About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
B3galnt1
UDP-GalNAc:betaGlcNAc beta 1,3-galactosaminyltransferase, polypeptide 1
MGI:1349405

126 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50816448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572594f 1SNP                 CG C/G
rs30451955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572858f 3SNPC T   C          TC C/T
rs31014640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572887f 1SNPTC TTTTTTCTTTTTT    C/T
rs31014642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572890f 1SNPC  CCCCCT CCCCCC    C/T
rs31015464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572912f 1SNP A GGGGGGAGG GGG    A/G
rs30402977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573142f 3SNPA G   A   A      GA A/G
rs30809270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573385f 4SNPGAA GGGGAAGAGAGA AG A/G
rs30107257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573634f 3SNPT C   T   T      CT C/T
rs31489967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573644f 3SNPT C   T   T      CT C/T
rs30214613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573650f 3SNPC G   C   C      GC C/G
rs31015467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573755f 1SNPGG GGGGGCGGGGGGG    C/G
rs31015469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573947f 2SNPC   CTTTTTT TCTC TC C/T
rs30400884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574278f 4SNPT C TTTTC TCTCTC CT C/T
rs31015472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574325f 1SNPTT  TTTTTTTCTCTC    C/T
rs31016354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574332f 1SNPCC  CCCCCTC CCCC    C/T
rs31016356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574792f 1SNPC  CCCCCT C CCCC    C/T
rs13459924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574843r 3SNPG A       G     GAG A/G
rs31016358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575111f 1SNPGA GGGGGGAGGGGGG    A/G
rs31016360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575189f 1SNPGG GGGGGGGG GAGG    A/G
rs31016362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575399f 4SNPAGG A AAGGA  AAAAGA A/G
rs31016363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575955f 1SNPCT CCCCCCCCCCCCC    C/T
rs31017225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576045f 1SNPT   TTTTTCT TTTT    C/T
rs33861864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576480f 3SNPC T   C   C     CTCCC/T
rs31017227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576532f 1SNPCA CCCCCCCCCCCCC    A/C
rs51079618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576670f 1SNPA     A         A  TA/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31017228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576855f 1SNPC  CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs30758156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576998f 3SNPC T   C          TC C/T
rs30569509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69577587f 3SNPC T   C         CTC C/T
rs31017230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69578005f 1SNPCT CCCCCCCCCCCCC    C/T
rs51320977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69578465f 2SNP      A         AGA A/G
rs52175708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579078f 2SNP                ATA A/T
rs52376239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579122f 2SNP      A          AC A/C
rs31017232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579635f 1SNPCG CCCCCCGCCCCCC    C/G
rs51374343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579743f 2SNPG     G         GAG A/G
rs31017964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579827f 1SNPGG GGGGGTGGGGGGG    G/T
rs31009764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579908f 1SNPTT TTTTTC TTTTTT    C/T
rs31009766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580311f 1SNPTT TTTTTCTTTTTTT    C/T
rs31728407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580603f 2SNPA G   G         GGA A/G
rs31009768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580654f 1SNPT  TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs31009770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580897f 1SNPA  AAA AGAAAAAAA    A/G
rs30899291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581109f 3SNPC T   C         CTC C/T
rs31009772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581525f 1SNPCC CCCCCCGCCCCCC    C/G
rs30506169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581588f 3SNPC G   C   C     CGC C/G
rs31010704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581613f 1SNPC   CCCCT CCCCCC    C/T
rs31010705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581911f 1SNPC   CC CT C  CCC    C/T
rs31010706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582086f 1SNPAG AAAAAGGAAAAAA    A/G
rs46578637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582402f 1SNP      C             C
rs51107165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582885f 2SNP      T          CT C/T
rs49305705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583071f 2SNPA     A         AGA A/G
rs230039953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583192f 1SNP                 CT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs258409387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583362f 1SNP                 CT C/T
rs47526728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583878f 1SNPC     C         C  AA/C
rs30118487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583979f 3SNP  A   C         CAC A/C
rs31010708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69584317f 1SNPC  CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs49846517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69585344f 1SNP      T             T
rs51104376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69585395f 2SNP      A          GA A/G
rs52256548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586076f 2SNP      G         GAG A/G
rs31010709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586576f 1SNPA   AAAAG A  AAA    A/G
rs31010711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586687f 1SNPT  TTTTTTGTTTTTT    G/T
rs31010712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587351f 1SNPA   AAAAC A AAAA    A/C
rs30120222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587789f 3SNP  G   T   T     TGT G/T
rs50557117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587979f 2SNP      C         CTC C/T
rs47616200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587980f 2SNP                AGA A/G
rs31011964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588056f 3SNPT  TTTTTCCTCTCTCTCT C/T
rs31011966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588161f 3SNP       AGG      AGA A/G
rs31011967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588419f 1SNPC  CCCCCCTCCCCCC    C/T
rs31011969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588436f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs31011970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588733f 1SNPC  CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs31011972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588791f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs31012994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588927f 1SNPT  TTTTTGTTTTTTT    G/T
rs31012996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588949f 1SNPG  GGGGGA GGGGGG    A/G
rs31012998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589155f 1SNPC  CCCCCCC CCCCT    C/T
rs31013000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589186f 1SNPC   CCCCC C CTCT    C/T
rs31013002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589398f 1SNPG   GGGGC GGGGGG    C/G
rs49703732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590640f 2SNP      T          AT A/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46913420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590662f 2SNP      C          TC C/T
rs234928437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590937f 1SNP                 GA A/G
rs31013824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591017f 1SNPA   AAAAGAA AAAA    A/G
rs47687842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591143f 2SNPT     T         TAT A/T
rs31013826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591245f 1SNPG  GGGGGA GGGGGG    A/G
rs31013828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591247f 1SNPG  GGGGG AGGGGGG    A/G
rs50199267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591290f 2SNP      C         CAC A/C
rs31013830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591673f 1SNP    CCCCT CC CCC    C/T
rs31013832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591803f 3SNPT  TTTTTCCTCTCTCTCT C/T
rs31014664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591911f 1SNPC  CCCCCACCCCCCC    A/C
rs31014666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591945f 1SNPA   AAAAGAAAAAAA    A/G
rs31014668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591987f 1SNPC  CCCCCTCCCCCCC    C/T
rs31014669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592553f 1SNPC   CCCCACCCCCCC    A/C
rs31014671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592744f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs31014673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592930f 1SNPA   AAAAGAAAAAAA    A/G
rs31006993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592982f 2SNPC T              TC C/T
rs31015345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592983f 1SNP       TCT          C/T
rs31015348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593526f 1SNPC  CCCCCCCC CTCT    C/T
rs31015350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593795f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs31015351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593891f 1SNPG  GGGGGAGGGGGGG    A/G
rs30313471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594190f 3SNPC T   C   C      TC C/T
rs46106244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594262f 2SNPC     C          GC C/G
rs49756746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594513f 2SNPG     G         GTG G/T
rs31015353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594922f 2SNPG   GG GA GA A A AG A/G
rs31016165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594971f 1SNP   GGGGGAGGA A A    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31016167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595170f 3SNPT   TTTTCTTCTCTC CT C/T
rs46422963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595250f 1SNP      T             T
rs48704472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595271f 2SNP      C          TC C/T
rs48219085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595276f 2SNP      C          TC C/T
rs50555599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595345f 1SNP      A             A
rs46279338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595348f 1SNP      C             C
rs31016169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595412f 3SNPC  CCCCCACCACACA AC A/C
rs51090628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595462f 2SNPA     A          TA A/T
rs47244337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595483f 1SNP      G             G
rs49744623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595626f 2SNPG     G          AG A/G
rs50092599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595732f 2SNPG     G          AG A/G
rs45642435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595827f 2SNPG     G          AG A/G
rs234863698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595912f 1SNP                 TC C/T
rs49890606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596030f 2SNPT     T          CT C/T
rs46386722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596032f 2SNPA     A          GA A/G
rs45840666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596063f 2SNPG     G          AG A/G
rs262403564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596324f 1SNP                 TC C/T
rs51542899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596333f 1SNPA     A         A   A
rs46907603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596342f 1SNPA     A         A   A
rs47704222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596731f 2SNPG     G         GAG A/G
rs47086369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596766f 2SNPG     G         GAG A/G
rs49667656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596877f 2SNPA     A         AGA A/G
rs47909570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596972f 1SNPA     A             A
rs31485065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69598465f 3SNPC G   C         CGC C/G
rs33862289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69598606f 1SNPC     G         G   C/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs242113427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69599315f 1SNP                 AG A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/22/2016
MGI 6.04
The Jackson Laboratory