About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
C1ra
complement component 1, r subcomponent A
MGI:1355313

67 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48134852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124511184fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AAGA      A        A      A     A A/G
rs48378616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124511215fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AAGA      A        A      A     A A/G
rs45727216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124511458fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC      C        C      C C   C C/T
rs47519218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124511764fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC      C        C      C C   A A/C
rs46175030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124512114fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC      C        C      C C   C C/T
rs48517295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124512192fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AACA      A        A      A A   A A/C
rs51991366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124512441fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA      A        A      A G   A A/G
rs50965339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124512574fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA      A        A      A G   A A/G
rs48283263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124512899fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG      G        G      G G   G A/G
rs49439266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124513054fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   T AATA      A        A      A T     A/T
rs49827647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124513255fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT      T        T      T C   T C/T
rs48931061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124513262fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG      G        G      G C   G C/G
rs46949783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124513330fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TT T      T        T      T C   T C/T
rs51733466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124513860fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCCC      C        C        T     C/T
rs46457722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124514501fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   G CCGC      C        C        G     C/G
rs50225560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124514557fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG G G    A  AA       G        G        A     A/G
rs107984977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124516068fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP A         G                                 A/G
rs108855723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124516074fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP C         T                                 C/T
rs107809176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124516079fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP           C                                 C
rs108576524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124516120fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP           G                                 G
rs108858114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124516121fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP           C                                 C
rs47991004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517180fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNPC CCCC   T CCCC      C        T    C C C   C C/T
rs108386075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517237fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                                   G         G
rs108550814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517276fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                                   A         A
rs48296480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517277fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNPG GGGG   G GGGG      G        G    G G A   G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108239357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517283fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                                   T         T
rs108040231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517295fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                                   T         T
rs108811057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517302fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                                   A         A
rs49412490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517542fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA   A    G  GA       A        G        A   A A/G
rs48283782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124517560fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC   C    G  GC       C        G        C     C/G
rs33893791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124518033fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
4SNPC AAAAC  A AAAA   C  C        CA     A A   A A/C
rs33893585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124518304fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPAAG   A    G      A            G             A/G
rs51380664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124518982fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG      G        G      G A   G A/G
rs46312207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519369fC1ra : Coding-Synonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   C GG G      G        C            G C/G
rs13459162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519391fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
5SNP ACCCCA  C CCCCA  A           AC     C C   C A/C
rs51143203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519398fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GG G      G        G      G A   G A/G
rs51588488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519535fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   A CC C      C        C      C     C A/C
rs46446842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519816fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCCC      C        C      C C   C C/T
rs45712284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519926fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGCG      G        G      G G   G C/G
rs49348179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124519997fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT      T        T      T C   C C/T
rs46992445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124520130fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP  G  G   G  GA       A        G      G A   G A/G
rs46558929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124520333fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA A A    T  AAA      A        A      A A     A/T
rs33893961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124520777fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPG T   G    T      G            T   T         G/T
rs46679941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124521250fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CC C      C        T      C C   C C/T
rs49219416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124521353fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG      G        G      G A   G A/G
rs29828809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124521406fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GT   G    T                                 G/T
rs30954582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124521431fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPGGAAAAG  A AAAA               G      A A     A/G
rs13479036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124521720fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
5SNPAAG   AA GAGGA AGAAAGAA A   AAAG  AA G A A A A/G
rs108769812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124522165fC1ra : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP  T                                          T
rs49709598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124522450fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AACA      A        A      A C   A A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50094885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124522533fC1ra : Coding-Synonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC      C        C      C T   C C/T
rs47685416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124522690fC1ra : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGGG      G        G      G G   G A/G
rs48180287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523079fC1ra : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AACA      A        A      A C   A A/C
rs45765599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523125fC1ra : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTAT      T        T      T A   T A/T
rs49284752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523137fC1ra : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTCT      T        T      T C   T C/T
rs45913866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523156fC1ra : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTCT      T        T      T C   T C/T
rs30512793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523516fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
4SNPCCTTTTC  C TTCT   C  C        CT     T C   C C/T
rs46778502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124523584fC1ra : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AA A      A        A      A G   A A/G
rs51255977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524253fC1ra : 813 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT CCCC   T  CT       T        T      C     T C/T
rs254482800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524255fC1ra : 815 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                  T            G             G/T
rs265867391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524257fC1ra : 817 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNP                  C            T             C/T
rs49225006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524499fC1ra : 1059 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCAC      C        C      C A   C A/C
rs47635347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524569fC1ra : 1129 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTCT      T        T      T C   T C/T
rs13479037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124524799fC1ra : 1359 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
4SNPCCAAAAC AAAAAAA A C  C A AAA C AAAAAAAA A AAAA/C
rs49165776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124525159fC1ra : 1719 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTTT      T        T      T G   T G/T
rs30755884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124525216fC1ra : 1776 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
4SNPGGAAAAG  A AAAA   G  G        AA     A A   G A/G
rs30663960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:124525244fC1ra : 1804 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
4SNPTTCCCCT  T CCCC   T  T        TC     C C   T C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/26/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory