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Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Sgce
sarcoglycan, epsilon
MGI:1329042

143 matching SNPs displayed
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Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29876204
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2SNP  C T CCC C/T
rs264205436
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1SNP       AG A/G
rs30007541
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rs32461923
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rs30612569
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rs231879160
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rs252206072
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rs30365680
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rs246728423
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rs30757383
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3SNP TT C TCT C/T
rs6394020
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rs227107480
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rs45796514
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rs30018010
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3SNP CC G CGC C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32460190
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rs32461067
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rs32461068
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rs32461069
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rs32461071
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rs32461864
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rs32461866
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rs212881165
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rs231826506
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rs32461868
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rs6223642
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rs6224160
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rs241320027
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rs30609515
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rs227523587
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1SNP       AG A/G
rs234976825
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Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs249262070
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rs30761937
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3SNPG G A GGG A/G
rs237175167
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rs255922170
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1SNP       CT C/T
rs223959778
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1SNP       AG A/G
rs248699437
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1SNP       CT C/T
rs32462769
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1SNP       AG A/G
rs234825281
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Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs249076599
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Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs32462770
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1SNP       TC C/T
rs225743366
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rs32463515
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Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs32463518
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Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs32463523
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1SNP       GC C/G
rs30708182
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rs6204534
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1SNP    AG    A/G
rs6204991
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Sig : within coordinates of
1SNP    AT    A/T
rs6204994
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1SNP    AT    A/T
rs6205085
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1SNP    TC    C/T
rs6205657
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1SNP    TG    G/T
rs6206159
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Sig : within coordinates of
1SNP    GA    A/G
rs6206656
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1SNP    TC    C/T
rs6206716
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Sig : within coordinates of
1SNP    CT    C/T
rs6207216
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1SNP    TA    A/T
rs32465777
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1SNP       CT C/T
rs3665949
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4SNPAAA T ATA A/T
rs32460530
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rs219650718
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1SNP       AG A/G
rs232487327
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1SNP       AG A/G
rs250151239
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1SNP       GT G/T
rs6349954
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Sig : within coordinates of
4SNPGG  A GGG A/G
rs246003950
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Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs6292526
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Chr6:4716037fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
2SNP   GC  GG C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs226498930
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Chr6:4716800fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       TG G/T
rs32463444
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Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs32463446
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Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs225702407
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Sig : within coordinates of
1SNP       TA A/T
rs32463453
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Chr6:4719339fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs32464297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4719968fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs233173301
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Sig : within coordinates of
1SNP       AC A/C
rs32464958
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Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs32464960
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Chr6:4721721fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs227893033
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Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs243290408
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Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs32465845
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Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs32465846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4722751fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs251555573
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Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs30413801
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Sig : within coordinates of
3SNPA A C AAA A/C
rs240576252
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Chr6:4725111fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs259944687
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Sig : within coordinates of
1SNP       CG C/G
rs32462096
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Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs30519854
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Sig : within coordinates of
3SNPGGG A  GG A/G
rs250275927
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Sig : within coordinates of
1SNP       AA A
rs32463024
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Sig : within coordinates of
1SNP GG   G  AA/G
rs32463026
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Sig : within coordinates of
1SNP GG   G  AA/G
rs32463028
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Sig : within coordinates of
1SNP CC   C  TC/T
rs32463029
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Chr6:4729983fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP  T      CC/T
rs219437817
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Chr6:4730150fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32463031
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Chr6:4730366fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs32463032
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Sig : within coordinates of
1SNP GG   G  AA/G
rs32463033
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Chr6:4730716fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP CC   C  AA/C
rs32463924
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Sig : within coordinates of
1SNP CC   C  TC/T
rs32463925
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Chr6:4730867fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP CC   C  TC/T
rs265493985
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Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs32463930
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Chr6:4733539fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs30163717
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Chr6:4734069fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
3SNPGGG A GGG A/G
rs264466922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4734474fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       TA A/T
rs32463932
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Chr6:4735227fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs243216910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4735381fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs213848189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4736262fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs6167532
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Chr6:4736287fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP    AC    A/C
rs6167546
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Chr6:4736293fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
2SNP    AG GA A/G
rs6168732
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Chr6:4736518fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
2SNP    TG GT G/T
rs6169263
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Chr6:4736601fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP    CT    C/T
rs6169761
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Sig : within coordinates of
1SNP    CT    C/T
rs217547585
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Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs30350766
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Sig : within coordinates of
1SNPGTT G T   G/T
rs30268177
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Sig : within coordinates of
2SNPGGT G TTT G/T
rs263606054
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Chr6:4737308fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs32464625
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Chr6:4737392fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs229691743
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Chr6:4737502fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs250184329
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Chr6:4737590fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs219404603
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Chr6:4737928fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs232630566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4738367fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs32464630
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Chr6:4739255fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs108724185
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Chr6:4740348fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP GG   G  CC/G
rs108240418
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Chr6:4740373fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP AA   A  TA/T
rs108252649
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Chr6:4740427fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP GG   G  AA/G
rs107845112
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Chr6:4740428fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP CC   C  GC/G
rs107851323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4740497fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP AA   A  GA/G
rs32465146
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Chr6:4740567fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP AA   A  GA/G
rs107724404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4740583fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP AA   A  GA/G
rs225115398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4740695fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs247435535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4741584fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       AG A/G
rs29877124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4742042fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
3SNP AA T AAA A/T
rs218016331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4742159fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs236813100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4742339fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       CT C/T
rs255597546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4742570fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GA A/G
rs32465147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4742659fSgce : Intron
Sig : within coordinates of
1SNP       GC C/G
rs257550298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4747462fPeg10 : mRNA-UTR
Sgce : Locus-Region
Sig : within coordinates of
1SNP       TC C/T
rs3712760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:4748196fPeg10 : Intron
Sgce : Locus-Region
Sig : within coordinates of
4SNPCCC T  CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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07/15/2014
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