About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Alx4
aristaless-like homeobox 4
MGI:108359

196 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32935917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93480947fAlx4 : Locus-Region1SNP AG   G G        A/G
rs29825493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93480948fAlx4 : Locus-Region1SNP AT   T T        A/T
rs29715523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93481401fAlx4 : Locus-Region1SNP  C   C T        C/T
rs33227930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93485285fAlx4 : Intron1SNP T    T C        C/T
rs29917644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93485966fAlx4 : Intron1SNP AA   A G        A/G
rs32856624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93486232fAlx4 : Intron1SNP  A   A G        A/G
rs29768167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93486983fAlx4 : Intron1SNP AA   A C        A/C
rs33425334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93487789fAlx4 : Intron1SNP AA   A G        A/G
rs29908536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93488037fAlx4 : Intron1SNP CC   C G        C/G
rs27383527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93488259fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAAAAAAGAA/G
rs27383526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93488811fAlx4 : Intron1SNP  GGGG GGGGG   TGG/T
rs27383525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93489235fAlx4 : Intron1SNP  CCCC  CC C   TCC/T
rs27383524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93490269fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCCCC/T
rs27383523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93490432fAlx4 : Intron2SNPG ?AAAG AA AGGG GA/G
rs27383522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93490462fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93490884fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGGGA/G
rs27383520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491151fAlx4 : Intron1SNPT TC        TTTCTC/T
rs27383519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491208fAlx4 : Intron1SNPT TCCC  CCCCTTTCTC/T
rs27383518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491724fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs27383517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491773fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAGAA/G
rs27383516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491859fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGCGGGGGGC/G
rs27383515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93491881fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTCTTTTCTC/T
rs27383514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93492574fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTGTTTTGTG/T
rs27383513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93492693fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs27383512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93492753fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27383511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93492867fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs27383510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93493076fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAGAA/G
rs27383509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494203fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTCTTTTTTC/T
rs27383508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494620fAlx4 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAAAAAA/G
rs27383507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494666fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCCCC/T
rs27383506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494807fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGCGGGGCGC/G
rs27383505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494928fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTCTTTTCTC/T
rs27383504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93494987fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs27383503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93495058fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTTTCTC/T
rs27383502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93495204fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs27383501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93495509fAlx4 : Intron1SNPG GAAA GAA  GGG GA/G
rs27383500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93495793fAlx4 : Intron1SNPC CCCC GCCGCCCCGCC/G
rs27383499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93495889fAlx4 : Intron1SNPG GCCC CCCCCGGGCGC/G
rs27383498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496071fAlx4 : Intron1SNPA AGGG GGG GAAAGAA/G
rs27383497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496166fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AACAAAACAA/C
rs27383496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496264fAlx4 : Intron1SNPC CT   CTTC CCCCCC/T
rs27383495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496450fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGGGA/G
rs27383494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496541fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGGGGGA/G
rs27383493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496771fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCCCC/T
rs27383492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93496999fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497046fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs27383490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497077fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497165fAlx4 : Intron2SNPAAAGGGAGGGGGAAAGAA/G
rs27383488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497282fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCACCCCACA/C
rs27383487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497379fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTTTTTTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27383486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497460fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAAAAAAGAA/G
rs27383485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93497546fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCC CC/T
rs27383484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498080fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs27383483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498106fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs27383482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498122fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGGGA/G
rs27383481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498292fAlx4 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAAAGAA/G
rs27383480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498350fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCTCC/T
rs27383479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498439fAlx4 : Intron1SNPG GTTT GTTGTGGGGGG/T
rs27383478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498531fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs27383477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498616fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTATTTTATA/T
rs27383476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498725fAlx4 : Intron2SNPTTTCCCTCCCCCTTTCTC/T
rs27383475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498805fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AACAAAAAAA/C
rs27383474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93498923fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAACAAAACAA/C
rs27383473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499088fAlx4 : Intron1SNPG GGGG TGGGGGGGGGG/T
rs27383472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499596fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCTCCCCTCC/T
rs27383471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499679fAlx4 : Intron1SNPG GGGG CGGCGGGGCGC/G
rs27383470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499734fAlx4 : Intron1SNPA AGGG  GG GAAA AA/G
rs27383469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499766fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs32827359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499936fAlx4 : Intron1SNP  A     G        A/G
rs29673486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93499937fAlx4 : Intron1SNP  A     G        A/G
rs27383468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500107fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTTTCTC/T
rs27383467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500288fAlx4 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAAAGAA/G
rs27383466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500363fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGGGAGA/G
rs27383465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500452fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs27383464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500592fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27383463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500618fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs27383462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500713fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs27383461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93500994fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs27383460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93501645fAlx4 : Intron1SNPT CCCC CCCCCTTTCCC/T
rs29865335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93501653fAlx4 : Intron1SNP  C   A C        A/C
rs27383459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93501750fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGTGGGGTGG/T
rs27383458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93501958fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs27383457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93502081fAlx4 : Intron2SNPA GGGGAGGGGGAAAGGA/G
rs27383456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93502311fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93502341fAlx4 : Intron1SNPA AAAA AAAAAAAAGAA/G
rs27383454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93502938fAlx4 : Intron1SNPG GAAA GAAGAGGGGGA/G
rs27383453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503053fAlx4 : Intron1SNPC CCCC C CTCCCCCCC/T
rs32884268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503193fAlx4 : Intron1SNP  C   A          A/C
rs27383452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503459fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs32851436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503499fAlx4 : Intron1SNP GG   G A        A/G
rs27383451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503523fAlx4 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs27383450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503699fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGGTGG/T
rs33710626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503813fAlx4 : Intron1SNP T    T A        A/T
rs27383449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503964fAlx4 : Intron2SNPT GGGGTGGGGGTTTGTG/T
rs27383448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93503982fAlx4 : Intron1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs27383447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504005fAlx4 : Intron1SNPA AAAA CAACAAAACAA/C
rs27383446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504054fAlx4 : Intron2SNPA AGGGAAGGAGAAAAAA/G
rs33577677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504076fAlx4 : Intron1SNP  C   G C        C/G
rs27383445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504143fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGGGA/G
rs27383444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504150fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGGCGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33126260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504406fAlx4 : Intron1SNP TC   T C        C/T
rs32903959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504412fAlx4 : Intron1SNP CT   C C        C/T
rs27383443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504413fAlx4 : Intron1SNPG  GGG   GAGGGGAGA/G
rs29537311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504425fAlx4 : Intron1SNP CG   C C        C/G
rs32997823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504483fAlx4 : Intron1SNP AC   A C        A/C
rs27383442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504566fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTTTCTC/T
rs27383441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504612fAlx4 : Intron1SNPT TTTT ATTATTTTATA/T
rs27383440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504781fAlx4 : Intron1SNPC CTTT CTTTTCCCTCC/T
rs27383439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504810fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGTGGGGTGG/T
rs27383438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504838fAlx4 : Intron1SNPA AGGG AGGAGAAAAAA/G
rs27383437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504914fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGGGAGA/G
rs27383436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93504943fAlx4 : Intron1SNPT TCCC CCCCCTTTCTC/T
rs27383435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93505052fAlx4 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs27383434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93505085fAlx4 : Intron2SNPTTCCCCTCCCCCTTTCTC/T
rs33511734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93505131fAlx4 : Intron1SNP GA   G G        A/G
rs27383433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93505243fAlx4 : Intron1SNPA AGGG GGGGGAAAGAA/G
rs27383432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506042fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506075fAlx4 : Intron1SNPT  CCC CCCCCT TCCC/T
rs27383430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506136fAlx4 : Intron1SNPC  TTT  TTCTCCCCCC/T
rs27383429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506186fAlx4 : Intron1SNPG AGGG AGGGGGGGGGA/G
rs27383428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506265fAlx4 : Intron1SNPT ATTT TTTTTTTTTTA/T
rs27383427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506412fAlx4 : Intron1SNPT  AAA  AAAATTTATA/T
rs27383426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506439fAlx4 : Intron1SNPT  AAA AAAAATTT TA/T
rs27383425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506481fAlx4 : Intron1SNPT CCCC CCCCCTTTCTC/T
rs27383424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506884fAlx4 : Intron1SNPA G    G  G AAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27383423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506896fAlx4 : Intron1SNPA G    G  G AAAGAA/G
rs27383422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93506927fAlx4 : Intron1SNPC TTTT CTTCTC CCCC/T
rs27383421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507064fAlx4 : Intron1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs27383420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507080fAlx4 : Intron1SNPA GGGG GGGAGAAAAAA/G
rs27383419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507169fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs27383418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507279fAlx4 : Intron1SNPA GGGG GGGAGAAAAAA/G
rs27383417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507322fAlx4 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27383416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507346fAlx4 : Intron1SNPG AAAA GAAGAGGGGGA/G
rs27383415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507403fAlx4 : Intron1SNPA GGGG  GGAGAAAAAA/G
rs27383414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507489fAlx4 : Intron1SNPT TTTT TTTTTTTTCTC/T
rs27383413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507571fAlx4 : Intron1SNPA GGGG AGGAGAAAAAA/G
rs27383412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507607fAlx4 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs27383411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507649fAlx4 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs27383410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507654fAlx4 : Intron1SNPG GAAA GAAGAGGGGGA/G
rs27383409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507702fAlx4 : Intron1SNPT GTTT  TTTTTTTTTG/T
rs27383408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93507976fAlx4 : Intron2SNPAAGGGGAGGGAGAAAAAA/G
rs32872056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508021fAlx4 : Intron1SNP AC     C        A/C
rs27383407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508102fAlx4 : Intron2SNPCCTTTTCTTTCTCCCCCC/T
rs27383406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508120fAlx4 : Intron2SNPCCCTTTCCTTCTCCCCCC/T
rs27383405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508151fAlx4 : Intron2SNPTTCCCCTCCCTCTTTTTC/T
rs27383404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508174fAlx4 : Intron2SNPTTGGGGTGGGTGTTTTTG/T
rs32867183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508343fAlx4 : Intron1SNP CT   C C        C/T
rs29672659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508414fAlx4 : Intron1SNP CT     C        C/T
rs27383403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508629fAlx4 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG GGGAGG   GA/G
rs27383402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93508630fAlx4 : Coding-Synonymous2SNPTTCCCCCCCCCC T CCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32850498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93509400fAlx4 : Intron1SNP CT              C/T
rs33425887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93509458fAlx4 : Intron1SNP AG              A/G
rs33711125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93509511fAlx4 : Intron1SNP CT   C          C/T
rs27383401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93509893fAlx4 : Intron1SNPC TCCC  CCCCCCCCCC/T
rs27383400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93509909fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCCCCCCTCC/T
rs27383399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510337fAlx4 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs27383398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510811fAlx4 : Intron2SNPGGAGGGG GGAGGGGAGA/G
rs33696060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510821fAlx4 : Intron1SNP AG   A A        A/G
rs27383397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510869fAlx4 : Intron2SNPCCACCCC CCCCCCCCCA/C
rs33589796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510946fAlx4 : Intron1SNP  A   G G        A/G
rs27383396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510954fAlx4 : Intron2SNPC TCCCC CCTCCCCTCC/T
rs32928115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93510990fAlx4 : Intron1SNP  A   G G        A/G
rs27383395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93511114fAlx4 : Intron2SNPT CTTTT TTCTTTTCTC/T
rs29964149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93511425fAlx4 : Intron1SNPG C     G        C/G
rs33017195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93511861fAlx4 : Intron1SNP GG     A        A/G
rs33627417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93511864fAlx4 : Intron1SNP CT     C        C/T
rs27383394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512368fAlx4 : Intron1SNPT CCCC  CCCCTTTCTC/T
rs27383393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512562fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs27383392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512623fAlx4 : Intron1SNPC GGGG  GGCGCCCCCC/G
rs27383391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512700fAlx4 : Intron1SNPC TTTT  TT TCCC CC/T
rs27383390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512885fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCCCCCCTCC/T
rs27383389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93512934fAlx4 : Intron1SNPT CCCC  CC CTTTCCC/T
rs27383388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93513427fAlx4 : Intron1SNPA  A A    A  AAGAA/G
rs27383387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93513797fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AAG AAAAAA/G
rs27383386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93513855fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27383385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93513866fAlx4 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs27383384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514205fAlx4 : Intron1SNPG GGGG  GGGGGGGAGA/G
rs27383383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514494fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTGTTTTGTG/T
rs27383382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514557fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AAAAAAAGAA/G
rs27383381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514588fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs27383380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514808fAlx4 : Intron1SNPT TCCC  CCTCTTTTTC/T
rs27383379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93514860fAlx4 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCCCC/T
rs27383378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93515222fAlx4 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAGAA/G
rs27383377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93516109fAlx4 : Intron2SNPTTCCCCT CC CTTT TC/T
rs27383376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93516128fAlx4 : Intron2SNPTTTCCCT CC  TTT TC/T
rs29770570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93516548fAlx4 : Intron1SNP CC   C T        C/T
rs27383375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93516712fAlx4 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs27383374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93517146fAlx4 : Intron2SNPAAGGGGA GGGGAAAGAA/G
rs27383373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93517169fAlx4 : Intron2SNPC CTTTC TTCTCCCCCC/T
rs27383372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93517400fAlx4 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs32954110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93517906fAlx4 : mRNA-UTR1SNPTTT     C        C/T
rs27383371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93518020fAlx4 : mRNA-UTR2SNPGGGAAA  AAGAGGGGGA/G
rs27383370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93518100fAlx4 : Locus-Region2SNPCCCTTTC TTCTCCCCCC/T
rs27383369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93518229fAlx4 : Locus-Region1SNPA AAAA  AACAAAACAA/C
rs27383368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93518281fAlx4 : Locus-Region1SNPA  AAA  AA ACAACAA/C
rs27383367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:93518576fAlx4 : Locus-Region1SNPC CCCC  CCACCCCCCA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory