About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Slc11a2
solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporters), member 2
MGI:1345279

246 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32174655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216393fSlc11a2 : Locus-Region2SNPGGAAGAA  G AAGG       G         G     G G    G A/G
rs32174657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216405fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG GGGG   A GGGG       G         G     G G    G A/G
rs32174659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216448fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG GGGG   A GGGG       G         G     G G    G A/G
rs31794897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216721fSlc11a2 : Locus-Region1SNPGGA   A    A                                   A/G
rs31702666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216728fSlc11a2 : Locus-Region1SNPGGA   A    A                                   A/G
rs31783081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216732fSlc11a2 : Locus-Region1SNPCCG   G    G                                   C/G
rs33859109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216763fSlc11a2 : Locus-Region1SNPAAG   G    G                                   A/G
rs31575427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216764fSlc11a2 : Locus-Region1SNPAAT   T    T                                   A/T
rs32174661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216968fSlc11a2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCCC       C         C     C T    C C/T
rs32174663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100216991fSlc11a2 : Locus-Region1SNPC CCCC   T CCTC       C         C     C C    C C/T
rs32175415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217022fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG G GG   A GGGG       G         G     G G    G A/G
rs32175417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217111fSlc11a2 : Locus-Region1SNPA AAAA   C AACA       A         A     A A    A A/C
rs32175419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217180fSlc11a2 : Locus-Region1SNPT TTTT   C TTCT       T         T     T T    T C/T
rs32175421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217280fSlc11a2 : Locus-Region1SNPC CCCC   T CCTC       C         C     C C    C C/T
rs32175423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217307fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGGG       G         G     G A    G A/G
rs32176295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217377fSlc11a2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCTC                       C      C C/T
rs32176297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217379fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG AAGA   A AA G       G         G     G G    G A/G
rs32382334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217431fSlc11a2 : Locus-Region1SNP T    A    A                                   A/T
rs32176299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217656fSlc11a2 : Locus-Region1SNPT TTTT   A TT T       T               T A    T A/T
rs31729617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217758fSlc11a2 : Locus-Region2SNPTTCCTCC    CC T       T         T     T      T C/T
rs32176302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217896fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGAG       G         G     G A    G A/G
rs32177084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217923fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG GGGG   A GGGG       G         G     G G    G A/G
rs32177086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100217942fSlc11a2 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTCT       T         T     T C    T C/T
rs32177088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218061fSlc11a2 : Locus-Region1SNPC CCCC   G CCCC       C         C     C C    C C/G
rs32169415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218111fSlc11a2 : Locus-Region1SNPA AAAA   G AAAA       A         A     A A    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32169417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218161fSlc11a2 : Locus-Region2SNPTTCCTCC  C CCCT       T               T T    T C/T
rs32169419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218215fSlc11a2 : Locus-Region1SNPG AAGA   G AAGG       G         G     G G    G A/G
rs32169421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218407fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPC TTCT   C TTCC       C               C C    C C/T
rs32169423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218428fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNP  TTTT   G TT                           G      G/T
rs32170345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218431fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPC GGCG   G GGGG       C               C G    C C/G
rs32170347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218510fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPC  TTT     TTTT                       C T      C/T
rs32170349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218541fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPA  GAG   A GGA        A         A     A A    A A/G
rs32170351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218569fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA   A AATA       A         A     A T    A A/T
rs32170353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100218638fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPA    G   A GGA        A         A     A A    A A/G
rs32171205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219184fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPG AAGA   G AAAA       G         G     G A    G A/G
rs32171207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219331fSlc11a2 : mRNA-UTR2SNPGGAA AA    AA         G               G        A/G
rs32171209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219359fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPC CCCC     CCT        C         C     C T    C C/T
rs32171211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219464fSlc11a2 : mRNA-UTR1SNPC TTCT     TTC        C         C     C C    C C/T
rs32171213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219634fSlc11a2 : Intron1SNPA AAAA   A AACA       A         A     A C    A A/C
rs32172175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100219863fSlc11a2 : Intron1SNPG   TG     GGT        G         G     G T    G G/T
rs32172177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220118fSlc11a2 : Intron2SNPAAGG GG    GGG        A         A     A G    A A/G
rs32543786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220230fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs32172179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220234fSlc11a2 : Intron1SNP   C C      CA                        C A    C A/C
rs32172181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220768fSlc11a2 : Intron1SNPG TTGT     T G                        G G      G/T
rs32172183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220816fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   T TTC        T         T     T C    T C/T
rs32173095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100220938fSlc11a2 : Intron1SNPG AA A   G AA         G               G      G A/G
rs32173097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221106fSlc11a2 : Intron1SNPC  T T     TTTT                       C        C/T
rs32173099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221120fSlc11a2 : Intron1SNP  GGGG     GGAG                       G G      A/G
rs32173101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221147fSlc11a2 : Intron1SNPA  G G     GGAG                       A A    A A/G
rs32173103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221235fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTCT       C         C     C C    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32173995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221275fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G         G     G A    G A/G
rs32173997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221429fSlc11a2 : Intron1SNPG AA A     AAGA                       G A      A/G
rs32173999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221437fSlc11a2 : Intron1SNP  GGGG     GG G       A         A     A G    A A/G
rs32174001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100221843fSlc11a2 : Intron1SNPA GG G   A GGG        G         A     A G    A A/G
rs6311819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222192fSlc11a2 : Intron1SNP      G   T                                    G/T
rs6312866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222352fSlc11a2 : Intron1SNP      G   A                                    A/G
rs6313328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222443fSlc11a2 : Intron1SNP      C   T                                    C/T
rs6313331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222449fSlc11a2 : Intron2SNPT CC CC   TCCTC       T         T     T T    T C/T
rs32174954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222554fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C         C     C T    C C/T
rs6313951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222598fSlc11a2 : Intron2SNPA GGAGG   AGGAG       A         A     A G    A A/G
rs32174957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222967fSlc11a2 : Intron1SNPG  G G     GGA        G                 A    G A/G
rs32174959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100222984fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TT         C               C T    C C/T
rs32174961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223111fSlc11a2 : Intron1SNPT CC C     CCCC       T         T     T C    T C/T
rs32174963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223166fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC     CCGC       C         C     C C    C C/G
rs32175895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223248fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTTT       C         C     C T    C C/T
rs32175897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223393fSlc11a2 : Intron1SNPA GGGG   A GG G       A         A     A G    A A/G
rs32175899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223465fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC     CCTC       C         C     C C    C C/T
rs32175901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223474fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA     AAAA       G               G A    G A/G
rs32175903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223537fSlc11a2 : Intron1SNPG AA A   G AAGA       G         G     G G    G A/G
rs32176715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223568fSlc11a2 : Intron1SNPC GGCG     GG G       C         C     C      C C/G
rs32176717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223703fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC     CCC        C         C     C T    C C/T
rs32176719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223740fSlc11a2 : Intron1SNPA GG G     GGGG                       A G    A A/G
rs32176721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223936fSlc11a2 : Intron2SNPTTCC CC    CCTC       T         T     T C    T C/T
rs32396889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223986fSlc11a2 : Intron1SNP T    G    G                                   G/T
rs31609003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100223996fSlc11a2 : Intron1SNP A    G    G                                   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32176723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224029fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G GGG        G         G     G A    G A/G
rs32406488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224110fSlc11a2 : Intron1SNP A    G    G                                   A/G
rs32450673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224111fSlc11a2 : Intron1SNP T    C    C                                   C/T
rs32177605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224169fSlc11a2 : Intron1SNPG  GGG     GGGG       G         G     G A    G A/G
rs32319468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224277fSlc11a2 : Intron1SNP T    C    C                                   C/T
rs32150071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224283fSlc11a2 : Intron1SNP T    C    C                                   C/T
rs31908549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224399fSlc11a2 : Intron1SNP GT   T    T                                   G/T
rs31579214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224405fSlc11a2 : Intron1SNP GA        A                                   A/G
rs32274801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224411fSlc11a2 : Intron1SNP TC        C                                   C/T
rs32177607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224521fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG     GGGG       A         A     A G    A A/G
rs32177608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224775fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTC                        C C      C/T
rs32177610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100224869fSlc11a2 : Intron1SNPA GGGG     GG         A                      A A/G
rs32169435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225109fSlc11a2 : Intron1SNPC GGCG     GGCG       C         C     C C    C C/G
rs32169437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225129fSlc11a2 : Intron1SNPG  CGC     CCGC       G         G     G G    G C/G
rs32169439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225289fSlc11a2 : Intron1SNPT  TTT     TTTT       T         T     T C    T C/T
rs32169441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225668fSlc11a2 : Intron1SNPG AA A   G AAGA       G         G     G G    G A/G
rs32169443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225790fSlc11a2 : Intron1SNPA  GAG   A GGAG       A         A     A A    A A/G
rs32170165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100225889fSlc11a2 : Intron1SNPC  TCT     TTCT       C         C     C C    C C/T
rs32170167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226002fSlc11a2 : Intron1SNP  AA A     AA         G                 A    G A/G
rs32170169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226012fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTCT                       C T    C C/T
rs32170171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226073fSlc11a2 : Intron1SNP  GGAG     GG G                         G      A/G
rs32170173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226074fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTCT       C         C     C T    C C/T
rs32170875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226368fSlc11a2 : Intron1SNPA GGGG     GGGG                       A G      A/G
rs32170877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226432fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C         C     C C    C C/T
rs32170879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226544fSlc11a2 : Intron1SNPC  CCC     CCCC       C         C     C A    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32170881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100226820fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C TTCT       C         C     C T    C C/T
rs32170883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100227008fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC     CCC        T         T     T C    T C/T
rs32171685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100227062fSlc11a2 : Intron1SNPG AA A   G AAG        G         G     G G    G A/G
rs32171687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100227897fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C         C     C T    C C/T
rs32171689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100227978fSlc11a2 : Intron1SNPG  GGG   G GGGG       G         G     G A    G A/G
rs32046697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100227993fSlc11a2 : Intron2SNPTTCCTCC  T CCTC       T         T     T C    T C/T
rs32171692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100228099fSlc11a2 : Coding-NonSynonymous1SNPT  TTT     TTTT       T               T A    T A/T
rs32172644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100228293fSlc11a2 : Intron1SNPC TT T     TTCT       C         C     C C      C/T
rs31725980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100228566fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs32172645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100228687fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC     CCT        T         T     T T    T C/T
rs32172647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100228700fSlc11a2 : Intron2SNPCCAA AA    AACA                       C      C A/C
rs32088898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229255fSlc11a2 : Intron1SNP CT   T    T                                   C/T
rs32487628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229258fSlc11a2 : Intron1SNP GA   A    A                                   A/G
rs32198670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229393fSlc11a2 : Intron1SNP TG   G    G                                   G/T
rs31708498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229650fSlc11a2 : Intron2SNPTTCC CC    CC                         T      T C/T
rs32485163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229658fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs32012584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229980fSlc11a2 : Intron1SNP TC   C    C                                   C/T
rs32172650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100229983fSlc11a2 : Intron2SNPAACCCCC    CCAC       A         A     A A    A A/C
rs32495934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230101fSlc11a2 : Intron1SNP GC   C    C                                   C/G
rs32172652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230168fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   T C CC       C         C     C C    C C/T
rs31965302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230430fSlc11a2 : Intron1SNP GA        A                                   A/G
rs32114658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230430fSlc11a2 : Intron1SNP GA        A                                   A/G
rs32047660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230822fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs31922515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230838fSlc11a2 : Intron1SNP GA        A                                   A/G
rs31876211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100230876fSlc11a2 : Intron1SNP CT   T    T                                   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32173684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100231248fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   T T T        T         T     T C    T C/T
rs32173686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100231546fSlc11a2 : Intron1SNPG   GG     G                          G A    G A/G
rs32149050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100231674fSlc11a2 : Intron2SNPTTCCTCC  C C TT       T         T     T C    T C/T
rs32173689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232190fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C T C        C               C C    C C/T
rs32173691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232201fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   A G A        A               A A      A/G
rs32173693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232374fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   T C CC       C         C     C C    C C/T
rs32174585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232448fSlc11a2 : Intron1SNPA   AG   A G A        A         A     A G    A A/G
rs32174587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232722fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C C T        C         C     C T    C C/T
rs32174589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232756fSlc11a2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   G A AA       A         A     A G    A A/G
rs32174591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100232913fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   G C G        C         C     C G    C C/G
rs32174593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233003fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   T T TT       T         T     T C    T C/T
rs32175435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233176fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A          G         G     G G    G A/G
rs31627257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233448fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs31839957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233489fSlc11a2 : Intron2SNPGGAAGAA  G A G        G         G     G G    G A/G
rs32175438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233522fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T         T     T C    T C/T
rs6304040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233911fSlc11a2 : Intron3SNPCCTTCTT  CCT C        C               C      C C/T
rs6304054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100233921fSlc11a2 : Intron3SNPCCAACAA  CCA                          C        A/C
rs32175442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234020fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   T T TT       T         T     T A    T A/T
rs32176464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234052fSlc11a2 : Intron1SNPA AAAA   G A A        A         A     A G    A A/G
rs32176466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234152fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   T C CC       C         C     C C    C C/T
rs32176468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234189fSlc11a2 : Intron2SNPAAG AG   G G A        A               A A    A A/G
rs32176470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234229fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   T C C        C         C     C C    C C/T
rs31704567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234480fSlc11a2 : Intron1SNP CT   T    T                                   C/T
rs32176472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234526fSlc11a2 : Intron2SNPTTCCTCC  T C T        T         T     T C    T C/T
rs32177174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234581fSlc11a2 : Intron2SNPCCTTCTT  C T C        C         C     C C    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32177176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234647fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   T C T        T         T     T C    T C/T
rs32170055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100234971fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   A G          A               A A    A A/G
rs32170057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235031fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C C CC       C         C     C T    C C/T
rs32170059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235075fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C T C        C               C T    C C/T
rs32170061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235363fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A G        G         G     G G    G A/G
rs32170063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235481fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C T C        C         C     C C    C C/T
rs31914104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235658fSlc11a2 : Intron2SNPC TTCTT    T C        C         C     C C    C C/T
rs32078304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235664fSlc11a2 : Intron2SNPC AACAA  C A                          C        A/C
rs32170907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235682fSlc11a2 : Intron2SNPC TTCTT  C T          C               C C      C/T
rs32170909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235725fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C T C        C         C     C C    C C/T
rs32170911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235839fSlc11a2 : Intron2SNPA G AGG  G G G                        A G    A A/G
rs32170913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100235952fSlc11a2 : Intron2SNPC TTCTT  C T                          C      C C/T
rs32172035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236277fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   C C CC       C         C     C T    C C/T
rs32172037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236308fSlc11a2 : Intron1SNPA   AC   A CAAA       A         A     A C    A A/C
rs32172039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236369fSlc11a2 : Intron2SNPAATTATT  A T                            A    A A/T
rs32229416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236376fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs32172041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236445fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A G        G         G     G G    G A/G
rs32172043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236482fSlc11a2 : Intron1SNPT GGTG   T G T        T         T     T G    T G/T
rs31796127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236552fSlc11a2 : Intron1SNP AC   C    C                                   A/C
rs32172965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236617fSlc11a2 : Intron1SNP  CCTC     C                            C      C/T
rs32398995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236632fSlc11a2 : Intron1SNP AG   G    G                                   A/G
rs32172967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236634fSlc11a2 : Intron1SNP  TT T   C T                                   C/T
rs32172969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100236918fSlc11a2 : Intron1SNPC CCCC   T C  C       C         C     C C    C C/T
rs3665919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237140fSlc11a2 : Intron2SNPG AAGAA  G A G                          G    G A/G
rs3666556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237256fSlc11a2 : Intron1SNPC     T                                        C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32172972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237477fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A G        G         G     G A    G A/G
rs32173804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237636fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A G        G               G      G A/G
rs32173806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237948fSlc11a2 : Intron1SNPA  CAC   C C C        A         A     A A    A A/C
rs32173808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100237972fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   T C C        T               T C    T C/T
rs32173810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238006fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G G          G         G     G A    G A/G
rs32173812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238086fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   A G A        A               A A    A A/G
rs32174754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238113fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   A G A        A         A       A    A A/G
rs32174756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238200fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A GG       G         G     G G    G A/G
rs32174758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238258fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   A G A        A         A     A G    A A/G
rs32174760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238271fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G G G        G         G     G A    G A/G
rs32174762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238340fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   C T C        C         C     C C    C C/T
rs32175614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238482fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   T C                            C    T C/T
rs32175616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238487fSlc11a2 : Intron1SNPA  T T     T A                  A     A A      A/T
rs32175618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238504fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT     T C                        C C      C/T
rs32175620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238732fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A          G               G G    G A/G
rs32175622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100238892fSlc11a2 : Intron1SNPA CCAC   A C C        A         A     A C    A A/C
rs32176314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239551fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   A A GG       G         G     G G    G A/G
rs32176316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239621fSlc11a2 : Intron1SNPC TTCT   T T TC       C         C     C T    C C/T
rs32176318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239670fSlc11a2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G G GG       G         G     G A    G A/G
rs32176320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239751fSlc11a2 : Coding-Synonymous1SNPG AAGA   A A G        G         G     G A    G A/G
rs32176322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239778fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G G GG       G         G     G A    G A/G
rs32177134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239820fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   A A          G               G      G A/G
rs32177136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239826fSlc11a2 : Intron1SNPA GG G   A G                          A A    A A/G
rs32177138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239874fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   A A          G               G        A/G
rs3023831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100239944fSlc11a2 : Intron2SNPCCTTCTTTCTTTTCCCCTTTCTCTTTCTTCCCCTCTTCCTTCCCTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32177141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240374fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A GG       G         G     G A    G A/G
rs32177143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240457fSlc11a2 : Intron1SNPA GGAG   G G G                  A     A G    A A/G
rs32177965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240491fSlc11a2 : Intron1SNP  TTCT   C T                          C T      C/T
rs32177967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240694fSlc11a2 : Intron1SNPA TTAT   T T T        A               A T    A A/T
rs32177969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240706fSlc11a2 : Intron1SNPT GGTG   G G G        T         T     T G    T G/T
rs32170225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240730fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   A A A        G               G A    G A/G
rs32170227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240782fSlc11a2 : Intron1SNPG AAGA   G A          G         G     G A    G A/G
rs32170229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100240819fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G G AG       G         G     G G    G A/G
rs3672460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241101fSlc11a2 : Intron1SNPC     T                                        C/T
rs32170231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241151fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   C T  T       T         T     T T    T C/T
rs32170233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241304fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   C C C        C         T     T C    T C/T
rs32171195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241311fSlc11a2 : Intron1SNPG GGGG   G G A        G         G     G G    G A/G
rs32171197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241326fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   T C C        T         T     T C    T C/T
rs32171199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241483fSlc11a2 : Intron1SNPA TTAT   A T A        A         A     A T    A A/T
rs32171201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241544fSlc11a2 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT       T         T     T T    T C/T
rs32171203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241660fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   C C C        T         T     T C    T C/T
rs32172105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241660fSlc11a2 : Intron1SNPT CCTC   C C C                          C    T C/T
rs32172107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100241776fSlc11a2 : Intron1SNPC GGCG   C G          C               C G    C C/G
rs32172109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100242351fSlc11a2 : Intron1SNP         C   T                                 C/T
rs32172111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100242427fSlc11a2 : Intron1SNP         G   A                          A      A/G
rs32172113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100242441fSlc11a2 : Intron1SNP         G   A                          A      A/G
rs32172995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100242740fSlc11a2 : Intron1SNP         A   G                          G      A/G
rs32172997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100243022fSlc11a2 : Intron1SNP         T   A                          A      A/T
rs32172999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100244440fSlc11a2 : Intron1SNP         G   A                          A      A/G
rs32032749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100244972fSlc11a2 : Intron1SNPGGA   A    A                                   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31733113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100244985fSlc11a2 : Intron1SNPGGT   T    T                                   G/T
rs32002154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245218fSlc11a2 : Intron1SNPCCT   T    T                                   C/T
rs32206629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245235fSlc11a2 : Intron1SNPTTA        A                                   A/T
rs32300416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245235fSlc11a2 : Intron1SNPGGA        A                                   A/G
rs32508891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245235fSlc11a2 : Intron1SNPTTC   C    C                                   C/T
rs32276913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245368fSlc11a2 : Intron1SNPC T        T                                   C/T
rs32173001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245504fSlc11a2 : Intron1SNP         G   T                                 G/T
rs31714322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100245505fSlc11a2 : Intron1SNPT C        C                                   C/T
rs32173003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100246915fSlc11a2 : Intron1SNP         G   A                                 A/G
rs32173785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100248111fSlc11a2 : Intron1SNP         C   T                                 C/T
rs31693176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100248394fSlc11a2 : Intron1SNP GA   A    A                                   A/G
rs32173787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100248634fSlc11a2 : Intron1SNP         C   A                          A    A A/C
rs32173789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100248777fSlc11a2 : Intron1SNP         A   G                          G      A/G
rs32408404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100248984fSlc11a2 : Intron1SNPTTA   A    A                                   A/T
rs31814119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100250794fSlc11a2 : Intron1SNPCCA   A    A                                   A/C
rs32173791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100250982fSlc11a2 : Intron1SNP         A   C                          C      A/C
rs32173793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100251205fSlc11a2 : Intron1SNP    G    T   G                          G      G/T
rs32070352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100251521fSlc11a2 : Intron1SNP GA   A    A                                   A/G
rs32174625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100251732fGm5475 : Locus-Region
Slc11a2 : Intron
1SNP         T   C                          C    T C/T
rs32174627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100251907fGm5475 : Locus-Region
Slc11a2 : Intron
1SNPA        A   G                        A      A A/G
rs32257651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:100253903fGm5475 : mRNA-UTR
Slc11a2 : Locus-Region
1SNP AG   G    G                                   A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory