About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Irf4
interferon regulatory factor 4
MGI:1096873

75 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29245217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30747261fIrf4 : Locus-Region3SNPC TTTTTC TTCT T    CTC/T
rs29963964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30747375fIrf4 : Locus-Region1SNPA AAAA A AACA AA  AAAA/C
rs29963013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30747514fIrf4 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGGG GG   AGA/G
rs29963012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30747781fIrf4 : Locus-Region1SNPT TTTT T TTTT T   TC C/T
rs29963011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30748052fIrf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C CCTC C   CTCC/T
rs29963010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30748202fIrf4 : Locus-Region1SNPC CCCC C  CTC C    T C/T
rs29240081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30748227fIrf4 : Locus-Region1SNP GT      T           G/T
rs29963009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30748381fIrf4 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs29880518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30749814fIrf4 : Intron3SNPGGA AAAG AA A A   A AA/G
rs29963008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30750594fIrf4 : Coding-Synonymous1SNPG G GG G GG G GG  G TG/T
rs29963007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30750678fIrf4 : Coding-Synonymous1SNPC C CC T CCCC CC  CCCC/T
rs48026569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30751377fIrf4 : Intron1SNP  C      C       A   A/C
rs29963006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30751666fIrf4 : Intron1SNPA CCCC C CCCC CC  CCCA/C
rs29963005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30752110fIrf4 : Intron1SNPG A AA G AA A AA  A AA/G
rs29229794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30753392fIrf4 : Intron3SNPG T TTTG TT T T   T TG/T
rs29963004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30754021fIrf4 : Intron4SNPT T TTCT TC  T  T C TC/T
rs29961943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30754387fIrf4 : Intron1SNPT TTTT C TT T TT  T TC/T
rs29779169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30754554fIrf4 : Intron3SNPAAG GGGG GG G G   G GA/G
rs29591474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755235fIrf4 : Coding-Synonymous3SNPA G GGGG GGGG GG  GGAA/G
rs50750787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755282fIrf4 : Intron1SNP  G      G       T   G/T
rs51715207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755326fIrf4 : Intron1SNP  G      G       A   A/G
rs47990369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755386fIrf4 : Intron1SNP  G      G       A   A/G
rs50159269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755391fIrf4 : Intron1SNP  A      A       G   A/G
rs45748973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755461fIrf4 : Intron1SNP  T      T       G   G/T
rs51109478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755587fIrf4 : Intron1SNP  G      G       T   G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29961942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755776fIrf4 : Intron2SNPCCC CC C CCGC CC GC CC/G
rs29961941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755815fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GG G T      G/T
rs46624507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30755854fIrf4 : Intron1SNP AA      A       C   A/C
rs29248410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30756080fIrf4 : Intron2SNP GT   T  T           G/T
rs29961940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30756419fIrf4 : Intron1SNPC C CC T CC C C   C  C/T
rs29961939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30757368fIrf4 : Intron2SNPTTTTTT C TT T T  CT CC/T
rs49731655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30757685fIrf4 : Coding-Synonymous1SNP A       A       G   A/G
rs29961938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30757844fIrf4 : Intron2SNPCCCCCC C CCTC CT TCT C/T
rs29961937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30758716fIrf4 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs30091218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30759038fIrf4 : Intron2SNP AG      G           A/G
rs6328924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760181fIrf4 : Intron2SNPC CCCCCCTCCCC CC  CTCC/T
rs6329451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760262fIrf4 : Intron2SNPC CCCCCCTCCCC CC  CTCC/T
rs29961936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760796fIrf4 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCGC/G
rs29961935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760844fIrf4 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs29961934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760926fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGAG G   GAGA/G
rs29961193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760956fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GCGC/G
rs29961192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30760987fIrf4 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  ATAA/T
rs29961191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30761081fIrf4 : Intron1SNPC CCCC C CCTC  T  CTCC/T
rs29961190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30761186fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGAG G   GAGA/G
rs29961189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762004fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGAG G   GAGA/G
rs29961188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762058fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGAG G   GAAA/G
rs29961187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762165fIrf4 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs29961186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762266fIrf4 : Intron1SNPG GGGG T GGTG GT  GTTG/T
rs29961185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762910fIrf4 : Intron1SNPC CCCC C CCTC C   CCCC/T
rs29961184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762937fIrf4 : Intron1SNPA AAAA A AAGA AG  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29960343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30762973fIrf4 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GGAA/G
rs29960342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763118fIrf4 : Intron1SNPT TTTT T TTGT TG  TGGG/T
rs29960341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763239fIrf4 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs29960340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763262fIrf4 : Intron1SNPC TTTT T TTCT T   T CC/T
rs29960339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763342fIrf4 : Intron1SNPG AAAA G AAGA AG  AGGA/G
rs29960338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763499fIrf4 : Intron1SNPT TTTT T TTCT  C  TCTC/T
rs29567250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763695fIrf4 : mRNA-UTR2SNP TC   C  C           C/T
rs29240319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30763964fIrf4 : mRNA-UTR3SNPAACCCCCC CCCC CC  CCCA/C
rs29960337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764051fIrf4 : mRNA-UTR1SNPG GGGG T GGTG G   GTGG/T
rs29960336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764512fIrf4 : mRNA-UTR1SNPT CCCC C CCCC CC  CCCC/T
rs29960335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764579fIrf4 : mRNA-UTR1SNPT T TT T TTCT TC  TCTC/T
rs29960334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764590fIrf4 : mRNA-UTR1SNPA AAAA G AAGA     AGGA/G
rs29959383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764627fIrf4 : mRNA-UTR1SNPT TTTT G TTTT TT  TTTG/T
rs29959382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30764839fIrf4 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs29233455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30765106fIrf4 : mRNA-UTR3SNPAAGGGGGG GGGG GG  GGGA/G
rs29235780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30765396fIrf4 : mRNA-UTR3SNPAAGGGGGG GGGG GG  GGGA/G
rs29959381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30765911fIrf4 : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGGG      GGA/G
rs29959380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30766026fIrf4 : mRNA-UTR1SNPC CCCC G CCC  CC  CCCC/G
rs29959379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30766094fIrf4 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGAG G   GAGA/G
rs29959378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30766532fIrf4 : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTTT T   TTTC/T
rs29959377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30766581fIrf4 : mRNA-UTR1SNPA AAAA G AAGA AG  AGGA/G
rs29959376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30767427fIrf4 : Locus-Region1SNPA AAAA A AAGA AG  AGAA/G
rs48747238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30767624fIrf4 : 697 bp downstream of1SNP  A                  A
rs29959375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30767739fIrf4 : 812 bp downstream of1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs29959374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:30768413fIrf4 : 1486 bp downstream of1SNPG GGGG G GGGG GG  GGAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory