About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Smn1
survival motor neuron 1
MGI:109257

85 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46537243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100123793fSmn1 : Intron
Smn1 : Locus-Region
1SNPC CCCC TCCCC   CC   TCC/T
rs50327872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100123963fSmn1 : Locus-Region
Smn1 : Intron
1SNPA AAAA AAAAA   AA  AGAA/G
rs51247085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100123983fSmn1 : Locus-Region
Smn1 : Intron
1SNPC CCCC TCCCC    C  CCCC/T
rs49934869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100124024fSmn1 : Locus-Region
Smn1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC   CC  CGCC/G
rs47677350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100124481fSmn1 : Locus-Region
Smn1 : Intron
1SNP  AA A GAAAA   AA   GAA/G
rs47744630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100124806fSmn1 : Intron
Smn1 : Locus-Region
1SNPC CCCC CCCCC   TC  CCCC/T
rs47466080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100124864fSmn1 : Intron
Smn1 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs47029074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100124914fSmn1 : Coding-Synonymous
Smn1 : Intron
1SNP  A    CA AA    A   C A/C
rs48631504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100125086fSmn1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC    C   TCC/T
rs50595269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100125188fSmn1 : Intron1SNP  TTTT ATTTT    T   TTA/T
rs49657374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100125673fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GAGA/G
rs50179887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100125785fSmn1 : Intron1SNPC CCCC GCCCC    C  CCCC/G
rs48930337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100125926fSmn1 : Intron1SNPT TTTT  TTTT   TT   CCC/T
rs48403419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100126410fSmn1 : Intron1SNPC CCC  CC CC    C  CACA/C
rs51456523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100126998fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT   CTC/T
rs29517666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100127207fSmn1 : Intron2SNP  A   C A             A/C
rs50003641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100127604fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs50058751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100127660fSmn1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GG  GAGA/G
rs50853867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100127726fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  C CC/T
rs47747079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100127748fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs51715460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128015fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T
rs50693297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128084fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  CTCC/T
rs49673922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128256fSmn1 : mRNA-UTR
Smn1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T
rs48002746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128383fSmn1 : Intron1SNPA  AAA GAAAA   AA  AGAA/G
rs45924574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128466fSmn1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GG  GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47689256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128691fSmn1 : Intron1SNPA AAAA CAAAA   AA  ACAA/C
rs52104532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100128893fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs3144871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100130380fSmn1 : Intron2SNP AA         A    C    A/C
rs3144872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100130611fSmn1 : Intron3SNP GG   A     G    G    A/G
rs49100569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100130908fSmn1 : Intron1SNPT TTTT TTTTT   TT  TCTC/T
rs51102922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100130943fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AGAA/G
rs108143990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132086fSmn1 : Intron1SNP AA     A             A
rs45829918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132223fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AGAA/G
rs49733159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132292fSmn1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GG  GAGA/G
rs48880269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132410fSmn1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC TCCCC   CC  CTCC/T
rs48011151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132524fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  AGAA/G
rs45805224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100132556fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AGAA/G
rs47377028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133498fSmn1 : Intron1SNPG GGGG CGGGG   GG  GCGC/G
rs45842011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133544fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  ATAA/T
rs47451502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133560fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  CTCC/T
rs48418344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133572fSmn1 : Intron1SNPG GGGG TGGGG   GG  GTGG/T
rs47226820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133618fSmn1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC   CC  CTCC/T
rs51535917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133619fSmn1 : Intron1SNPG GGGG CGGGG   GG  GGGC/G
rs52005456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133711fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  AGAA/G
rs46327201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133900fSmn1 : Intron1SNPT TTTT GTTTT   TT  TGTG/T
rs47563819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133915fSmn1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GG  G GA/G
rs48244599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133960fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T
rs47001900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100133993fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs46898986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134022fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GAGA/G
rs47820260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134101fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50642199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134158fSmn1 : Intron1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T
rs50949605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134255fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs51779592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134432fSmn1 : Intron1SNPG GGGG AGGGG   GG  GGGA/G
rs48868201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134447fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AGAA/G
rs51169286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134477fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  AGAA/G
rs47594060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134491fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GAGA/G
rs48997555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134645fSmn1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC   CC  CTCC/T
rs46371814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134662fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  T TC/T
rs51434083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134667fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GTGG/T
rs49896127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134717fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GAGA/G
rs50401894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134750fSmn1 : Intron1SNPG GGGG TGGGG   GG  G GG/T
rs47786207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100134843fSmn1 : Intron1SNPG GGGG GGGGG   GG  GAGA/G
rs48269314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100135116fSmn1 : Intron1SNPC CCCC CCCCC   CC  CTCC/T
rs47471436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100135653fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AAAA/G
rs47293337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100136052fSmn1 : Intron1SNPA AAAA GAAAA   AA  AAAA/G
rs46208697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100136089fSmn1 : Intron1SNPA AAAA AAAAA   AA  ATAA/T
rs47011198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100136146fSmn1 : Intron1SNPT TTTT CTTTT   TT  TCTC/T
rs4230026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137242rSmn1 : Intron1SNP  G GGGGG    AG       A/G
rs4230025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137310rSmn1 : Intron1SNP  T TTTTT    CT       C/T
rs4230024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137354rSmn1 : Intron1SNP  C CCCCC    TC       C/T
rs4230023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137424rSmn1 : mRNA-UTR1SNP  C CCCCC    TC       C/T
rs4230022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137436rSmn1 : mRNA-UTR1SNP  G GGGGG    AG       A/G
rs4230021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137476rSmn1 : mRNA-UTR3SNPCCCCCCCTCCCC TCCC TCTCC/T
rs4230020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137485rSmn1 : mRNA-UTR1SNP  T TTTTT    CT       C/T
rs46690294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137512fSmn1 : mRNA-UTR2SNPCCCCCC CCCCC   CC GCGCC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4230019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137514rSmn1 : mRNA-UTR2SNPA AAAAATAAAA AAAA  AAAA/T
rs49163156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137546fSmn1 : mRNA-UTR1SNP GG     G         A   A/G
rs50420825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137783fSmn1 : Locus-Region2SNPAAAAAA AAAAA   AA TATAA/T
rs45668345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100137816fSmn1 : Locus-Region2SNPTTTTTT TTTTT   TT CTCTC/T
rs47776713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138560fSmn1 : 870 bp downstream of1SNPA AAAA AAAAA   AA  ATAA/T
rs47917810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138672fSmn1 : 982 bp downstream of1SNPA AAAA GAAAA   AA  AAAA/G
rs49945955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138715fSmn1 : 1025 bp downstream of1SNPT TTTT ATTTT   TT  TTTA/T
rs48546923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138751fSmn1 : 1061 bp downstream of1SNPT TTTT CTTTT   TT  TTTC/T
rs47528642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138890fSmn1 : 1200 bp downstream of1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T
rs51051089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:100138963fSmn1 : 1273 bp downstream of1SNPC CCCC TCCCC   CC  CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/01/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory