About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Rnaseh2c
ribonuclease H2, subunit C
MGI:1915459

41 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30821695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600203fRnaseh2c : Locus-Region3SNP GA   G     A    A   A/G
rs36837304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600352fRnaseh2c : Locus-Region1SNP   G   A  G          A/G
rs30645154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600522fRnaseh2c : Locus-Region1SNP GA     G            A/G
rs50133684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600556fRnaseh2c : Locus-Region1SNP CT     C            C/T
rs38483985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600769fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  AA   G  G          A/G
rs30500572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5600894fRnaseh2c : Locus-Region3SNP CT     C   T    C   C/T
rs30400638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601031fRnaseh2c : Locus-Region3SNPGGC     G   C    G   C/G
rs39012724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601320fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  AA   A  C       ACAA/C
rs37315489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601355fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  TT   C  T    T   T C/T
rs36733432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601523fRnaseh2c : Locus-Region1SNP  AA   C  A     A AACA/C
rs31092202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601541fRnaseh2c : Locus-Region4SNPCCTT   CC C T  C CCC C/T
rs31229498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601935fRnaseh2c : Coding-NonSynonymous3SNP CA   C C   A    C   A/C
rs39093288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601941fRnaseh2c : Coding-Synonymous1SNP       GA A    AA AA A/G
rs39347386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5601977fRnaseh2c : Coding-Synonymous1SNP  TT   C  C     T T  C/T
rs31049009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602181fRnaseh2c : Intron3SNP TC   T T   C    T   C/T
rs36892070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602604fKat5 : Intron
Rnaseh2c : Intron
1SNP  CCC  C  T       CT C/T
rs37120362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602805fKat5 : Intron
Rnaseh2c : Intron
1SNP  GG   G  T       G GG/T
rs36977627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5602882fKat5 : Intron
Rnaseh2c : mRNA-UTR
1SNP  CCC  C  T    CC C CC/T
rs36414985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603012fKat5 : Splice-Site
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  CG   G  G    CG CCCC/G
rs4232021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603068fKat5 : mRNA-UTR
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  C CCC C    TC      C/T
rs4232022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603078fKat5 : mRNA-UTR
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  C CCC C    TC      C/T
rs4232023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603222fKat5 : mRNA-UTR
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : Locus-Region
4SNP TC CCT C C CCTTCCC CC/T
rs36393537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603316fKat5 : mRNA-UTR
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  GGG  A  G    GG    A/G
rs38614472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603370fKat5 : mRNA-UTR
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : Locus-Region
1SNP  TTT  C  C    T   CCC/T
rs47957088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603797fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 358 bp downstream of
2SNP  T     A   T    A   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31160213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5603958fKat5 : Coding-Synonymous
Kat5 : Noncoding-Transcript-Variant
Rnaseh2c : 519 bp downstream of
3SNP  A   G G   A    G   A/G
rs36670603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604031fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 592 bp downstream of
1SNPT TT C CTTTT   TT TTTC/T
rs30959024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604125fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 686 bp downstream of
3SNP  T   C C   T    C   C/T
rs36515776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604159fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 720 bp downstream of
1SNPT TTT   TTCT   TT TCTC/T
rs30317119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604357fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 918 bp downstream of
3SNP  A   T T   A    T   A/T
rs37409537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604437fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 998 bp downstream of
1SNPG GGG   GGAG   GG GAGA/G
rs39117906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604550fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 1111 bp downstream of
1SNPA AAAA  AAGA   AA AGAA/G
rs37776680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604596fKat5 : Intron
Rnaseh2c : 1157 bp downstream of
1SNPC CCC   CCAC   CC CACA/C
rs37687608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604707fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1268 bp downstream of
1SNPT TTT    TCT   TT TCTC/T
rs37690217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604822fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1383 bp downstream of
1SNPT TTTT TTTTT   TT TCTC/T
rs30965454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604881fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1442 bp downstream of
4SNPAATT  A ATATT  ATAAAAA/T
rs37283372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604896fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1457 bp downstream of
1SNPG GGG   GGCG    G GC C/G
rs37437187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5604898fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1459 bp downstream of
1SNP  GGG  AGGGG    G GGAA/G
rs37180437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5605074fKat5 : Intron
Kat5 : Locus-Region
Rnaseh2c : 1635 bp downstream of
1SNPA AAA   AAGA   AA AGAA/G
rs36286959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5605276fKat5 : Coding-NonSynonymous
Kat5 : Intron
Rnaseh2c : 1837 bp downstream of
1SNPC CCC   CCTC   CC CTCC/T
rs37070845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:5605318fKat5 : Coding-NonSynonymous
Kat5 : Intron
Rnaseh2c : 1879 bp downstream of
1SNPG GGG   GGAG   GG GAAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory