About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Shank3
SH3/ankyrin domain gene 3
MGI:1930016

195 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3720931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89498466fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Locus-Region
4SNPGG    A  A   A  G    A/G
rs31908277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89502921fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GG   G GGAG GG  G GA/G
rs31908279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89503524fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GG   G GGAG GG  G GA/G
rs31908281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89503918fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AA   A AAGA AA  A AA/G
rs31908283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89504018fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AA   A AAGA AA  A AA/G
rs31909065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89504322fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Coding-Synonymous
2SNPC T    T TC TTC C C TC/T
rs31909067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89504610fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CC   C CCTC CC  C CC/T
rs31909069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89504743fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CC   C CCTC CC  C CC/T
rs31843616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89505068fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
4SNPTTA   AA ATTAA  T TTAA/T
rs31909072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89505176fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
3SNPCCCC  CC TC CTCCC C CC/T
rs31909854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89505266fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TT   T TTGT TT  TGTG/T
rs31909856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89505908fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CC   C CCTC CC  C CC/T
rs234707931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89506116fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs252802662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89506564fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs31909858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89507030fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CC   C CCTC CC  CTCC/T
rs31909860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89507060fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TT   T TTCT TT  TCTC/T
rs31909862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89507568fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CC   C CCTC CC  C CC/T
rs214413624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89507975fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs231253705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508056fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs250138431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508067fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs219789271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508157fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs248144851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508184fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs264347344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508277fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  C    C/G
rs226073258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89508351fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs240354425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89509351fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  T    G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs257634221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89509715fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs226471722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89510101fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  A    A/C
rs31706165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89510668fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC T      T           C/T
rs32338064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89510714fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPT T      C   C  T    C/T
rs31910744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89510951fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GG   G GGTG GG  G GG/T
rs31910745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89511407fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC  C   C CCGC  C  C CC/G
rs31910747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89511447fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA  A   A AAGA     A AA/G
rs261991766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89511773fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  A    A/T
rs31890801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89511941fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
3SNPCCT   T  T   T  C    C/T
rs31910749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89512738fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs31910750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89512865fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs31910751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89512967fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs31910753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89513437fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs31911635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89513872fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs254877547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89514600fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs31911637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89514912fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC   CC C CC C CA  CACA/C
rs31904284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89514988fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA A AA A AATA AA  ATAA/T
rs31904286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89515456fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs31904288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89515865fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPA AAG  A AAGAAAAG AGAA/G
rs31904289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89515909fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs31904290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89516109fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs6278673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89516313fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPT TTTTTTCTTCT TT  TCTC/T
rs6291475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89516364fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP      T C            C/T
rs31904293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89518180fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs31905465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89518711fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPG G AG G GGAGGGGA GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs246380832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89518764fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  G    G/T
rs31905467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89519672fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT  TTT T TTGT TT  TGTG/T
rs214355188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89520055fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs31905469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89520193fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs31905471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89520229fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAA  A AAGA A   AGAA/G
rs31905472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89520261fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCAC CC  CACA/C
rs31905473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89521182fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs31906745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89521423fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs31906746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89521740fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs31906748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89521972fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs231725884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89522008fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  G    G/T
rs31906749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89522054fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs261256834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89522646fcmy2 : within coordinates of
Gm15609 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs32503662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89526147fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
3SNP  A      T   T  T    A/T
rs242725227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89526153fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs31809945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89526287fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
3SNP GT      T   T  G    G/T
rs221305807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89526577fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs240291280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89526966fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs251502771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89527432fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  A    A/T
rs220340263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89527644fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs237971697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89527728fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs264870294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528617fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs227730792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528702fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs251521420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528742fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs264101659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528745fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  A    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs228213436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528784fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs246323242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528800fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs214296163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89528892fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  G    C/G
rs225700513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89529243fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs249872744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89529387fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs212270404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89529568fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  T    G/T
rs239969268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89529583fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  G    C/G
rs258877041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89530168fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs215690392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89530765fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs50911343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89531775fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs251450041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89531814fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs220285932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89532854fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  A    A/C
rs238502220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89533671fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs256660393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89533927fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs31906750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89534057fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT T T  T TT T T   TC C/T
rs31906751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89534268fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AACA AA  ACAA/C
rs31906753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89534664fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs31907855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89534745fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AAGA AA  AGAA/G
rs51023079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535112fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP AA      A       G   A/G
rs48473012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535197fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP  C      C       T   C/T
rs51484644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535204fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP         C       T   C/T
rs220598176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535278fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  T    A/T
rs49933875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535408fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP TT      T       C   C/T
rs31907856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535704fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs31907858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89535860fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC C CC C CCTC C   CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31907860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89536181fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPC CCTC C CCCCCCCT CCCC/T
rs31907862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89536396fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCTC CC  CTCC/T
rs31908744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89536557fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA A AAGA A   AGAA/G
rs260714493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89536702fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  G    G/T
rs31908746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89537408fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT T   TCTC/T
rs222018788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89537607fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs31908747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538131fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs31908748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538233fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT G TTGT TT  TGTG/T
rs240703877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538309fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs258170784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538353fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs225633522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538452fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs254078768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538467fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs261470689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538558fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs31908750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538618fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPG GGAG G GGAGGGGA GAGA/G
rs31908752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538980fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPA AAGA A AAAAAA G AAAA/G
rs215636213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89538982fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs31909814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539247fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPC CCTC T CCCCCC T CCCC/T
rs31909816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539458fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPA AAGA G AAAAAAAG AAAA/G
rs31909818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539510fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA   AA A AATA     ATAA/T
rs31909820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539564fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA T AAAA AA  AAAA/T
rs31909822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539604fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs31910684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89539833fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPC CCTC C CCCCCCCT CCCC/T
rs31910686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540159fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTGT TT  TGTG/T
rs236451148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540230fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs31910688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540240fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA G AAAA A   AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31910690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540364fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT G TTGT TT  TGTG/T
rs31910692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540379fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT A TTTT TT  TTTA/T
rs31911544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540614fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPT   CT C TT TT  C TCTC/T
rs220881986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89540925fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs31911546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541101fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT C TT T  T  T TC/T
rs243521378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541381fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  A    A/T
rs254448715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541401fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  C    C/G
rs221956829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541413fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs240636395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541420fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs258492925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541523fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs222377970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541526fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs242019465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541693fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs31911548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541845fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG C GGCG G   GCGC/G
rs31699365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89541917fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP AG   G  G           A/G
rs31911550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89543167fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC C CCTC C   CTCC/T
rs31911552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89543221fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT C TTTT T   TTTC/T
rs31912124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89543660fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA C AACA AA  ACAA/C
rs31912126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544132fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs31912128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544133fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs31912130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544267fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CC C CC  CTCC/T
rs31909364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544356fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs31909365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544607fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA  AAA   AAGA     AGAA/G
rs31909367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89544667fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
2SNPC CCTC C CCCCCCCT CCCC/T
rs31909369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89545424fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT  TTT C TTCT TT  TCTC/T
rs31909371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89545613fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA   AA A  A A A   AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31909372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89545902fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs31909373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546032fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs31910464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546525fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT  TTT T TTCT     TCTC/T
rs31910465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546557fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCT TT  TCTC/T
rs31910467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546614fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC  CCC C CCTC  C  CTCC/T
rs31910469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546745fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG   G  G GGGG     GAGA/G
rs31910471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546793fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT T TT T  T  TGTG/T
rs31910472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546857fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs31911464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89546930fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT T TTGT     TGTG/T
rs31911466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89547026fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC   CC C CCCC     CTCC/T
rs31911468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89547591fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT T  T T      C C/T
rs31911470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89549574fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG G GG G     GT G/T
rs31911471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89550464fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC   CC T CCCC     CC C/T
rs31911473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89550508fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA   AA T AAAA     AA A/T
rs31912195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89550531fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA   AA G AAGA A   AGAA/G
rs31912196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89550970fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA  AAA A AAGA  A  AGAA/G
rs31912198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89551123fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs31912200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89551376fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC C CC   CCTC C   CTCC/T
rs31912201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89552751fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
4SNPCCTCCTTC CCCTCCCC CC C/T
rs50365361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89552855fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP  C                  C
rs31912202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89553479fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG   GG C  G G     GG C/G
rs31913214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554432fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG A GGGG GG  G GA/G
rs31913216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554437fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG  GGG   GGAG GG  G GA/G
rs31913217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554439fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPA AAAA G AAAA AA  AGAA/G
rs31913219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554469fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT C TTTT  T  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31913220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554495fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT TTTT C TTTT TT  TT C/T
rs31913222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554504fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT T TT T  T  TCTC/T
rs31914124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554514fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC   CC A CC C     CC A/C
rs31914126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554720fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG GGGG G GGAG G   GAGA/G
rs31914128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89554777fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC  CCC C CCCC  C  CTCC/T
rs31914130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89555010fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPC CCCC C CCC      CTCC/T
rs107948794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89555039fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNP  C                  C
rs31914132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89555111fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPG   GG A GG G     GA A/G
rs31915004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89555528fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Intron
1SNPT   TT T TTCT     TC C/T
rs31587759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89560308fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Locus-Region
3SNPT C CCC  C CC     TC C/T
rs31915006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89560404fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Locus-Region
1SNPA  AAA A A GA     AG A/G
rs31915007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89560539fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : Locus-Region
1SNPC  CCC T C CC  C  CC C/T
rs31915008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89561126fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 865 bp downstream of
1SNPA  AAA G A AA AA  AA A/G
rs31915009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89561219fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 958 bp downstream of
1SNPA  AAA G A GA  A  AG A/G
rs48042766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562017fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1756 bp downstream of
2SNP TG      G   G  T    G/T
rs51876268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562091fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1830 bp downstream of
2SNP TC      C   C  T    C/T
rs49234916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562093fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1832 bp downstream of
2SNP TG      G   G  T    G/T
rs49250221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562106fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1845 bp downstream of
2SNP AT      T   T  A    A/T
rs46458966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562176fcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1915 bp downstream of
1SNP  T      T           T
rs50204666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:89562176rcmy2 : within coordinates of
Shank3 : 1915 bp downstream of
1SNPC TTCT T T C  T     TC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory