About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Rnaseh2c
ribonuclease H2, subunit C
MGI:1915459

23 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30821695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600203fRnaseh2c : Locus-Region1SNP GA   G          A/G
rs36837304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600352fRnaseh2c : Locus-Region1SNP   G   A G       A/G
rs30645154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600522fRnaseh2c : Locus-Region1SNP GA     G        A/G
rs38483985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600769fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  AA   G G       A/G
rs30500572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600894fRnaseh2c : Locus-Region1SNP CT     C        C/T
rs30400638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601031fRnaseh2c : Locus-Region1SNPGGC     G        C/G
rs39012724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601320fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  AA   A C    ACAA/C
rs37315489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601355fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  TT   C T  T  T C/T
rs36733432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601523fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  AA   C A   AAACA/C
rs31092202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601541fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
2SNPCCTT   CCC  C CC C/T
rs31229498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601935fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Coding-NonSynonymous
1SNP CA   C C        A/C
rs39093288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601941fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Coding-Synonymous
1SNP       GAA  AAAA A/G
rs39347386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601977fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Coding-Synonymous
1SNP  TT   C C   TT  C/T
rs31049009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602181fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Intron
1SNP TC   T T        C/T
rs36892070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602604fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Intron
1SNP  CCC  C T    CT C/T
rs37120362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602805fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Intron
1SNP  GG   G T    G GG/T
rs36977627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602882fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : mRNA-UTR
1SNP  CCC  C T  CCC CC/T
rs36414985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603012fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  CG   G G  CGCCCC/G
rs4232021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603068fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  C CCC C TC     C/T
rs4232022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603078fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  C CCC C TC     C/T
rs4232023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603222fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
3SNP TC CCT CCCTTCC CC/T
rs36393537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603316fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  GGG  A G  GG   A/G
rs38614472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603370fKat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  TTT  C C  T  CCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory