About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ifngr1
interferon gamma receptor 1
MGI:107655

88 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51257218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19309793fIfngr1 : Locus-Region1SNPG GGGG AGGAGGGGGGA/G
rs47931282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19309889fIfngr1 : Locus-Region1SNPG AAAA GAAGAAA A A/G
rs47044962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19309993fIfngr1 : Locus-Region1SNPG G    AGAAAGGGAGA/G
rs50888686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310290fIfngr1 : Locus-Region1SNPG AGAA GAGGG GGGGA/G
rs51559651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310366fIfngr1 : Locus-Region1SNP  AAAA GA GAAA A A/G
rs50630252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310385fIfngr1 : Locus-Region1SNP    A  AA A    T A/T
rs50468759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310419fIfngr1 : Locus-Region1SNPT CCCC TCCTCCCCCTC/T
rs49737864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310463fIfngr1 : Locus-Region1SNPG  GAA GAGGG GGGGA/G
rs51979326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310682fIfngr1 : Locus-Region1SNPG CCCC CCCCCCC GGC/G
rs48583210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19310875fIfngr1 : Locus-Region1SNPG GGGG GGGGGGGGAGA/G
rs46252256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311002fIfngr1 : Locus-Region1SNPG C CC GC GG   GGC/G
rs50421559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311233fIfngr1 : Locus-Region1SNP  CCCC CCCCCCC T C/T
rs46682886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311379fIfngr1 : Locus-Region1SNPG GAGG GGAGAGA GGA/G
rs46068080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311406fIfngr1 : Locus-Region1SNPC GCGG CGCCC CCCCC/G
rs47065936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311422fIfngr1 : Locus-Region1SNPA GGGG GGGGGGG GAA/G
rs46596119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311458fIfngr1 : Locus-Region1SNPT GTGG GGTGT TT TG/T
rs29349414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311649fIfngr1 : Locus-Region1SNP CC   T          C/T
rs29356851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311843fIfngr1 : mRNA-UTR1SNP CC   A C        A/C
rs29383124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311844fIfngr1 : mRNA-UTR1SNP CC   G C        C/G
rs13467527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19311981fIfngr1 : Coding-Synonymous2SNPC CTCCTCCTCTCTTCCC/T
rs29336579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312249fIfngr1 : Intron1SNPG A   A A        A/G
rs29359700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312256fIfngr1 : Intron2SNPT AAAAAGAAGAAA GGA/G/T
rs29326407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312265fIfngr1 : Intron1SNPT C   C C        C/T
rs48659284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312456fIfngr1 : Intron1SNP  CCCC TCCTCCC C C/T
rs6307185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312461fIfngr1 : Intron1SNPG     A          A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6307192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312466fIfngr1 : Intron1SNPG     A          A/G
rs3681091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19312513fIfngr1 : Intron2SNPG CCCCCGCCGCCCCGGC/G
rs51097133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19313265fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA AAA AAAAGAA/G
rs51512651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19313485fIfngr1 : Intron1SNPC CCCC CCC CCCCTCC/T
rs29372567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19313579fIfngr1 : Intron2SNPGGGAGGA GA AGA GGA/G
rs47320628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19313740fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG GGG GGGGAGA/G
rs52613730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19314010fIfngr1 : Intron1SNPT TTTT  TT TTTTCTC/T
rs51688473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19314270fIfngr1 : Intron1SNPT TTTT  TT TTTTGTG/T
rs46826676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19314835fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA  AA  AA GAA/G
rs51641798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19314987fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG  GG GGGGAGA/G
rs50908805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19315085fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG  GG GGG AGA/G
rs46391391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19315483fIfngr1 : Intron1SNPC CCCC  CC CCCCTCC/T
rs48171637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19315535fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA  AAGAA GGAA/G
rs4137440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19315664fIfngr1 : Intron1SNPT     G          G/T
rs46126560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317015fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA AAA AAAAGAA/G
rs45802744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317052fIfngr1 : Intron1SNPC CCCC CCC CCCCTCC/T
rs49149334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317198fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA  AA AAA GAA/G
rs47543406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317234fIfngr1 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC  CC CCCCACA/C
rs29336260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317445fIfngr1 : Intron1SNP AA   G A        A/G
rs29343960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317453fIfngr1 : Intron1SNP CC   A C        A/C
rs29331230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317680fIfngr1 : Intron1SNP  C   T C        C/T
rs46416565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317799fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG  GG GGGGAGA/G
rs29315942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19317930fIfngr1 : Intron1SNP GG   T G        G/T
rs29327592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318266fIfngr1 : Intron2SNPCTTCTTCCTC CTCC CC/T
rs29326836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318319fIfngr1 : Intron1SNP GG   C G        C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51633668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318359fIfngr1 : Intron1SNPA TTTT  TT TTT  AA/T
rs48059797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318468fIfngr1 : Intron1SNPT CCCC  CC CCC  TC/T
rs51862239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318531fIfngr1 : Intron1SNPT CCCC  CCCCCCTCCC/T
rs29377033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19318661fIfngr1 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs33857654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19319657fIfngr1 : Intron2SNPG AGAAGGAGGGAGGGGA/G
rs29347154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19319955fIfngr1 : Intron2SNPGGG GGA GA AGG GGA/G
rs50123178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19320503fIfngr1 : Intron1SNPT T T   TT  T  CTC/T
rs52622438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19320718fIfngr1 : Intron1SNPT TTTT  TT TTT GTG/T
rs49603673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19321007fIfngr1 : Intron1SNPC TTTT  TT TTTTCCC/T
rs13467528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19321182fIfngr1 : Coding-NonSynonymous2SNPA G GGA GA AG AAAA/G
rs46637409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19321308fIfngr1 : Intron1SNPC T TT  T   T C CC/T
rs50234282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19321848fIfngr1 : Intron1SNPA AAAA AAA AAAAGAA/G
rs46104437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19321886fIfngr1 : Intron1SNPA T TT  TT TT  TAA/T
rs29320505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322170fIfngr1 : Intron1SNP TT   G T        G/T
rs29359910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322265fIfngr1 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs51728420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322403fIfngr1 : Intron1SNPG GGG   GG GGG AGA/G
rs29331763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322405fIfngr1 : Intron2SNPTTTCTTC TC CTC CTC/T
rs51753163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322431fIfngr1 : Intron1SNPA AAA   AA AAA GAA/G
rs29348289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322526fIfngr1 : Intron2SNPCTTCTTC TC CT CCCC/T
rs48364347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322640fIfngr1 : Intron1SNPC CCCC CCC CCCCGCC/G
rs29371256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322787fIfngr1 : Intron2SNPCTTCTTCCTC CTCCCCC/T
rs51713854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19322795fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG GGG GGGGTGG/T
rs3702815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323171fIfngr1 : Intron2SNPGGG   C G        C/G
rs46656492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323275fIfngr1 : Intron1SNPG GGGG  GG GGGGAGA/G
rs29327973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323378fIfngr1 : Intron2SNPGGGAGGA GA A   GGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29316518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323517fIfngr1 : Intron2SNPCCCTCCT CT TCT CCC/T
rs29323906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323820fIfngr1 : Intron2SNPGGGAGGA GAGAGAAGGA/G
rs47974009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19323923fIfngr1 : Intron1SNPT TTTT TTT TTTTATA/T
rs29324397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324501fIfngr1 : Intron1SNP GG   T G        G/T
rs49821437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324588fIfngr1 : Intron1SNPC CCCC CCC CCCCTCC/T
rs29370379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324615fIfngr1 : Intron2SNPAGGAG AAGA A AAGAA/G
rs48803156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324664fIfngr1 : Intron1SNPC ACAA CAC CACC CA/C
rs46874956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324732fIfngr1 : Intron1SNP  AAAA AAA A   GAA/G
rs29325940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19324927fIfngr1 : Intron1SNP CC   T C        C/T
rs29346781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19325376fIfngr1 : Intron1SNP GG   A G        A/G
rs50647979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19325739fIfngr1 : Intron1SNPG GGG     A     GA/G
rs3691292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19326444fIfngr1 : Intron1SNPA     G          A/G
rs29323743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:19328876fIfngr1 : Intron1SNPTCC   C C        C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory