About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Trex1
three prime repair exonuclease 1
MGI:1328317

37 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51026814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109055946fcir : within coordinates of
Shisa5 : Intron
Trex1 : 1987 bp downstream of
1SNPG GGGG AGGAG GG GAGA/G
rs48842419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109056115fcir : within coordinates of
Shisa5 : Intron
Trex1 : 1818 bp downstream of
1SNPT TTTT CTTCT TT TCTC/T
rs51523999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109056601fcir : within coordinates of
Shisa5 : Intron
Trex1 : 1332 bp downstream of
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs50830459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109057254fcir : within coordinates of
Shisa5 : mRNA-UTR
Trex1 : 679 bp downstream of
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs48775205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109057339fcir : within coordinates of
Shisa5 : mRNA-UTR
Trex1 : 594 bp downstream of
1SNPA AAAA GAAGA AA AGAA/G
rs45773269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109057395fcir : within coordinates of
Shisa5 : mRNA-UTR
Trex1 : 538 bp downstream of
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs13474766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109057581fcir : within coordinates of
Shisa5 : mRNA-UTR
Trex1 : Locus-Region
3SNPAAA   G A   A  A   A/G
rs48820952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109057925fcir : within coordinates of
Shisa5 : Locus-Region
Trex1 : Locus-Region
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs48887923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109058216fAtrip : within coordinates of
cir : within coordinates of
Shisa5 : Locus-Region
Trex1 : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG GGGTG GG GTGG/T
rs49095601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109058442fAtrip : within coordinates of
cir : within coordinates of
Trex1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs49163370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109058927fAtrip : within coordinates of
cir : within coordinates of
Trex1 : mRNA-UTR
2SNP GG     G   G  G   G
rs48461416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059200fAtrip : within coordinates of
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : mRNA-UTR
1SNPC CCCC CCCAC CC  ACA/C
rs3685576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059379fAtrip : Locus-Region
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : Locus-Region
5SNPG GGGGA GAAGGGGGGAGA/G
rs47875816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059383fAtrip : Locus-Region
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : Locus-Region
1SNP       G AA      A A/G
rs47054965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059471fAtrip : Locus-Region
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : Locus-Region
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs3686744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059553fAtrip : Locus-Region
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : Locus-Region
4SNPA A   G A   A  A   A/G
rs30475462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059558fAtrip : Locus-Region
cir : within coordinates of
Trex1 : Intron
Trex1 : Locus-Region
1SNP  T   C C          C/T
rs50668372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059786fAtrip : mRNA-UTR
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPA AAAA AAGAA AA AAAA/G
rs49943176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059817fAtrip : mRNA-UTR
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNP    CC TCCC  C  C  C/T
rs52065714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109059881fAtrip : Coding-NonSynonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs46477230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060242fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPG GG   AGGGG GG  GGA/G
rs33775143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060251fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
4SNPA AAAAGGAGGAAAAAAGAA/G
rs33714019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060290fAtrip : Coding-NonSynonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
4SNPT TTTTCCTCCTTTTTTCTC/T
rs46680169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060390fAtrip : Coding-Synonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs47057183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060754fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPT TTTT TTTGT TT T TG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs45989045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060845fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPT TTTT CTTCT TT TTTC/T
rs30421244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060933fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
3SNP GG   A G   G  G   A/G
rs29636454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109060955fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
4SNPAAAAAAT AT AAAAAATAA/T
rs33666596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109061075fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
3SNP AA   G A   A  A   A/G
rs50128109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109061209fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPG GGGG GGGAG GG GGGA/G
rs48524204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109061553fAtrip : Coding-NonSynonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
2SNP  G     G   G  G   G
rs51676792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109061596fAtrip : Coding-Synonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
3SNPT T    ATAA TTTA A A/T
rs46920584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109061631fAtrip : Coding-NonSynonymous
cir : within coordinates of
Trex1 : Locus-Region
1SNPC CCCC CCC C CC CTCC/T
rs50203358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109062055fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : 1717 bp upstream of
1SNPA AA A AAAGA AA AGAA/G
rs30483481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109062156fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : 1818 bp upstream of
3SNP CC   T C   C  C   C/T
rs29982683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109062227fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : 1889 bp upstream of
3SNP CC   A C   C  C   A/C
rs46638483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:109062326fAtrip : Intron
cir : within coordinates of
Trex1 : 1988 bp upstream of
1SNPT TTCT CTCCT TT T TC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory