About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Icos
inducible T cell co-stimulator
MGI:1858745

144 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29752476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60976034f 1SNP A AA AAGG AA  A     A/G
rs29752479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60976364f 1SNP G TT  TTG T   T     G/T
rs3161942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60976427f 1SNP   GG  GGG G   C     C/G
rs29753434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60976442f 1SNP G AA  AAA A   A     A/G
rs29753437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60976960f 1SNP G  A  GGG A   A     A/G
rs29753440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60977122f 1SNP   CC  CGG C   C     C/G
rs29753443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60977951f 1SNP   TT  CCT T   T     C/T
rs3161944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60977978f 1SNP G AA  GGG A   G     A/G
rs29754348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978296f 1SNP   TT  CTC T   T     C/T
rs29754351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978338f 1SNP C C   CCT C   C     C/T
rs29755134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978426f 1SNP   AA ATTT AA  A     A/T
rs3161945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978578f 1SNP G G   GGG G   T     G/T
rs29755139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978737f 1SNP C AA  AAC A   A     A/C
rs29755142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978790f 1SNP G  A  AAG A   A     A/G
rs3161946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60978852f 1SNP G AA  GGG AA  G     A/G
rs29755837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60979030f 1SNP G GG  GGA GG  G     A/G
rs29755840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60979071f 1SNP G GG GAAG GG  G     A/G
rs29755843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60979138f 1SNP C CC  ACC CC  C     A/C
rs29748916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980006f 1SNP A AA  AAC A   A     A/C
rs29748919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980121f 1SNP A  G  GGG G   G     A/G
rs29748922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980400f 1SNP G GG GGAG GG  G     A/G
rs3157946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980656f 1SNP T CC  TCT C   T     C/T
rs29749657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980869f 1SNP T TT TTTG T   T     G/T
rs29749660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60980911f 1SNP C TT  CTT T   T     C/T
rs29749663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60981343f 1SNP T TT  CTT T   T     C/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29750546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60981598f 1SNPC  CCCCTTTCCCCCC     C/T
rs29750549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60981612f 1SNPCT CCCCTCCCCCCCC     C/T
rs3157948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60981737f 1SNPTT  GTTGG TGTTTT     G/T
rs29751534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982201f 1SNPAA  AAAAC AAAAAA     A/C
rs29751537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982246f 1SNPTT  TTTTC TTTTTT     C/T
rs29751540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982262f 1SNPCC  CCCTC CCCCCC     C/T
rs29751543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982287f 1SNPCC CCCCCTTCCCCCC     C/T
rs29752506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982388f 1SNPG   GGGTG GGGGGG     G/T
rs29752509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982404f 1SNPTT TTTT G TTTTTT     G/T
rs29752512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982411f 1SNP C  CCCT   CCCCC     C/T
rs29753285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982451f 1SNPCT CCCCTCCCCCCCC     C/T
rs29753288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982463f 1SNPT   TTTATTTTTTTT     A/T
rs29753291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982616f 1SNPTT TTTTCC TTTTTT     C/T
rs29754244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60982855f 1SNPGG  GGGGC GGGGGG     C/G
rs29754247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60983108f 1SNPTT TTTT CCTTTTTT     C/T
rs3161948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60983292f 1SNPGG  AGG GGGAGGGG     A/G
rs29754252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60983383f 1SNPAA AAAA C AAAAAA     A/C
rs29755045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60983942f 1SNPAG  AAA G AAAAAA     A/G
rs29755048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60984296f 1SNPA   AA  GG AA  A     A/G
rs29755051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60984509f 1SNPCC  CCC TTCCCCCC     C/T
rs29755764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60984559f 1SNPA   AAA C AAAAAA     A/C
rs29755767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60984953f 1SNPAA  AAA AGAAAAAA     A/G
rs29755770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60985088f 1SNPTT TTTT CCTTTTTT     C/T
rs29755773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60985849f 1SNPGG GGGGGAGGGGGGG     A/G
rs3161949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60985943f 1SNPTT TATTTTTTATTTT     A/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3162164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986029f 1SNPA   GA AA  GA AA     A/G
rs3158193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986074f 1SNPCT CTCCTT CTCCCC     C/T
rs29748997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986222f 1SNPCC  CCCCT CCCCCC     C/T
rs3157950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986246f 1SNPCC  ACCCCCCACCCC     A/C
rs29749002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986403f 1SNPCC CCCCTCCCCCCCC     C/T
rs3157951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60986490f 1SNPGG  AGGGGGGAGGGG     A/G
rs3162173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60987124f 1SNPA   GAAGG AGAAAA     A/G
rs29749989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60987301f 1SNPGG  GGGGA GGGGGG     A/G
rs3158211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989201f 1SNPA   GAAGG AGAAAA     A/G
rs29751304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989367f 1SNPGG GGGGAGGGGGGGG     A/G
rs29751307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989391f 1SNPA   AAAGA AAAA A     A/G
rs3157953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989427f 2SNPTC TCTTCC TCTTTT CT  C/T
rs29751312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989610f 1SNPGG GGGGGC GGGGGG     C/G
rs3157954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989630f 1SNPAT  TAATT ATAAAA     A/T
rs212899570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60989943f 1SNP                 TC  C/T
rs29752237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990055f 1SNPAA  AAAAT AAAAAA     A/T
rs29752240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990165f 1SNPA  AAAAAG AAAAAA     A/G
rs3162195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990181f 1SNPTT TCTTCTTTCTTTT     C/T
rs29753345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990494f 1SNPCC  CCCCT CCCCCC     C/T
rs29753348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990512f 1SNPCC CCCCCT CCCCCC     C/T
rs3158229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990527f 1SNPA   GAAGG AGAAAA     A/G
rs3158231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990546f 1SNPCG  GCCGG CGCCCC     C/G
rs3158236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990872f 1SNPGG  TGGGGGGTGGGG     G/T
rs29754377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60990973f 1SNPA   AAAACAAAAAAA     A/C
rs29754380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60991002f 1SNPCC CCCCCCTCCCCCC     C/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29754383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60991017f 1SNPT   TTTTGTTTTTTT     G/T
rs3162202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60991058f 1SNPTG  GTTGGGTGTT T     G/T
rs29755168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60991775f 1SNPGG  GGGGAGGGGGGG     A/G
rs3158242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60991900f 1SNPAA  GAAGGGAGAAAA     A/G
rs29755173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992041f 1SNPGG  GGGGAGGGGGGG     A/G
rs29756126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992094f 1SNPC   CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29756129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992163f 1SNPC   CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29756132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992229f 1SNPGG  GGGGAGGGGGGG     A/G
rs29756975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992534f 1SNPCC  CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29756978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992726f 1SNPA   AAAA C AAA A     A/C
rs3157956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992810f 1SNPTT  ATTTTTTATTTT     A/T
rs29749056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60992865f 1SNPC  CCCCCTCCCCCCC     C/T
rs31422130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993096f 1SNPC C   C         C    C
rs29749059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993221f 1SNPG  GGGGGTGGGGGGG     G/T
rs29749062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993283f 1SNPCC CCCCCCTCCCCCC     C/T
rs29749965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993319f 1SNPGG  GGGGTTGGGGGG     G/T
rs3157957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993357f 1SNPGG  TGGGGGGT GGG     G/T
rs29749970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993522f 1SNPAG AAAAAGAAAAAAA     A/G
rs29749973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993535f 1SNPCC CCCCCGCCCCCCC     C/G
rs29750926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993748f 1SNPT   TTTTCTTTTTTT     C/T
rs4222390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993832r 1SNPGAGG GG            G A/G
rs4222389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993919r 1SNPGAGG GG            G A/G
rs4222388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993922r 1SNPAGAA AA            A A/G
rs4222387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60993923r 1SNPTGTT TT            T G/T
rs4222386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994082r 2SNPTGTTTTTTGTTTTTTT   T G/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4222385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994092r 1SNPGAGG GG            G A/G
rs29750931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994200f 1SNPTT  TTTTCTTTTTTT     C/T
rs29751844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994311f 1SNPG   GGGGAGGGGGGG     A/G
rs29751847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994394f 1SNPAA  AAAAGAAAAAAA     A/G
rs29751850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994419f 1SNPC   CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29751853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994485f 1SNPG   GGGGAGGGGGGG     A/G
rs3162138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994836f 1SNPTT TCTTTTTTCTTTT     C/T
rs29752868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60994912f 1SNPGG  GG GTGGGGGGG     G/T
rs29752871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60995005f 1SNPCC  CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29753864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60995017f 1SNPTT TTTTTCTTTTTTT     C/T
rs29753866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60995048f 1SNPTT  TTTTCTTTTTTT     C/T
rs29753869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60996381f 1SNP      AA G AA  A     A/G
rs3161953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60996658f 1SNPA   TAAAAAATAAAA     A/T
rs29754914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60997191f 1SNPGG GGGGGGAGGGGGG     A/G
rs29754917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60997271f 1SNPGG GGGGGGAGGGGGG     A/G
rs29754920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60997556f 1SNPAA AAAAAAGAAAAAA     A/G
rs29754923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60997571f 1SNPA   AAAAGGAAAAAA     A/G
rs29755586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60998139f 1SNPA   AAAAGAAAAAAA     A/G
rs29755589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60998223f 1SNPCC  CCCTCCCCCCCC     C/T
rs29755592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60998707f 1SNPGG  GGGGAGGGGGGG     A/G
rs3158189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60998807f 2SNPGG GAGGGGGGAGGGG AG  A/G
rs29756487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60998959f 1SNPA  AAAAAGGAAAAAA     A/G
rs29756490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999017f 1SNPGG  GGGTGGGGGGGG     G/T
rs29756493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999302f 1SNPGG  GGGGAAGGGGGG     A/G
rs29757566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999348f 1SNPGG  GGGGGAGGGGGG     A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29750036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999551f 1SNPA   AAAAG AAAAAA     A/G
rs29750039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999582f 1SNPTT  TTTTTCTTTTTT     C/T
rs29750042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999672f 1SNPTT  TTTTGGTTTTTT     G/T
rs29750835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999749f 1SNPAA  AAAAAGAAAAAA     A/G
rs3158190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:60999974f 1SNP                 AT  A/T
rs29750838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61000399f 1SNPTT TTTTTGTTTTTTT     G/T
rs29750841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61000622f 1SNPAA AAAAGAAAAAAAA     A/G
rs29751814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61000725f 1SNPTT TTTTTAATTTTTT     A/T
rs29751817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61000915f 1SNPAA AAAAATAAAAAAA     A/T
rs29751820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61000928f 1SNPC  CCCCCCTCCCCCC     C/T
rs29751823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001107f 1SNPCC  CCCCTCCCCCCC     C/T
rs29752766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001184f 1SNPTT TTTTTCTTTTTTT     C/T
rs29752769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001447f 2SNPAA  AAAA TAAAAAAA   TA/T
rs29752772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001638f 1SNPTT TTTTTGTTTTTTT     G/T
rs29753695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001721f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG     A/G
rs29753698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001792f 1SNPTT  TTTTCTTTTT T     C/T
rs29754704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61001968f 1SNPCT  CCCCTTCCCCCC     C/T
rs29754707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61002077f 1SNPTT  TTTTCCTTTTTT     C/T
rs29754710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:61002104f 1SNPTT TTTTTCTTTTTTT     C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/26/2016
MGI 6.03
The Jackson Laboratory