About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pitx3
paired-like homeodomain transcription factor 3
MGI:1100498

61 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37273972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46133856fElovl3 : Intron
Pitx3 : 1829 bp downstream of
stn : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC   CC  CC C/T
rs36573705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46133922fElovl3 : Intron
Pitx3 : 1763 bp downstream of
stn : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG   GG  GGGA/G
rs38282494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46133997fElovl3 : Intron
Pitx3 : 1688 bp downstream of
stn : within coordinates of
1SNPC CCCC TCCCC   CC  CC C/T
rs36714677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46134021fElovl3 : Coding-NonSynonymous
Pitx3 : 1664 bp downstream of
stn : within coordinates of
1SNPT TTTT CTTTT   TT  TTTC/T
rs37985391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46134104fElovl3 : Coding-NonSynonymous
Pitx3 : 1581 bp downstream of
stn : within coordinates of
1SNPG GGGG AGGGG   GG  GGGA/G
rs50731697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46134325fElovl3 : Intron
Pitx3 : 1360 bp downstream of
stn : within coordinates of
2SNP  A     A   G    G    A/G
rs216336196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46135726fElovl3 : Locus-Region
Pitx3 : mRNA-UTR
stn : within coordinates of
1SNP            C    C    C
rs36569093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46135897fElovl3 : Locus-Region
Pitx3 : mRNA-UTR
stn : within coordinates of
1SNP          A        C  A/C
rs233387956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46135941fElovl3 : Locus-Region
Pitx3 : mRNA-UTR
stn : within coordinates of
1SNP            A    A    A
rs36277350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46136582fPitx3 : Coding-Synonymous
stn : within coordinates of
3SNPTG      G G T    T TG G/T
rs4232227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46136837rPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP  C C CCC    TC       C/T
rs4232226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46136943rPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP  C C CCC    GC       C/G
rs4232225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46136948rPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
3SNP CC C CCC   ACA  C    A/C
rs4232224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46136961rPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP  C C CCC    AC       A/C
rs4232223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137031rPitx3 : Coding-Synonymous
stn : within coordinates of
1SNP  C C CCC    GC       C/G
rs37014284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137115fPitx3 : Coding-Synonymous
stn : within coordinates of
1SNP          T        CT C/T
rs50820876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137345fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP CC     C         T   C/T
rs48084471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137667fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP A      A         T   A/T
rs37091521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137797fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPG         A     G  GA A/G
rs247193096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46137915fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            T    T    T
rs257487493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46138168fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            T    T    T
rs221535671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46138427fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            C    C    C
rs237294119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46138453fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            G    G    G
rs30322746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46139459fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
3SNPAC    C C   A    A    A/C
rs38650913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46139482fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPT         A     T  TA A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36379555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46140254fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
2SNPT         C T   TT TC C/T
rs30370492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46140568fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
3SNPG     A A   G    G    A/G
rs37952455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46140974fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
2SNPG         A G    G GA A/G
rs36483156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46141205fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPC         T     C  CT C/T
rs31011012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46142013fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
3SNPCAA   A A   C    C    A/C
rs255065358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46142671fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            T    T    T
rs38178827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46142807fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPA         A     A  AG A/G
rs38567863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46143276fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPG         A     G  GA A/G
rs36321592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46143979fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPT         G     T  TG G/T
rs37679956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46144011fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP  T       A     T  TA A/T
rs37092269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46144579fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPA         G     A  AG A/G
rs261945596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46144873fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            G    G    G
rs36750264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46144993fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPC C       T     C  CT C/T
rs223502484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46145427fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            T    T    T
rs247376608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46145773fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            G    G    G
rs37322056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46145833fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPC         T     C  CT C/T
rs39443341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46146076fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPG G       G     G  GA A/G
rs216373912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46146791fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            G    G    G
rs36392849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147101fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPT TT   T TCT    T  TCTC/T
rs39297834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147331fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
2SNPA GA   A AG A   AA AGGA/G
rs36925996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147712fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
2SNPC GC   G CG C   CC CGGC/G
rs214864770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147765fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNP            T    T    T
rs38322339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147847fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPC CC   C CA     C  CACA/C
rs36440159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46147927fPitx3 : Intron
stn : within coordinates of
1SNPG CG     GC     G  GCCC/G
rs37030345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46148245fPitx3 : mRNA-UTR
stn : within coordinates of
1SNP  CC     CT     C  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs237320618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46148365fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            T    C    C/T
rs52550344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46148443fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP  C     C             C
rs262146507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46148446fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            C    T    C/T
rs221933518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46148474fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            C    C    C
rs36819625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149366fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
2SNPT GT   G TG T   TT TGGG/T
rs39246765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149636fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
2SNPA GA   G AG A   AA AGGA/G
rs222755332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149708fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            C    C    C
rs241323156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149713fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            C    C    C
rs263282756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149720fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            A    C    A/C
rs37878269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46149800fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNPC CC   C CGC    C  CGCC/G
rs223323387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr19:46150053fPitx3 : Locus-Region
stn : within coordinates of
1SNP            A    A    A

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory