About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Nr5a1
nuclear receptor subfamily 5, group A, member 1
MGI:1346833

178 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690657rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1999 bp downstream of
1SNP  CCCCCCT C   CC CCC CC CCCCCC C  C/T
rs27159598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690784fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1872 bp downstream of
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C ACA/C
rs27159597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690807fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1849 bp downstream of
1SNPT TTT T A  TTT      T  T      T TTA/T
rs16819598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690861rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1795 bp downstream of
1IN-DEL  AAAAAA- A   AAA AA AA A AAAA A  -/A
rs16819597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690863rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1793 bp downstream of
1IN-DEL  ------A -   ------ -- ------ -  -/A
rs16819596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690909rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1747 bp downstream of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690929rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1727 bp downstream of
1SNP  CCCCCCT C   CCT CC CC CCCCCC C  C/T
rs16819594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690950rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1706 bp downstream of
1SNP  CCCCCCT C   CCCCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38690986rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1670 bp downstream of
2SNPT TTTTTTC TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTC/T
rs16819586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691036rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1620 bp downstream of
7Mixed  GGGGGG- G   GGGGGG GG GGGGGG G  -/A/C/G/T
rs16819585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691046rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1610 bp downstream of
1SNP  GGGGGGG G   GGGGGG GG GGGGAG G  A/G
rs16819584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691077rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1579 bp downstream of
1SNP  TTTTTTC T   TTTTTT TT TTTTTT T  C/T
rs16819583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691095rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1561 bp downstream of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691148rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1508 bp downstream of
2SNPG GGGGGGA GGGGGGAGGGGGGGGGGGAGGGAGA/G
rs16819581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691185rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1471 bp downstream of
1SNP  GGGGGGA G   GGGGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691265rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1391 bp downstream of
1SNP  CCCCCCT C   CCTCCC CC CCCCTC C  C/T
rs16819610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691442rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1214 bp downstream of
1SNP  G G GGG G   GGA         GG G G  A/G
rs16819609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691465rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1191 bp downstream of
1SNP  GGG GGG G   GGT         GG G G  G/T
rs16819608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691570rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 1086 bp downstream of
1SNP  GGG GGG G   GGAG G GG  GGG G G  A/G
rs16819607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691729rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 927 bp downstream of
1SNP  CCC CCC C   CCTC   CC  CCC C C  C/T
rs27159596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691764fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 892 bp downstream of
1SNPC CCC C C  CCC      C  C      C TCC/T
rs16819602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691782rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 874 bp downstream of
5Mixed  T?T TT- T   TTTT   ??  TTT T T  -/A/C/G/T
rs16819601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691787rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 869 bp downstream of
1SNP  C C CCC C   CCTC       CCCCC C  C/T
rs27159595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691911fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 745 bp downstream of
1SNPT TTT T T TTTT      T  T      T GTG/T
rs16819600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691915rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 741 bp downstream of
1SNP  C C CCT C   CCCC   C   CCC C C  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691929rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 727 bp downstream of
1SNP  AAA AAA A   AAGA    A  AAA A A  A/G
rs27159594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38691934fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 722 bp downstream of
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A GAA/G
rs16819614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692062rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 594 bp downstream of
1SNP  AAAAAAG A   AAAAAA AA  AAA A A  A/G
rs16819613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692107rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : 549 bp downstream of
1SNP  CCCCCCC C   CCCCCC CC  CCCTC C  C/T
rs16819612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692352rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Locus-Region
1IN-DEL  ------- -   --G--- -- ---- - -  -/G
rs16819611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692368rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Locus-Region
1SNP  CCCCCCC C   CCACCC CC  CCC C C  A/C
rs16819618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692593rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Locus-Region
1SNP  GGGGGGA G   GG GGG  G GGGGAG G  A/G
rs16819617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692896rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
2SNPT TTTTTTT TTCTTT TTTTTTTTTCTTTTTTTC/T
rs16819616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38692923rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  CCCCCCG C   CC CCC CC CCCCGC C  C/G
rs16819615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693002rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
2SNPC CCCCCCT CCCCCC CCCCCCCCCCCTCCCTCC/T
rs16819627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693238rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693412rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693420rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT TTTTTT T  C/T
rs16819624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693442rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693449rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
2SNPA AAAAAAG AAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAGAA/G
rs16819622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693478rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693516rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693518rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  TTTTTTC T   TTCTTT TT TTTTCT T  C/T
rs16819619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38693544rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16782877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694185rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
2SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16782878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694218rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
3SNPA AAAAAAG AAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAGAA/G
rs16819638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694304rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAG A   AAGAAA AA AAAAGA A  A/G
rs16819637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694441rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL  GGGGGG- G   GGGGGG GG GGGG-G G  -/G
rs16819636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694442rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL  CCCCCCC C   CC-CCC CC CCCCCC C  -/C
rs16819635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694453rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694497rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
3IN-DEL  ------- -   --A--- -- ----A- -  -/A
rs16819631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694530rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGC G   GGC GG GG GGGGCG G  C/G
rs16819630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694547rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL  ------- -   --C--- -- ------ -  -/C
rs16819629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694616rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38694688rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs27159593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38695019fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A GAA/G
rs27159592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38695087fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38696252fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G  GGG      G  G      G AGA/G
rs27159590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38696280fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38696865fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG      G  G      G TGG/T
rs27159588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38698100fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG      G  G      G AGA/G
rs27159587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38698341fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A C AAAA      A  A      A AAA/C
rs27159586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38698525fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C T CCTC      C  C      C TCC/T
rs27159585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38699616fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G AGA/G
rs27159584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38699958fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs16819570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700422rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPA AAAAAAG AAAAAA AAAAAAAAAAAGAAAGAA/G
rs16819569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700542rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700631rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AAAAAA AA AAAAGA A  A/G
rs16819567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700632rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGT G   GGGGGG GG  GGGGG G  G/T
rs16819566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700640rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTT T   TTATTT TT TTTTTT T  A/T
rs16819565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38700646rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCC CCC C   CCCCCC CC  CCCGC C  C/G
rs27159583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701000fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701108fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A C AAAA      A  A      A CAA/C
rs27159581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701231fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC      C  C      C CCC/T
rs16819556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701551rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAG A   AAGAAA AA  AAAGA A  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701671rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPC CCCCCCC CCCCCCCCCCCCCC CCCTCCCTCC/T
rs16819554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701686rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCCC C  C/T
rs16819553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701691rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPT TTTTTTA TTTTTTATTTTTTT TTTATTTATA/T
rs16819552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701810rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAAA A  A/G
rs16819551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701838rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPG GGGGGGG GGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGAGA/G
rs16819550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701844rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AATAAA AA AAAAAA A  A/T
rs16819549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701854rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPT TTTTTTA TTTTTTATTTTTTTTTTTATTTATA/T
rs16819548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701900rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPC CCCCCCT CCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCTCC/T
rs16819547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701908rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCC C   CCCCCC CC  CCCTC C  C/T
rs16819546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701941rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTT T   TTGTTT TT TTTTTT T  G/T
rs16819545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701946rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPC CCCCCCT CCCCCCCCCCCCCC CCCTCCCTCC/T
rs16819544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38701952rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL  CCCCCCC C   CC-CCC CC  CCCCC C  -/C
rs16819564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702065rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC   CCCC C  C/T
rs16819563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702203rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AACAAA AA  AAAAA A  A/C
rs16819562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702205rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGGG G  A/G
rs16819561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702293rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGA G   GGGGGG GG G GGAG G  A/G
rs16819560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702303rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1Mixed  GGGGGG- G   GGAGGG GG GGGG-G G  -/A/G
rs16819559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702336rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTT T   TTGTTT TT TTTTTT T  G/T
rs16819558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702362rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPA AAAAAAG AAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAGAA/G
rs16819557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702418rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAG A   AAGAAA AA AAAAGA A  A/G
rs27159580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702502fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C T CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702685fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A GAA/G
rs27159578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38702968fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38703176fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A C AAAA      A  A      A CAA/C
rs27159576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38703258fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T T  TTT      T  T      T CTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27159575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38703352fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A   AAAA      A  A      A GAA/G
rs27159574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38703414fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A C AAAA      A  A      A AAA/C
rs27159573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704107fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G AGA/G
rs27159572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704129fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704173fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G T GGGG      G  G      G TGG/T
rs6311662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704382fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPA AAA AAGGAAAA      A  A      A GAA/G
rs27159570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704611fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGAG      G  G      G GGA/G
rs6312816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704613fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPG GGG GGAAGGGG      G  G      G AGA/G
rs6313206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704644fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPT TTT TT CTTTT      T  T      T CTC/T
rs6313271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704691fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPG GGG GGAAGGGG      G  G      G AGA/G
rs6313272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704692fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP       C T                        C/T
rs6313713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704756fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPA AAA AAGGAAAA      A  A      A GAA/G
rs6314777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38704953fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPT TTT TTTATTTT      T  T      T ATA/T
rs27159569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705022fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG      G  G      G AGA/G
rs27159568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705073fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG      G  G      G TGG/T
rs27159567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705170fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A C  AAA      A  A      A AAA/C
rs27159566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705242fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT      T  T      T TTC/T
rs27159565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705282fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G G GGGG      G  G      G AGA/G
rs27159564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705455fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G C GGGG      G  G      G CGC/G
rs27159563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705489fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38705499fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A AAA/G
rs27159561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706283fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A A  AGA      A  A      A AAA/G
rs27159560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706314fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A GAA/G
rs27159559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706506fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C G CCCC      C  C      C GCC/G
rs27159558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706603fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G GGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27159557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706627fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G GGA/G
rs27159556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38706671fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A A AAAA      A  A      A GAA/G
rs27159555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707047fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A  AA/G
rs27159554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707064fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T T TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707119fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T T TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707385fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T T TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707386fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G  GA/G
rs27159550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707673fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPG GGG G A GGGG      G  G      G GGA/G
rs16819532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707707rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AAC AA AA AAAAAA    A/C
rs16819531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707727rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCC C   CCT CC CC CCCCCC    C/T
rs16819530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707748rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGA GG GG GGGGGG    A/G
rs16819529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707749rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPA AAAAAAG AAAAAAG AAAAAAAAAAAAA AAA/G
rs16819528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707796rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPG GGGGGGA GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG GGA/G
rs16819527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707900rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC    C/T
rs16819526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38707901rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCT C   CCTCCC CC CCCCCC    C/T
rs16819535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708135rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-NonSynonymous
1SNP  C CCCCC C   CCTCCC    CCCCCC C  C/T
rs3142929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708270fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-NonSynonymous
5SNPAAAACCACC AACAAACAACA  AAACACAACCCA/C
rs16819534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708349rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
2SNPC CCCCCCT CCCCCCCCCCC  CCCCCCCCCCCC/T
rs16819533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708355rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
2SNPC CCCCCCC CCCCCCTCCCC  CCCCCTCCCTCC/T
rs16819543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708648rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTT T   TTATTT TT TTTT T T  A/T
rs27159549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708703fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs16819542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708790rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708822rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTG T   TTTTTT TT TTTTTT T  G/T
rs16819540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708840rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTT TTC T   TTTTTT TT TTTTCT T  C/T
rs16819539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708888rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNPG GGGGGGG GGAGGGAGGGGGGGGGAGAGGGAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708894rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  CCCCCCC C   CCCCCC CC CCCCTC C  C/T
rs16819537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708915rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAAA A  A/G
rs16819536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38708919rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGCGGG GG GGGGGG G  C/G
rs27159548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709278fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709308fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPC CCC C C CCCC      C  C      C TCC/T
rs27159546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709329fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPT TTT T C TTTT      T  T      T CTC/T
rs27159545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709580fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A AAA/G
rs27159544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709650fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A G AAAA      A  A      A AAA/G
rs27159543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709941fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNPA AAA A A AAAA      A  A      A TAA/T
rs16819522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38709992rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  AAAAAAG A   AAGAAA AA AAAAAA A  A/G
rs16819521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710079rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTC T   TTCTTT TT TTTTCT T  C/T
rs16819520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710199rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGT GG GG GGGGGG G  G/T
rs16819519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710211rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL   - -T-      --T- - -- ----T-    -/T
rs16819518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710212rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1IN-DEL   T T-T      TTTT T T  T TT-     -/T
rs16819517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710241rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGGGGG GG GGGGAG G  A/G
rs16819516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710245rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  TTTTTTC T   TTCTTT TT TTCTCT C  C/T
rs16819515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710308rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG GGGGGG G  A/G
rs16819525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710637rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
1SNP   CCCC C C   CC  C  CC C CCGC C  C/G
rs16819524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710695rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
1SNP   GGGG G G   GG GG  GG G GGAG G  A/G
rs16819523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710748rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding
1IN-DEL   C--C - C   CC CC  -C C -C-C -  -/C
rs3142930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710749fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding
Nr5a1 : Coding-Synonymous
3Mixed  G?AA?AA G   ?- ??A AG ?GA?A? A  -/A/G
rs221510702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38710749fDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Coding-Synonymous
1SNP               G        G         G
rs16782879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38711042rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
2SNP  AAAAA A A   AA AAA AA AAAACA A  A/C
rs16819514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38713995rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
Nr5a1os : within coordinates of
1SNP  CCC CCC C   CCTCCC CC  CCCCC C  C/T
rs16819513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38714095rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
Nr5a1os : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGGG G  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16819512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38714311rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
Nr5a1os : within coordinates of
1SNP  TTTTTTC T   TTCTTT TT TTTTCT T  C/T
rs16819511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38714312rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : Intron
Nr5a1os : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC CCCCCC C  C/T
rs16819510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:38714400rDwh : within coordinates of
Nr5a1 : mRNA-UTR
Nr5a1os : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT TTTTTT T  C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory