About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Rad51
RAD51 homolog
MGI:97890

87 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33465132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118936780fRad51 : Locus-Region1SNPC T   C  T        C/T
rs33331591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118936825fRad51 : Locus-Region1SNPG A      A        A/G
rs27453724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118937928fRad51 : Locus-Region2SNPTTGTGT T GTGTTTTTTG/T
rs27453723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938084fRad51 : Locus-Region2SNPTTCTCTCC CTCTT TC C/T
rs27453722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938231fRad51 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs27453721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938264fRad51 : Locus-Region2SNPGGGGGGCC GGCGGCGCGC/G
rs27453720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938353fRad51 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGGGGGGAGA/G
rs33124820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938408fRad51 : Locus-Region1SNP GA   A  A        A/G
rs29832153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938416fRad51 : Locus-Region1SNP AG   G  G        A/G
rs27453719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938509fRad51 : Locus-Region2SNPAAGAGAGG GAGAAGAGAA/G
rs27453718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938640fRad51 : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27453717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938678fRad51 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGGGGAGGGA/G
rs27453716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938685fRad51 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGGGGGGAGA/G
rs27453715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938735fRad51 : mRNA-UTR1SNPT GGGG G GGGGTGGGGG/T
rs27453714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938761fRad51 : mRNA-UTR1SNPC TCTC C TCC CC CCC/T
rs27453713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118938878fRad51 : Intron1SNPA GAGA A  AAAAAAAAA/G
rs27453712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118939077fRad51 : Intron1SNPT GTGT T GTGTTGTGTG/T
rs27453711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118939099fRad51 : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs29506223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118939578fRad51 : Intron1SNPG G   A  G        A/G
rs33203171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118939870fRad51 : Intron1SNP AA   G  A        A/G
rs33479084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118940449fRad51 : Intron1SNP TC   T  C        C/T
rs33085148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118940657fRad51 : Intron1SNPTTC      C        C/T
rs27453710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941264fRad51 : Intron1SNPA      A A G AAA  A/G
rs29769886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941480fRad51 : Intron1SNP TC   C           C/T
rs29820093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941480fRad51 : Intron1SNP GA   G           A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33097752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941647fRad51 : Intron1SNP GC   G  C        C/G
rs29721022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941701fRad51 : Intron1SNP CC   T  C        C/T
rs27453709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118941961fRad51 : Intron2SNPG AGAGGG AGGGGGG GA/G
rs29632876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118942494fRad51 : Intron1SNPTTA      A        A/T
rs29732879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118942512fRad51 : Intron1SNPTTC   C  C        C/T
rs29719202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118942953fRad51 : Intron1SNP GG   A           A/G
rs33192950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118943093fRad51 : Intron1SNP CC   T           C/T
rs33037810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118943529fRad51 : Intron1SNP CA   C  A        A/C
rs33595238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118943610fRad51 : Intron1SNP CT   C  T        C/T
rs33082188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118943743fRad51 : Intron1SNP CC   T  C        C/T
rs33318957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118943764fRad51 : Intron1SNP AG   G  G        A/G
rs33061960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118947717fRad51 : Intron1SNP TA   T           A/T
rs27453708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118947807fRad51 : Intron2SNPAAAA ATA AAT ATA  A/T
rs29546268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118948903fRad51 : Intron1SNPCCC   T           C/T
rs27453707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118949757fRad51 : Intron2SNPCCC   T  C   CTC  C/T
rs29765040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118949862fRad51 : Intron1SNP TT   C  T        C/T
rs29860330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118950052fRad51 : Intron1SNP TC   C  C        C/T
rs29971694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118950152fRad51 : Intron1SNP G    A  G        A/G
rs29685388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118950442fRad51 : Intron1SNP      G  A        A/G
rs27453706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118951581fRad51 : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs27453705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118951622fRad51 : Intron1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs27453704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118951709fRad51 : Intron1SNPT TTTT T TTCTTTTTTC/T
rs27453703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118952118fRad51 : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs27453702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118952745fRad51 : Intron1SNPT TTTT T TTCTTCTCTC/T
rs27453701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118952873fRad51 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG G GGGGGGGCGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33057076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118953543fRad51 : Intron1SNP GG   T  G        G/T
rs29504910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118954857fRad51 : Intron1SNP  A   T  A        A/T
rs27453700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118955896fRad51 : Intron1SNPC CCCC C CCGCCCCCCC/G
rs6409590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118956158fRad51 : Intron1SNP      C T         C/T
rs27453699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118956300fRad51 : Intron1SNP  A AA   A A AG AAA/G
rs33734606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118956503fRad51 : Intron1SNPAAC   C  C        A/C
rs27453698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118956574fRad51 : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs27453697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118957196fRad51 : Intron2SNPCCTCTCCC TCCCCCCCCC/T
rs27453696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118957243fRad51 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs3670615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118957360fRad51 : Intron3SNPAAAAAAGA AAAAAGAAAA/G
rs4139952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118957500fRad51 : Intron1SNPA     G           A/G
rs27453695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958255fRad51 : Intron1SNPG GGGG A GGGGGGGGGA/G
rs27453694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958264fRad51 : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs33269478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958473fRad51 : Intron1SNPAAA   G  A        A/G
rs32978677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958617fRad51 : Intron1SNPC T   C  T        C/T
rs27453693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958690fRad51 : Intron1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27453692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118958807fRad51 : Intron2SNPAAGAGAGG GAG AGAGAA/G
rs27453691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959034fRad51 : Intron2SNPGGGGGGAG GG GGAGGGA/G
rs27453690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959086fRad51 : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs32996084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959151fRad51 : Intron1SNP TT   A  T        A/T
rs29672006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959574fRad51 : Intron1SNP  C   G  C        C/G
rs32971448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959582fRad51 : Intron1SNP  A   G  A        A/G
rs29579507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118959770fRad51 : Intron1SNPCCC   T  C        C/T
rs33226946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118960433fRad51 : Intron1SNP AA   G  A        A/G
rs27453689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118960939fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPA AAAA A AATAAAAAAA/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13461170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961095fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
2SNPGGGGGGAG GGAGGAGA A/G
rs13461171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961545fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
2SNPCCCCCCTC CCCCCTCCCC/T
rs27453688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961603fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27453687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961660fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
2SNPGGAGAGAG AGAGGAGAGA/G
rs32889086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961691fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPTTT   A  T        A/T
rs27453686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961725fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
1SNP  A AA   A G  A AAA/G
rs27453685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961733fRad51 : mRNA-UTR
Rmdn3 : Locus-Region
2SNPGGAGAGAG AG GGAGAGA/G
rs27453684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961912fRad51 : Locus-Region
Rmdn3 : Locus-Region
2SNPGGGGGGAG GGGGGAGAGA/G
rs27453683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961938fRad51 : Locus-Region
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPA AAAA A AAGAAAAAAA/G
rs27453682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118961992fRad51 : Locus-Region
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGAGGGGGGA/G
rs29539265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118962040fRad51 : Locus-Region
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPAAA   T  A        A/T
rs33292361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:118962040fRad51 : Locus-Region
Rmdn3 : Locus-Region
1SNPAAA   T  A        A/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory