About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Hsd11b2
hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2
MGI:104720

47 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30910765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108040692fHsd11b2 : Locus-Region1SNPA  A A   AG       A     AG A/G
rs30910768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108041071fHsd11b2 : Locus-Region1SNPGG G G   GA       G     GA A/G
rs30910771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108041530fHsd11b2 : Locus-Region1SNPCC C C   CTC      C     CT C/T
rs30911754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108042350fHsd11b2 : Locus-Region1SNPTT T T   TCT      T     TC C/T
rs30911757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044021fHsd11b2 : Intron1SNPAAAA A AAAAA      AA    AATA/T
rs30911760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044181fHsd11b2 : Intron1SNPTTTT T GTTGT      TT    TGTG/T
rs30911763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044349fHsd11b2 : Intron1SNPCCCC C CCCTC      CC    CTCC/T
rs30912676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044430fHsd11b2 : Intron1SNPA AA A GAAAA      AA    AAAA/G
rs30912679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044537fHsd11b2 : Intron1SNP   C C CCCCC      CC     CTC/T
rs30912682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044550fHsd11b2 : Intron1SNPC CC C CCCCC      CC    CCAA/C
rs30913365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044675fHsd11b2 : Intron1SNPGGGG G AGGGG      GG    GGGA/G
rs30913368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044677fHsd11b2 : Intron1SNPGGGG G  GGAG      GG    GAGA/G
rs30913371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108044842fHsd11b2 : Intron1SNPGGGG G GGGAG      GG    GAGA/G
rs30914234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108045703fHsd11b2 : Intron1SNPAAAA A GAAGA      AA    AGGA/G
rs8278938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108045972fHsd11b2 : Intron1IN-DEL       TT     -  T    TT   -/T
rs8278939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108045973fHsd11b2 : Intron1IN-DEL       TT     -  T    TT   -/T
rs8237132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046014fHsd11b2 : Intron2SNP AAA AAGA   A GA A    AA   A/G
rs8278940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046025fHsd11b2 : Intron2SNPTC T T TTTCT  C   TT  TTTCTC/T
rs8278941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046081fHsd11b2 : Coding-Synonymous1SNP       C      T       CC   C/T
rs8237133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046156fHsd11b2 : Coding-NonSynonymous2SNP CCC CCAC   C CC C    CC   A/C
rs8237134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046164fHsd11b2 : Coding-Synonymous3SNP TTTTTTCT   TTCTTT  T TT   C/T
rs8237135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046254fHsd11b2 : Coding-Synonymous3SNPTTTTTTTCTTCTT CTTTTT  TTTCTC/T
rs8278913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046314fHsd11b2 : Intron1SNP    GGGGG   G A GG    GG   A/G
rs8278914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046317fHsd11b2 : Intron1SNP   CCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs8278915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046422fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
1SNP   CCCCCC   C T CC    CC   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8278937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046524rAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
2SNP  CC CCCC   CCT CC  CCCC   C/T
rs8278936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046542rAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
1SNP  GG GGGG   G A GG    GG   A/G
rs8238610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108046815rAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Intron
1SNP CCCCCC C   C  C T    CC   C/T
rs8278916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047056rAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-NonSynonymous
1SNP      T          G     G   G/T
rs8278917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047259fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
2SNPTTTTTTTCTTCTT C TTTT  TTTCTC/T
rs8278918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047295fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
1SNP  CCCCCCC   C T CC    CC   C/T
rs8278919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047300fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-NonSynonymous
1SNP  AAAAACA   A C AA    AA   A/C
rs8278920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047307fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Coding-Synonymous
1SNP  TTTTTAT   T T TT    TT   A/T
rs30914243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047489fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
1SNPCCCC C TCCTC      CC    CTCC/T
rs30915306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047662fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
1SNPCCCC C TCCTC      CC    CTCC/T
rs8238210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047783fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
1IN-DEL  A-   A                   -/A
rs8238211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047818fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
2SNP TTTTTTCT   T CT T    TT   C/T
rs8238212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047827fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
2SNP TTTTTTCT   T CT T    TT   C/T
rs8278923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047831fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : mRNA-UTR
1SNP  TTTTTTT   T G TT    TT   G/T
rs8238213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047958fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
15Mixed ------A-   - A---    --   -/A/C/G/T
rs8238222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108047968fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
3SNPTTTTTTTCTTCTT CTTTTT  TTTCTC/T
rs8238223
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048025fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
2SNP GGGGGGAG   G GGGG    GG   A/G
rs8278932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048044fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
1SNP  CCCCCCC   C A CC    CC   A/C
rs8238224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048071fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
2SNP AAAAAAGA   A AAAA    AA   A/G
rs8278934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048119fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
1SNP  AAA AAA   A C AA    A    A/C
rs8278935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048120fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
1SNP  GGG GGG   G A GG    G    A/G
rs30915311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:108048305fAtp6v0d1 : Locus-Region
Hsd11b2 : Locus-Region
1SNPAAAA A GAAGA      AA    AGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory