About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Gabbr1
gamma-aminobutyric acid (GABA) B receptor, 1
MGI:1860139

118 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50460203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37181400fGabbr1 : Locus-Region1SNP  CCC     CCCC     CC  TC C/T
rs6395771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37181970fGabbr1 : Locus-Region1SNP       G A                A/G
rs6396740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182114fGabbr1 : Locus-Region1SNP       C T                C/T
rs6396807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182170fGabbr1 : Locus-Region1SNP       G A                A/G
rs45802701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182228fGabbr1 : Locus-Region1SNPC CCC     CCAC     CC  CC A/C
rs6397299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182254fGabbr1 : Locus-Region1SNP       T C                C/T
rs6397736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182292fGabbr1 : Locus-Region1SNP       T C                C/T
rs8237879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37182292fGabbr1 : Locus-Region1SNP  TCTTCTT T   T T    CT   C/T
rs33170780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37185650fGabbr1 : Intron1SNP GG       A               A/G
rs8237882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37185814rGabbr1 : Intron1SNP  AGAAGAA     AAAAA  GA   A/G
rs8237881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37185846rGabbr1 : Intron1SNP  GGGGGG      GAGGG  GG   A/G
rs8237880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37185988rGabbr1 : Intron1SNP  AAAAAAG     AAAAA  AA   A/G
rs33508895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37192557fGabbr1 : Intron1SNPG G    A  G               A/G
rs33376630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37194430fGabbr1 : Intron1SNPGGA    G  G               A/G
rs52193393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37194667fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCAC     CC  CCCA/C
rs49857429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37194717fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C G CCCC     CC  CCCC/G
rs33227917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37194946fGabbr1 : Intron2SNP  TT  TTT ATTT      T  TTTA/T
rs51395523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195179fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTCT     TT  TTTC/T
rs50196693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195233fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     CC  CTCC/T
rs51780593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195495fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC     CC  CCCC/T
rs49827328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195588fGabbr1 : Intron1SNPC CAC A C CC C     CC  A CA/C
rs49325631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195590fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTCT     TT  TCTC/T
rs46402256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195653fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA     AA  AAAA/G
rs49589178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195836fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AAGA     AA  AGAA/G
rs51956527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195879fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     CC  CACA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46716389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37195905fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTTT     TT  TATA/T
rs46586720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37196051fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs51852647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37196245fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AAGA     AA  AAAA/G
rs52515805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37196282fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GGGA/G
rs52361343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37197136fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C G CCGC     CC  CGCC/G
rs49613418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37197226fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTTT     TT  TTCC/T
rs33360942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37197470fGabbr1 : Intron2SNPTTTTC TCT CTCT     TT  CCTC/T
rs33238680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37197511fGabbr1 : Intron1SNP TT    C  T               C/T
rs33722559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37198597fGabbr1 : Intron1SNPT T    C  T               C/T
rs33241551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37198794fGabbr1 : Intron2SNPT TTC TCC CCCT     TT  CCTC/T
rs33261514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37198832fGabbr1 : Intron1SNP  T    C  T               C/T
rs33224342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37198845fGabbr1 : Intron1SNP  A    G  A               A/G
rs46917653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199034fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GCGC/G
rs48625689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199046fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     CC  CTCC/T
rs47763887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199069fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GGAA/G
rs48070142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199222fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTTT     TT  TCTC/T
rs51420413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199362fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs33404465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199388fGabbr1 : Intron2SNPTTTTT TGG TTGT     TT  TGTG/T
rs49210321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37199778fGabbr1 : Intron1SNPT CTC T C CCCC     TC  CCCC/T
rs33555338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37200051fGabbr1 : Intron1SNP  G    A  G               A/G
rs49793337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37200764fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T G TTGT     TT  TGTG/T
rs50988576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37200828fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTCT     TT  TTTC/T
rs48140568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201036fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCCC     CC  CTCC/T
rs47304823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201248fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT     TT  TCTC/T
rs50382601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201299fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52495083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201395fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA     AA  AAAA/G
rs33080594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201430fGabbr1 : Intron2SNPG GGG GAA GGAG     GG  GAGA/G
rs47300399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201431fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T C TTTT     TT  TTTC/T
rs47568412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201539fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC     CC  CCCC/T
rs45640577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201606fGabbr1 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C C CTCC     CC  CCCC/T
rs51531058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201711fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GGGA/G
rs50257906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37201942fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
rs6291904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37202813fGabbr1 : Intron1SNP       C T                C/T
rs6292360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37202847fGabbr1 : Intron1SNP       T C                C/T
rs6292393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37202869fGabbr1 : Intron1SNP       C T                C/T
rs6292395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37202874fGabbr1 : Intron1SNP       C T                C/T
rs6293015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37202988fGabbr1 : Intron1SNP       C A                A/C
rs6196445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203217fGabbr1 : Intron1SNP       C T                C/T
rs6196977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203291fGabbr1 : Intron1SNP       T A                A/T
rs6196978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203291fGabbr1 : Intron1SNP       A T                A/T
rs51401856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203408fGabbr1 : Intron1SNP   T  T G T  T      T  T TG/T
rs49633600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203439fGabbr1 : Intron1SNP   A    T   AA      A    AA/T
rs47891120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203450fGabbr1 : Intron1SNPA AA  A G   GA     AA   AAA/G
rs47803870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203510fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A G AGGA     AA  AAAA/G
rs46253706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37203596fGabbr1 : Intron1SNPA AAT A A TAAA     AA  TAAA/T
rs48409775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204082fGabbr1 : Intron1SNPC CCA C C ACCC     CC  AACA/C
rs29504123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204117fGabbr1 : Intron1SNP TT    C  T               C/T
rs29536896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204347fGabbr1 : Intron1SNP TT    A  T               A/T
rs3725428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204488fGabbr1 : Intron2SNPGGG    A  G               A/G
rs3725488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204518fGabbr1 : Intron1SNPA      G                  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33140065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204551fGabbr1 : Intron1SNP CC    T  C               C/T
rs33132725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204656fGabbr1 : Intron1SNP CC    C  T               C/T
rs3653377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37204739fGabbr1 : Coding-Synonymous1SNPA      G                  A/G
rs47980612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37205110fGabbr1 : Intron1SNPA AAG A A GAAA     AA   AAA/G
rs49265115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37205264fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GG A/G
rs47071992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37205496fGabbr1 : Intron1SNPG GGA G G AGGG     GG  AGGA/G
rs48305453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37205681fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AACA     AA  AAAA/C
rs49605558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37206379fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
rs48646155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37206398fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGTG     GG  GGGG/T
rs47470901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37206824fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AAAA     AA  AGAA/G
rs45697881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37206891fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCAC     CC  CCCA/C
rs45957813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207270fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AAAA     AA  AGAA/G
rs51817502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207309fGabbr1 : Intron1SNPA AAC   C CCCA     AA  CC A/C
rs52026362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207314fGabbr1 : Intron1SNP  G G   G GGAG         GG A/G
rs48717783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207439fGabbr1 : Intron1SNPA AAA A A AAGA     AA  AAAA/G
rs47760255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207496fGabbr1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GGGA/G
rs3712587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207559fGabbr1 : Intron2SNPT TTC TCC CCCT     TT  CCTC/T
rs49627283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207622fGabbr1 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs50951556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207775fGabbr1 : Intron1SNPT TT  T     CT     TT   CTC/T
rs50902002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37207782fGabbr1 : Intron1SNPC CCT C T T CC     CC  T CC/T
rs50377166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37208244fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs33208606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37208636fGabbr1 : Intron1SNP AA       C               A/C
rs33271577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37208730fGabbr1 : Intron1SNP AA    A  G               A/G
rs33206270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37208733fGabbr1 : Intron1SNP AA    A  G               A/G
rs51168420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37208762fGabbr1 : Intron1SNPT TTT T T TTAT     TT  TT A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33354969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209139fGabbr1 : Coding-Synonymous2SNPAAAAG AAG GGGA     AA   GAA/G
rs50686390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209169fGabbr1 : Coding-Synonymous1SNPT TTT T T TTCT     TT  TTTC/T
rs33599921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209347fGabbr1 : Intron1SNP G     G  A               A/G
rs51029094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209490fGabbr1 : Intron1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs33644524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209531fGabbr1 : Intron1SNPCC     C  A               A/C
rs29517571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37209544fGabbr1 : Intron1SNPGG     G  A               A/G
rs33247462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210168fGabbr1 : mRNA-UTR2SNPCCCC  CC  TCTC     CC  C CC/T
rs33665605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210313fGabbr1 : mRNA-UTR2SNPTTTT  TTG GGGT     TT  GGTG/T
rs51071577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210515fGabbr1 : mRNA-UTR1SNPG GG  G   AAAG     GG   AGA/G
rs33326967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210609fGabbr1 : mRNA-UTR1SNP GG       A               A/G
rs33580127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210633fGabbr1 : mRNA-UTR2SNPCCCC  C G GGGC     CC   GCC/G
rs33246434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210655fGabbr1 : mRNA-UTR2SNPAAAAG A G GGGA     AA  GG A/G
rs51326390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37210834fGabbr1 : mRNA-UTR1SNPC CCC C C CCTC     CC  CCCC/T
rs33392754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37211167fGabbr1 : mRNA-UTR2SNPAAAAG AAG GGGA     AA  GGAA/G
rs33244971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37211287fGabbr1 : Locus-Region2SNPGGGGC GGC CCGG     GG   C C/G
rs33377176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37211381fGabbr1 : Locus-Region1SNPGGG    G  T               G/T
rs45710980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37211414fGabbr1 : Locus-Region1SNPG GGG G G GGAG     GG  GGGA/G
rs33231500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr17:37211507fGabbr1 : Locus-Region2SNPAAAAG AA  GGGA     AA  GG A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory