About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Bcl11a
B cell CLL/lymphoma 11A (zinc finger protein)
MGI:106190

249 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs231816679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24077231fBcl11a : Locus-Region
Gm12063 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs250451268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24081385fBcl11a : Intron1SNP             T  T    T
rs108549569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24082166fBcl11a : Intron1SNP TT              C   C/T
rs220074919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24084727fBcl11a : Intron1SNP             G  G    G
rs28202174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24088467fBcl11a : Intron1SNPA AAGA   AAGG AA  AGAA/G
rs28202173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24089168fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  T TC/T
rs248257618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24095343fBcl11a : Intron1SNP             T  C    C/T
rs6248447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24096389fBcl11a : Intron1SNP      G A            A/G
rs28202172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24097705fBcl11a : Intron1SNPG GGGG   GGCG GG  GCGC/G
rs28202171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24100787fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGAG G GGG      GG A/G
rs28202170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24103161fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTC  TT  T TC/T
rs48668348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24108356fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNP AA      A           A
rs46104146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24108405fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNP GG      G           G
rs28202169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24109814fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTG GG  GGGG/T
rs28202168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24109910fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT   TT C  TC  T      C/T
rs28202167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110159fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA   AAA/G
rs28202166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110189fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPA AAAA   AA C AA   CAA/C
rs28202165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110248fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG G GG G GGGA GG    GA/G
rs28202164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110276fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110355fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTC TT  TTTC/T
rs28202162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110363fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs28202161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110466fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCAC CC  CCCA/C
rs28202160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110633fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCGC CC  CCCC/G
rs28202159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110703fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCT CC    CC/T
rs28202158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110769fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTCT T TTTT TT  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110933fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTTT A TTAT TT  TTTA/T
rs47840009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24110959fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNP G       G           G
rs49980973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111111fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNP T       T           T
rs28202156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111266fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CACA/C
rs28202155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111319fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28202154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111577fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPA A AA G A  A AA     A/G
rs28202153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111645fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAGA AA   AAA/G
rs28202152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24111906fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24112243fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTGT T TTTT TT  TTTG/T
rs28202150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24112409fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTCT C TTCC TT  TCTC/T
rs28202149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24112859fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGGG GG  GGGG/T
rs28202148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24112975fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC   CCC/T
rs28202147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24113121fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGAG G GGGG GG  GGGA/G
rs28202146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24113424fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCT CC  CCCC/T
rs28202145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24113493fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28202144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24113501fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CC C CC   CCC/T
rs28202143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114380fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTTC TT  TTTC/T
rs28202142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114461fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTT CC  C TC/T
rs28202141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114701fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114764fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTCT T TTTT TT  TTCC/T
rs28202139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114872fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs28202138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24114979fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT T C  C  TT  TT     C/T
rs28202137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24115007fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24115189fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTCT TT   TTC/T
rs28202135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24115311fBcl11a : Intron
Gm12064 : within coordinates of
1SNPC CCCC G CCCC CC   CCC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24115924fBcl11a : Intron1SNPA AAGA G AAGA AA   GGA/G
rs28202133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24115990fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT   TCC/T
rs28202132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24116184fBcl11a : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCTC/T
rs28202131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24116187fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28202130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24116268fBcl11a : Intron1SNPT TTCT   TTCT TT  TTCC/T
rs3712194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117310fBcl11a : Intron2SNP  C G CC C C        GC/G
rs28202129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117456fBcl11a : Intron1SNP  A A  G A G   A    AA/G
rs28202128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117560fBcl11a : Intron1SNP  C CC T C T   C    CC/T
rs28202127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117622fBcl11a : Intron1SNP  T T  G T G        TG/T
rs28202126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117660fBcl11a : Intron1SNP  G    T G T   G     G/T
rs28202125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117706fBcl11a : Intron1SNP  G G  A G A        GA/G
rs28202124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117848fBcl11a : Intron3SNP  C T  T C T T CTT   C/T
rs28202123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117900fBcl11a : Intron2SNP  T G    T G   T G  GG/T
rs51056003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117929fBcl11a : Intron1SNP  T              C   C/T
rs47116062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117937fBcl11a : Intron1SNP  A              C   A/C
rs49979135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117967fBcl11a : Intron1SNP  A              T   A/T
rs28202122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24117971fBcl11a : Intron1SNP  C GC G  CGC  C    GC/G
rs49653852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118063fBcl11a : Intron1SNP TT      T       C   C/T
rs50204835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118106fBcl11a : Intron1SNP  A              G   A/G
rs46687438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118158fBcl11a : Intron1SNP CC      C       T   C/T
rs49085833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118203fBcl11a : Intron1SNP         G       C   C/G
rs28202121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118209fBcl11a : Intron1SNP  C CC T C T   C    CC/T
rs47363731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24118300fBcl11a : Intron1SNP GG      G       T   G/T
rs46179146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24123482fBcl11a : Intron1SNP GG      A           A/G
rs28202120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24128816fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24129215fBcl11a : Intron1SNPT TTTT   TTAT TT  TTAA/T
rs28202118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24129486fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A  GAG GG  G AA/G
rs28202117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24129497fBcl11a : Intron1SNPC CCGC C CCCC CC  CC C/G
rs28202116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24129578fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs28202115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24129721fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24130042fBcl11a : Intron1SNPT T CT C TTCT TT  TCCC/T
rs28202113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24130568fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  C CC/T
rs28202112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24131110fBcl11a : Intron1SNPC CCAC   CCAA CC  CAAA/C
rs28202111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24131742fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGT GG  GGGG/T
rs28202110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24131888fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24131943fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TCTC/T
rs28202108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24132178fBcl11a : Intron1SNPC CCC  G  CGC CC  CCCC/G
rs28202107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24132201fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GCGC/G
rs28202106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24132293fBcl11a : Intron1SNPA AAAA C  ACA AA  ACAA/C
rs28202105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133176fBcl11a : Intron1SNPT    A T A  T TT     A/T
rs28202104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133219fBcl11a : Intron1SNPG GGGG T GGTG GG  GTGG/T
rs28202103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133286fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs28202102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133322fBcl11a : Intron2SNPT TCCT   TC CCTTC T CC/T
rs28202101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133522fBcl11a : Intron1SNPT T T    TT C TT    CC/T
rs51356926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24133796fBcl11a : Intron1SNP  G      A           A/G
rs28202100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24134241fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24134328fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C TTCT T   T  C/T
rs28202098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24134833fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
rs28202097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24134975fBcl11a : Intron1SNPA AAA  C  ACA AA  AAAA/C
rs247565886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24135684fBcl11a : Intron1SNP             C  C    C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136038fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A  GAG GG  G GA/G
rs28202095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136216fBcl11a : Intron1SNPT TTTT A TT T TT  TTTA/T
rs48560152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136291fBcl11a : Intron1SNP  C                  C
rs28202094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136590fBcl11a : Intron1SNPC CCCC G  CGC CC  CCCC/G
rs28202093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136662fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C  TCT TT  TCTC/T
rs28202092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24136995fBcl11a : Intron1SNPA AAGA G AAGA AA  AGGA/G
rs28202091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24137036fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCGC/G
rs28202090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24137680fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24138352fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24139678fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24139729fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGA GG  GGGA/G
rs28202086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24140091fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24140178fBcl11a : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCCC/T
rs28202084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24140344fBcl11a : Intron1SNPA AAGA A AAAA AA  AAAA/G
rs28202083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24140945fBcl11a : Intron1SNPT TTTT G TTGT TT  TTTG/T
rs28202082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141052fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141440fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCGC/G
rs28202080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141758fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs28202079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141798fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141916fBcl11a : Intron1SNPC CCCC A CCAC CC  CCCA/C
rs28202077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24141998fBcl11a : Intron1SNPT T TT A TTAT TT  TTTA/T
rs28202076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142015fBcl11a : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCCC/T
rs28202075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142100fBcl11a : Intron1SNPC CCCC G CC C CC  CCCC/G
rs28202074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142105fBcl11a : Intron1SNPA AAAA   AA A AA  AGAA/G
rs28202073
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142249fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142370fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
rs28202071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142672fBcl11a : Intron1SNPT TTCT C TTCC TT  TCCC/T
rs28202070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24142802fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGA GG  GGGA/G
rs28202069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143051fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143103fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GAGA/G
rs28202067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143482fBcl11a : Intron1SNPA AAGA G AAGA AA  AGAA/G
rs28202066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143544fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143671fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CC C CC  CCTC/T
rs28202064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143679fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AA A/G
rs28202063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24143991fBcl11a : Intron1SNPA AACA A AAAA AA  AAAA/C
rs256030005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144037fBcl11a : Intron1SNP             A  A    A
rs28202062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144038fBcl11a : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCCC/T
rs28202061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144573fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GGAA/G
rs28202060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144621fBcl11a : Intron1SNPG GGTG T GGTG GG  GTTG/T
rs28202059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144679fBcl11a : Intron1SNPG GGCG G GGGG GG  GCCC/G
rs28202058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144704fBcl11a : Intron1SNPA AACA C AACA AA  ACCA/C
rs28202057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144945fBcl11a : Intron1SNPA AATA T AATA AA  ATTA/T
rs28202056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24144979fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs28202055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24145123fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CCCC/T
rs28202054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24145780fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs28202053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24145983fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
rs6325691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146040fBcl11a : Intron2SNPT TTTTTCCTTCT TT  TCTC/T
rs28202052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146146fBcl11a : Intron1SNPT TTTT C TTCT TT  TTTC/T
rs28202051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146437fBcl11a : Intron1SNPT TTTT G TTGT TT  TTTG/T
rs28202050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146552fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTC TT  TTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs224975788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146712fBcl11a : Intron1SNP             C  A    A/C
rs28202049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24146865fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CCTC/T
rs28202048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147253fBcl11a : Intron2SNPG GAGG G GAGGGGGA GGGA/G
rs253563098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147317fBcl11a : Intron1SNP             G  A    A/G
rs28202047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147354fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28202046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147456fBcl11a : Intron1SNPG GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28202045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147516fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28202044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24147882fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148100fBcl11a : Intron1SNPT T TT T TTTT TT  TCTC/T
rs228749665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148215fBcl11a : Intron1SNP             A  G    A/G
rs28202042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148294fBcl11a : Intron2SNPG GAGG G GAGGGGGA GGGA/G
rs28202041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148334fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  C CC/T
rs28202040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148337fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28202039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148605fBcl11a : Intron2SNPG GTGG T GTTTTGGT G GG/T
rs28202038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24148786fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCTC CC  CCCC/T
rs28202037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24149043fBcl11a : Intron1SNPT TTTT G TTGT TT  TTTG/T
rs28202036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24149064fBcl11a : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GCGC/G
rs28202035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24149132fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24149621fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs28202033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24150274fBcl11a : Intron2SNPC CGCC C CGCCCCCG CCCC/G
rs28202032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24150309fBcl11a : Intron1SNPG GAGG G GAGG GG  GGGA/G
rs28202031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24150375fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TT C TT  T TC/T
rs28202030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24150499fBcl11a : Intron1SNPA AAAA C AACA AA  AAAA/C
rs28202029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24150930fBcl11a : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  AGAA/G
rs28202028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151039fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151519fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs246706584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151524fBcl11a : Intron1SNP             C  A    A/C
rs214555160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151677fBcl11a : Intron1SNP             A  A    A
rs231896688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151814fBcl11a : Intron1SNP             T  G    G/T
rs28202026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151981fBcl11a : Intron1SNPC CCCC C CCCT CC  CCCC/T
rs250518791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24151995fBcl11a : Intron1SNP             A  G    A/G
rs212075089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24152231fBcl11a : Intron1SNP             T  C    C/T
rs28202025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24152285fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
rs28202024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24152975fBcl11a : Intron2SNPA AAAA G AAGGGAAA AGAA/G
rs260220133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24153035fBcl11a : Intron1SNP             C  C    C
rs225091563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24153504fBcl11a : Intron1SNP             T  C    C/T
rs28202023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24153607fBcl11a : Intron1SNPC CCCC A CCAC CC  CACA/C
rs28202022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24153738fBcl11a : Intron2SNPG GAGG G GAGGAGGA GGGA/G
rs250311178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24153805fBcl11a : Intron1SNP             A  C    A/C
rs28202021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24154025fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs28202020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24154517fBcl11a : Intron1SNPG GGAG G GGGG GG  GGGA/G
rs28202019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24154815fBcl11a : Intron2SNPA ACAA   ACAAAAAC  AAA/C
rs28202018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24154838fBcl11a : Intron2SNPT TCCT C TCCCCTTC TCCC/T
rs264497679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24155053fBcl11a : Intron1SNP             A  G    A/G
rs28202017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24155532fBcl11a : Intron1SNPC CCCC G CCGC CC  CCCC/G
rs233532611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24155987fBcl11a : Intron1SNP             A  G    A/G
rs28202016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24156024fBcl11a : Intron1SNPC CCCC   CCTC CC  CCCC/T
rs251903499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24156226fBcl11a : Intron1SNP             T  G    G/T
rs28202015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24156870fBcl11a : Intron1SNPA AAAA G AAGA AA  AAAA/G
rs28202014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24156940fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28202013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24156979fBcl11a : Intron2SNPC CTCC C CTCCTCCC CCCC/T
rs28202012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157076fBcl11a : Intron2SNPC CTCC C CTCCTCCT CCCC/T
rs28202011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157412fBcl11a : Intron1SNPC CCCC T CCTC CC  CTCC/T
rs246765522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157471fBcl11a : Intron1SNP             G  G    G
rs214615362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157504fBcl11a : Intron1SNP             G  A    A/G
rs225962319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157514fBcl11a : Intron1SNP             G  T    G/T
rs28202010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157707fBcl11a : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs244412713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157816fBcl11a : Intron1SNP             C  C    C
rs28202009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24157955fBcl11a : Intron1SNPA A AA A AAAA AA   G A/G
rs212370744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24158344fBcl11a : Coding-Synonymous1SNP             A  G    A/G
rs240375758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24158426fBcl11a : Intron1SNP             C  T    C/T
rs28202008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24158577fBcl11a : Intron1SNP  GGGG T GGTG GG  GGGG/T
rs28202007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24158610fBcl11a : Intron1SNP  TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs259221194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159085fBcl11a : Intron1SNP             T  C    C/T
rs216649307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159099fBcl11a : Intron1SNP             A  A    A
rs28202006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159311fBcl11a : Intron2SNP  AAGA G AAGAGAAA AGAA/G
rs250379379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159494fBcl11a : Intron1SNP             C  G    C/G
rs219244172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159519fBcl11a : Intron1SNP             A  G    A/G
rs28202005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159621fBcl11a : Intron1SNP  CCCC T CCCC CC  CTCC/T
rs28202004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159907fBcl11a : Intron2SNP  CCTC C CCCCTCCC CCCC/T
rs28202003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159929fBcl11a : Intron1SNP  AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs255259353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24159998fBcl11a : Intron1SNP             C  G    C/G
rs28202002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24160057fBcl11a : Intron1SNP  TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs28202001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24160158fBcl11a : Intron1SNP  GGGG G GGGG GG  GCGC/G
rs28202000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24160282fBcl11a : Intron1SNP  CCCC C CCCC CC  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28201999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24160731f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
2SNP  CCTC C CCCCTCCC CCCC/T
rs28201998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24160957f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  G GG A GGAG GG  GGGA/G
rs28201997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24161014f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  GGGG A GGAG GG  G GA/G
rs28201996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24161301f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
2SNP  CCTC C CCCCTCCC CCCC/T
rs28201995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24161390f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
2SNP  T GT T TTTTGTTT TTTG/T
rs28201994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24161868f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
2SNP  GGAG   GGGGAGGG G GA/G
rs28201993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24162703f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
2SNP  GGAG A GGAGAGGG GAGA/G
rs28201992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24166347f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
Bcl11a : mRNA-UTR
2SNP  TTCT C TTCTCTTT TCTC/T
rs28201991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24168620f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  GGGG A GGAG GG  GGGA/G
rs28201990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24168814f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  A  A G A G   A     A/G
rs226019240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24168825f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs28201989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24169079f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  AAAA G AAGA AA  AGAA/G
rs108407423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24169718f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP CC      C       G   C/G
rs108801386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24169820f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP C       C       T   C/T
rs108582138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24169832f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP         G       A   A/G
rs108273735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24169850f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP         A       G   A/G
rs108890049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24170115f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP  G      G       A   A/G
rs108310856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24170184f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP CC      C       A   A/C
rs254439915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24170386f4930538E20Rik : within coordinates of
Bcl11a : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs261621823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24173840fBcl11a : Locus-Region1SNP             T  G    G/T
rs235099529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24174270fBcl11a : 147 bp downstream of1SNP             C  T    C/T
rs253990668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24174750fBcl11a : 627 bp downstream of1SNP             A  C    A/C
rs217214282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24175574fBcl11a : 1451 bp downstream of1SNP             C  T    C/T
rs232845071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:24176123fBcl11a : 2000 bp downstream of1SNP             C  A    A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory