About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Prnp
prion protein
MGI:97769

80 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27242152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910373fCpgi12296 : within coordinates of
nmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPT TTTT A TTTT T   TTTA/T
rs27242151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910469fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG C GGGG G   GCCC/G
rs27242150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910520fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   CCGC/G
rs27242149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910547fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG A GGGG G   GAAA/G
rs27242148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910592fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA G AAAA A   AAAA/G
rs6326824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910674fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP      A T            A/T
rs27242147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910783fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA G AAAA A   AAAA/G
rs27242146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910828fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGGG G   GAAA/G
rs27242145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131910837fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA G AAAA A   AAAA/G
rs27242144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911245fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA C AAAA A   AAAA/C
rs27242143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911262fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGGG G   GAAA/G
rs27242142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911318fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC A CCCC C   CAAA/C
rs27242141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911567fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   CTTC/T
rs27242140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911666fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG C GGGG G   GCCC/G
rs27242139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911695fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGAG G   GGGA/G
rs27242138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911716fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   CTTC/T
rs27242137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911833fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGGG G   GAAA/G
rs27242136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131911882fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT T TTTT T   TAAA/T
rs27242135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912029fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT G TTTT T   TTTG/T
rs27242134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912073fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA A AAAA A   ATTA/T
rs27242133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912089fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27242132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912114fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG A GGGG G   GAAA/G
rs27242131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912302fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27242130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912384fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27242129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912422fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG C GGCC G   GCCC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27242128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912472fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27242127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912581fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTT    TTGG T   TGGG/T
rs27242126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912852fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       G  AAA     A  A/G
rs27242125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131912944fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG A GGGG G   GGGA/G
rs27242124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131913233fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC A CCCC C   CCCA/C
rs27242123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131913585fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA A AAAA A   AGGA/G
rs27242122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131914634fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG A GGGG G   GGGA/G
rs27242121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131914728fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG A GGGG G   GGGA/G
rs27242120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131914897fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT T TTTT T   TCCC/T
rs27242119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131914945fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT C TTTT T   TTTC/T
rs27242118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131915235fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT T TT T T   TCTC/T
rs27242117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131915757fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCCC C   CCCC/T
rs27242116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131915880fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   CTTC/T
rs27242115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131915934fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT C TTTT T   TCCC/T
rs27242114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131915974fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   CTTC/T
rs27242113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131916126fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC C CCCC C   C TC/T
rs27242112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131916136fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT A TTTT T   TAAA/T
rs27242111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131916241fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC G CCCC C   CCCC/G
rs27242110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131916372fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  CCCC T CCTC C   CCCC/T
rs27242109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917081fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGGG G   GAAA/G
rs27242108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917099fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA T AAAA A   ATTA/T
rs27242107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917136fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA G AAAA A   AGGA/G
rs27242106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917235fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  TTTT C TTTT T   TTTC/T
rs27242105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917289fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  AAAA A AAAA A   ATTA/T
rs27242104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131917373fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP  GGGG G GGGT G   GGGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27242103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931365fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPT      G   TT     T  G/T
rs27242102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931489fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       G   GA     A  A/G
rs27242101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931512fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPT      T   CT T   T  C/T
rs27242100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931858fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPA      A   CA     A  A/C
rs27242099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931887fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPA      G    A     A  A/G
rs27242098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131931893fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       A   GA     A  A/G
rs27242097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131932024fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       A   GA     A  A/G
rs27242096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131932107fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPT  T   T   AT     T  A/T
rs27242095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131932250fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPC  C C T   CC     C  C/T
rs27242094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131932271fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPA  A A T    A AA  A  A/T
rs27242093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131932413fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       C   CT TT  T  C/T
rs27242092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131933129fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       G   TT     T  G/T
rs27242091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131933536fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       T   TC     T  C/T
rs27242090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131933613fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       G   AG     G  A/G
rs27242089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131933700fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPT  T T C   TT TT  T  C/T
rs233387438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131934025fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs51228479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131934910fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP CC      C           C
rs27242088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131935115fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       T   GT     T  G/T
rs27242087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131935157fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
2SNPCCCC   C C CT  C  C  C/T
rs49226490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131935167fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP GG      G           G
rs27242086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131936020fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNPG  G   A   GG GG  G  A/G
rs27242085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131936087fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Intron
1SNP       C   CC A   A  A/C
rs27242084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131936921fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : Coding-Synonymous
1SNPA  A A G   AA AA  A  A/G
rs6325757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131937635fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : mRNA-UTR
2SNP  A   A G        G   A/G
rs27242083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131938123fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : mRNA-UTR
1SNP       C   TT     T  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13474336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131938200fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : mRNA-UTR
2SNP AA    G   GG     A  A/G
rs27242082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131939378fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : 949 bp downstream of
1SNPA  A A G   GG     A  A/G
rs27242081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131939658fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : 1229 bp downstream of
1SNP   A A G   GA AA  A  A/G
rs27242080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131940117fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : 1688 bp downstream of
1SNP       G   AA     A  A/G
rs27242079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:131940290fnmf62 : within coordinates of
Prn : within coordinates of
Prnp : 1861 bp downstream of
1SNPC  C   T   CC CC  C  C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
02/02/2016
MGI 6.02
The Jackson Laboratory