About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Aptx
aprataxin
MGI:1913658

73 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27760395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40681827fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
4SNPAAGG  AGA   A  GA  A/G
rs27760394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40682743fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPG      A        G  A/G
rs27760393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40682900fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPC  C   T   C    C  C/T
rs32104689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40683979fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPGAG   G G          A/G
rs32159997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685538fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPC T     T          C/T
rs32303010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685565fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPC T     T          C/T
rs32028640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685568fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPT C     C          C/T
rs32554711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685608fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPT C     C          C/T
rs27760392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685777fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPG      A  G     GA A/G
rs27760391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40685817fAptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPG      A  G     GA A/G
rs27760390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40687920fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP       T  C     C  C/T
rs219148238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40689667fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP            G  T   G/T
rs27760389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40693525fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP       G  T     TT G/T
rs27760388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694182fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs27760387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694201fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs27760386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694235fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT T TC/T
rs27760385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694298fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TCCC/T
rs27760384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694458fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AGAA/G
rs27760383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694488fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs27760382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694599fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs27760381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694667fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA  A A CA/C
rs27760380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694698fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA AA AAGA/G
rs27760379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694733fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs27760378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694806fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTCC/T
rs27760377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694826fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGGG GG GTTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27760376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694843fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CTCC/T
rs27760375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40694995fAptx : Coding-NonSynonymous
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTCC/T
rs27760374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40695167fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP     A GA A     A  A/G
rs27760373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40695365fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs32808802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696317fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP  G     A          A/G
rs32910616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696357fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNP AG     A          A/G
rs27760372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696392fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs27760371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696406fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT TTTTT TT TTGG/T
rs27760370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696450fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs27760369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696631fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA AA AAGA/G
rs27760368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696636fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GCGC/G
rs27816856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696668fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs27816855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696962fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs27816854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40696996fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs27816853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697069fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA AAAAA AA A GA/G
rs27816852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697117fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AGGA/G
rs27816851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697372fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs27816850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697565fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTCC/T
rs27816849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697587fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CTCC/T
rs27816848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697651fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG CGGGG GG G GC/G
rs27816847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697702fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG    G GA/G
rs27816846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697740fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC ACCCC CC CAAA/C
rs27816845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40697860fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
4SNPAAGGAGAGAAAGAGGGAGGA/G
rs27816844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40698590fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs27816843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40698786fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27816842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40698819fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs27816841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40699206fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGGG GG GGGG/T
rs27816840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40699289fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs27816839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40699323fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs27816838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40699667fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs27816837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40699745fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs27816836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700469fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs27816835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700481fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs27816834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700515fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GAAA/G
rs27816833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700654fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs27816832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700689fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT TTTTT TT TCTC/T
rs27816831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700790fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs27816830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700801fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs27816829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700851fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC CC CTCC/T
rs27816828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40700893fAptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs27816827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40702733fAptx : Coding-NonSynonymous
Aptx : Intron
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG CGGGG GG GGGC/G
rs27816826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40702814fAptx : Intron
Aptx : mRNA-UTR
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs27816825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40703267fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GAGA/G
rs27816824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40703828fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs27816823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40704150fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPA AAAA  AAAA AA ACAA/C
rs27816822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40704268fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPG GGGG TGGGG GG GGGG/T
rs27816821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40704344fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs27816820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:40704473fAptx : Locus-Region
vsd : within coordinates of
1SNPT TTTT TTTTT TT TCTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory