About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Ncstn
nicastrin
MGI:1891700

176 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31581746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064243fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1770 bp downstream of
1SNPC CCCC CCTCC  C CCCC/T
rs30655030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064550fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1463 bp downstream of
6SNPGGGGG AGGAGGGAGGGGGA/G
rs31581745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064598fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1415 bp downstream of
6SNPTTT TTCCT T TCTTTTTC/T
rs31581744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064599fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1414 bp downstream of
1SNPG G G  GGA    G  G A/G
rs31580812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064612fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1401 bp downstream of
1SNPC CCCC AC C  CC CCCA/C
rs31819181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064643fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1370 bp downstream of
5SNP CC   A C   A  C   A/C
rs31580811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064879fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1134 bp downstream of
3SNPGGAGGG  GGAGAGGGGAGA/G
rs31580810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172064908fLootl : within coordinates of
Ncstn : 1105 bp downstream of
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs50044859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065047fLootl : within coordinates of
Ncstn : 966 bp downstream of
4SNP CC   T C   C  C   C/T
rs31580809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065073fLootl : within coordinates of
Ncstn : 940 bp downstream of
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs108867369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065102fLootl : within coordinates of
Ncstn : 911 bp downstream of
1SNP      A G          A/G
rs31580807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065168fLootl : within coordinates of
Ncstn : 845 bp downstream of
5SNPGGGGGGAGGGGGGAGGGGGA/G
rs31580806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065274fLootl : within coordinates of
Ncstn : 739 bp downstream of
4SNPGGGGGGAGGG GGAGGGGGA/G
rs31580805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065337fLootl : within coordinates of
Ncstn : 676 bp downstream of
1SNPT T T  GTGTT T    TG/T
rs48115979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065340fLootl : within coordinates of
Ncstn : 673 bp downstream of
4SNP  T   C T   T  T   C/T
rs31579923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065343fLootl : within coordinates of
Ncstn : 670 bp downstream of
4SNPA AAAACCAC  A AAAA A/C
rs31579922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065370fLootl : within coordinates of
Ncstn : 643 bp downstream of
5SNPT TTTTCCTCTTTCTCTTTC/T
rs49883582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065394fLootl : within coordinates of
Ncstn : 619 bp downstream of
3SNP  A   G A   A  A   A/G
rs46173475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065399fLootl : within coordinates of
Ncstn : 614 bp downstream of
2SNP  T     T   T  T   T
rs48565405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065420fLootl : within coordinates of
Ncstn : 593 bp downstream of
3SNP  C   T C   C  C   C/T
rs49038647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065421fLootl : within coordinates of
Ncstn : 592 bp downstream of
3SNP  C   T C   C  C   C/T
rs49959691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065487fLootl : within coordinates of
Ncstn : 526 bp downstream of
4SNP  A   G A   A  A   A/G
rs108795485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065488fLootl : within coordinates of
Ncstn : 525 bp downstream of
1SNP      G A          A/G
rs46117963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065489fLootl : within coordinates of
Ncstn : 524 bp downstream of
3SNP  G   A G   G  G   A/G
rs48743571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065514fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  G   T G   G  G   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50536461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065531fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNP  G   A G   G  G   A/G
rs31579921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065592fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC ACCCC  C CCCA/C
rs108903087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065625fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP      G A          A/G
rs47890578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065662fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  C   A C   C  C   A/C
rs31579920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065748fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPT TTTT GTTTT TT TTTG/T
rs31579919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065759fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCC  CCGCC CC CCCC/G
rs31579918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065786fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs51563195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065828fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNP  G   T G          G/T
rs31579917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065889fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPA A A GGAA  A AA A A/G
rs46985409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172065906fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  A   C A   A  A   A/C
rs32437269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066058fLootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
5SNP  T   C T   C  T   C/T
rs108623802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066500fLootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
1SNP      G A          A/G
rs31579916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066564fLootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs47883186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066657fLootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
4SNP CC   G C   C  C   C/G
rs31579915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066710fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG GGAGG GG GGGA/G
rs48452308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066755fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
4SNP AA   G A   A  A   A/G
rs47701498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066763fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-NonSynonymous
3SNP TT   C T   T  T   C/T
rs48249803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066768fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-NonSynonymous
4SNP AA   G A   A  A   A/G
rs31579123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066779fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
1SNP  CC C CCC   AC  C A/C
rs51646257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066809fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP AA   G A   A  A   A/G
rs31579122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066873fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPAAAAAAGAAAAAAGAAAAAA/G
rs47792088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066923fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  A   G A   A  A   A/G
rs49098460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172066999fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  A   G A   A  A   A/G
rs31579120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067053fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNPC TCC  CCC CTCCCCTCC/T
rs50928578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067184fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  G   A G   G  G   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs261188962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067606fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP            A  G   A/G
rs218536587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067607fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP            T  C   C/T
rs108934291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067611fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP      T C          C/T
rs31579119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067651fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPTTTTTTAATATTT TTTTTA/T
rs30810797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067918fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
5SNPGGGGGGGGAGGG GG GGGA/G
rs32388209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172067996fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP CC   T C   C  C   C/T
rs31579117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068035fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPTTT T CCTC  TCTT TCC/T
rs32229761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068041fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP GG   A G   G  G   A/G
rs13466163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068213rLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
6SNPCCCCCCTTCC  CTCCCCCC/T
rs31579115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068242fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC CCTCC CC CCCC/T
rs31578263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068896fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPG GGGGAGGG GGAGGGGGA/G
rs31578261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172068975fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs31578260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069499fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPG GGGGTGGGTGGTGGGGGG/T
rs31578259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069573fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPCCCCCCTTCCTCCTCCCCCC/T
rs31501252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069613fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPCCCCCCTCCCT CTCCCCCC/T
rs31578256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069816fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPAAAAAAGGAAGAAGAAAAAA/G
rs30665802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069954fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGCCGGCGGCGGGGGC/G
rs31578255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172069961fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGG GGAGGGA GA G  GA/G
rs31578254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070053fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC TCTCC CC CCCC/T
rs31577303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070231fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGAAGGAGGAGGGGGA/G
rs31550891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070299fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPAAAAAAGGAGGAAGAAAAGA/G
rs31577301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070527fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPCCCCCCACCCA CAAC   A/C
rs30857937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070530fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP AA   G A   A  A   A/G
rs31577300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172070831fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPG GGGG GGAGG GG GGGA/G
rs31421197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071042fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP  T   G T   T  T   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32345529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071123fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP  A   G A   A  A   A/G
rs31577299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071489fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
5SNPGGGGGGAAGGAGGAGGGGGA/G
rs31577298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071762fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPAAAAAAGAAAGAAGAAAAAA/G
rs31577297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071845fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs31577295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071875fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPTTTTTTCCTCCTTCTTTTCC/T
rs31577294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071939fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPCCC C AACAACCACC CCA/C
rs31576273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071950fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPAAA A GAAAG AGAA AAA/G
rs46939731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071989fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNP AA   C A   A  A   A/C
rs46163375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172071992fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP AA   G A   A  A   A/G
rs31576272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072415fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs31576271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072553fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
5SNPA AAAAGGAAGAAGAA AAA/G
rs31576269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072618fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPG GGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs31398850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072744fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPT TTTTCCTTCTTCTTTTTC/T
rs30651264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072760fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPA AAAAGGAAGAAGAAAAAA/G
rs31576268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172072880fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs31576267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172073343fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPC C CCTCCC CCTCCCCCC/T
rs51905300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172073532fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP      C T   T  T   C/T
rs48962895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172073542fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP      C T   T  T   C/T
rs108773811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172073718fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNP      C A   A  C   A/C
rs31576266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172073954fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC CCTCC CC CCCC/T
rs52057855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172074120fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  A   G A   A  A   A/G
rs31576265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172074167fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPG GGGGTGGGTGGTGGGGGG/T
rs242680864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172074511fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP            G  A   A/G
rs31576264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172074625fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNPG GGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs31583012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172074847fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC CCTCC CC CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31583011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075012fLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs31583010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075069fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs31583009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075393fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPA AAAA CAAAA AA AAAA/C
rs13466162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075497rLootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-Synonymous
5SNPC C   T C   C  C   C/T
rs31583007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075536fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs31029020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075786fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPT TTTTCCTTCTTCTTTTTC/T
rs31583006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075905fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPCCCCCCTTCTTCCTCCCCTC/T
rs31500265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172075932fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPTTTTTTCCTTCTTCTTTTTC/T
rs31583005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076043fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGAAGGAGGAGGGGGA/G
rs31583004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076258fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNP TTTT CCTCC TCTT T C/T
rs31582412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076277fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs31582411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076406fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPCCCCCCTCCCTCCTCCCCCC/T
rs31582410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076434fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC CCTCC CC CCCC/T
rs31582409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076525fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPCCCCCCTTCTTCCTCCCCCC/T
rs31582408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076776fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs48830116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076821fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
2SNP      C T          C/T
rs32637805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076856fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
2SNPGGG   A G          A/G
rs31888764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076933fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNPT T   C T   T  C   C/T
rs32310828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076953fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNPA A   G A   A  G   A/G
rs31490057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172076964fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPA A   G A   A  G   A/G
rs51492685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077126fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  A   G A   A  A   A/G
rs31582407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077421fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
3SNPT T T CCTTCT C  TTTC/T
rs31582406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077543fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPT TTTT ATTTT TT TTTA/T
rs31582404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077704fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPTTTTTTCCTTCTTCTTTTTC/T
rs31581383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077732fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPGGGGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31581381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077799fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPT TTTT GTTTT TT TTTG/T
rs31581380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077953fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPAAAAAAGAAAGAAGAAAAAA/G
rs108179545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077996fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP      T C          C/T
rs108790602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172077997fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNP      C T          C/T
rs31518733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078123fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPAAA A GGAAG AGAA AAA/G
rs30770304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078137fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPTTT TTCCTCCTTCTTTTTC/T
rs31581379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078456fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPAAAAAAGAAAGAAGAAAAAA/G
rs32265418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078516fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPTTT   C T   T  T   C/T
rs108629743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078763fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
2SNP      T G          G/T
rs108443505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078765fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
2SNP      G T          G/T
rs31795068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078781fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
2SNPGGG   T            G/T
rs31888776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078899fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP TT   C T   T  T   C/T
rs31581378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172078976fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs30713266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172079198fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP TT   C T   T  T   C/T
rs31317193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172079233fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP CC   T C   C  C   C/T
rs31581376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172079300fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGCGGGCGGCGGGGGC/G
rs31332163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172079625fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPAAA   G A   A  A   A/G
rs32036101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172079638fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNPCCC   A C   C  C   A/C
rs31928810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080002fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP  C   G C   C  C   C/G
rs31818887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080086fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP  C   T C   C  C   C/T
rs32201088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080101fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP  G   A G   G  G   A/G
rs31299960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080117fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP  T   C T   T  T   C/T
rs31581375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080308fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
1SNPG GGGG AGAGG GG GGGA/G
rs31581374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080362fLootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPG G GGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs31472303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172080863fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
4SNP TT   C T   T  T   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30464531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172081402fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs31580402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172081600fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPAAAAAAGGAGGAAGAAAAAA/G
rs32723319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172081718fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
5SNP TT   C T   T  T   C/T
rs31580401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172081760fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPGGGGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs30491162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172082234fCopa : Locus-Region
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Intron
6SNPT TTTTCTTTCTTCTTTTTC/T
rs31580400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172082621fCopa : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Coding-NonSynonymous
4SNPA AAAAGGAGGAAGAGAAAA/G
rs31580399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172082719fCopa : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
6SNPT TTTTCCTCCTTCTCTTCC/T
rs31580398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172082725fCopa : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ncstn : mRNA-UTR
1SNPT T TT CTTTT TT  TTC/T
rs31580396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172082890fCopa : mRNA-UTR
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
6SNPG GGGGAAGGAGGAGGGGGA/G
rs51021933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083121fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
3SNP  T   C T   C  T   C/T
rs32311384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083125fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
2SNPG G   A G   A  G   A/G
rs51313420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083130fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
2SNP  C   A C          A/C
rs31580395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083156fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs31580394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083285fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
1SNPA AAAA CAAAA AA AAAA/C
rs31579733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083608fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
5SNPAAA AACCACCAAC AAACA/C
rs50401990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083709fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
3SNP AA   G A   A  A   A/G
rs49195117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083710fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
3SNP CC   T C   C  C   C/T
rs31579732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172083862fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
1SNPT TTTT ATTTT TT TTTA/T
rs48635486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084087fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
4SNP  C   T C   C  C   C/T
rs30891905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084206fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
5SNP  C   T C   C  C   C/T
rs31579731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084435fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
5SNPGGGGGGAGGGAGGAGGGGGA/G
rs31579730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084467fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
1SNPG GGGG TGGGG GG GGGG/T
rs50234237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084498fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
4SNP TT   C T   T  T   C/T
rs31579729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084522fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs31579728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084622fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
5SNPTTT T CCTTC TCTTTT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31579727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:172084649fCopa : Intron
Lootl : within coordinates of
Ncstn : Locus-Region
5SNPGGG G AAGG  GAGG G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/01/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory