About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Cfi
complement component factor i
MGI:105937

282 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6362953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537679fCfi : Locus-Region1SNP       T C                          C/T
rs6362986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537695fCfi : Locus-Region1SNP       T C                          C/T
rs6363054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537734fCfi : Locus-Region3SNPC TCT  TCCCC C          T        C CC/T
rs6363462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537761fCfi : Locus-Region1SNP       C A                          A/C
rs6363477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537771fCfi : Locus-Region1SNP       A G                          A/G
rs6363527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537812fCfi : Locus-Region1SNP       C T                          C/T
rs6364587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129537944fCfi : Locus-Region1SNP       T C                          C/T
rs30628011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538510fCfi : Locus-Region1SNPG A A   A GGG           A           A/G
rs30628013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538584fCfi : Locus-Region1SNP  C C   T               C          TC/T
rs30629045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538688fCfi : Locus-Region1SNPG GGG   T G             G   G      GG/T
rs30629047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538781fCfi : Locus-Region1SNPA AAA A G AAAA          A   A    A AA/G
rs30629049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538802fCfi : Locus-Region1SNPG AGA A A AGGG          A   A    G AA/G
rs16797780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538926rCfi : Locus-Region1SNP   TCCT T      TT   C C             C/T
rs16797779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538952rCfi : Locus-Region1SNP   AGGA G      AG   G G      A      A/G
rs16797778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538963rCfi : Locus-Region1SNP   CTTC C      CC   T T      C      C/T
rs30629051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129538980fCfi : Locus-Region1SNPC T T     CCCC          T           C/T
rs30629053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539016fCfi : Locus-Region1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30630015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539229fCfi : Locus-Region1SNPC T T     CCCC          T   C    C CC/T
rs30630017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539278fCfi : Locus-Region1SNPG GGG G C GGGG          G   G    G GC/G
rs30630019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539406fCfi : Locus-Region1SNPT C C   T TTTT          C          TC/T
rs3695423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539422fCfi : Locus-Region1SNP    T  C                            C/T
rs30630021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129539665fCfi : mRNA-UTR1SNP  G G   T G             G   G      GG/T
rs30630023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540189fCfi : Intron1SNPT G G   G T             G           G/T
rs30631015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540508fCfi : Intron1SNPA G G   G AAAA          G   A      AA/G
rs30631017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540529fCfi : Intron1SNPC CCC C T CCCC          C   C    C CC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30631019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540746fCfi : Intron1SNPT C C   C TTT           C        T CC/T
rs30631021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540784fCfi : Intron2SNPGGAGA GAA GGGG          A   G    G GA/G
rs30805398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540954fCfi : Intron1SNP GA    A  G                         A/G
rs30060580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129540959fCfi : Intron2SNP TA A  AA TTTT          A        T  A/T
rs30631994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541233fCfi : Intron1SNPG TGT   T G GG          T   G    G GG/T
rs30631996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541451fCfi : Intron1SNPA G G   A AAA           G   A      AA/G
rs30655262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541489fCfi : Intron1SNP G     T                            G/T
rs31479290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541512fCfi : Intron1SNP C     T                            C/T
rs30459978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541658fCfi : Intron2SNPTTCTC TCT TTTT          C   T    T TC/T
rs30077572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541692fCfi : Intron2SNPCCA A CAC CCCC          A          CA/C
rs31738615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541748fCfi : Intron1SNP C     T                            C/T
rs30498990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541866fCfi : Intron2SNPTTCTC CCC CTTT          C   C    T TC/T
rs30460944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541896fCfi : Intron2SNPGGA A   G GGGG          A        G GA/G
rs30632002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129541911fCfi : Intron1SNPG GGG   G AGGG          G        G GA/G
rs30633194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542314fCfi : Intron1SNP  G G   A A             G           A/G
rs30633196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542412fCfi : Intron1SNPC TCT   C CCCC          T   C    C CC/T
rs30633198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542473fCfi : Intron1SNPA GAG   A AAAA          G   A    A AA/G
rs30633199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542507fCfi : Intron1SNPG GGG   G TGGG          G        G TG/T
rs30633201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542612fCfi : Intron1SNPG A A   G G  G          A           A/G
rs30633203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542689fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30625125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542730fCfi : Intron1SNPG AGA   G GGGG          A   G    G GA/G
rs30625127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129542844fCfi : Intron1SNPC T T   T  C            T           C/T
rs30625129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543004fCfi : Intron1SNPA GAG   G GAGA          G        A GA/G
rs30625131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543078fCfi : Intron1SNPA G G   A AAA           G          AA/G
rs30625133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543353fCfi : Intron1SNPC GCG G G GCCC          G   G    C GC/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30551685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543664fCfi : Intron1SNP AC       A                         A/C
rs30162177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543828fCfi : Intron2SNPGGTGT T G TGGG          T   T    G GG/T
rs30662633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543959fCfi : Intron1SNP CT       T                         C/T
rs30206822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543962fCfi : Intron1SNP AG       G                         A/G
rs30610851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543995fCfi : Intron1SNP AG       G                         A/G
rs30626096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129543997fCfi : Intron1SNP  A A   A A G           A   A      AA/G
rs30264258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544218fCfi : Intron2SNPCCTCT   C TCCC          T   T    C CC/T
rs30626099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544292fCfi : Intron1SNPG CGC C C CGGG          C   C    G GC/G
rs30626101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544311fCfi : Intron1SNPG GGG G C GGGG          G   G    G GC/G
rs30626103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544417fCfi : Intron1SNPT TTT T   TTTT          T   T    T CC/T
rs30627095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544550fCfi : Intron1SNP  T T T G T             T   T      TG/T
rs30627097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544623fCfi : Intron1SNPT TTT T C TTTT          T        T TC/T
rs30627099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544672fCfi : Intron1SNPC CCC T C TCCC          C        C CC/T
rs30627101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544694fCfi : Intron1SNPT TTT T A TTTT          T   T    T TA/T
rs30627103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129544749fCfi : Intron1SNPG GGG   A GGGG          G   G    G GA/G
rs30627955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129545499fCfi : Intron1SNPC CCC C A CCCC          C   C    C CA/C
rs31102786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129545884fCfi : Intron1SNPCCT    T  T                         C/T
rs30324843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129546565fCfi : Intron1SNP  G       A                         A/G
rs30627956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129546863fCfi : Intron1SNPA AAA A G AAAA          A   A      AA/G
rs30627957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129547439fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30627959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129547531fCfi : Intron1SNPC CCC C G CCCC          C   C    C CC/G
rs30627961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129547588fCfi : Intron1SNPT TTT T A TTTT          T   T    T TA/T
rs30627963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129547622fCfi : Intron1SNPA AAA A C AAAA          A   A    A AA/C
rs30628795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129548103fCfi : Intron1SNPA AAA A G AAAA          A   A    A AA/G
rs30628797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129548128fCfi : Intron1SNPT TTT   A TTTT          T   T    T TA/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30628799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129548170fCfi : Intron1SNPT T T T C TTTT          T   T    T TC/T
rs30628801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129548772fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30628803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129549057fCfi : Intron1SNPT TTT T C TTTT          T   T    T TC/T
rs30629675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129549075fCfi : Intron2SNPAAAAA CAA CAAA          A   C    A AA/C
rs30629677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129550460fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30629679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129550782fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G GA/G
rs30629680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129550888fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G AA/G
rs16797784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551031rCfi : Intron1IN-DEL    ----A       A     -      -      -/A
rs16797781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551048rCfi : Intron3Mixed   T-T -T      -T   - -      -      -/A/T
rs30629682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551110fCfi : Intron1SNPA AAA A G AAAA          A   A    A AA/G
rs30630684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551236fCfi : Intron1SNPG GGG G T GGGG          G   G    G GG/T
rs30630685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551280fCfi : Intron1SNPC CCC C T CCCC          C   C    C CC/T
rs30630687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551498fCfi : Coding-NonSynonymous1SNPC CCC C G CCCC          C   C      CC/G
rs16800626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551865rCfi : Intron1SNP    GAG         A   G        G      A/G
rs16800625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129551894rCfi : Intron1SNP     AG         A   G        G      A/G
rs30672920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129552115fCfi : Intron1SNP  A    A  G                         A/G
rs16797785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129552524rCfi : Intron1SNP   GGGGGG      GA   G G      G      A/G
rs30630688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129552803fCfi : Intron1SNPG C C C C CGCG          C   C      CC/G
rs6167965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129553640fCfi : Coding-Synonymous1SNP       G A                          A/G
rs30630690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129553674fCfi : Coding-NonSynonymous1SNPC CCC   C CCCC          C   C      TC/T
rs30630692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129553763fCfi : Coding-Synonymous1SNPA AAA A C AAAA          A   A    A AA/C
rs6169187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129553876fCfi : Intron1SNP       G A                          A/G
rs6169755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129553971fCfi : Intron3SNPC ACAAAACCACCC CA   A A A   AC   C CA/C
rs16800628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554017rCfi : Intron1SNP   CCCCCC      CT   C C      C      C/T
rs16800627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554031rCfi : Intron1SNP   GAAAAG      GG   A A      G      A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30631775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554267fCfi : Intron1SNPA G G G G GAGA          G   G      GA/G
rs30631777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554490fCfi : Intron1SNPC GCG G C GCGC          G   G      GC/G
rs30631779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554558fCfi : Intron1SNPT CTC   T CTCT          C   C      CC/T
rs30631780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554567fCfi : Intron1SNPT TTT   T A T           T   A      TA/T
rs30631782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129554736fCfi : Intron1SNP  T T T C T T           T   T      CC/T
rs30632704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555311fCfi : Intron1SNPC CCC C T CCCC          C   C      CC/T
rs30632706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555349fCfi : Intron1SNPC TCT T T TCTC          T   T    C TC/T
rs30632708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555356fCfi : Intron1SNPT TTT T T T T           T   T      CC/T
rs30632710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555367fCfi : Intron1SNPA GAG G A GAGA          G   G      GA/G
rs30632712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555467fCfi : Intron1SNPC CCC C T CCCC          C   C    C  C/T
rs30633544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555831fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    G AA/G
rs30625225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555858fCfi : Intron1SNPC T T   C TC C          T          CC/T
rs30625227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129555904fCfi : Intron1SNPA GAG   A GAG           G   G       A/G
rs30625229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556016fCfi : Intron1SNPA AAA A G AAAA          A   A    A AA/G
rs30625231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556060fCfi : Intron1SNPT CTC   T CTCT          C   C       C/T
rs30625233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556110fCfi : Intron1SNPG GGG G T GGGG          G   G      GG/T
rs30625965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556150fCfi : Intron1SNPC CCC C A CCCC          C   C      CA/C
rs30625967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556279fCfi : Intron1SNPC CCC T C TCCC          C   T    CCCC/T
rs30625969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129556634fCfi : Intron1SNP  A A   C A             A         C A/C
rs30625971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557397fCfi : Intron1SNP  G G   A G             G         AAA/G
rs30625973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557470fCfi : Intron1SNP  A A   G               A         G A/G
rs30626845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557533fCfi : Intron1SNP  G G   G G             G         AGA/G
rs30626847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557577fCfi : Intron1SNP  A A   T               A          TA/T
rs30626849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557695fCfi : Intron1SNP  C C   T C             C         TTC/T
rs30626851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557806fCfi : Intron1SNP  C C   G C             C         GGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30626853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129557932fCfi : Coding-Synonymous1SNP  C C   T               C         TTC/T
rs16799499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558009rCfi : Coding-NonSynonymous1SNP   TGG          G   G G             G/T
rs16799498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558014rCfi : Coding-Synonymous2SNP GAGAA AG A    GG   A A      G      A/G
rs16799497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558015rCfi : Coding-NonSynonymous2SNP GAGAA AG G    GG   A A      G      A/G
rs16799496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558019rCfi : Coding-Synonymous1SNP   GGG         GT   G G      G      G/T
rs16799495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558020rCfi : Coding-NonSynonymous2SNP CTCTT TC T    CC   T T      C      C/T
rs16799494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558069rCfi : Intron2SNP  TTTTT C T    TT   T T T    T    TTC/T
rs16799493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558106rCfi : Intron1SNP   GGGG G      GA   G G      G      A/G
rs16799492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558195rCfi : Intron3SNP AGAGGG A G    AA   G G G    A    AAA/G
rs30627747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558291fCfi : Intron1SNP  C C                   C         CTC/T
rs30627749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558320fCfi : Intron2SNPCCG G  GC G             G          GC/G
rs16800623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558375fCfi : Intron2SNPAAG    G  G   G  A            AAA   A/G
rs30627750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558418fCfi : Intron1SNP  A A   G A             A         AAA/G
rs16800624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558458fCfi : Intron2SNPGGC    C  C   C  G            GGG   C/G
rs30753188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558534fCfi : Intron1SNPGGA    A  A                         A/G
rs30549548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558536fCfi : Intron2SNPGGA A  AG A             A         G A/G
rs31570376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558730fCfi : Intron1SNP CC    C  T                         C/T
rs30800556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129558955fCfi : Intron1SNP GA    A  A                         A/G
rs31485512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129559048fCfi : Intron1SNP AC    C  C                         A/C
rs31638674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560296fCfi : Intron1SNP TC                                 C/T
rs31147214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560770fCfi : Intron1SNPGGA    A  A                         A/G
rs31531043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560828fCfi : Intron1SNPGGA    A  A                         A/G
rs16797789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560910rCfi : Intron1SNP   CCCCCT      CC     C      C      C/T
rs16797788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560943rCfi : Intron1SNP   CCCCCC      CT     C      C      C/T
rs16797787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560975rCfi : Intron1SNP   CCCCCC      CT     C      C      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16797786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129560976rCfi : Intron1SNP   GGGGGG      GA     G      G      A/G
rs30905377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561000fCfi : Intron1SNPTTC    C  C                         C/T
rs31289166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561021fCfi : Intron1SNPAAG    G  G                         A/G
rs30133554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561122fCfi : Intron1SNPGGC       C                         C/G
rs31099070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561199fCfi : Intron1SNP TC       C                         C/T
rs30627753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561283fCfi : Coding-Synonymous1SNP  G G   G G             G         AGA/G
rs30628985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561288fCfi : Coding-NonSynonymous1SNP  T T   C T             T          CC/T
rs30628987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561340fCfi : Coding-Synonymous2SNP TC C   T C             C         TTC/T
rs30016760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561367fCfi : Coding-Synonymous2SNP TC C   C C             C         TTC/T
rs30628990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561396fCfi : Intron1SNP  C C   A C             C         C A/C
rs30628992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561446fCfi : Intron1SNP  G G   A G             G         AGA/G
rs31199159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561501fCfi : Intron1SNP AG    G                            A/G
rs30619448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561604fCfi : Intron2SNP AG G  GA G             G         GGA/G
rs16799500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129561826fCfi : Intron1SNP   AA AAA      AG   A        A      A/G
rs30630004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129562534fCfi : Intron1SNP  A A   G               A         GGA/G
rs31477020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129562741fCfi : Intron1SNP C     C  G                         C/G
rs31623536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129563064fCfi : Intron1SNP C     C  T                         C/T
rs31710722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129563509fCfi : Intron1SNP  C    C  A                         A/C
rs31003181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129563998fCfi : Intron1SNPT A    A                            A/T
rs31080384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564066fCfi : Intron1SNPT G    G                            G/T
rs31180493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564226fCfi : Intron1SNPC G    G                            C/G
rs30008595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564227fCfi : Intron2SNPT A A  A                A         TAA/T
rs30505609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564333fCfi : Intron1SNPT A    A                            A/T
rs30630007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564449fCfi : Intron1SNP  T T   C T             T         CTC/T
rs16799510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564467rCfi : Intron2SNP CTCTT TT      C    T T      C      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16799509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564487rCfi : Intron1SNP   TCCC C      T    C C      T      C/T
rs16799508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564539rCfi : Intron2SNP AGAGGAGA      A    G G      A      A/G
rs16799507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564551rCfi : Intron2SNP CTCTTCTT      C    T T      C      C/T
rs16799506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564575rCfi : Intron2SNP GAGAAGAG      G    A A      G      A/G
rs16799504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564658rCfi : Intron1IN-DEL   C--C-C      C    - -      C      -/C
rs16799505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564658rCfi : Intron1SNP   GGGGGA      G    G G      G      A/G
rs16799503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564747rCfi : Intron2SNP  CCCCGCG      C    C C C    C    GCC/G
rs16799502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564752rCfi : Intron2SNP GCGCCCCC      G    C C      G      C/G
rs16799501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564760rCfi : Intron1SNP   AAAAAT      A    A A      A      A/T
rs30564154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564796fCfi : Intron1SNP AT    T                            A/T
rs30406986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564822fCfi : Intron1SNP TC    C                            C/T
rs30891135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564857fCfi : Intron1SNP TG    G                            G/T
rs33862562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564868fCfi : Intron1SNP GT    T                            G/T
rs30991937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564901fCfi : Coding-NonSynonymous1SNP GA    A                            A/G
rs30630010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129564991fCfi : Intron1SNP  C C                   C         TTC/T
rs30630012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565037fCfi : Intron1SNP  C C   T               C         CCC/T
rs30631084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565063fCfi : Coding-NonSynonymous1SNP  C C   T   C           C         CCC/T
rs30631086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565136fCfi : Intron1SNP  T T   G G             T         TTG/T
rs30631088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565215fCfi : Intron1SNP  G G   T T             G         TGG/T
rs30631090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565290fCfi : Intron1SNP  T T   A               T         TTA/T
rs30631092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565320fCfi : Intron1SNP  A A   G               A         AAA/G
rs31592292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129565719fCfi : Intron1SNP A     G                            A/G
rs30632014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566129fCfi : Intron1SNP  T T   C T             T         TCC/T
rs30632016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566148fCfi : Intron2SNP  T T   C C             T         CCC/T
rs30632018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566247fCfi : Intron1SNP  A A   G               A         GAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30632020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566261fCfi : Intron1SNP  C C   T C             C         CCC/T
rs30632022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566331fCfi : Intron1SNP  G G   A G             G         GGA/G
rs30632874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566413fCfi : Intron1SNP  T T   G               T         GGG/T
rs30632876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566490fCfi : Intron1SNP  C C   C               C         TCC/T
rs30632878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566785fCfi : Intron1SNP  C C   T C             C         CTC/T
rs31139134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566794fCfi : Intron1SNP T     C                            C/T
rs30632880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566863fCfi : Intron2SNP CT T  TC T             T         CCC/T
rs30632881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566888fCfi : Intron1SNP  T T   T T             T         TCC/T
rs30632883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566904fCfi : Intron1SNP  T T   C T T           T         TTC/T
rs30625115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129566953fCfi : Intron2SNP TC C  C  C             C         TCC/T
rs30549202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567156fCfi : Intron1SNP CT    T  T                         C/T
rs31528005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567194fCfi : Intron1SNP AT    T  T                         A/T
rs30625117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567343fCfi : Intron1SNP  T T   C T             T         CTC/T
rs30625119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567431fCfi : Intron1SNP  T T   C T             T         CTC/T
rs30625121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567550fCfi : Intron1SNP  G G   T               G         TGG/T
rs30625123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567616fCfi : Intron1SNP  G G   G G             G         AGA/G
rs30626075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567695fCfi : Intron1SNP  A A   G               A         G A/G
rs30626077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567895fCfi : Intron1SNPA AAA   A AACA          A        ACAA/C
rs30626079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129567911fCfi : Intron1SNPA AAA A A AAAA          A        AACA/C
rs30626080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568073fCfi : Intron1SNPC TCT T C TCCC          T         CCC/T
rs30626081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568098fCfi : Intron1SNPC TCT T C TCCC          T        CCTC/T
rs30626083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568336fCfi : Intron1SNPT A A A T ATTT          A        TTAA/T
rs30627135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568546fCfi : Intron1SNPC T T   C TCCC          T         CTC/T
rs30627137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568719fCfi : Intron1SNPG AGA A A AGAG          A   A    GAAA/G
rs30627139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129568732fCfi : Intron1SNPC CCC C T CCCC          C   C    CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30627141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129569329fCfi : Intron1SNPC CCC C C CCTC          C   C    CTCC/T
rs16797791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129570100rCfi : Intron1SNP   GAA A        G     A             A/G
rs16797790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129570107rCfi : Intron1SNP   CGG G        C     G             C/G
rs30627143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129570399fCfi : Intron1SNPA G G G A GAA           G   G     AGA/G
rs30628035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129570493fCfi : Intron1SNPT C C C T CTCT          C   C     T C/T
rs30628037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571162fCfi : Coding-Synonymous1SNPC CCC C T CCCC          C        CCCC/T
rs30628039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571570fCfi : Intron1SNPG AGA A G AGGG          A   A    GGGA/G
rs30628041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571736fCfi : Intron1SNPC A A A A ACA           A   A    CAAA/C
rs30628043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571871fCfi : Intron1SNPC CCC C C CCCC          C   C    CCTC/T
rs30628925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571880fCfi : Intron1SNPT C C C C CTCT          C        TTCC/T
rs30628926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571885fCfi : Intron1SNP  A A A G A A           A   A      AA/G
rs30628928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129571971fCfi : Intron1SNPA G G G   G G           G         AGA/G
rs30628930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129572071fCfi : Intron1SNP  T T T C T C           T   T     CCC/T
rs30628932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129572508fCfi : Intron1SNPA CAC C C CA A          C   C    ACAA/C
rs30628933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129572531fCfi : Intron1SNP  C C C G C             C   C     G C/G
rs30630045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129572881fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G     AGA/G
rs30630046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129573168fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G   G    GGGA/G
rs30630048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129573230fCfi : Intron1SNPG GGG G G GGGG          G   G    GCGC/G
rs30630050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129573501fCfi : Intron1SNPT C C C C CTCT          C   C    TCCC/T
rs30630052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129573512fCfi : Intron1SNPG GGG G G GGGG          G   G    GGTG/T
rs30631094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129573924fCfi : Intron1SNPT CTC C C CTCT          C        TTTC/T
rs30631096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574047fCfi : Intron1SNPT C C     CTC           C         T C/T
rs30631098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574098fCfi : Intron1SNP  G G G G G C           G          GC/G
rs30631100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574102fCfi : Intron1SNPT CTC C C CTCT          C         TCC/T
rs30631102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574210fCfi : Intron1SNPC C C C T CCCC          C   C    CCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30632074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574342fCfi : Intron1SNPG GGG G   GGAG          G        GAGA/G
rs30632076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574413fCfi : Intron1SNPG A A A A AGAG          A   A    GAAA/G
rs30632078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574467fCfi : Intron1SNP  G G G G G T           G   G     TGG/T
rs30632080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574533fCfi : Intron1SNPG GGG G G GGTG          G   G    GTGG/T
rs30632082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574584fCfi : Intron1SNPC CCC C C CCCC          C        CTCC/T
rs30632964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574626fCfi : Intron1SNPT CTC C C CTCT          C        TCCC/T
rs30632966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574771fCfi : Intron1SNPG A A   G AGGG          A        GGAA/G
rs30456906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574825fCfi : Intron1SNPG A    A  A                         A/G
rs30632968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574908fCfi : Intron1SNPC CCC C A CCCC          C   C    CACA/C
rs30453495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129574995fCfi : Intron1SNPAAG    G  G                         A/G
rs30632970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575206fCfi : Intron1SNPG GGG G T GGGG          G        GGGG/T
rs31054331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575681fCfi : Intron1SNP AG    G  G                         A/G
rs30886804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575701fCfi : Intron1SNP AG    G  G                         A/G
rs30632972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575843fCfi : Coding-Synonymous1SNPG GGG G A GGGG          G   G    GAAA/G
rs30633974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575873fCfi : Coding-Synonymous1SNPT TTT T C TTTT          T   T    TCCC/T
rs16797799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575954rCfi : Coding-Synonymous1SNP   GGGGGA      GG   G G      G      A/G
rs16797798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575963rCfi : Coding-Synonymous1SNP   GGGGGG      GA   G G      G      A/G
rs16797797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575966rCfi : Coding-Synonymous1SNP   GGGGGA      GG   G G      G      A/G
rs16797796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129575992rCfi : Coding-NonSynonymous1SNP   TTTTTC      TC   T T      T      C/T
rs30633976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129576157fCfi : Intron1SNPC T T T C TCTC          T   T    CCCC/T
rs30633978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129576728fCfi : Intron1SNPG A A A   A A           A         G A/G
rs30627415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129576864fCfi : Intron1SNPT TTT T   TTTT          T   T    TC C/T
rs30627417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129576939fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G        GAAA/G
rs30627419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129576996fCfi : Intron1SNPG GGG G A GGGG          G        GGGA/G
rs16797795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129577151rCfi : Intron1IN-DEL   T -  T                    T      -/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16797794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129577161rCfi : Intron1SNP     A  G       G            G      A/G
rs16797793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129577164rCfi : Intron1SNP     A  G       G            G      A/G
rs16797792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129577169rCfi : Intron1SNP    A AAA      AG   A        A      A/G
rs31472277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129577368fCfi : Intron1SNP CT       T                         C/T
rs30459870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129578081fCfi : mRNA-UTR1SNPCCT    T  T                         C/T
rs3091032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129578160fCfi : mRNA-UTR1SNP        T         CC C C CCC        C/T
rs31622951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:129578236fCfi : mRNA-UTR1SNPT C    C  C                         C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory