About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Slc12a5
solute carrier family 12, member 5
MGI:1862037

107 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46982458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164958853fSlc12a5 : 1963 bp upstream of1SNP TC      C           C/T
rs33506268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164959148fSlc12a5 : 1668 bp upstream of3SNP GA   G  A   A  G    A/G
rs32917387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164960294fSlc12a5 : 522 bp upstream of3SNP  A   T  A   A  T    A/T
rs29499815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164961525fGm11459 : within coordinates of
Slc12a5 : within coordinates of
3SNPT        C   C  T    C/T
rs265210811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164961966fGm11459 : within coordinates of
Slc12a5 : within coordinates of
1SNP             T  A    A/T
rs32835656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164962641fGm11459 : within coordinates of
Slc12a5 : within coordinates of
3SNP CT   C  T   T  C    C/T
rs33567106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164962850fSlc12a5 : within coordinates of3SNP  C   A  C   C  A    A/C
rs33683964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164963053fSlc12a5 : within coordinates of2SNP AT   T  T           A/T
rs29627118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164963580fSlc12a5 : within coordinates of3SNPAAG      G   G  A    A/G
rs47559622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164963735fSlc12a5 : within coordinates of1SNP  C                  C
rs229089515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164964279fSlc12a5 : within coordinates of1SNP             A  T    A/T
rs245185271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164964281fSlc12a5 : within coordinates of1SNP             A  T    A/T
rs33392393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164966010fSlc12a5 : Locus-Region3SNPCCT   C  T   T  C    C/T
rs48722682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164966344fSlc12a5 : Locus-Region1SNP TG      T           G/T
rs28262042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164966553fSlc12a5 : Locus-Region3SNPGGTG GGG G G  TG  GGGG/T
rs46363745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164966640fSlc12a5 : Locus-Region1SNP CC      C       T   C/T
rs28262041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164966732fSlc12a5 : Locus-Region3SNP CTC T T T C TT CCTCCC/T
rs28262040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164967532fSlc12a5 : Locus-Region1SNP  TT T G   T  T   TGTG/T
rs28262039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164967708fSlc12a5 : Locus-Region1SNP  GG G T   G  G   GTGG/T
rs32929534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164967844fSlc12a5 : Locus-Region3SNPT C   T  C   C  T    C/T
rs33122227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164967858fSlc12a5 : Locus-Region2SNPA G   A  G           A/G
rs33523191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164968730fSlc12a5 : Intron3SNP  T   C      T  C    C/T
rs28262038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164968886fSlc12a5 : Intron1SNP  CC C C   C  CC  CTCC/T
rs28262037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164968906fSlc12a5 : Intron1SNP  CC C T   C  C   CCCC/T
rs28262036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164969110fSlc12a5 : Intron1SNPG GG G G   G  G   GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6360628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164969406fSlc12a5 : Intron2SNPT TT TTGG  T  T   TGTG/T
rs6361746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164969624fSlc12a5 : Intron2SNP  CC CCCT  C  C   CTCC/T
rs6375316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164969813fSlc12a5 : Intron1SNP      T C            C/T
rs28262035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164970336fSlc12a5 : Intron1SNP  CC C T   C  CT  CTCC/T
rs29811512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164970608fSlc12a5 : Intron2SNP T    T  C   C  T    C/T
rs28262034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164971015fSlc12a5 : Intron1SNPA AA   G   A  A   AGAA/G
rs28262033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164971152fSlc12a5 : Intron1SNP  GG G T   G  G   GGGG/T
rs28262032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164972167fSlc12a5 : Intron1SNP  GG G G   G  G   GAGA/G
rs28262031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164972266fSlc12a5 : Intron1SNP  TT T C   T  T   TCTC/T
rs28262030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164972321fSlc12a5 : Intron1SNP  AA   G   A  A   AGAA/G
rs28262029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164972413fSlc12a5 : Intron1SNPT TT T C   TT TT  TTTC/T
rs28262028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164972481fSlc12a5 : Intron1SNPC CC C T   C  C   C CC/T
rs28262027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164973512fSlc12a5 : Intron1SNP  GG G C   G  G   GCGC/G
rs28262026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164973569fSlc12a5 : Intron1SNP  AA A     A  A   ACAA/C
rs28262025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164974338fSlc12a5 : Intron1SNP  CC C T   C  CC  CCCC/T
rs28262024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164975246fSlc12a5 : Intron1SNP  TT T C   T  T   TCTC/T
rs28262023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164975319fSlc12a5 : Intron4SNPGGAG  GG A G AAGG AGGA/G
rs28262022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164975752fSlc12a5 : Intron1SNP  TT   C   T  T   TCTC/T
rs28262021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164976285fSlc12a5 : Intron1SNPG GG G G   G  G   GAGA/G
rs28262020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164976931fSlc12a5 : Intron1SNPA AA A G   A  AG  AGAA/G
rs28262019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164977047fSlc12a5 : Intron4SNPCCTC TCC   C TTTC TCCC/T
rs234247894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164977488fSlc12a5 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs33336311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164978726fSlc12a5 : Intron3SNP CT      T   T  C    C/T
rs50628457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164979908fSlc12a5 : Intron1SNP TT      T       C   C/T
rs49466469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164980076fSlc12a5 : Intron1SNP TT      T       G   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48154211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164980128fSlc12a5 : Intron1SNP AA      A       C   A/C
rs33529823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164980187fSlc12a5 : Coding-NonSynonymous2SNPGGG   G  A       G   A/G
rs28262018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164980864fSlc12a5 : Intron3SNPCCTCTT   TTCTTT C T CC/T
rs28262017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164982215fSlc12a5 : Intron3SNP GAGAA   AAGAAA G A GA/G
rs28262016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164982475fSlc12a5 : Intron3SNPTTCTCC   CCTCCC T C TC/T
rs33338461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164983112fSlc12a5 : Intron3SNP  G   T      G  T    G/T
rs52418381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164983369fSlc12a5 : Intron1SNP  A                  A
rs28262015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164983740fSlc12a5 : Intron2SNPT C C     CT CC C C CC/T
rs48355164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164983849fSlc12a5 : Intron2SNP  C      C   G  C    C/G
rs229055770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164984003fSlc12a5 : Intron1SNP             A  T    A/T
rs28262014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164984476fSlc12a5 : Intron3SNPGGCGC    CCGCCC G C CC/G
rs258003546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164984531fSlc12a5 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs225158682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164984858fSlc12a5 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs33606625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164985147fSlc12a5 : Intron3SNP AG   A  G   G  G    A/G
rs212041382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164985670fSlc12a5 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs229285857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164985704fSlc12a5 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs254024217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164985822fSlc12a5 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs33237045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164986042fSlc12a5 : Intron2SNPAA    G              A/G
rs29539271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164986424fSlc12a5 : Intron2SNP TC   C  C           C/T
rs217568408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164987350fSlc12a5 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs28262013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164987470fSlc12a5 : Intron4SNPCCTTTT   TTCTTT T T TC/T
rs253854100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164987920fSlc12a5 : Intron1SNP             G  T    G/T
rs28262012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164988736fSlc12a5 : Intron4SNPGGAGAAG  AAGAAA G A AA/G
rs28262011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164989255fSlc12a5 : Intron2SNPC CTCC C  CCCCC T C CC/T
rs33573365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164990021fSlc12a5 : Intron3SNP AG      G   G  G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33059807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164990066fSlc12a5 : Intron3SNP TC      C   C  C    C/T
rs244604888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164990074fSlc12a5 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs52137278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164990125fSlc12a5 : Intron2SNP  T      T   T  G    G/T
rs222455404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164990905fSlc12a5 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs238936637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164991419fSlc12a5 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs29958500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164991703fSlc12a5 : Intron3SNP GA   G  A   A  G    A/G
rs225118608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164992617fSlc12a5 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs52537851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164992652fSlc12a5 : Intron1SNP AG                  A/G
rs50662927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164992689fSlc12a5 : Intron2SNP TC          C  C    C/T
rs32982294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164993296fSlc12a5 : Intron1SNP AC      A           A/C
rs52558551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164993307fSlc12a5 : Intron1SNP GC      C           C/G
rs52520565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164993309fSlc12a5 : Intron1SNP GC      G           C/G
rs264641685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164993371fSlc12a5 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs33597088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164993584fSlc12a5 : Intron3SNP GA   G  A   A  G    A/G
rs259254499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164994118fSlc12a5 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs33294849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164994419fSlc12a5 : Intron2SNPAAC   C  C           A/C
rs32989875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164994427fSlc12a5 : Intron3SNPTTG   T  G   G  T    G/T
rs33642393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164995622fSlc12a5 : Intron1SNPC G   C  C           C/G
rs29499715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164995878fSlc12a5 : Intron3SNPAAG   A  G   G  G    A/G
rs33564794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164996627fSlc12a5 : Intron3SNP  G   A  G   G  A    A/G
rs29860332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164997294fSlc12a5 : Intron3SNPG C   G  C   C  G    C/G
rs51776169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164997596fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP  T      T       C   C/T
rs46965941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164997674fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP  T      T       C   C/T
rs52083405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164997801fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP GG      G       A   A/G
rs49326935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164998059fSlc12a5 : mRNA-UTR2SNP A       T   T  AT   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs255789614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164998228fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP             G  A    A/G
rs213699511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164998414fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP             T  C    C/T
rs239918132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164998686fSlc12a5 : mRNA-UTR1SNP             G  T    G/T
rs50935952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164999064fSlc12a5 : mRNA-UTR2SNP CC      C   C  T    C/T
rs33444165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:164999863fNcoa5 : Intron
Slc12a5 : Intron
2SNP AG   G  G           A/G
rs48168259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:165001134fNcoa5 : mRNA-UTR
Slc12a5 : 1407 bp downstream of
2SNP  T      T   T  C    C/T
rs232582030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:165001152fNcoa5 : mRNA-UTR
Slc12a5 : 1425 bp downstream of
1SNP             G  A    A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory