About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cer1
cerberus 1 homolog (Xenopus laevis)
MGI:1201414

52 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6243199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82525911fCer1 : Locus-Region1SNPG    A           A/G
rs6256759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526139fCer1 : Locus-Region3SNPTT T CT TCT TCTTTC/T
rs6257761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526309fCer1 : Locus-Region2SNPGG   A  G        A/G
rs6257774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526310fCer1 : Locus-Region2SNPGG   A  G        A/G
rs28072612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526353fCer1 : Locus-Region2SNPAA A CA AC   C  AA/C
rs6258769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526506fCer1 : Locus-Region2SNPAA   G AA        A/G
rs28072611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526692fCer1 : Locus-Region2SNPAAGG AA G A  AAAGA/G
rs32994125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82526862fCer1 : Locus-Region1SNPGGA  A           A/G
rs28072610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527442fCer1 : Locus-Region2SNPGGGG AA G G    GGA/G
rs28072609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527473fCer1 : Locus-Region2SNPTTTT AT T T  ATTTA/T
rs32591015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527745fCer1 : mRNA-UTR1SNPT C  T  C        C/T
rs28072608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527844fCer1 : mRNA-UTR2SNPA GGGGG GGGGAG GGA/G
rs28072607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527863fCer1 : mRNA-UTR2SNPA GG AG   G AAAGGA/G
rs28072606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527903fCer1 : mRNA-UTR1SNPG  G  G  GT GGGTGG/T
rs32539735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527967fCer1 : mRNA-UTR1SNPT    C           C/T
rs28072605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82527980fCer1 : mRNA-UTR1SNPA  G  A  AA AAAAGA/G
rs28072604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528065fCer1 : mRNA-UTR1SNPA  G  G   G AGAGGA/G
rs32595538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528265fCer1 : mRNA-UTR1SNPT C  T           C/T
rs32341980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528299fCer1 : mRNA-UTR1SNPA T              A/T
rs32825828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528299fCer1 : mRNA-UTR1SNPA T              A/T
rs32984374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528299fCer1 : mRNA-UTR1SNPA T              A/T
rs32341805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528633fCer1 : Coding-NonSynonymous1SNP  A  C  A        A/C
rs31776352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528670fCer1 : Coding-NonSynonymous1SNP  C  A  C        A/C
rs28072603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528908fCer1 : Intron2SNPC A  CC A C CC CAA/C
rs31781185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82528953fCer1 : Intron1SNP  C  T  C        C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28072602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529140fCer1 : Intron1SNPG  G  C   G GG GGC/G
rs28072601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529268fCer1 : Intron1SNPC  T  C  CC CCCCTC/T
rs28072600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529282fCer1 : Intron1SNPC  C  T   C CCCCCC/T
rs28072599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529348fCer1 : Intron1SNPG     G   G GGGGTG/T
rs28072598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529366fCer1 : Intron1SNP      T   C TC CCC/T
rs28072597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529571fCer1 : Intron1SNP      G   G TG GGG/T
rs28072596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529684fCer1 : Intron2SNPG    GG TGG GGGGTG/T
rs28072595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529738fCer1 : Intron1SNPG  G  A GG  GGG GA/G
rs28072594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529740fCer1 : Intron1SNPC  C  C CCT CCCTCC/T
rs28072593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529778fCer1 : Intron1SNP   C  T   C C   CC/T
rs28072592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82529993fCer1 : Intron1SNPG  G  A  GG GGGGGA/G
rs28072591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530064fCer1 : Intron2SNPA CC A   CA A AACA/C
rs28072590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530066fCer1 : Intron1SNPT  T  C  TT TTTTTC/T
rs28072589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530094fCer1 : Intron1SNP      A      C  CA/C
rs31940362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530108fCer1 : Intron1SNP  T  A           A/T
rs28072588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530363fCer1 : Intron1SNPT     T   T TTTTCC/T
rs32757000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530382fCer1 : Intron1SNP  G  C           C/G
rs31840724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530402fCer1 : Intron1SNP  A  T           A/T
rs31934191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530404fCer1 : Intron1SNP  C  T           C/T
rs28072587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530450fCer1 : Intron2SNPA TT AA  AA AAAATA/T
rs28072586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530581fCer1 : Coding-NonSynonymous2SNPC TTCCC TCC CCCCCC/T
rs28072585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530735fCer1 : Coding-Synonymous1SNPT  T  G  TT TTTTTG/T
rs28072584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530810fCer1 : Coding-NonSynonymous2SNP  T  CC T C     TC/T
rs28072583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82530972fCer1 : Coding-NonSynonymous1SNPC  CC    CC C CCAA/C
rs28072582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82531267fCer1 : Locus-Region1SNPT  T  G T T TTTTTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28072581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82531303fCer1 : Locus-Region1SNPT     C   T  T TTC/T
rs28072580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:82531541fCer1 : Locus-Region1SNPT  TT G TTG TTT TG/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory