About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
B3galnt1
UDP-GalNAc:betaGlcNAc beta 1,3-galactosaminyltransferase, polypeptide 1
MGI:1349405

126 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50816448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572594fB3galnt1 : 1592 bp downstream of1SNP            C  G    C/G
rs30451955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572858fB3galnt1 : 1328 bp downstream of3SNP  C   T C   T  C    C/T
rs31014640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572887fB3galnt1 : 1299 bp downstream of1SNPT TTTT CTTTT TT  TCTC/T
rs31014642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572890fB3galnt1 : 1296 bp downstream of1SNPC CCCC  CCTC CC  C CC/T
rs31015464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69572912fB3galnt1 : 1274 bp downstream of1SNPG GGGG A  GG GG  GAGA/G
rs30402977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573142fB3galnt1 : 1044 bp downstream of3SNPA A   G A   G  A    A/G
rs30809270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573385fB3galnt1 : 801 bp downstream of4SNPG GG GAAGGAAAGAG GAAA/G
rs30107257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573634fB3galnt1 : 552 bp downstream of3SNPT T   C T   C  T    C/T
rs31489967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573644fB3galnt1 : 542 bp downstream of3SNPT T   C T   C  T    C/T
rs30214613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573650fB3galnt1 : 536 bp downstream of3SNPC C   G C   G  C    C/G
rs31015467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573755fB3galnt1 : Locus-Region1SNPG GGGG GGGCG GG  GGGC/G
rs31015469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69573947fB3galnt1 : Locus-Region2SNPT TC T  CTT TTCC TTCC/T
rs30400884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574278fB3galnt1 : mRNA-UTR4SNPT TT TC TTCCCTCT T CC/T
rs31015472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574325fB3galnt1 : within coordinates of1SNPT TT T TTTTC TC  TTCC/T
rs31016354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574332fB3galnt1 : mRNA-UTR1SNPC CC C CCCC  CC  CTCC/T
rs31016356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574792fB3galnt1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  CCT  CC  C CC/T
rs13459924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69574843rB3galnt1 : mRNA-UTR3SNPGG    A G   A  G    A/G
rs31016358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575111fB3galnt1 : Coding-NonSynonymous
B3galnt1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG AGGGG GG  GAGA/G
rs31016360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575189fB3galnt1 : within coordinates of1SNPG GGGG GGGG  GA  GGGA/G
rs31016362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575399fB3galnt1 : within coordinates of4SNPAAAA  GGA G GAAA AGAA/G
rs31016363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69575955fB3galnt1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs31017225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576045fB3galnt1 : Intron1SNPT TT T  TTT  TT  TCTC/T
rs33861864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576480fB3galnt1 : Intron3SNPCCC   T C   T  CC   C/T
rs31017227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576532fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC ACCCC CC  CCCA/C
rs51079618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576670fB3galnt1 : Intron1SNP AA     A       T   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31017228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576855fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCTC CC  CCCC/T
rs30758156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69576998fB3galnt1 : Intron3SNP  C   T C   T  C    C/T
rs30569509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69577587fB3galnt1 : Intron3SNP CC   T C   T  C    C/T
rs31017230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69578005fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs51320977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69578465fB3galnt1 : Intron2SNP AA         G  A    A/G
rs52175708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579078fB3galnt1 : Intron2SNP A          T  A    A/T
rs52376239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579122fB3galnt1 : Intron2SNP  A         A  C    A/C
rs31017232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579635fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC GCCCC CC  CGCC/G
rs51374343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579743fB3galnt1 : Intron2SNP GG     G   A  G    A/G
rs31017964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579827fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG GGGTG GG  GGGG/T
rs31009764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69579908fB3galnt1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT TT  T TC/T
rs31009766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580311fB3galnt1 : Intron1SNPT TTTT TTTCT TT  TTTC/T
rs31728407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580603fB3galnt1 : Intron2SNP GG   G A   G  A    A/G
rs31009768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580654fB3galnt1 : Intron1SNPT TTTT  TTCT TT  TCTC/T
rs31009770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69580897fB3galnt1 : Intron1SNPA  AAA  AAGA AA  AAAA/G
rs30899291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581109fB3galnt1 : Intron3SNP CC   T C   T  C    C/T
rs31009772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581525fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CGCC/G
rs30506169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581588fB3galnt1 : Intron3SNPCCC   G C   G  C    C/G
rs31010704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581613fB3galnt1 : Intron1SNPC CC C  CCTC CC  C CC/T
rs31010705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69581911fB3galnt1 : Intron1SNPC  C C  C T  CC  C CC/T
rs31010706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582086fB3galnt1 : Intron1SNPA AAAA GAAGA AA  AGAA/G
rs46578637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582402fB3galnt1 : Intron1SNP  C                 C
rs51107165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69582885fB3galnt1 : Intron2SNP  T         C  T    C/T
rs49305705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583071fB3galnt1 : Intron2SNP AA     A   G  A    A/G
rs230039953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583192fB3galnt1 : Intron1SNP            C  T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs258409387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583362fB3galnt1 : Intron1SNP            C  T    C/T
rs47526728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583878fB3galnt1 : Intron1SNP CC     C       A   A/C
rs30118487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69583979fB3galnt1 : Intron3SNP CC   A     A  C    A/C
rs31010708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69584317fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCTC CC  CCCC/T
rs49846517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69585344fB3galnt1 : Intron1SNP  T                 T
rs51104376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69585395fB3galnt1 : Intron2SNP  A         G  A    A/G
rs52256548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586076fB3galnt1 : Intron2SNP GG         A  G    A/G
rs31010709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586576fB3galnt1 : Intron1SNPA AA A  A G  AA  A AA/G
rs31010711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69586687fB3galnt1 : Intron1SNPT TTTT  TTTT TT  TGTG/T
rs31010712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587351fB3galnt1 : Intron1SNPA AA A  AAC  AA  A AA/C
rs30120222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587789fB3galnt1 : Intron3SNPTTT   G     G  T    G/T
rs50557117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587979fB3galnt1 : Intron2SNP CC         T  C    C/T
rs47616200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69587980fB3galnt1 : Intron2SNP A          G  A    A/G
rs31011964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588056fB3galnt1 : Intron3SNPTTTTTT  TTCCCTCT TCCC/T
rs31011966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588161fB3galnt1 : Intron3SNP A        G G  A AG A/G
rs31011967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588419fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCCC CC  CTCC/T
rs31011969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588436fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs31011970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588733fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCTC CC  CCCC/T
rs31011972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588791fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs31012994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588927fB3galnt1 : Intron1SNPT TTTT  TTGT TT  TTTG/T
rs31012996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69588949fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  G GA/G
rs31012998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589155fB3galnt1 : Intron1SNP  CCCC  CCCC CC  CCTC/T
rs31013000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589186fB3galnt1 : Intron1SNPC CC C  CCC  CT  C TC/T
rs31013002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69589398fB3galnt1 : Intron1SNPG GG G  GGCG GG  G GC/G
rs49703732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590640fB3galnt1 : Intron2SNP  T         A  T    A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46913420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590662fB3galnt1 : Intron2SNP  C         T  C    C/T
rs234928437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69590937fB3galnt1 : Intron1SNP            G  A    A/G
rs31013824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591017fB3galnt1 : Intron1SNPA AA A  AAG  AA  AAAA/G
rs47687842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591143fB3galnt1 : Intron2SNP TT     T   A  T    A/T
rs31013826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591245fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  G GA/G
rs31013828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591247fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GG G GG  GAGA/G
rs50199267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591290fB3galnt1 : Intron2SNP CC         A  C    A/C
rs31013830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591673fB3galnt1 : Intron1SNPC CC C    TC CC  C CC/T
rs31013832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591803fB3galnt1 : Intron3SNPTTTTTT  TTCCCTCT TCCC/T
rs31014664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591911fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCAC CC  CCCA/C
rs31014666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591945fB3galnt1 : Intron1SNPA AA A  AAGA AA  AAAA/G
rs31014668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69591987fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCTC CC  CCCC/T
rs31014669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592553fB3galnt1 : Intron1SNPC CC C  CCAC CC  CCCA/C
rs31014671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592744fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs31014673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592930fB3galnt1 : Intron1SNPA AA A  AAGA AA  AAAA/G
rs31006993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592982fB3galnt1 : Intron2SNP      T C   T  C    C/T
rs31015345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69592983fB3galnt1 : Intron1SNP          C      TT C/T
rs31015348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593526fB3galnt1 : Intron1SNPC CCCC  CCC  CT  CCTC/T
rs31015350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593795fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs31015351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69593891fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG  GGAG GG  GGGA/G
rs30313471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594190fB3galnt1 : Intron3SNPC C   T C   T  C    C/T
rs46106244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594262fB3galnt1 : Intron2SNP  C     C   G  C    C/G
rs49756746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594513fB3galnt1 : Intron2SNP GG     G   T  G    G/T
rs31015353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594922fB3galnt1 : Intron2SNPG  G G  G AAA AG G AA/G
rs31016165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69594971fB3galnt1 : Intron1SNPG GGGG    AA  A  GGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31016167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595170fB3galnt1 : Intron3SNPT TT T  TTCCCTCT TTCC/T
rs46422963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595250fB3galnt1 : Intron1SNP  T                 T
rs48704472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595271fB3galnt1 : Intron2SNP  C         T  C    C/T
rs48219085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595276fB3galnt1 : Intron2SNP  C         T  C    C/T
rs50555599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595345fB3galnt1 : Intron1SNP  A                 A
rs46279338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595348fB3galnt1 : Intron1SNP  C                 C
rs31016169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595412fB3galnt1 : Intron3SNPC CCCC  CCAAACAC CCAA/C
rs51090628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595462fB3galnt1 : Intron2SNP  A     A   T  A    A/T
rs47244337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595483fB3galnt1 : Intron1SNP  G                 G
rs49744623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595626fB3galnt1 : Intron2SNP  G     G   A  G    A/G
rs50092599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595732fB3galnt1 : Intron2SNP  G     G   A  G    A/G
rs45642435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595827fB3galnt1 : Intron2SNP  G     G   A  G    A/G
rs234863698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69595912fB3galnt1 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs49890606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596030fB3galnt1 : Intron2SNP  T     T   C  T    C/T
rs46386722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596032fB3galnt1 : Intron2SNP  A     A   G  A    A/G
rs45840666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596063fB3galnt1 : Intron2SNP  G     G   A  G    A/G
rs262403564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596324fB3galnt1 : Intron1SNP            T  C    C/T
rs51542899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596333fB3galnt1 : Intron1SNP AA     A           A
rs46907603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596342fB3galnt1 : Intron1SNP AA     A           A
rs47704222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596731fB3galnt1 : Intron2SNP GG     G   A  G    A/G
rs47086369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596766fB3galnt1 : Intron2SNP GG     G   A  G    A/G
rs49667656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596877fB3galnt1 : Intron2SNP AA     A   G  A    A/G
rs47909570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69596972fB3galnt1 : Intron1SNP  A     A           A
rs31485065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69598465fB3galnt1 : Intron3SNP CC   G C   G  C    C/G
rs33862289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69598606fB3galnt1 : Intron1SNP GG     C           C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs242113427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:69599315fB3galnt1 : Locus-Region1SNP            A  G    A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory