About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Alas2
aminolevulinic acid synthase 2, erythroid
MGI:87990

137 matching SNPs displayed
Exclude SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29296526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146980792fAlas2 : Locus-Region1SNPC CCTC CCT  CC CCC/T
rs29296525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146981066fAlas2 : Locus-Region1SNPG GGGG CGGGGGGGGGC/G
rs29296524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146981207fAlas2 : Locus-Region1SNPT TT   TTGTTTT TTG/T
rs29296103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146981369fAlas2 : Locus-Region1SNPT TTTT TTTTTTT GTG/T
rs29296102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146981702fAlas2 : Locus-Region1SNPC CCCC TCC CCCCTTC/T
rs29296101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146981892fAlas2 : Locus-Region1SNPT TTTT TTTAT T ATA/T
rs29296100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982217fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCCTC/T
rs29296099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982227fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGAGGGGGGGA/G
rs29296098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982350fAlas2 : Intron1SNPA AAAA TAAAAAA AAA/T
rs29296097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982889fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCCTC/T
rs29296096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982933fAlas2 : Intron1SNPG GGGG CGGGGGGGGGC/G
rs29296095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146982952fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAA GAA/G
rs29296094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146983241fAlas2 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTTTCTC/T
rs29295653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146983676fAlas2 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs29295652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146983701fAlas2 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTTTCTC/T
rs29295651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146983901fAlas2 : Intron1SNPG G GG AGGGGGGGGGA/G
rs29295650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146984059fAlas2 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs29295649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146984126fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGGAGA/G
rs29295648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146984137fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCCTC/T
rs29295647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146984617fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs29295646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146984907fAlas2 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs29295645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146985060fAlas2 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs29295644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146985678fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAAAGAA/G
rs29295293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146985799fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs29295292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146985950fAlas2 : Intron1SNPT TTTT TTTTTTTTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29295291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986032fAlas2 : Intron1SNPC CCCC ACC CCCC CA/C
rs29295290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986162fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs29295289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986343fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs29295288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986808fAlas2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29295287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986912fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGGGGGGAGA/G
rs29295286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146986948fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29295285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987173fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTGTTTTGTG/T
rs29295284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987596fAlas2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29294843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987646fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AATAAAATAA/T
rs29294842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987817fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AAGA A G A/G
rs29294841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987885fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GT GGGGTTG/T
rs29294840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146987939fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TT TTTTCTC/T
rs29294839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146988188fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29294838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146988228fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCACCCCACA/C
rs29294837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146988812fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTATTTTATA/T
rs29294836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146989073fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CTTCCCCTTC/T
rs29294835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146989180fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GCCGGGGCCC/G
rs29294834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146989370fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AC AAAA CA/C
rs29294333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146989377fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGCGGGGCGC/G
rs29294332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146989426fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCTCC/T
rs29294331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146990005fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCTCC/T
rs29294330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146990256fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGTGGGGTGG/T
rs29294329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146990329fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCTCC/T
rs29294328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146990618fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCCC/T
rs29294327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146990943fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29294326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146991026fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGTGGGGTGG/T
rs29294325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146991136fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GAGGGGGGGA/G
rs29294324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146991381fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCGCCCCGCC/G
rs29297583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146991982fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29297582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146991999fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29297581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992055fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29297580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992144fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29297579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992296fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCCCCCCCTC/T
rs29297578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992434fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs29297577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992747fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GAGGGGGGGA/G
rs29297576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146992830fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCCCCCCACA/C
rs29297575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993094fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CTTCCC TCC/T
rs29297574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993161fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AACAAAACAA/C
rs29297163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993225fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs29297162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993415fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29297161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993437fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAGAA/G
rs29297160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993692fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCTCCCCTCC/T
rs29297159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146993724fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AACAAAACAA/C
rs29297158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994013fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29297157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994159fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29297156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994252fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAAACA/C
rs29297155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994258fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CCGCCCCG C/G
rs29297154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994286fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29296703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994357fAlas2 : Intron1SNPC C CC  CC CCC TCC/T
rs29296702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146994895fAlas2 : Intron2SNPAGGAGAA AGGGAAGGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29296701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146995007fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTTTTTTCTC/T
rs29296700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146995232fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs29296699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146995763fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29296698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996146fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTTTTTTTAA/T
rs29296697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996241fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCTCCCCCCCC/T
rs29296696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996306fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AGGAAAAGGA/G
rs29296695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996386fAlas2 : Intron1SNPT TTT   TTCTTT   C/T
rs29296694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996492fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AATAAAATAA/T
rs29296283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996618fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs29296282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996634fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CACCCCCCCA/C
rs29296281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996740fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29296280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996803fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGAGGGGAGA/G
rs29296279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146996966fAlas2 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs29296278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997005fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CTCCCCCCCC/T
rs29296277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997140fAlas2 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTTTCTC/T
rs29296276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997280fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCCCTCC/T
rs29296275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997523fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AACAAAACAA/C
rs29296274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997695fAlas2 : Intron1SNPA AAAA  AAGAAAAGAA/G
rs29295843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997782fAlas2 : Intron1SNPG GGGG  GGCGGGGCGC/G
rs29295842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997850fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGTGGG GGGG/T
rs29295841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146997931fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCTTCCCCTCC/T
rs29295840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998120fAlas2 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGGGAGA/G
rs29295839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998199fAlas2 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAAAGAA/G
rs29295838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998443fAlas2 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs29295837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998695fAlas2 : Intron1SNPG GGGG TGG GGGGTGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29295836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998817fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAG AAAAGGA/G
rs29295835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998832fAlas2 : Intron2SNPAGGAGAAGAG GAAG GA/G
rs29295834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146998886fAlas2 : Intron1SNPC CCCC TCC CCCC CC/T
rs29295443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146999127fAlas2 : Intron1SNPT TTTT GTT TTTT TG/T
rs29295442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146999311fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CC CCCC TC/T
rs29295441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146999563fAlas2 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT CTT TTTT TC/T
rs29295440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:146999899fAlas2 : Intron1SNPT TTTT CTT TTTTCTC/T
rs29295439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000276fAlas2 : Intron1SNPC CCCC GCC CCCC  C/G
rs29295438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000281fAlas2 : Intron1SNPC CCCC  CT CCCC TC/T
rs29295437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000380fAlas2 : Intron1SNPG GGGG AGG GGGG GA/G
rs29295436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000495fAlas2 : Intron1SNPC C CC CCT CCCCCTC/T
rs29295435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000574fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCTCCCCCCTC/T
rs29295434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000882fAlas2 : Intron1SNPT TTTT TTGTTTTTTGG/T
rs29295003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000981fAlas2 : Intron1SNPA AAAA AAGAAAAAAGA/G
rs29295002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147000992fAlas2 : Intron1SNPC CCCC TCCTCCCCTCC/T
rs29295001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147001335fAlas2 : Intron1SNPA AAAA AAAAAAAAACA/C
rs29295000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147001584fAlas2 : Intron1SNPA AAAA CAC AAAACAA/C
rs29294999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147001632fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAA AAAA AA/G
rs31404327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147001989rAlas2 : Intron1SNP AA   G          A/G
rs29294998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002334fAlas2 : Intron1SNPA AAAA GAG A A   A/G
rs29294997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002376fAlas2 : Intron1SNPT TTTT ATA TTTT  A/T
rs29294996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002596fAlas2 : Intron1SNPT TTTT TTC TTTT CC/T
rs29294995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002625fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCT CCCCCTC/T
rs29294994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002900fAlas2 : Intron1SNPG GGGG GGCGGGGGGCC/G
rs29294553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147002988fAlas2 : Intron1SNPT TTTT TTCTTTTTTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29294552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003017fAlas2 : Intron1SNP  AAAA AAC AAAAACA/C
rs29294551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003206fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCACCCCCCAA/C
rs29294550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003404fAlas2 : Intron1SNPA AAAA CAC AAAACCA/C
rs29294549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003588fAlas2 : Intron1SNPG GGGG CGC GGGGCCC/G
rs29294548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003746fAlas2 : Intron1SNPC CCCC CCTCCCCCCTC/T
rs29294547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003802fAlas2 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs29294546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147003876fAlas2 : Intron1SNPA AAAA TAAAAAA AAA/T
rs29294545
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147004446fAlas2 : Intron
Apex2 : Locus-Region
1SNPG GGGG AGG GGGGAGA/G
rs29294544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147004723fAlas2 : Intron
Apex2 : Locus-Region
1SNPT TTTT CTCCTTTTCCC/T
rs29294113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147004797fAlas2 : Intron
Apex2 : Locus-Region
2SNPCTTCTCCCCCCTCC CCC/T
rs29294112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147005036fAlas2 : mRNA-UTR
Apex2 : Locus-Region
1SNPG GGGG GGGAGGGGAGA/G
rs29294111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:147005501fAlas2 : Locus-Region
Apex2 : Locus-Region
1SNPT TTTT CTT TTTT TC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory