About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Apoc3
apolipoprotein C-III
MGI:88055

90 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8254909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230949fApoa1 : Locus-Region
Apoc3 : 1984 bp downstream of
1SNP     GGG  C G   G   G  GG                G           C/G
rs8254910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230961fApoa1 : Locus-Region
Apoc3 : 1972 bp downstream of
1IN-DEL  C  CCC  C C   C   -  CC                C           -/C
rs8254911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230962fApoa1 : Locus-Region
Apoc3 : 1971 bp downstream of
1IN-DEL  AA AAA  A A   A   -  AA                A           -/A
rs8254912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231009fApoc3 : 1924 bp downstream of4SNPG GA GGA  G G GGA  AG  G A          GG   G   A G   A A/G
rs8254913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231032fApoc3 : 1901 bp downstream of1IN-DEL   A AAA    A   A   -  AA                A           -/A
rs8254914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231033fApoc3 : 1900 bp downstream of1IN-DEL   A AAA    A   A   -  AA                A           -/A
rs8254915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231034fApoc3 : 1899 bp downstream of1IN-DEL   C CCC    C       -  CC                C           -/C
rs8254916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231035fApoc3 : 1898 bp downstream of1IN-DEL   A AAA    A       -  AA                A           -/A
rs8254917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231045fApoc3 : 1888 bp downstream of1SNP   A AAA  A A   A   G  AA                A           A/G
rs30179423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231278fApoc3 : 1655 bp downstream of3SNP GA    G    A      G                 A               A/G
rs30163859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231303fApoc3 : 1630 bp downstream of3SNP GG    A    G      A                 G               A/G
rs8254926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231569rApoc3 : 1364 bp downstream of1SNP  TT TTT  A T       A ATT                A           A/T
rs8254925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231570rApoc3 : 1363 bp downstream of1SNP  CC CCC  T C       T TCC                T           C/T
rs8254924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231571rApoc3 : 1362 bp downstream of1SNP  GG GGG  A G       A AGG                A           A/G
rs8254923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231572rApoc3 : 1361 bp downstream of1SNP  CC CCC  A C       A ACC                A           A/C
rs8254922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231574rApoc3 : 1359 bp downstream of1SNP  GG GGG  T G       T TGG                T           G/T
rs46458436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231601fApoc3 : 1332 bp downstream of2SNP  C         C      T                 C               C/T
rs8254921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231642rApoc3 : 1291 bp downstream of1SNP  GGGGGG  G G       A GGG                G  G        A/G
rs8254920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231700rApoc3 : 1233 bp downstream of1SNP  CCCCCC  C C       T CCC                C  C        C/T
rs8254919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231705rApoc3 : 1228 bp downstream of1SNP  CCCCCC  C C       A CCC                C  C        A/C
rs8254918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231745rApoc3 : 1188 bp downstream of1SNP  AAAAAA  A A       T AAA                A  A        A/T
rs30481522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231832fApoc3 : 1101 bp downstream of1SNPA           C                                        A/C
rs33638305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231838fApoc3 : 1095 bp downstream of1SNPC           A                                        A/C
rs29890415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231857fApoc3 : 1076 bp downstream of2SNPT AAA AA  A AATA         A          T        A T   A A/T
rs8239771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231972rApoc3 : 961 bp downstream of2SNPA AAAAAA  G AAAA        AA          A    A   A A   A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8239770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231997rApoc3 : 936 bp downstream of2SNPG GGGGGG  A GGGG        GG          G    G   G G   G A/G
rs8239769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232061rApoc3 : 872 bp downstream of2SNPC TTTTTT  C TTCT        TT          C    T   T C   T C/T
rs8239768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232117rApoc3 : 816 bp downstream of1SNP     TTT  G             T                T           G/T
rs32675401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232285fApoc3 : 648 bp downstream of4SNPG GAG GA    GG G   A     A           G       A     A A/G
rs32675403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232294fApoc3 : 639 bp downstream of2SNPG TTT T   G TTGT         T          G        T     T G/T
rs30143276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232310fApoc3 : 623 bp downstream of1SNPA T    A    T                                        A/T
rs32676605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232311fApoc3 : 622 bp downstream of1SNPG  G      G  TGT         G          G        G G   G G/T
rs29692542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232331fApoc3 : 602 bp downstream of1SNPA G    A    G                                        A/G
rs29734906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232332fApoc3 : 601 bp downstream of1SNPT C    T    C                                        C/T
rs30086290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232334fApoc3 : 599 bp downstream of3SNPG GA   A    G G          A          G        A G   A A/G
rs29738245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232514fApoc3 : 419 bp downstream of3SNPA GGG GG  A GGAG         G          A        G A   G A/G
rs29882647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232589fApoc3 : Locus-Region2SNPA G    G    G                                        A/G
rs30480236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232592fApoc3 : Locus-Region2SNPT C    C    C                                        C/T
rs8254927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232653fApoc3 : Locus-Region5SNPA AGAAAG  G AAAA   G  A GG          AA   A   G     G A/G
rs8254928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232667fApoc3 : Locus-Region3SNPC TT TTT    T         C T                T           C/T
rs8254929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232794fApoc3 : Locus-Region4SNPG AAAAAA  G AAGA      G AA          G    A   A G   A A/G
rs3673973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232927fApoc3 : Locus-Region5SNPG AGA AG  G AAGA   G     G          GA       G G   G A/G
rs32674708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233080fApoc3 : mRNA-UTR1SNPA GGG G   A GGAG         G          A        G A   G A/G
rs32674710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233203fApoc3 : mRNA-UTR1SNP  AAA A     AAGA         A          G        A G   A A/G
rs32674712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233317fApoc3 : Coding-NonSynonymous2SNPG AGA A   G AAGA   G     G          GA       G G   G A/G
rs32675664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233496fApoc3 : Intron
D9Mit93 : within coordinates of
2SNP   A        TTTT   A     A          TT       A     A A/T
rs32675666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233535fApoc3 : Intron
D9Mit93 : within coordinates of
1SNPT CCC C   C CCTC         C          T        C T   C C/T
rs32675668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233643fApoc3 : Intron1SNP  AAA A   C AACA         A          C        A C   A A/C
rs32675670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233693fApoc3 : Intron1SNPT CCC C   T CCTC         C          T        C T   C C/T
rs32675672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46233752fApoc3 : Intron1SNPG AAA A   G AAGA         A          G        A G   A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33698221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234007fApoc3 : Intron3SNP GG    A    G      A                 G               A/G
rs32676264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234138fApoc3 : Intron1SNPG GGG G   A GGGG         G          G        G G   G A/G
rs32676266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234258fApoc3 : Intron1SNPC CCC C   T CCCC         C          C        C C   C C/T
rs8254946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234285rApoc3 : Intron3SNP ACCCC C  A C       A AC                    C        A/C
rs8254945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234289rApoc3 : Intron3SNP TGGGG G  T G       G TG                    G        G/T
rs8254944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234308rApoc3 : Intron3SNP TCCCCCC  C C       T TCC                C  C        C/T
rs8254943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234345rApoc3 : Intron4SNPGGTTTTTT  G TTGT    T GTTT          G       TT G   T G/T
rs8254933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234398rApoc3 : Intron10Mixed  TTTTTT  - T       T TTT                T  T        -/C/G/T
rs8254932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234452rApoc3 : Coding-Synonymous1SNP  TTTTTT  T T       C TTT                T  T        C/T
rs8254931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234500rApoc3 : Coding-Synonymous5SNPGGGAGGGA  G GGGG   AG GGAA          GG   G  AA G   A A/G
rs32676270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234543fApoc3 : Intron3SNPTTGGG GG  G GGTG         G          T        G     G G/T
rs8254930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234573rApoc3 : Intron4SNPAAGGGGGG  G GGAG    G AG G          A       GG A   G A/G
rs29889677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234722fApoc3 : mRNA-UTR3SNPTTCCC CC    CCTC         C          T        C T   C C/T
rs33631048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234844fApoc3 : Intron1SNP CT    T    T                                        C/T
rs29838551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234857fApoc3 : Intron1SNP AT    T    T                                        A/T
rs32677564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46234924fApoc3 : Intron1SNPC TTT T   T TTCT         T          C        T C   T C/T
rs30377955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235110fApoc3 : Intron1SNP TC    C                                             C/T
rs29586745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235130fApoc3 : Intron1SNP CC    A                                             A/C
rs263673065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235130fApoc3 : Intron1SNP                   A                 C               A/C
rs29881777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235183fApoc3 : Intron2SNPCCAAA AA  C AACA         A          C        A C   A A/C
rs8254951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235208rApoc3 : Intron1IN-DEL  GG GGG  G G   G   - GGG                G           -/G
rs8254950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235209rApoc3 : Intron1IN-DEL  AA AAA  A A   A   - AAA                A           -/A
rs8254949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235444rApoc3 : Locus-Region1SNP  CC CCC  C C   C   T CCC                C           C/T
rs8254948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235483rApoc3 : Locus-Region4SNPAAGGGGGG  G GGAGG   G AGGG          A    G   G A   G A/G
rs8254947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235521rApoc3 : Locus-Region1SNP  GG GGG  G G   G   A GGG                G           A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32677568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46235592fApoc3 : Locus-Region1SNPG GGG G   A GGGG         G          G        G G   G A/G
rs29599646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236045fApoc3 : Locus-Region3SNPGGAAA AA  A AAGA         A          G        A G   A A/G
rs32677571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236101fApoc3 : Locus-Region1SNPA GGG G   A GGAG         G          A        G     G A/G
rs33637453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236120fApoc3 : Locus-Region2SNP  G    A    G                                        A/G
rs3687238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236490fApoc3 : Locus-Region1SNPG      A                                             A/G
rs4138339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236660fApoc3 : Locus-Region3SNPC C    T    C      T                 C               C/T
rs3703028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236811fApoc3 : Locus-Region3SNPGGTTT TT  T TTGT         T          G        T G   T G/T
rs3703046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236825fApoc3 : Locus-Region3SNPAAGGG GG  G GGAG         G          A        G A   G A/G
rs32678855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46236994fApoc3 : Locus-Region1SNPA AAA A   G AAAA         A          A        A A   A A/G
rs29737246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237144fApoc3 : Locus-Region4SNPCCCTC CT  C CCCC   T     T          CC       T C   T C/T
rs30177614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237215fApoc3 : Locus-Region3SNPGGAGA AG  G AAGA         G          G        G G   G A/G
rs32678859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237218fApoc3 : Locus-Region3SNPCCGGG GG  G GGCG         G          C        G C   G C/G
rs32678861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237241fApoc3 : Locus-Region1SNPG AAA A   G A  A         A                   A G   A A/G
rs13480172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237354fApoc3 : 1718 bp upstream of5SNPGGTGT TGGGGGTTGTGGGG T   GTGGGTGTGGGGTGGG GG GGGTGGGTG/T
rs32679864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46237623fApoc3 : 1987 bp upstream of3SNPCCTTT TT  T TTCT         T          C        T C   T C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory