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Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Aire
autoimmune regulator (autoimmune polyendocrinopathy candidiasis ectodermal dystrophy)
MGI:1338803

139 matching SNPs displayed
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Legend
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SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8243621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
1SNP  GG GGGA G     G G       A/G
rs8243620
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1SNP  CC CCCA C     C C       A/C
rs49934961
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1SNP  TTT     TT       TT  TTCC/T
rs8243619
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2SNP  GGGGGGA G A   G G G   AAA/G
rs8243618
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2SNP  CCCCCCT C T   C C C    CC/T
rs8243617
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Gn : within coordinates of
1SNP  AA AAAC A     A A       A/C
rs50708779
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rs47930142
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1SNP    T   T   T       T   TGG/T
rs45825359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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rs51619281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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rs49710426
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1SNP  C C   T CCT      CC   CCC/T
rs8256340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1IN-DEL  - ----  -   -G--    -   -/G
rs8256339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP  A AAAA  A   ATAA        A/T
rs8256338
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1SNP  A AAAA      ACAA    A   A/C
rs8256337
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rs8256336
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1SNP  C CCCC      CTCC        C/T
rs8256335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP  C CCCC  C    TCC    C   C/T
rs8256334
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rs8256333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP    G  G  G    AG         A/G
rs8256332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP       G       A          A/G
rs8256331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP       G  G    A      A   A/G
rs8256327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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4SNP  A AAA?  A   AG?A    A   A/G
rs51302742
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1SNPA AAA A G AAGA     AA  AA A/G
rs8256326
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1SNP              A G     A   A/G
rs8256325
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Gn : within coordinates of
1SNP    G A   A    GG         A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8256324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78029434rAire : 588 bp downstream of
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Gn : within coordinates of
1SNP  A AAA   A    GA         A/G
rs8256323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78029438rAire : 584 bp downstream of
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP     A          G         A/G
rs8244993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
1SNP  GG G GA G     G G       A/G
rs8244994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78030365fAire : Intron
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNPC CCCCCCA CC C  C CCC  CCCA/C
rs8244995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNP  A  ACAA A               A/C
rs8244996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78030399fAire : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  A  ACAA A               A/C
rs8244997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
1SNP     AG A A               A/G
rs8244998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78030427fAire : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  C  C  C C       G       C/G
rs49210779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78030750fAire : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA     AA  AG A/G
rs8244992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78031509rAire : Intron
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  TT  TTC       T         C/T
rs46612788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78031778fAire : Intron
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGAG     GG  GGGA/G
rs8243615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78031958fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TT T    TTT  T  C/T
rs8243616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78031966fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TTCT  T TTT  TCCC/T
rs50658499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032042fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNPT TTT T T TTTT     TT  TCTC/T
rs48253063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032086fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP    T T C TTCT     TT   CCC/T
rs8243614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032401rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  CC  CCA C     C C       A/C
rs8237631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032534rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNP  TT TTTG T     T T       G/T
rs51220315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032601fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNPG GGG G C GGCG     GG  GCGC/G
rs8244989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032734fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  AA AAAG A     A         A/G
rs51943058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032790fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
rs51154558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032808fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG     GG  GAGA/G
rs8244990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032857fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TTCT  T  TT  T TC/T
rs8244991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78032967fAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
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Gn : within coordinates of
1SNP  TT TTTA T     T T       A/T
rs8244988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78033359rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  TT T TC T     T T       C/T
rs8237507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78033411rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNP  TT TTTA T     T T       A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8237508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78033560rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNP  GG GGGA G     G G       A/G
rs8237509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78033561rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNP  TT TTTC T     T T       C/T
rs8237510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78033605rAire : Intron
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
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Gn : within coordinates of
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rs52598671
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rs8245021
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rs8245020
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rs8245015
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rs8245014
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rs49157940
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rs46380521
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1SNP CC       C          T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49808253
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rs49390591
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1SNP  T       T          G    G/T
rs8245013
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3SNPGGGGGGGGA GGAG  G  GGA G GA/G
rs46677561
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rs8245012
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rs46489448
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rs6397169
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rs6397179
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2SNP  T    T CT          C    C/T
rs6398227
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1SNP       G A                A/G
rs6398286
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1SNP       T C                C/T
rs6398346
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1SNP       T C                C/T
rs6398861
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1SNP       C T                C/T
rs6399431
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rs8245009
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1SNP  T  TTTC T               C/T
rs8245010
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2SNPA AAAAAAG AAGA    AAA  AG A/G
rs8245011
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rs48552683
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1SNPT TTT T   TTCT     TT  TT C/T
rs46861932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNPG GGG G A GGAG     GG  GGGA/G
rs49358844
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1SNPG GGG G G GGGG     GG  GA A/G
rs8244986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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rs47163619
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1SNPG GGG G A GGAG     GG  GG A/G
rs47932093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNPT TTT T   TT T     TT  TCTC/T
rs48853055
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rs8245008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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rs51879804
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Gn : within coordinates of
1SNPC C C C   CC C     CC  CT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8244982
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Gn : within coordinates of
1SNP  C  CCCT C               C/T
rs8244983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78038632fAire : Intron
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
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rs8244984
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Gn : within coordinates of
1SNP  T  TTTC T               C/T
rs8244985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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2SNPC CCCCCCT CCTC     CC  CC C/T
rs8237522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
3SNPA AAAAAAC AACA  A AAA  AA A/C
rs8244981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78039343rAire : Intron
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1SNP  CC CCCA C     C C       A/C
rs52647583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNPT TTT T C TTCT     TT  TT C/T
rs52274518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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1SNPC CCC C G CCGC     CC  CC C/G
rs8245007
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1SNP  GG GGGT G     G G       G/T
rs8237523
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1SNP  TT TTTG T     T T       G/T
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1SNP  GG GGGC G     G G       C/G
rs8245004
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rs51595180
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1SNP  AAA A G AAGA     AA  AA A/G
rs8245003
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1SNP  C  CCCT C     C         C/T
rs8245002
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Gn : within coordinates of
1SNP  T  TTTG T     T         G/T
rs8237524
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rs8237525
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rs8237526
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rs8237527
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rs8237528
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rs8237529
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2SNP  TT TTTC T     T T       C/T
rs8237530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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2SNP  CC CCCT C     C         C/T
rs8244980
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2SNP  CC CCCT C T   C C      CC/T
rs8244979
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1SNP  CC CCCA C     C C       A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8244978
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1SNP  CC CCCG C     C C       C/G
rs8244977
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Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  CC CCCG C     C C       C/G
rs8244976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78042431rAire : Intron
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Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  GG GGGA G     G G       A/G
rs8237531
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Gn : within coordinates of
2SNP  AA AAAG A     A A       A/G
rs8245001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78042846rAire : Intron
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Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  GG GGGT G     G         G/T
rs8245000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78043464rAire : Coding-Synonymous
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dnmt3l : Intron
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  GG GGGT       G G       G/T
rs8237532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78043544fAire : mRNA-UTR
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Dnmt3l : Intron
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
2SNP  CC CCCT C     C C       C/T
rs8237533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78043828fAire : Locus-Region
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Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
2SNP  TT TTTC T     T T       C/T
rs8237534
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Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
2SNP  CC CCCT C     C C       C/T
rs8244975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
1SNP  AA AAAG A     A A       A/G
rs8256571
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Chr10:78044173rAire : Locus-Region
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dnmt3l : Intron
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C    TCC    C   C/T
rs8256570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78044231rAire : Locus-Region
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dnmt3l : Intron
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  C C T       CCCC    C   C/T
rs8256569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78044266rAire : Locus-Region
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dnmt3l : Intron
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Gn : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A    CAA    A   A/C
rs8244999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:78044776rAire : Locus-Region
Del(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dnmt3l : Intron
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
1SNP  TT TTTC T     T         C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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07/15/2014
MGI 5.18
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