About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Phyh
phytanoyl-CoA hydroxylase
MGI:891978

134 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27063461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4918885fPhyh : Locus-Region2SNPG GGCG GGGGGCCGG GGCC/G
rs27063460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919034fPhyh : mRNA-UTR1SNPA AAAA AAAAA AA  AGAA/G
rs27063459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919038fPhyh : mRNA-UTR2SNPG GGCG GGGGGCGGG GGCC/G
rs27063458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919075fPhyh : Coding-NonSynonymous2SNPT TTAT TTTTTAATT TTAA/T
rs264808635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919135fPhyh : Coding-Synonymous1SNP            T  C    C/T
rs223152815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919347fPhyh : Intron1SNP            T  A    A/T
rs27063457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919353fPhyh : Intron1SNPC CCGC  CCCC  C  CCGC/G
rs244304108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919378fPhyh : Intron1SNP            A  G    A/G
rs27063456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919427fPhyh : Intron1SNPC CCAC  CCCC  C  CAAA/C
rs27063455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919451fPhyh : Intron2SNPT TTCT  TTTTCCTT TTCC/T
rs225750148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919452fPhyh : Intron1SNP            T  G    G/T
rs27063454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4919482fPhyh : Intron2SNPC CCTC  CCCCTTCC CCTC/T
rs215995104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920123fPhyh : Intron1SNP            T  C    C/T
rs243389364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920152fPhyh : Intron1SNP            A  T    A/T
rs27063453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920196fPhyh : Intron2SNPG GGCG  GGGGCCGG GGCC/G
rs27063452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920262fPhyh : Intron2SNPG GGAG  GGGGAAGG GAAA/G
rs27063451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920320fPhyh : Intron2SNPG GGAG  GGGGAAGG GAAA/G
rs27063450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920398fPhyh : Intron2SNPT TTCT  TTTTCCTT TTCC/T
rs27063449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920427fPhyh : Intron1SNPG GGGG  GGGG GG  GAGA/G
rs27063448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920502fPhyh : Intron1SNPA AAAA  AAAA AA  AGAA/G
rs219539865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920614fPhyh : Intron1SNP            T  G    G/T
rs246335497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4920699fPhyh : Intron1SNP            G  A    A/G
rs27063447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921001fPhyh : Intron2SNPC CCTC  CCCCTCCC CCTC/T
rs226530469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921554fPhyh : Intron1SNP            A  C    A/C
rs250004297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921922fPhyh : Intron1SNP            T  C    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs261819870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921926fPhyh : Intron1SNP            T  G    G/T
rs223316484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921982fPhyh : Intron1SNP            C  T    C/T
rs238055333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4921986fPhyh : Intron1SNP            A  G    A/G
rs255103246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922031fPhyh : Intron1SNP            A  T    A/T
rs227275429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922168fPhyh : Intron1SNP            T  C    C/T
rs253479947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922402fPhyh : Intron1SNP            G  A    A/G
rs33251268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922424fPhyh : Intron3SNPA G   A A   A  G    A/G
rs33254846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922445fPhyh : Intron3SNPG C   G C   G  C    C/G
rs27063446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922550fPhyh : Intron1SNPC CCCC  CCCC CC  CGCC/G
rs259542604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922551fPhyh : Intron1SNP            A  G    A/G
rs27063445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4922792fPhyh : Intron1SNPC CCCC  CCCC CC  CTCC/T
rs213051865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4923083fPhyh : Intron1SNP            A  G    A/G
rs230077126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4923425fPhyh : Intron1SNP            G  A    A/G
rs27063444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4923432fPhyh : Intron1SNPT TTTT  TTTT TT  TCTC/T
rs27063443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4923464fPhyh : Intron1SNPG GGGG  GGGG GG  GTGG/T
rs27063442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4924672fPhyh : Intron1SNPT TTTT  TTT  TT  TATA/T
rs27063441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4924796fPhyh : Intron1SNPA AAAA   AAA AA  ACAA/C
rs27063440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4925443fPhyh : Intron1SNPT TTTT CCTTT  C  CTTC/T
rs27063439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4925818fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4925996fPhyh : Intron1SNPT TTTT  TTTT TT  TCTC/T
rs27063437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4926111fPhyh : Intron1SNPT TTTT  TTTT TT  TCTC/T
rs27063436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4926529fPhyh : Intron1SNPT TTTT  TTTT TT  TCTC/T
rs47752294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4926632fPhyh : Intron1SNP G      G       A   A/G
rs47097188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4926864fPhyh : Intron1SNP A      A       G   A/G
rs50062450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4926977fPhyh : Intron1SNP A      A       T   A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51521338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927231fPhyh : Intron1SNP  C     C       T   C/T
rs27063435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927264fPhyh : Intron2SNPG GGGG  GGGG GG AGAGA/G
rs27063434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927515fPhyh : Coding-Synonymous1SNPC CCCC  CCCC CC  CTCC/T
rs27063433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927644fPhyh : Intron1SNPC CCCC  CCCC CC  CTCC/T
rs49443918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927748fPhyh : Intron1SNP  C     G           C/G
rs27063432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4927976fPhyh : Intron1SNPA AAAA AAAAA AA  ATAA/T
rs27063431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4928667fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
rs27063430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4928697fPhyh : Coding-Synonymous1SNPT TTTT GTTTT TT  TTTG/T
rs27063429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4929030fPhyh : Intron1SNPC CCCC GCCCC CC  CGCC/G
rs27063428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4929156fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4929899fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930092fPhyh : Intron1SNPA AAAA GAAAA AA  AAAA/G
rs27063425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930376fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TCTC/T
rs245892447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930397fPhyh : Intron1SNP            T  C    C/T
rs27063424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930411fPhyh : Intron1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs27063423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930460fPhyh : Intron1SNPA AAAA CAAAA AA  A AA/C
rs27063422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4930462fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4931850fPhyh : Intron1SNPG GGGG TGGGG GG  GTGG/T
rs27063420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4932044fPhyh : Intron1SNP  AAAA G AAA  A   GAA/G
rs27063419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4932443fPhyh : Intron1SNPC CC C CCCCC CC  CTCC/T
rs27063418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4933126fPhyh : Intron1SNPA AAAA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4933137fPhyh : Intron1SNPG GGGG AGGGG GG  GAGA/G
rs27063416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4933343fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs213679226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4933632fPhyh : Intron1SNP            T  C    C/T
rs27063415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934298fPhyh : Intron1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27063414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934316fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CGCC/G
rs27063413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934398fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TCTC/T
rs27063412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934486fPhyh : Intron1SNPA AAGA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934793fPhyh : Intron1SNPT TTTT ATTTT TT  TTTA/T
rs27063410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934821fPhyh : Intron1SNPG GGGG TGGGG GG  GGGG/T
rs27063409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4934997fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT  T  TCTC/T
rs27063408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4935038fPhyh : Intron1SNPA AAAA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4935237fPhyh : Intron1SNPA AAAA CAAAA AA  ACAA/C
rs27063406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4935263fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TGTG/T
rs27063405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4935280fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TATA/T
rs27063404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4935888fPhyh : Intron1SNPG GGAG AGGGG GG  GAGA/G
rs27063403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936055fPhyh : Coding-Synonymous1SNPT TTTT CTTTT TT  TCTC/T
rs27063402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936076fPhyh : Coding-Synonymous1SNPC CCCC CCCCC TC  CCCC/T
rs27063401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936206fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
rs27063400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936319fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC TC  CCCC/T
rs27063399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936485fPhyh : Intron1SNPG GGGG AGGGG GG  GAGA/G
rs27063398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936522fPhyh : Intron1SNPA AAGA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936590fPhyh : Intron1SNPC CCCC TCCCC CC  CCCC/T
rs27063396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936622fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
rs27063395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936634fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TCTC/T
rs27063394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936706fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936745fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936880fPhyh : Intron1SNPG GGGG AGGGG GG  GGGA/G
rs27063391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936887fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936953fPhyh : Intron1SNPT TTTT CTTTT TT  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27063389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4936998fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937013fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937060fPhyh : Intron1SNPA AA A A A    A  AGAA/G
rs27063386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937564fPhyh : Intron1SNPA AAAA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937590fPhyh : Intron1SNPT TTCT CTTTT TT  T TC/T
rs27063384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937597fPhyh : Intron1SNPA AATA  AAAA AA  ATAA/T
rs27063383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937607fPhyh : Intron1SNPA AAGA GAAAA AA  AGAA/G
rs27063382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937641fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937661fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937673fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937726fPhyh : Coding-Synonymous1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937898fPhyh : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937959fPhyh : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CGCC/G
rs27063376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4937984fPhyh : Intron1SNPT TTCT CTTTT TT  T TC/T
rs27063375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4938103fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TATA/T
rs27063374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4938279fPhyh : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4938576fPhyh : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCCC CC  CACA/C
rs27063372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939068fPhyh : Locus-Region1SNPA AAAA AAAAA AA  AGAA/G
rs27063371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939096fPhyh : Locus-Region1SNPG GGGG GGGGG GG  GCGC/G
rs27063370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939122fPhyh : Locus-Region1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939151fPhyh : Locus-Region1SNPT TTTT TTTTT TT  TATA/T
rs241199935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939292fPhyh : 562 bp downstream of1SNP            A  G    A/G
rs27063368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939485fPhyh : 755 bp downstream of1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs27063367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939515fPhyh : 785 bp downstream of1SNPA AAGA AAAAA AA  AAAA/G
rs27063366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4939600fPhyh : 870 bp downstream of1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27063365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940053fPhyh : 1323 bp downstream of1SNPA AAGA GAAAA AA  A AA/G
rs27063364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940071fPhyh : 1341 bp downstream of1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940249fPhyh : 1519 bp downstream of1SNPC CCTC CCCCC CC  CCCC/T
rs27063362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940449fPhyh : 1719 bp downstream of1SNPC CCTC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940511fPhyh : 1781 bp downstream of1SNPT TTCT TTTTT TT  TCTC/T
rs27063360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940539fPhyh : 1809 bp downstream of1SNPA AAGA AAAAA AA  AGAA/G
rs27063359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940611fPhyh : 1881 bp downstream of1SNPA AAGA A AA      AAAA/G
rs27063358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940653fPhyh : 1923 bp downstream of1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs27063357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:4940725fPhyh : 1995 bp downstream of1SNPG GGGG AGGGG GG  GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/15/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory