About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Axin2
axin2
MGI:1270862

75 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29447109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108780412fAxin2 : Locus-Region1SNP C    G C        C/G
rs27006602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108790428fAxin2 : Intron1SNPC  C C TCCCCCCCCCC/T
rs27006601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108790438fAxin2 : Intron1SNPA A  A AAA AAAATAA/T
rs27006600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108790722fAxin2 : Intron1SNP       GAAAAAAAAAA/G
rs27006599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108791286fAxin2 : Intron1SNPT T TT CTT TTTTT C/T
rs27006598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108791519fAxin2 : Intron1SNPT T TT TTT TTTTC C/T
rs27006597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108791597fAxin2 : Intron1SNPA A AA CAA AAAAA A/C
rs27006596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108791795fAxin2 : Intron1SNP  C CC TCC CC  C C/T
rs27006595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108791996fAxin2 : Intron1SNP  G GG C G GG GC C/G
rs27006594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108792186fAxin2 : Intron1SNP  G GG CGG GGGGG C/G
rs27006593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108792255fAxin2 : Intron1SNP  G GG A   GGG G A/G
rs27006592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108792515fAxin2 : Intron1SNP  A AA  AA AAAAG A/G
rs27006591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108792825fAxin2 : Coding-Synonymous1SNPC C CC CCC CCCCT C/T
rs27006590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108793119fAxin2 : Intron1SNP  T TT T T TTTTC C/T
rs27006589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108793310fAxin2 : Intron1SNP  A AA G A AAA G A/G
rs27006588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108793321fAxin2 : Intron1SNP  A AA GAA AAAAG A/G
rs27006587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108793755fAxin2 : Intron1SNPG G GG AGG GGGGG A/G
rs27006586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108794342fAxin2 : Intron1SNP  G GG  GG GGGGA A/G
rs27006585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795158fAxin2 : Intron1SNP  T TT C T TTT C C/T
rs27006584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795183fAxin2 : Intron1SNPG G GG AGG GGGGA A/G
rs27006583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795306fAxin2 : Intron1SNP    AA T   AA  A A/T
rs27006582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795402fAxin2 : Intron1SNPA A AA GAA AAAAA A/G
rs27006581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795478fAxin2 : Intron1SNP  A AA A A AAA G A/G
rs27006580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795527fAxin2 : Intron1SNP  G GG  GG GGG T G/T
rs27006579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795529fAxin2 : Intron1SNP  C CC TCC CCCCC C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27006578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795601fAxin2 : Intron1SNP  T TT C T TTTTC C/T
rs27006577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108795996fAxin2 : Intron1SNP  T TT CTT TTTT  C/T
rs27006576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108796110fAxin2 : Intron1SNP  A AA GAA AAAAA A/G
rs27006575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108796394fAxin2 : Intron1SNP  A AA G A AAAAG A/G
rs27006574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108796740fAxin2 : Intron1SNPG G GG AGG GGGGG A/G
rs29466636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797041fAxin2 : Intron1SNP CC   A C        A/C
rs27006573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797125fAxin2 : Intron1SNPT T TT CTT TTTTT C/T
rs27006572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797329fAxin2 : Intron1SNP  T TT TTT TTTTC C/T
rs27006571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797490fAxin2 : Intron1SNP  G GG A G GG    A/G
rs27006570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797529fAxin2 : Intron1SNPC C CC TCC CCCCC C/T
rs27006569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797582fAxin2 : Intron1SNP  C CC CCC CCCCT C/T
rs27006568
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797683fAxin2 : Intron1SNP  G  G   G GGG T G/T
rs27006567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797746fAxin2 : Intron1SNP  A AA AAA AAA T A/T
rs27006566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108797926fAxin2 : Intron1SNP  C CC TCC CCC T C/T
rs29451121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108798137fAxin2 : Intron1SNP  G   A G        A/G
rs27006565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108798711fAxin2 : Intron1SNP  A AA  AA AAAAG A/G
rs27006564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108798810fAxin2 : Intron1SNP  A AA AAA AAAAG A/G
rs27006563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799197fAxin2 : Intron1SNP  A AA CAA AAAAA A/C
rs27006562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799294fAxin2 : Intron1SNPT T TT TTT TTTTA A/T
rs27006561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799310fAxin2 : Intron1SNP  C CC T C CCC C C/T
rs27006560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799357fAxin2 : Intron1SNPC C CC CCC CCCCT C/T
rs27006559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799394fAxin2 : Intron1SNP  A AA C A AAA C A/C
rs27006558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799464fAxin2 : Intron1SNP  G GG G G GGGGC C/G
rs27006557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799671fAxin2 : Intron1SNPC C CC T C CCCCT C/T
rs27006556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799827fAxin2 : Intron1SNP    TT   C TT  T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27006555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108799829fAxin2 : Intron1SNP  C CC T C CCC C C/T
rs27006554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108800194fAxin2 : Intron1SNP  T TT TTT TTTTG G/T
rs27006553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108800376fAxin2 : Intron1SNPG GT G GG TGGGGGTG/T
rs27006552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108800423fAxin2 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs27006551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108800535fAxin2 : Intron1SNPA AG A  AAGA AAAGA/G
rs27006550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108800556fAxin2 : Intron1SNPG GC G  GGCG GG CC/G
rs27006549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108801792fAxin2 : Intron1SNPG GGGG GGGGG GGAGA/G
rs27006548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108801843fAxin2 : Intron1SNPG GA G  GGAG GGAAA/G
rs27006547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108802236fAxin2 : Intron1SNPT TC T  TTCT TTCCC/T
rs27006546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108802470fAxin2 : Intron1SNPC CTCC CCCTC CCTTC/T
rs27006545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108803173fAxin2 : Intron1SNP  AC A  AACA A CCA/C
rs27006544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108803684fAxin2 : Coding-Synonymous1SNPT TCTT CTTCT TT CC/T
rs29468973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108804677fAxin2 : Intron1SNP  C   T          C/T
rs29446456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108805367fAxin2 : Intron1SNP GA              A/G
rs27006543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108805632fAxin2 : Intron1SNPC CG C  CCGC CCGGC/G
rs27006542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108805737fAxin2 : Intron1SNPA AG A  AAGA AAGGA/G
rs27006541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108806013fAxin2 : Intron1SNPC CT C  CCTC CCTTC/T
rs27006540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108806050fAxin2 : Intron1SNPA AT A  AATA AATTA/T
rs27006539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108806256fAxin2 : Intron1SNPA AG A  AAGA AAGGA/G
rs27006538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108809753fAxin2 : Intron1SNPA AG A  AAGA AAGGA/G
rs27006537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108812212fAxin2 : Locus-Region1SNP   A   G  A GG AAA/G
rs27006536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108812270fAxin2 : Locus-Region1SNP   G   G  G  G GTG/T
rs27006535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108812370fAxin2 : Locus-Region1SNP   G   G     G GAA/G
rs27006534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108812489fAxin2 : Locus-Region1SNP   A   G  A  A AAA/G
rs27006533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:108812567fAxin2 : Locus-Region1SNP  TT   C  T  T TTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory