAAA   GA     A/G
rs4222949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957562rOptn : Intron1SNP  T TTTTT   CT     C/T
rs4222948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957583rOptn : Intron1SNP  C CCCTC   CC     C/T
rs4222947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957606rOptn : Intron1SNP  T TTTTT   CT     C/T
rs4222946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957656rOptn : Intron1SNP  T TTTTT   CT     C/T
rs4222945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957661rOptn : Intron1SNP  C CCCCC   TC     C/T
rs4222944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957729rOptn : Coding-NonSynonymous1SNP  A AAAAA   CA     A/C
rs4222943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957735rOptn : Coding-NonSynonymous1SNP  G GGGGG   CG     C/G
rs4222942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957740rOptn : Coding-NonSynonymous1SNP  A AAAAA   GA     A/G
rs4222941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957758rOptn : Coding-NonSynonymous1SNP  A AAAAA   GA     A/G
rs4222940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957777rOptn : Coding-Synonymous1SNP  T TTTGT   GT     G/T
rs4222939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957856rOptn : Intron1SNP  A AAAAA   CA     A/C
rs27096098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4957921fOptn : Intron1SNPG   G  A         AGA/G
rs27096097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4958646fOptn : Intron1SNPG   G  G         AGA/G
rs27096096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4959489fOptn : Intron1SNPA   A  A         GAA/G
rs27096095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4960557fOptn : Intron1SNPC   C  C         TCC/T
rs27096094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4960675fOptn : Intron1SNPT   T  A         TTA/T
rs27096093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4960978fOptn : Intron1SNPA   A  C         A A/C
rs27096092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4961429fOptn : Intron1SNPC   C  T         CCC/T
rs27096091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4961793fOptn : Intron1SNPG   G  A G       AGA/G
rs27096090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4961842fOptn : Intron2SNPGG  A AAA        AAA/G
rs27096089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4961867fOptn : Intron1SNPC   C  T         TCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4962005fOptn : Intron1SNPC   C  A         ACA/C
rs27096087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4962636fOptn : Intron1SNPA   A  A         CAA/C
rs27096086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4963101fOptn : Intron1SNPA   C  A         CAA/C
rs27096085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4963775fOptn : Intron2SNP GC C CGCC       C C/G
rs27096084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4963891fOptn : Intron2SNPGGA A AGA        G A/G
rs33410677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4963941fOptn : Intron1SNP TC   C C          C/T
rs27096083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964027fOptn : Intron1SNPT TTTT GTTTT  TTTGTG/T
rs27096082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964079fOptn : Intron1SNP  CC C GCCCC  CCC CC/G
rs27096081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964203fOptn : Intron2SNPCCT   TTT        CCC/T
rs27096080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964575fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  TTTTTC/T
rs27096079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964655fOptn : Intron1SNPC CCCC GCCCC  CCCCCC/G
rs27096078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964810fOptn : Intron1SNPA AAAA CAAAA  AAACAA/C
rs29535175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964850fOptn : Intron1SNPG T   T T          G/T
rs29760904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964855fOptn : Intron1SNPG C   C C          C/G
rs32862561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4964933fOptn : Intron1SNPGGA     A          A/G
rs33615197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965073fOptn : Intron1SNPCCT   T T          C/T
rs27096077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965223fOptn : Intron1SNPC CCCC ACCCC  CCCACA/C
rs27096076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965288fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGAGA/G
rs27096075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965323fOptn : Intron1SNPC CCTC CCCCC  CCCCCC/T
rs27096074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965376fOptn : Intron1SNPA AAAA AAAAA  CAA AA/C
rs27096073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965383fOptn : Intron2SNPT CCTCCTCCCC  CCCTCC/T
rs27096072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965407fOptn : Intron1SNPT TTTT TTTTT  TTTTCC/T
rs27096071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965430fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCACA/C
rs29498184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965431fOptn : Intron1SNPC T   T T          C/T
rs27096070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965478fOptn : Intron1SNPC GGGG GGGGG  CGGGGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4965668fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  CCCCCC/T
rs27096068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966209fOptn : Intron1SNPA AAAA GAAAA  AAAGAA/G
rs27096067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966290fOptn : Intron1SNPT TTTT ATTTT  TTTATA/T
rs33419908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966290fOptn : Intron1SNPAA    C C          A/C
rs27096066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966499fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCTCC/T
rs27096065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966920fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  TTTCTC/T
rs27096064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4966940fOptn : Intron1SNPC CCCC GCCCC  CCCGCC/G
rs27096063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4967063fOptn : Coding-Synonymous1SNPC CCCC GCCCC  CCCGCC/G
rs27096062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4967868fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  CCCTCC/T
rs27096061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4967962fOptn : Intron1SNPG GGGG CGGGG  GGGCGC/G
rs27096060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4968011fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  TTTCTC/T
rs27096059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4968111fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGAGA/G
rs27096058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4968663fOptn : Intron1SNPG GGGG CGGGG  GGGGGC/G
rs27096057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4968864fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  CTTCTC/T
rs27096056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4968888fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCTCC/T
rs27096055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4969382fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CCCCC/T
rs27096054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4970055fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  TCCTCC/T
rs27096053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4970217fOptn : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA AA/G
rs27096052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4970253fOptn : Intron1SNPA AAAA CAAAA  CAACAA/C
rs27096051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4970323fOptn : Intron1SNPC CCCC GCCCC   CCCCC/G
rs27096050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4970385fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TTCTC/T
rs27096049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4971200fOptn : Intron1SNPA AAAA C AAA   AACAA/C
rs27096048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4971233fOptn : Intron1SNPG GGGG CGGGG  GGGCGC/G
rs27096047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4971299fOptn : Intron1SNPT TTTT  TTTT  TTTCTC/T
rs27096046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4971379fOptn : Intron1SNPT TTTT ATTTT  TTTTTA/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4971566fOptn : Intron1SNPA AAAA GAAA    AAGAA/G
rs27096044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4972288fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCTCC/T
rs27096043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4972323fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCACA/C
rs27096042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4972361fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGGCGC/G
rs27096041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4972369fOptn : Intron1SNPA AAAA C AA    AA AA/C
rs27096040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4974276fOptn : Intron1SNPG AAAA AAAAA  AAAAAA/G
rs29521836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4974300fOptn : Intron1SNP C    A A          A/C
rs27096039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4974721fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  CCCCCC/T
rs27096038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4975553fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGCGC/G
rs27096037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4975807fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCCGC/G
rs27096036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976007fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG   GGAGA/G
rs27096035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976086fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  TCCTTC/T
rs27096034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976379fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGG AA/G
rs27096033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976380fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  TCCT C/T
rs28318403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976405fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGG AA/G
rs33489595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976418fOptn : Intron1SNPG C   C C          C/G
rs32869105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976470fOptn : Intron1SNPG C   C C          C/G
rs32897543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976496fOptn : Intron1SNPG C   C C          C/G
rs28318398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976509fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGG AA/G
rs27096032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976535fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGG AA/G
rs27096031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976536fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  TCCT C/T
rs27096030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976561fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGG AA/G
rs27096029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976562fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  TCCT C/T
rs27096028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4976861fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GGAGA/G
rs27096027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977223fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27096026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977346fOptn : Intron2SNPGGTTTTTGTTTT  TTTGGG/T
rs27096025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977448fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCCTC/T
rs27096024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977500fOptn : Intron1SNPT TTTT CTTTT  TTTCCC/T
rs27096023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977543fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGGGA/G
rs27096022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977577fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCCTC/T
rs27096021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977677fOptn : Intron1SNPA AAAA AAAAA  AAAGAA/G
rs27096020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977713fOptn : Intron1SNPG GGGG GGGGG  GGGAGA/G
rs27096019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977807fOptn : Intron1SNPG GGGG AGGGG  GGGGGA/G
rs27096018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977829fOptn : Intron1SNPC CCCC CCCCC  CCCCTC/T
rs27096017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4977880fOptn : Intron1SNPG AAAA GAAAA  GAAGAA/G
rs27096016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4978466fOptn : Intron1SNPT GGGG  GGGG   GGTTG/T
rs27096015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4978530fOptn : Intron1SNPG AAAA  AAAA  GAAGAA/G
rs27096014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979434fOptn : Intron1SNPT GGGG GGGGG  GGGGGG/T
rs27096013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979480fOptn : Intron1SNPC CCCC TCCCC  CCCCCC/T
rs27096012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979535fOptn : Intron1SNPG GGGG  GGGG  GGGTTG/T
rs27096011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979654fOptn : Intron1SNPG GGGG CGGGG  GGGCCC/G
rs27096010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979884fOptn : Intron1SNP  G GG           T G/T
rs27096009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4979986fOptn : Intron1SNP  G GG   G       A A/G
rs29762300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980112fOptn : Intron1SNP CA     A          A/C
rs27096008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980295fOptn : Intron1SNP  A AA   A       G A/G
rs33175906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980568fOptn : Intron1SNP TC   C C          C/T
rs29819614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980620fOptn : Intron1SNP TC   C C          C/T
rs29519992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980707fOptn : Intron1SNP GA   A A          A/G
rs29773336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980751fOptn : Intron1SNP GA   A A          A/G
rs33097749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4980751fOptn : Intron1SNP CG   G G          C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33605139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981026fOptn : Intron1SNP AG     G          A/G
rs33382029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981036fOptn : Intron1SNP GC     C          C/G
rs33613887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981037fOptn : Intron1SNP GC     C          C/G
rs27096007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981063fOptn : Intron2SNP CT TT  TT       C C/T
rs33553006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981099fOptn : Intron1SNP TC     C          C/T
rs27096006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981300fOptn : Intron1SNP  C CC   C       T C/T
rs33145376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981355fOptn : Intron1SNPTTA   A            A/T
rs27096005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981440fOptn : Intron1SNP  C CC   C       T C/T
rs33608458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981619fOptn : Intron1SNPAAG   G            A/G
rs32971581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981685fOptn : Intron1SNPGGA   A A          A/G
rs29524747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981750fOptn : Intron1SNPCCG   G G          C/G
rs32978510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4981897fOptn : Intron1SNPCCT   T T          C/T
rs27096004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982027fOptn : Intron1SNP  A AA   A       G A/G
rs27096003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982105fOptn : Intron1SNP  T TT   T       C C/T
rs27096002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982370fOptn : Intron1SNP  A  A   A       T A/T
rs29819527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982456fOptn : Intron1SNP AT   T T          A/T
rs33542385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982617fOptn : Intron1SNP AG     G          A/G
rs33509943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982656fOptn : Intron1SNP TC   C C          C/T
rs29919035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982677fOptn : Intron1SNP TC   C C          C/T
rs27096001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982873fOptn : Intron1SNP  T  T   T       C C/T
rs27096000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982955fOptn : Intron1SNP  C CC   C       T C/T
rs29630472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982956fOptn : Intron1SNPAAG   G G          A/G
rs32871041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982966fOptn : Intron1SNPTTC   C C          C/T
rs29508378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4982977fOptn : Intron1SNPAAT   T T          A/T
rs29524692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983192fOptn : Intron1SNPT C   C C          C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33265693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983223fOptn : Intron1SNPT A     A          A/T
rs29730333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983448fOptn : Intron1SNPAAG   G G          A/G
rs29911413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983500fOptn : Intron1SNPAAG   G G          A/G
rs33141797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983503fOptn : Intron1SNPCCA   A A          A/C
rs27095999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983597fOptn : Intron1SNP  C CC   C       T C/T
rs27095998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4983976fOptn : Intron1SNP  T TT   T       C C/T
rs27095997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4984029fOptn : Intron1SNP  G GG   G       T G/T
rs27095996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4984237fOptn : Intron1SNP  G GG   G       A A/G
rs27095995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4984476fOptn : Intron1SNP  T TT   T       C C/T
rs27095994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4985311fOptn : Locus-Region1SNP  A AA           G A/G
rs27095993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4985424fOptn : Locus-Region1SNP  C CC TCCCC  TCCT C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory