About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Aga
aspartylglucosaminidase
MGI:104873

110 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs37822967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595090fAga : Locus-Region1SNP   T     C  TT                          T   T C/T 
rs37261901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595117fAga : Locus-Region1SNP   C     C  CGC                         C   C C/G 
rs32998458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595165fAga : Locus-Region1SNP GG   A    A                                  A/G 
rs36669066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595398fAga : Locus-Region1SNP   A     C  ACA                         A   A A/C 
rs36249596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595594fAga : Locus-Region1SNP   T     T  TA                          T   T A/T 
rs37678224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595719fAga : Locus-Region1SNP   C     A  CC                          C   C A/C 
rs37053443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595742fAga : Locus-Region1SNP  AA     T  AA                          A   A A/T 
rs6372035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54595769fAga : Locus-Region2SNP      A  TT ATA                             A A/T 
rs6373503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596036fAga : Locus-Region2SNP  GG  G  CC GC                          G   G C/G 
rs33603671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596095fAga : Locus-Region2SNP AAG  G  G GAG        G                 A   G A/G 
rs37021791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596116fAga : Locus-Region1SNP         C  CG                          C   C C/G 
rs32818576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596280fAga : Locus-Region2SNP CCT  T  T TCT                          C   T C/T 
rs6387767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596391fAga : Locus-Region1SNP      G   A                                   A/G 
rs6387775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596398fAga : Locus-Region2SNP   C  C  AA CCC                         C   C A/C 
rs36458588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596461fAga : Locus-Region1SNP         A  CC                          C   C A/C 
rs6388280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596472fAga : Locus-Region1SNP      G   A                                   A/G 
rs37216251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596559fAga : Locus-Region1SNP   C     A  CAC                         C   C A/C 
rs36721121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596607fAga : Locus-Region1SNP         A  TA                              T A/T 
rs36292962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596747fAga : Locus-Region1SNPT TT     T  TA                          T   T A/T 
rs38700486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54596865fAga : Locus-Region1SNP         A  CAC                         C   C A/C 
rs37071228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597028fAga : Locus-Region1SNP         A  AT                          A   A A/T 
rs33041218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597056fAga : Locus-Region2SNP AA   G  G GAG                          A   A A/G 
rs13479764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597080fAga : mRNA-UTR3SNPCCCG GGCCCC?CCGCCCCCC  CCCCCGGCCCCCCCCCCCCCCCCC/G 
rs37803707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597163fAga : Coding-NonSynonymous1SNP  AA     C  ACA                             A A/C 
rs37508330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597164fAga : Coding-Synonymous1SNPG GG     G  AG                          A   G A/G 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs38482985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597267fAga : Coding-NonSynonymous1SNP         G   AG                         G   A A/G 
rs36243286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597524fAga : Intron1SNP   C     T  CTC                         C   C C/T 
rs37662003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597711fAga : Intron1SNP   C     T  CC                          C   C C/T 
rs37472407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597744fAga : Intron1SNP         T  TCT                             T C/T 
rs36700138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597869fAga : Intron1SNP         C  CT                              C C/T 
rs33530248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54597946fAga : Intron1SNP GG        T                                  G/T 
rs32620965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54598297fAga : Intron2SNP GGA  A  A AGG                          G   G A/G 
rs38682838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599101fAga : Intron1SNP         G  AA                          A   A A/G 
rs36414314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599188fAga : Intron1SNP         C  GGC                         G   G C/G 
rs36875426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599203fAga : Intron1SNPA AAA    A  ACA                         A   A A/C 
rs36307297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599273fAga : Intron1SNP   G     A  GG                          G   G A/G 
rs36495849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599289fAga : Intron1SNP         T  TG                          T   T G/T 
rs37617479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599639fAga : Coding-Synonymous1SNPC CC     C  CT                          C   C C/T 
rs36775082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54599737fAga : Intron1SNPG GG     C  GGG       G                 G   G C/G 
rs37107020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600030fAga : Intron1SNP         G  GTG                         G   G G/T 
rs39453671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600092fAga : Intron1SNP         T  TC                          T   T C/T 
rs39473596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600139fAga : Intron1SNPT TT        CC                          T   T C/T 
rs36595737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600154fAga : Intron1SNPG GG     G  GA                          G   G A/G 
rs36914143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600363fAga : Intron1SNPC        C  CGC                         C   C C/G 
rs37042454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600396fAga : Intron1SNP         C  CT                              C C/T 
rs39284775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600425fAga : Intron1SNP   A     A  AG                          A   A A/G 
rs37112770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600456fAga : Intron1SNP   C     C  CT                          C   C C/T 
rs37826150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54600458fAga : Intron1SNP   G     A  GG                          G   G A/G 
rs36852228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601265fAga : Intron1SNP         G  TG                          G   T G/T 
rs37722246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601680fAga : Intron1SNP         A  TA                          A   A A/T 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs36673614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601732fAga : Intron1SNPT  T     C  TTT                         T   T C/T 
rs36689523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601773fAga : Intron1SNP         G  GA                          A   G A/G 
rs37170384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601809fAga : Intron1SNP         C  CA                          A   C A/C 
rs36322485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601841fAga : Intron1SNP   T     A  AT                          T   A A/T 
rs38211878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54601935fAga : Intron1SNP         G  GAG                         G   G A/G 
rs37477493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602013fAga : Intron1SNP   G     G  AGG                         G   A A/G 
rs37205221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602077fAga : Intron1SNP  AA     A  CAC                         A   A A/C 
rs37553430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602097fAga : Intron1SNP         C  TCT                         C   C C/T 
rs36992775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602125fAga : Intron1SNP  AA        CAA                         A     A/C 
rs38387534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602176fAga : Intron1SNP         T  TTT                         T   C C/T 
rs37057751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602204fAga : Intron1SNP         C  CCC                         C   T C/T 
rs37424827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602425fAga : Intron1SNP         T  TC                          C   C C/T 
rs37030540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602529fAga : Intron1SNP         A  AG                          G   A A/G 
rs37586601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602658fAga : Intron1SNP  GG     G  GCG                         G   G C/G 
rs36826704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602886fAga : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C    C C   A A/C 
rs36610913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54602944fAga : Intron1SNPG GGGG   A GAGG       G          G    G G   G A/G 
rs36265099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54603183fAga : Coding-NonSynonymous1SNPA ACCC     CCCC       C          A    A C     A/C 
rs36819312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54603321fAga : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C    C C   T C/T 
rs36915461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54603918fAga : Intron1SNPT TTT    A TATT       T          T    T T   A A/T 
rs37269254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604654fAga : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C    C C   T C/T 
rs36912620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604806fAga : Intron1SNPG GGGG   T GGGG       G          G    G G   T G/T 
rs37103412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604831fAga : Intron1SNPT TTTA      AT                   T    T T   A A/T 
rs36375618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604892fAga : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G          G    G G   A A/G 
rs37443068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604946fAga : Intron1SNPC CCC    C CCCC       C          C    C C   T C/T 
rs36786544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604957fAga : Intron1SNPA AAAA   T AAAA       A          A    A A   A A/T 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs38656694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54604982fAga : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C          C    C C   T C/T 
rs39051051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54605025fAga : Intron1SNPC CCC    C CCTC       C          C    C C   C C/T 
rs36619404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54605061fAga : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C    C C   T C/T 
rs36982833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54605727fAga : Intron1SNPA AAAA     AGAA       A          A    A A   G A/G 
rs36635696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54605985fAga : Intron1SNPT TTTT   A TTAT       T          T    T T   A A/T 
rs38336859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606019fAga : Intron1SNPT TTTT   A TAAT       T          T    T T   A A/T 
rs39341128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606076fAga : Intron1SNPA AAAA   A AATA       A          A    A A   A A/T 
rs36391911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606336fAga : Intron1SNPC CCCC   G CCGC       C          C    C C   C C/G 
rs37039437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606581fAga : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T          T    T T   A A/T 
rs37451219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606642fAga : Intron1SNPG GGGG   G GGCG       G          G    G G   G C/G 
rs36568909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606779fAga : Intron1SNPG GGGG     GCGG       G          G    G G     C/G 
rs37210810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606831fAga : Intron1SNPA AAA      AAGA       A          A    A A     A/G 
rs6198718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606981fAga : Intron1SNP      A   T                                   A/T 
rs6198737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54606986fAga : Intron2SNPA AAAAA   GAG A       A          A    A A   G A/G 
rs6199209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607075fAga : Intron2SNPT TTTTT  AATTAT       T          T    T T   T A/T 
rs36574588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607121fAga : Intron1SNPG GGGG   G GAGG       G          G    G G   G A/G 
rs6213139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607339fAga : Intron1SNP      T   C                                   C/T 
rs6213232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607393fAga : Intron2SNPG GGGGG   T GTG       G          G    G G     G/T 
rs6213634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607406fAga : Intron1SNP      G   A                                   A/G 
rs33362490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607478fAga : Intron2SNPAAAGG G    GAAG       G          A    A G   A A/G 
rs36339660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54607651fAga : Intron1SNPG GGGG     GGAG       G          G    G G   G A/G 
rs37386946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608510fAga : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T          T    T T   C C/T 
rs37063194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608598fAga : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG     GGGG       G          G    G G   C C/G 
rs4227165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608606rAga : Coding-Synonymous1SNP  G GGG  G G       A G                        A/G 
rs6151973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608748rAga : mRNA-UTR1IN-DEL  i iii  j i       - i                        -/TT/TTTi-TT, j-TTT
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs4227164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608750rAga : mRNA-UTR1SNP  T TTT  T T       G T                        G/T 
rs4227163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608758rAga : mRNA-UTR1SNP  G GGG  C G       C G                        C/G 
rs4227162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608783rAga : Locus-Region1SNP  A AAA  A A       C A                        A/C 
rs4227161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608817rAga : Locus-Region1SNP  A AAA  G A       A A                        A/G 
rs4227160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608821rAga : Locus-Region1SNP  G GGG  A G       G G                        A/G 
rs4227159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54608926rAga : Locus-Region1SNP  T TTT  G T       T T                        G/T 
rs36532156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54609037fAga : Locus-Region1SNPT TTTT   G TGGT       T          T    T T     G/T 
rs36525138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54609097fAga : Locus-Region1SNPC CCC    T CTTC       C          C    C C     C/T 
rs37317071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54609132fAga : Locus-Region1SNPG GGGG     GCCG       G          G    G G     C/G 
rs36274168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:54609220fAga : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTTT       T          T    T T   C C/T 

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory