About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Cpt2
carnitine palmitoyltransferase 2
MGI:109176

94 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6393941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902061fCpt2 : 1920 bp downstream of2SNPT TTTTTTATTTT TT  TATA/T
rs28146842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902156fCpt2 : 1825 bp downstream of1SNPC CCCC   CCTC CC  CCCC/T
rs28146841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902224fCpt2 : 1757 bp downstream of1SNPT TTTT   TTCT TT  TC C/T
rs28146840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902270fCpt2 : 1711 bp downstream of1SNPG GGGG   GGGG GG  GAGA/G
rs28146839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902276fCpt2 : 1705 bp downstream of1SNPT TTTT G TTGT TT  TTTG/T
rs28146838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902676fCpt2 : 1305 bp downstream of1SNPT TTTT   TTTT TT  TCTC/T
rs28146837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902717fCpt2 : 1264 bp downstream of1SNPT TTTT   TTTT TT  TCTC/T
rs213274112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902759fCpt2 : 1222 bp downstream of1SNP             G  G    G
rs28146836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107902914fCpt2 : 1067 bp downstream of1SNPG   GG   GGGG GG  GAGA/G
rs28146835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107903779fCpt2 : Locus-Region1SNPT TTTT   TTTT TT  TCTC/T
rs28146834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107903805fCpt2 : Locus-Region1SNPC CC     CCC  CC  CGCC/G
rs28146833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107903864fCpt2 : Locus-Region1SNPG GGGG   GGAG GG  GAGA/G
rs28146832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107903913fCpt2 : Locus-Region1SNPA   AA   AAAA AA  ATAA/T
rs28146831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904100fCpt2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA C AACA AA  AAAA/C
rs28146830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904256fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   GGTG GG  GTGG/T
rs28146829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904436fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   AAGA AA  AAAA/G
rs28146828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904457fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs28146827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904475fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs28146826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107904532fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs28146825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107905383fCpt2 : Intron1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs28146824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107905559fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G AGGG GG  AGGA/G
rs28146823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107906353fCpt2 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  ATAA/T
rs28146822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107906726fCpt2 : Intron1SNPC CCCC   CCTC CC  CTCC/T
rs28146821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107906970fCpt2 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC   CCCC CC  CTCC/T
rs28146820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107907531fCpt2 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA   AAGA AA  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13465226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107907633rCpt2 : Coding-NonSynonymous1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs51453761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107908511fCpt2 : Intron1SNP  C      C       T   C/T
rs48441571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107908545fCpt2 : Intron1SNP  C              T   C/T
rs49564172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107908616fCpt2 : Intron1SNP  A              T   A/T
rs52328814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107908877fCpt2 : Intron1SNP         T       G   G/T
rs28146819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107909078fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs28146818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107909268fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs28146817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107909683fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G GGCG GG  GGGC/G
rs28146816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107910458fCpt2 : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28146815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107912216fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28146814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107912482fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GG G GG  GAGA/G
rs28146813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107912526fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTAT TT  TTTA/T
rs28146812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107912771fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs28146811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107912810fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G  GAG GG  GGGA/G
rs28146810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107913271fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28146809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914239fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTGT TT  TTTG/T
rs28146808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914442fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28146807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914460fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs28146806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914602fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C C CC CC  CTCC/T
rs28146805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914725fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TATA/T
rs28146804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107914775fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs6160871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107915751fCpt2 : Intron2SNPT TTTTTGGTTGT TT  TGTG/T
rs28146803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107915905fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TATA/T
rs6162579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916049fCpt2 : Intron1SNP      G A            A/G
rs6163156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916210fCpt2 : Intron1SNP      C T            C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28146802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916420fCpt2 : Intron1SNPA AAAA A AAG  A   AGAA/G
rs28146801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916782fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CGCC/G
rs28146800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916823fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28146799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107916865fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TGTG/T
rs32050937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107917326fCpt2 : Intron1SNPG G   A  G           A/G
rs28146798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107917403fCpt2 : Intron1SNPC CCCC A CCCC CC  CCCA/C
rs47412467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107917562fCpt2 : Intron1SNP C                   C
rs28146797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107917960fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28146796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107918145fCpt2 : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TTTC/T
rs28146795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107918190fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28146794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107918217fCpt2 : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TTTC/T
rs28146793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107919266fCpt2 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28146792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107919795fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs28146791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107919891fCpt2 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  AGAA/G
rs28146790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920152fCpt2 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTTC/T
rs28146789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920587fCpt2 : Intron1SNPA A    A   A  A    G A/G
rs28146788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920641fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G GGG  GG  GAGA/G
rs28146787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920652fCpt2 : Intron1SNPA A  A A  AA  A   AG A/G
rs28146786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920843fCpt2 : Intron1SNPA A A  G  AG  AA  AGAA/G
rs28146785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107920943fCpt2 : Intron1SNPG GGGG C GGCG GG  GCGC/G
rs28146784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107921022fCpt2 : Intron1SNPC C CC C CCC  CC  CT C/T
rs28146783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107921271fCpt2 : Intron1SNPC C C  C CCTC CC  CC C/T
rs28146782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107921407fCpt2 : Intron1SNPT TT T C  TC  TT  TC C/T
rs28146781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107921606fCpt2 : Intron1SNPC CCCC T CCT  CC  CTCC/T
rs28146780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107921971fCpt2 : Intron1SNPA AAAA A AATA AA  AT A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28146779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922006fCpt2 : Intron1SNPT   GT G  T   TT  T  G/T
rs28146778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922007fCpt2 : Intron1SNPA A       AG  AA  AG A/G
rs28146777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922131fCpt2 : Intron1SNPT T  T T  TCT TT  TTTC/T
rs28146776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922323fCpt2 : Intron1SNPA A A  A  AG  AA  AAAA/G
rs28146775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922357fCpt2 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs28146774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922359fCpt2 : Intron1SNPG GGGG A GGG  GG  GGGA/G
rs230346156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922389fCpt2 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs28146773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922420fCpt2 : Intron1SNPC      T  CC  CC  CC C/T
rs28146772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922430fCpt2 : Intron1SNPG GG   G GGG  GG  GA A/G
rs28146771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922534fCpt2 : Intron1SNPA AAAA A  AAA A   AT A/T
rs28146770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107922611fCpt2 : Intron1SNPA A AA G AAAA AA  AGAA/G
rs28146769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107923024fCpt2 : Intron1SNPC CCCC T  CTC CC  CTCC/T
rs28146768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107923088fCpt2 : Intron1SNPC C  C C  CC  CC  CT C/T
rs28128167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107923556fCpt2 : mRNA-UTR1SNPT      C  TC  T   TC C/T
rs28128166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107923910fCpt2 : Locus-Region1SNPA A A  A  AA  AA  AG A/G
rs28128165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107923989fCpt2 : Locus-Region1SNPT T T  T  TT      TA A/T
rs28128164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107924352fCpt2 : Locus-Region1SNPG G GG G  GG  GG  GT G/T
rs28128163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107924731fCpt2 : Locus-Region1SNPG G GG A  GAG GG  GGGA/G
rs32711430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:107924937fCpt2 : Locus-Region2SNPA A   A  G           A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory